MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus thermophilus HB27 plasmid pTT27

Total Repeats: 6024

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_005838	TGG	2	6	36386	36391	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46255110
1002	NC_005838	TGAGG	2	10	36464	36473	20 %	20 %	60 %	0 %	46255110
1003	NC_005838	G	6	6	36478	36483	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_005838	C	6	6	36492	36497	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1005	NC_005838	TTC	2	6	36501	36506	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1006	NC_005838	CTC	2	6	36576	36581	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255111
1007	NC_005838	TCC	2	6	36697	36702	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255111
1008	NC_005838	CAC	2	6	36749	36754	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46255111
1009	NC_005838	CCT	2	6	36755	36760	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255111
1010	NC_005838	TGG	2	6	36769	36774	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46255111
1011	NC_005838	TGG	2	6	36805	36810	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46255111
1012	NC_005838	CCT	2	6	36815	36820	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255111
1013	NC_005838	TCC	2	6	36835	36840	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255111
1014	NC_005838	TCC	3	9	36862	36870	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255111
1015	NC_005838	GTG	2	6	36876	36881	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46255111
1016	NC_005838	GTG	2	6	36891	36896	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46255111
1017	NC_005838	AGG	2	6	36925	36930	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255111
1018	NC_005838	TCA	2	6	36934	36939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46255111
1019	NC_005838	ACC	2	6	36940	36945	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46255111
1020	NC_005838	CCT	2	6	36965	36970	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255111
1021	NC_005838	TGC	2	6	37021	37026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46255111
1022	NC_005838	ACCT	2	8	37062	37069	25 %	25 %	0 %	50 %	46255111
1023	NC_005838	CGC	2	6	37070	37075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46255111
1024	NC_005838	GGC	2	6	37106	37111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255111
1025	NC_005838	CGG	2	6	37180	37185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255111
1026	NC_005838	TCC	2	6	37186	37191	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255111
1027	NC_005838	ATG	2	6	37239	37244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46255111
1028	NC_005838	GGGC	2	8	37255	37262	0 %	0 %	75 %	25 %	46255111
1029	NC_005838	G	6	6	37276	37281	0 %	0 %	100 %	0 %	46255111
1030	NC_005838	CCT	2	6	37283	37288	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255111
1031	NC_005838	GCG	3	9	37341	37349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255111
1032	NC_005838	CTC	2	6	37365	37370	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255111
1033	NC_005838	TGCG	2	8	37417	37424	0 %	25 %	50 %	25 %	46255111
1034	NC_005838	TCCTCG	2	12	37474	37485	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	46255112
1035	NC_005838	CCTC	2	8	37528	37535	0 %	25 %	0 %	75 %	46255112
1036	NC_005838	GGC	2	6	37550	37555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255112
1037	NC_005838	CTT	2	6	37622	37627	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46255112
1038	NC_005838	TCCT	2	8	37644	37651	0 %	50 %	0 %	50 %	46255112
1039	NC_005838	CGGAG	2	10	37730	37739	20 %	0 %	60 %	20 %	46255112
1040	NC_005838	CAT	2	6	37805	37810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46255112
1041	NC_005838	TCCGC	2	10	37834	37843	0 %	20 %	20 %	60 %	46255112
1042	NC_005838	G	6	6	37878	37883	0 %	0 %	100 %	0 %	46255112
1043	NC_005838	CTT	2	6	37904	37909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46255112
1044	NC_005838	CTT	2	6	37940	37945	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46255112
1045	NC_005838	GGA	2	6	37967	37972	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255112
1046	NC_005838	GGC	2	6	37973	37978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255112
1047	NC_005838	TGG	2	6	37981	37986	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46255112
1048	NC_005838	CTC	2	6	38091	38096	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255112
1049	NC_005838	CAC	2	6	38111	38116	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46255112
1050	NC_005838	GGCCAC	2	12	38120	38131	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	46255112
1051	NC_005838	GCC	3	9	38193	38201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46255112
1052	NC_005838	CGTCCT	2	12	38219	38230	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	46255112
1053	NC_005838	CTT	3	9	38231	38239	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46255112
1054	NC_005838	CCG	2	6	38269	38274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46255112
1055	NC_005838	GGA	2	6	38298	38303	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_005838	CCA	2	6	38350	38355	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46255113
1057	NC_005838	AGG	2	6	38383	38388	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255113
1058	NC_005838	CGGGA	2	10	38442	38451	20 %	0 %	60 %	20 %	46255113
1059	NC_005838	CCG	2	6	38480	38485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46255113
1060	NC_005838	GAG	2	6	38490	38495	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255113
1061	NC_005838	TGGCC	2	10	38545	38554	0 %	20 %	40 %	40 %	46255113
1062	NC_005838	TCC	2	6	38560	38565	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255113
1063	NC_005838	TGG	2	6	38617	38622	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46255113
1064	NC_005838	GGA	2	6	38690	38695	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255113
1065	NC_005838	CGCCTT	2	12	38723	38734	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	46255113
1066	NC_005838	CTT	2	6	38783	38788	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46255113
1067	NC_005838	CGC	2	6	38882	38887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46255113
1068	NC_005838	CCA	2	6	38888	38893	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46255113
1069	NC_005838	CCT	3	9	38894	38902	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255113
