MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Thermus thermophilus HB27

Total Repeats: 1804

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005835	CCCTG	2	10	223	232	0 %	20 %	20 %	60 %	46198309
2	NC_005835	CCCTT	2	10	796	805	0 %	40 %	0 %	60 %	46198309
3	NC_005835	GTCCA	2	10	855	864	20 %	20 %	20 %	40 %	46198309
4	NC_005835	GGGTG	2	10	949	958	0 %	20 %	80 %	0 %	46198309
5	NC_005835	GGACG	2	10	4219	4228	20 %	0 %	60 %	20 %	46198313
6	NC_005835	GCGGA	2	10	6400	6409	20 %	0 %	60 %	20 %	46198315
7	NC_005835	CGGGG	2	10	9625	9634	0 %	0 %	80 %	20 %	46198318
8	NC_005835	GCCGG	2	10	10820	10829	0 %	0 %	60 %	40 %	46198319
9	NC_005835	GGGGT	2	10	12613	12622	0 %	20 %	80 %	0 %	46198320
10	NC_005835	AGGGG	2	10	13407	13416	20 %	0 %	80 %	0 %	46198321
11	NC_005835	GTGGC	2	10	15661	15670	0 %	20 %	60 %	20 %	46198325
12	NC_005835	GGGGA	2	10	16561	16570	20 %	0 %	80 %	0 %	46198325
13	NC_005835	CCCTT	2	10	17328	17337	0 %	40 %	0 %	60 %	46198327
14	NC_005835	GGGGC	2	10	18297	18306	0 %	0 %	80 %	20 %	46198328
15	NC_005835	GCGGG	2	10	20251	20260	0 %	0 %	80 %	20 %	46198331
16	NC_005835	AAGGG	2	10	21350	21359	40 %	0 %	60 %	0 %	46198331
17	NC_005835	GGGGC	2	10	21423	21432	0 %	0 %	80 %	20 %	46198331
18	NC_005835	GGGGA	2	10	22976	22985	20 %	0 %	80 %	0 %	46198335
19	NC_005835	GAGGT	2	10	23384	23393	20 %	20 %	60 %	0 %	46198335
20	NC_005835	TCCCC	2	10	23798	23807	0 %	20 %	0 %	80 %	46198335
21	NC_005835	AGGCG	2	10	23963	23972	20 %	0 %	60 %	20 %	46198336
22	NC_005835	GCGGG	2	10	25407	25416	0 %	0 %	80 %	20 %	46198336
23	NC_005835	GAAGG	2	10	27098	27107	40 %	0 %	60 %	0 %	46198337
24	NC_005835	CCGCC	2	10	27313	27322	0 %	0 %	20 %	80 %	46198337
25	NC_005835	CCTGC	2	10	29508	29517	0 %	20 %	20 %	60 %	46198340
26	NC_005835	CCTGG	2	10	33257	33266	0 %	20 %	40 %	40 %	46198344
27	NC_005835	GGCCG	2	10	35793	35802	0 %	0 %	60 %	40 %	46198346
28	NC_005835	GGGCC	2	10	36867	36876	0 %	0 %	60 %	40 %	46198347
29	NC_005835	GGGGC	2	10	38462	38471	0 %	0 %	80 %	20 %	46198349
30	NC_005835	CCGCG	2	10	40602	40611	0 %	0 %	40 %	60 %	46198351
31	NC_005835	CTTCC	2	10	40793	40802	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
32	NC_005835	TGGCC	2	10	43909	43918	0 %	20 %	40 %	40 %	46198355
33	NC_005835	GCCTC	2	10	44218	44227	0 %	20 %	20 %	60 %	46198355
34	NC_005835	GCCCC	2	10	45310	45319	0 %	0 %	20 %	80 %	46198357
