MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus thermophilus HB27 plasmid pTT27

Total Repeats: 6024

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_005838	GAGG	2	8	53969	53976	25 %	0 %	75 %	0 %	46255130
1502	NC_005838	CTG	2	6	54021	54026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46255130
1503	NC_005838	GGGCC	2	10	54032	54041	0 %	0 %	60 %	40 %	46255130
1504	NC_005838	CTTC	2	8	54053	54060	0 %	50 %	0 %	50 %	46255130
1505	NC_005838	CTC	2	6	54117	54122	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255130
1506	NC_005838	ACC	2	6	54132	54137	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46255130
1507	NC_005838	CCT	2	6	54185	54190	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255130
1508	NC_005838	G	6	6	54199	54204	0 %	0 %	100 %	0 %	46255130
1509	NC_005838	AGG	2	6	54214	54219	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255130
1510	NC_005838	GAA	2	6	54251	54256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46255130
1511	NC_005838	GGA	3	9	54281	54289	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255130
1512	NC_005838	CTT	2	6	54299	54304	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46255130
1513	NC_005838	G	6	6	54316	54321	0 %	0 %	100 %	0 %	46255130
1514	NC_005838	CCT	2	6	54365	54370	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255130
1515	NC_005838	CGGG	2	8	54371	54378	0 %	0 %	75 %	25 %	46255130
1516	NC_005838	CCT	2	6	54470	54475	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255130
1517	NC_005838	GCC	2	6	54483	54488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46255130
1518	NC_005838	G	6	6	54511	54516	0 %	0 %	100 %	0 %	46255130
1519	NC_005838	GC	3	6	54578	54583	0 %	0 %	50 %	50 %	46255130
1520	NC_005838	TGG	2	6	54607	54612	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46255130
1521	NC_005838	TCC	2	6	54655	54660	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255130
1522	NC_005838	GAG	2	6	54702	54707	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255130
1523	NC_005838	CGC	2	6	54716	54721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46255130
1524	NC_005838	AGG	2	6	54727	54732	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255130
1525	NC_005838	C	7	7	54746	54752	0 %	0 %	0 %	100 %	46255130
1526	NC_005838	CTC	2	6	54786	54791	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255130
1527	NC_005838	C	6	6	54809	54814	0 %	0 %	0 %	100 %	46255130
1528	NC_005838	CAC	2	6	54818	54823	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46255130
1529	NC_005838	GGA	2	6	54899	54904	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255130
1530	NC_005838	CTC	2	6	54978	54983	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255130
1531	NC_005838	CTT	2	6	55007	55012	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46255130
1532	NC_005838	CCG	2	6	55013	55018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46255130
1533	NC_005838	CCCCT	2	10	55032	55041	0 %	20 %	0 %	80 %	46255130
1534	NC_005838	CG	3	6	55091	55096	0 %	0 %	50 %	50 %	46255130
1535	NC_005838	GAG	2	6	55104	55109	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255130
1536	NC_005838	ACCT	2	8	55121	55128	25 %	25 %	0 %	50 %	46255130
1537	NC_005838	TCC	3	9	55146	55154	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255131
1538	NC_005838	TCC	2	6	55167	55172	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255131
1539	NC_005838	C	6	6	55193	55198	0 %	0 %	0 %	100 %	46255131
1540	NC_005838	CCT	2	6	55213	55218	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255131
1541	NC_005838	ACC	2	6	55244	55249	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46255131
1542	NC_005838	GGAGG	2	10	55294	55303	20 %	0 %	80 %	0 %	46255131
1543	NC_005838	TCC	2	6	55305	55310	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255131
1544	NC_005838	GGA	2	6	55333	55338	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255131
1545	NC_005838	CTT	2	6	55345	55350	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46255131
1546	NC_005838	CCT	2	6	55351	55356	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255131
1547	NC_005838	CTC	2	6	55364	55369	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255131
1548	NC_005838	TCC	2	6	55380	55385	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255131
1549	NC_005838	GCC	2	6	55402	55407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46255131
1550	NC_005838	GGC	2	6	55418	55423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255131
1551	NC_005838	GTG	2	6	55433	55438	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46255131
1552	NC_005838	G	6	6	55438	55443	0 %	0 %	100 %	0 %	46255131
1553	NC_005838	CTT	2	6	55454	55459	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46255131
1554	NC_005838	GCC	2	6	55463	55468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46255131
1555	NC_005838	TCC	3	9	55476	55484	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255131
1556	NC_005838	CGTCTT	2	12	55540	55551	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	46255131
1557	NC_005838	GGA	2	6	55565	55570	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255131
1558	NC_005838	CCT	2	6	55573	55578	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255131
1559	NC_005838	GGC	2	6	55587	55592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255131
1560	NC_005838	CTC	3	9	55598	55606	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255131
1561	NC_005838	GGGC	2	8	55608	55615	0 %	0 %	75 %	25 %	46255131
1562	NC_005838	TGG	2	6	55670	55675	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46255131
1563	NC_005838	C	6	6	55680	55685	0 %	0 %	0 %	100 %	46255131
1564	NC_005838	GGA	2	6	55723	55728	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255131
1565	NC_005838	TCT	2	6	55734	55739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46255131
1566	NC_005838	CCT	3	9	55771	55779	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255131