1070	NC_005838	CTT	2	6	39032	39037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46255113
1071	NC_005838	C	6	6	39086	39091	0 %	0 %	0 %	100 %	46255113
1072	NC_005838	ACT	2	6	39157	39162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46255113
1073	NC_005838	CGGGGA	2	12	39184	39195	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	46255113
1074	NC_005838	CGGCCA	2	12	39229	39240	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	46255113
1075	NC_005838	CAC	2	6	39270	39275	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46255113
1076	NC_005838	GCC	2	6	39333	39338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46255113
1077	NC_005838	GTG	2	6	39366	39371	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46255113
1078	NC_005838	GCC	2	6	39414	39419	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46255113
1079	NC_005838	GAA	2	6	39432	39437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46255113
1080	NC_005838	CTA	2	6	39521	39526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46255113
1081	NC_005838	CCAG	2	8	39538	39545	25 %	0 %	25 %	50 %	46255113
1082	NC_005838	CG	3	6	39590	39595	0 %	0 %	50 %	50 %	46255113
1083	NC_005838	GGGC	2	8	39623	39630	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1084	NC_005838	AAG	2	6	39642	39647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46255114
1085	NC_005838	CCG	2	6	39677	39682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46255114
1086	NC_005838	CGG	2	6	39694	39699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255114
1087	NC_005838	GCTCC	2	10	39728	39737	0 %	20 %	20 %	60 %	46255114
1088	NC_005838	CAC	2	6	39773	39778	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46255114
1089	NC_005838	GGAG	2	8	39823	39830	25 %	0 %	75 %	0 %	46255114
1090	NC_005838	AGG	2	6	39831	39836	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255114
1091	NC_005838	CGC	2	6	39845	39850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46255114
1092	NC_005838	AGG	2	6	39922	39927	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255114
1093	NC_005838	CCGC	2	8	39931	39938	0 %	0 %	25 %	75 %	46255114
1094	NC_005838	TCC	2	6	39954	39959	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255114
1095	NC_005838	TCC	2	6	39963	39968	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255114
1096	NC_005838	GCC	2	6	40087	40092	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46255114
1097	NC_005838	CCA	2	6	40102	40107	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46255114
1098	NC_005838	GAG	2	6	40193	40198	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255114
1099	NC_005838	C	6	6	40202	40207	0 %	0 %	0 %	100 %	46255114
1100	NC_005838	GAG	2	6	40235	40240	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255114
1101	NC_005838	GTT	2	6	40277	40282	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	46255114
1102	NC_005838	CCT	2	6	40333	40338	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255114
1103	NC_005838	C	6	6	40354	40359	0 %	0 %	0 %	100 %	46255114
1104	NC_005838	GAG	2	6	40367	40372	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255114
1105	NC_005838	ACC	2	6	40404	40409	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46255114
1106	NC_005838	C	6	6	40418	40423	0 %	0 %	0 %	100 %	46255114
1107	NC_005838	GCC	2	6	40442	40447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46255114
1108	NC_005838	GC	4	8	40465	40472	0 %	0 %	50 %	50 %	46255114
1109	NC_005838	GGCCC	2	10	40478	40487	0 %	0 %	40 %	60 %	46255114
1110	NC_005838	CGC	2	6	40502	40507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46255114
1111	NC_005838	A	7	7	40509	40515	100 %	0 %	0 %	0 %	46255114
1112	NC_005838	CCT	2	6	40557	40562	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1113	NC_005838	GGA	2	6	40567	40572	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_005838	CCTC	2	8	40680	40687	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1115	NC_005838	GTTCTG	2	12	40732	40743	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	46255115
1116	NC_005838	GGCC	2	8	40752	40759	0 %	0 %	50 %	50 %	46255115
1117	NC_005838	AGG	2	6	40868	40873	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255115
1118	NC_005838	CGC	2	6	40896	40901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46255115
1119	NC_005838	GGT	2	6	40917	40922	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46255115
1120	NC_005838	CTA	2	6	40983	40988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46255115
1121	NC_005838	GCC	2	6	40996	41001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46255115
1122	NC_005838	CCT	2	6	41043	41048	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255115
1123	NC_005838	CTT	2	6	41055	41060	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46255115
1124	NC_005838	CGGG	2	8	41065	41072	0 %	0 %	75 %	25 %	46255115
1125	NC_005838	GGT	2	6	41088	41093	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46255115
1126	NC_005838	CGG	2	6	41114	41119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255115
1127	NC_005838	GGC	2	6	41137	41142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255115
1128	NC_005838	CCTTC	2	10	41160	41169	0 %	40 %	0 %	60 %	46255115
1129	NC_005838	CCG	2	6	41198	41203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46255115
1130	NC_005838	GCG	2	6	41227	41232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255115
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1257	NC_005838	GAG	2	6	45174	45179	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255119
1258	NC_005838	CGGG	2	8	45232	45239	0 %	0 %	75 %	25 %	46255119
1259	NC_005838	TGG	2	6	45308	45313	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46255119
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1385	NC_005838	ACG	2	6	50084	50089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46255125
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1387	NC_005838	GGC	2	6	50140	50145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255126
1388	NC_005838	AGG	2	6	50153	50158	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255126
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1390	NC_005838	CGG	2	6	50195	50200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255126
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1500	NC_005838	GCCC	2	8	53907	53914	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding

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