MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus thermophilus HB27 plasmid pTT27

Total Repeats: 6024

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_005838	GCC	2	6	191496	191501	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46255265
5002	NC_005838	CGG	2	6	191614	191619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255265
5003	NC_005838	CCCG	2	8	191640	191647	0 %	0 %	25 %	75 %	46255265
5004	NC_005838	GGT	2	6	191648	191653	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46255265
5005	NC_005838	GAGG	2	8	191670	191677	25 %	0 %	75 %	0 %	46255265
5006	NC_005838	G	6	6	191709	191714	0 %	0 %	100 %	0 %	46255265
5007	NC_005838	CCT	2	6	191753	191758	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255265
5008	NC_005838	GGGACG	2	12	191773	191784	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	46255265
5009	NC_005838	GGA	2	6	191798	191803	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255265
5010	NC_005838	G	6	6	191809	191814	0 %	0 %	100 %	0 %	46255265
5011	NC_005838	G	6	6	191839	191844	0 %	0 %	100 %	0 %	46255265
5012	NC_005838	CCT	2	6	191849	191854	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255265
5013	NC_005838	ACCGCC	2	12	191924	191935	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
5014	NC_005838	GAGG	2	8	192068	192075	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
5015	NC_005838	GCG	2	6	192304	192309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5016	NC_005838	G	6	6	192386	192391	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5017	NC_005838	G	6	6	192414	192419	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5018	NC_005838	GCGCAC	2	12	192485	192496	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
5019	NC_005838	TCT	2	6	192533	192538	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5020	NC_005838	CGCT	2	8	192592	192599	0 %	25 %	25 %	50 %	46255266
5021	NC_005838	AAG	2	6	192677	192682	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46255266
5022	NC_005838	TCC	3	9	192698	192706	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255266
5023	NC_005838	TTG	2	6	192707	192712	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	46255266
5024	NC_005838	GCC	2	6	192786	192791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46255266
5025	NC_005838	AGC	2	6	192809	192814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46255266
5026	NC_005838	AGG	2	6	192919	192924	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255267
5027	NC_005838	GTC	2	6	193080	193085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46255267
5028	NC_005838	CGG	2	6	193105	193110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255267
5029	NC_005838	GAG	2	6	193116	193121	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255267
5030	NC_005838	ACC	2	6	193129	193134	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46255267
5031	NC_005838	CCAACG	2	12	193172	193183	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	46255267
5032	NC_005838	GGC	2	6	193187	193192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255267
5033	NC_005838	GAG	2	6	193242	193247	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255267
5034	NC_005838	GAG	2	6	193269	193274	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255267
5035	NC_005838	AGG	2	6	193291	193296	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255267
5036	NC_005838	GCGG	2	8	193316	193323	0 %	0 %	75 %	25 %	46255267
5037	NC_005838	GCTCC	2	10	193326	193335	0 %	20 %	20 %	60 %	46255267
5038	NC_005838	CGG	2	6	193388	193393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255267
5039	NC_005838	GC	3	6	193432	193437	0 %	0 %	50 %	50 %	46255267
5040	NC_005838	GTA	2	6	193632	193637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46255267
5041	NC_005838	GAG	2	6	193692	193697	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255267
5042	NC_005838	ACC	2	6	193708	193713	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46255267
5043	NC_005838	TCC	2	6	193735	193740	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255267
5044	NC_005838	CGG	2	6	193783	193788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255267
5045	NC_005838	C	6	6	193804	193809	0 %	0 %	0 %	100 %	46255267
5046	NC_005838	G	6	6	193925	193930	0 %	0 %	100 %	0 %	46255268
5047	NC_005838	G	6	6	193944	193949	0 %	0 %	100 %	0 %	46255268
5048	NC_005838	GCC	2	6	193986	193991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46255268
5049	NC_005838	CGG	2	6	194031	194036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255268
5050	NC_005838	GTA	2	6	194051	194056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46255268
5051	NC_005838	GGCCC	2	10	194153	194162	0 %	0 %	40 %	60 %	46255268
5052	NC_005838	C	6	6	194188	194193	0 %	0 %	0 %	100 %	46255268
5053	NC_005838	GCC	2	6	194194	194199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46255268
5054	NC_005838	CCA	2	6	194212	194217	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46255268
5055	NC_005838	AAG	2	6	194222	194227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46255268
5056	NC_005838	CTC	2	6	194261	194266	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255268
5057	NC_005838	GGT	3	9	194314	194322	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46255268
5058	NC_005838	ACC	2	6	194376	194381	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46255268