1567	NC_005838	AAAGG	2	10	55844	55853	60 %	0 %	40 %	0 %	46255132
1568	NC_005838	CCT	2	6	55874	55879	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255132
1569	NC_005838	TCC	2	6	55894	55899	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255132
1570	NC_005838	G	6	6	55936	55941	0 %	0 %	100 %	0 %	46255132
1571	NC_005838	ACC	2	6	55975	55980	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46255132
1572	NC_005838	CTT	2	6	55985	55990	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46255132
1573	NC_005838	CCT	2	6	56042	56047	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255132
1574	NC_005838	GAG	2	6	56055	56060	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255132
1575	NC_005838	G	6	6	56143	56148	0 %	0 %	100 %	0 %	46255132
1576	NC_005838	GTGG	2	8	56150	56157	0 %	25 %	75 %	0 %	46255132
1577	NC_005838	CTC	2	6	56250	56255	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255132
1578	NC_005838	TCC	2	6	56275	56280	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255132
1579	NC_005838	TGGG	2	8	56310	56317	0 %	25 %	75 %	0 %	46255132
1580	NC_005838	TCC	2	6	56327	56332	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255132
1581	NC_005838	G	7	7	56357	56363	0 %	0 %	100 %	0 %	46255132
1582	NC_005838	CTC	2	6	56385	56390	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255132
1583	NC_005838	ACCC	2	8	56397	56404	25 %	0 %	0 %	75 %	46255132
1584	NC_005838	GGA	2	6	56456	56461	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255132
1585	NC_005838	GCT	2	6	56483	56488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46255132
1586	NC_005838	CTT	3	9	56506	56514	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46255133
1587	NC_005838	TCTTCC	2	12	56520	56531	0 %	50 %	0 %	50 %	46255133
1588	NC_005838	TCC	3	9	56529	56537	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255133
1589	NC_005838	CTC	2	6	56552	56557	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255133
1590	NC_005838	CCT	2	6	56563	56568	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255133
1591	NC_005838	GCCCC	2	10	56587	56596	0 %	0 %	20 %	80 %	46255133
1592	NC_005838	CCTC	2	8	56616	56623	0 %	25 %	0 %	75 %	46255133
1593	NC_005838	CTC	2	6	56675	56680	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255133
1594	NC_005838	GAC	2	6	56711	56716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46255133
1595	NC_005838	GGC	2	6	56752	56757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255133
1596	NC_005838	ACC	2	6	56763	56768	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46255133
1597	NC_005838	CCT	2	6	56779	56784	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255133
1598	NC_005838	C	7	7	56793	56799	0 %	0 %	0 %	100 %	46255133
1599	NC_005838	GAA	2	6	56818	56823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46255133
1600	NC_005838	AGG	2	6	56847	56852	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255133
1601	NC_005838	G	6	6	56856	56861	0 %	0 %	100 %	0 %	46255133
1602	NC_005838	GGTCTT	2	12	56863	56874	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	46255133
1603	NC_005838	CCGACG	2	12	56877	56888	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	46255133
1604	NC_005838	GAG	2	6	56897	56902	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255133
1605	NC_005838	CGG	2	6	56911	56916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255133
1606	NC_005838	AGG	2	6	56967	56972	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255133
1607	NC_005838	AGGG	2	8	56981	56988	25 %	0 %	75 %	0 %	46255133
1608	NC_005838	TGG	2	6	56994	56999	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46255133
1609	NC_005838	TGA	2	6	57006	57011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46255133
1610	NC_005838	TC	3	6	57019	57024	0 %	50 %	0 %	50 %	46255133
1611	NC_005838	TCC	2	6	57027	57032	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255133
1612	NC_005838	GGC	2	6	57091	57096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255133
1613	NC_005838	G	6	6	57110	57115	0 %	0 %	100 %	0 %	46255133
1614	NC_005838	GGA	2	6	57142	57147	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255133
1615	NC_005838	TGGCCC	2	12	57150	57161	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	46255133
1616	NC_005838	G	6	6	57194	57199	0 %	0 %	100 %	0 %	46255133
1617	NC_005838	GAA	2	6	57253	57258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46255133
1618	NC_005838	GAA	2	6	57277	57282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46255133
1619	NC_005838	TCC	2	6	57291	57296	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255133
1620	NC_005838	ACC	2	6	57312	57317	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46255133
1621	NC_005838	CCCTG	2	10	57330	57339	0 %	20 %	20 %	60 %	46255133
1622	NC_005838	TTC	2	6	57341	57346	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46255133
1623	NC_005838	G	6	6	57407	57412	0 %	0 %	100 %	0 %	46255133
1624	NC_005838	GCCC	2	8	57421	57428	0 %	0 %	25 %	75 %	46255133
1625	NC_005838	C	6	6	57444	57449	0 %	0 %	0 %	100 %	46255133
1626	NC_005838	TCC	3	9	57453	57461	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255133
1627	NC_005838	CCT	2	6	57469	57474	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255133
1628	NC_005838	CTC	2	6	57479	57484	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255133
1629	NC_005838	AGAC	2	8	57537	57544	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1630	NC_005838	GA	3	6	57645	57650	50 %	0 %	50 %	0 %	46255134
1631	NC_005838	C	6	6	57728	57733	0 %	0 %	0 %	100 %	46255134
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1752	NC_005838	GCCCC	2	10	62175	62184	0 %	0 %	20 %	80 %	46255139
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1755	NC_005838	GGGCCT	2	12	62423	62434	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	46255140
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