MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus thermophilus HB27 plasmid pTT27

Total Repeats: 6024

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_005838	CTT	2	6	72309	72314	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46255149
2002	NC_005838	CAC	2	6	72318	72323	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46255149
2003	NC_005838	GAGCGT	2	12	72342	72353	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	46255149
2004	NC_005838	GCA	2	6	72449	72454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2005	NC_005838	CTC	2	6	72482	72487	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2006	NC_005838	AAG	2	6	72501	72506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2007	NC_005838	CAAC	2	8	72511	72518	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2008	NC_005838	TCC	2	6	72532	72537	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2009	NC_005838	GCC	2	6	72543	72548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2010	NC_005838	GGC	2	6	72560	72565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2011	NC_005838	GGC	2	6	72573	72578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2012	NC_005838	CTTGC	2	10	72592	72601	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
2013	NC_005838	AGG	2	6	72609	72614	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2014	NC_005838	TC	4	8	72626	72633	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2015	NC_005838	CTTC	2	8	72651	72658	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2016	NC_005838	AGG	2	6	72677	72682	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2017	NC_005838	CTGC	2	8	72693	72700	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2018	NC_005838	GCC	2	6	72746	72751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2019	NC_005838	CCT	2	6	72783	72788	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2020	NC_005838	CTT	2	6	72801	72806	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2021	NC_005838	CACCT	2	10	72808	72817	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
2022	NC_005838	CTTCC	2	10	72861	72870	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
2023	NC_005838	CCT	2	6	72927	72932	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255150
2024	NC_005838	GGC	2	6	73023	73028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255150
2025	NC_005838	C	7	7	73034	73040	0 %	0 %	0 %	100 %	46255150
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2036	NC_005838	CGGGG	2	10	73358	73367	0 %	0 %	80 %	20 %	46255150
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2051	NC_005838	GGA	2	6	73793	73798	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255150
2052	NC_005838	GGGT	2	8	73821	73828	0 %	25 %	75 %	0 %	46255150
2053	NC_005838	GAAG	2	8	73888	73895	50 %	0 %	50 %	0 %	46255150
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2057	NC_005838	GGCG	2	8	74189	74196	0 %	0 %	75 %	25 %	46255150
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2065	NC_005838	CCT	2	6	74423	74428	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255150
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2106	NC_005838	GCC	2	6	76271	76276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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2110	NC_005838	GGCGG	2	10	76430	76439	0 %	0 %	80 %	20 %	46255152
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2119	NC_005838	CCT	2	6	76865	76870	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255152
2120	NC_005838	GGA	2	6	76886	76891	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255152
2121	NC_005838	CCT	2	6	76892	76897	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255152
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2127	NC_005838	CCGGG	2	10	76994	77003	0 %	0 %	60 %	40 %	46255152
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2129	NC_005838	G	6	6	77034	77039	0 %	0 %	100 %	0 %	46255152
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2131	NC_005838	GGGAG	2	10	77147	77156	20 %	0 %	80 %	0 %	46255152
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2370	NC_005838	CCT	2	6	86015	86020	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255163
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2387	NC_005838	TGGG	2	8	86564	86571	0 %	25 %	75 %	0 %	46255163
2388	NC_005838	G	6	6	86569	86574	0 %	0 %	100 %	0 %	46255163
2389	NC_005838	TTC	2	6	86648	86653	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46255163
2390	NC_005838	TC	3	6	86652	86657	0 %	50 %	0 %	50 %	46255163
2391	NC_005838	AGCCC	2	10	86701	86710	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
2392	NC_005838	GGA	2	6	86712	86717	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2394	NC_005838	TCC	2	6	86736	86741	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255164
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