5059	NC_005838	ACCT	2	8	194439	194446	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5060	NC_005838	CTT	2	6	194556	194561	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5061	NC_005838	GCC	2	6	194574	194579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5062	NC_005838	GGT	2	6	194586	194591	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5063	NC_005838	TCCCT	2	10	194642	194651	0 %	40 %	0 %	60 %	46255269
5064	NC_005838	CT	3	6	194650	194655	0 %	50 %	0 %	50 %	46255269
5065	NC_005838	CGG	2	6	194715	194720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255269
5066	NC_005838	GGA	2	6	194728	194733	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255269
5067	NC_005838	AGG	2	6	194764	194769	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255269
5068	NC_005838	GCC	2	6	194803	194808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46255269
5069	NC_005838	CTTC	2	8	194816	194823	0 %	50 %	0 %	50 %	46255269
5070	NC_005838	CTT	2	6	194826	194831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46255269
5071	NC_005838	CGC	2	6	194867	194872	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46255269
5072	NC_005838	GGC	2	6	194887	194892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255269
5073	NC_005838	CCT	2	6	194970	194975	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255269
5074	NC_005838	GAG	2	6	195027	195032	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255269
5075	NC_005838	C	6	6	195163	195168	0 %	0 %	0 %	100 %	46255269
5076	NC_005838	C	6	6	195182	195187	0 %	0 %	0 %	100 %	46255269
5077	NC_005838	GCGG	2	8	195200	195207	0 %	0 %	75 %	25 %	46255269
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5079	NC_005838	TGG	2	6	195325	195330	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46255269
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5081	NC_005838	CGC	2	6	195462	195467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46255269
5082	NC_005838	CCG	2	6	195542	195547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46255269
5083	NC_005838	CGC	2	6	195552	195557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46255269
5084	NC_005838	CACCC	2	10	195558	195567	20 %	0 %	0 %	80 %	46255269
5085	NC_005838	GGT	2	6	195569	195574	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46255269
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5087	NC_005838	GAG	2	6	195684	195689	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255269
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5090	NC_005838	GGC	2	6	195728	195733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255269
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5093	NC_005838	GTG	2	6	196127	196132	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46255270
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5095	NC_005838	CGGG	2	8	196285	196292	0 %	0 %	75 %	25 %	46255270
5096	NC_005838	GTGCCC	2	12	196310	196321	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	46255270
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5098	NC_005838	CGC	2	6	196412	196417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46255270
5099	NC_005838	AGG	3	9	196422	196430	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255270
5100	NC_005838	GCG	2	6	196486	196491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255270
5101	NC_005838	G	7	7	196523	196529	0 %	0 %	100 %	0 %	46255270
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5103	NC_005838	GAA	2	6	196547	196552	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46255270
5104	NC_005838	GAG	3	9	196562	196570	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255270
5105	NC_005838	GCG	2	6	196585	196590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255270
5106	NC_005838	GAC	2	6	196712	196717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46255270
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5108	NC_005838	GAG	2	6	196865	196870	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255270
5109	NC_005838	CTC	2	6	196871	196876	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255270
5110	NC_005838	CCT	2	6	196879	196884	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255270
5111	NC_005838	GCC	2	6	196912	196917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46255270
5112	NC_005838	GCC	2	6	197105	197110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46255270
5113	NC_005838	CCT	2	6	197116	197121	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255270
5114	NC_005838	GGGGA	2	10	197138	197147	20 %	0 %	80 %	0 %	46255270
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5252	NC_005838	C	6	6	203189	203194	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5253	NC_005838	ACC	2	6	203352	203357	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5254	NC_005838	CGCC	2	8	203423	203430	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5255	NC_005838	ACA	2	6	203545	203550	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5496	NC_005838	G	7	7	213412	213418	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5497	NC_005838	GAAAA	2	10	213515	213524	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
5498	NC_005838	A	6	6	213550	213555	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5499	NC_005838	CA	3	6	213603	213608	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5500	NC_005838	GAA	2	6	213640	213645	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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