35	NC_005835	TTAGG	2	10	47767	47776	20 %	40 %	40 %	0 %	46198361
36	NC_005835	TCCGC	2	10	48533	48542	0 %	20 %	20 %	60 %	46198361
37	NC_005835	GCCCA	2	10	48787	48796	20 %	0 %	20 %	60 %	46198361
38	NC_005835	CCAGG	2	10	48906	48915	20 %	0 %	40 %	40 %	46198361
39	NC_005835	AAGCG	2	10	49694	49703	40 %	0 %	40 %	20 %	46198362
40	NC_005835	CCCAC	2	10	54340	54349	20 %	0 %	0 %	80 %	46198368
41	NC_005835	GCAGG	2	10	59373	59382	20 %	0 %	60 %	20 %	46198375
42	NC_005835	CCGTC	2	10	59754	59763	0 %	20 %	20 %	60 %	46198376
43	NC_005835	CGAGG	2	10	60927	60936	20 %	0 %	60 %	20 %	46198377
44	NC_005835	CGGGG	2	10	61938	61947	0 %	0 %	80 %	20 %	46198378
45	NC_005835	CGGGG	2	10	62568	62577	0 %	0 %	80 %	20 %	46198379
46	NC_005835	CCGGC	2	10	64673	64682	0 %	0 %	40 %	60 %	46198381
47	NC_005835	CGGGG	2	10	65018	65027	0 %	0 %	80 %	20 %	46198381
48	NC_005835	AGGAG	2	10	66551	66560	40 %	0 %	60 %	0 %	46198383
49	NC_005835	GTCCC	2	10	67114	67123	0 %	20 %	20 %	60 %	46198383
50	NC_005835	GGTGG	2	10	67364	67373	0 %	20 %	80 %	0 %	46198384
51	NC_005835	GCCCT	2	10	67711	67720	0 %	20 %	20 %	60 %	46198385
52	NC_005835	GGTTG	2	10	67918	67927	0 %	40 %	60 %	0 %	46198385
53	NC_005835	CGGGG	2	10	68220	68229	0 %	0 %	80 %	20 %	46198386
54	NC_005835	TCGCC	2	10	69863	69872	0 %	20 %	20 %	60 %	46198387
55	NC_005835	GCCTC	2	10	71097	71106	0 %	20 %	20 %	60 %	46198388
56	NC_005835	TCTCC	2	10	71778	71787	0 %	40 %	0 %	60 %	46198389
57	NC_005835	CGGGG	2	10	74188	74197	0 %	0 %	80 %	20 %	46198391
58	NC_005835	CGGGG	2	10	75046	75055	0 %	0 %	80 %	20 %	46198392
59	NC_005835	GGCCC	2	10	77199	77208	0 %	0 %	40 %	60 %	46198395
60	NC_005835	GGCGG	2	10	77647	77656	0 %	0 %	80 %	20 %	46198395
61	NC_005835	GTGGG	2	10	78986	78995	0 %	20 %	80 %	0 %	46198396
62	NC_005835	CGGGG	2	10	79229	79238	0 %	0 %	80 %	20 %	46198396
63	NC_005835	GGCCG	2	10	79245	79254	0 %	0 %	60 %	40 %	46198396
64	NC_005835	GAGGG	2	10	79756	79765	20 %	0 %	80 %	0 %	46198397
65	NC_005835	ATCCC	2	10	80773	80782	20 %	20 %	0 %	60 %	46198398
66	NC_005835	CGGGG	2	10	81577	81586	0 %	0 %	80 %	20 %	46198400
67	NC_005835	GGGAG	2	10	82511	82520	20 %	0 %	80 %	0 %	46198402
68	NC_005835	CCCCT	2	10	84421	84430	0 %	20 %	0 %	80 %	46198404
69	NC_005835	GCCCC	2	10	84794	84803	0 %	0 %	20 %	80 %	46198404
70	NC_005835	GTGCC	2	10	85542	85551	0 %	20 %	40 %	40 %	46198405
71	NC_005835	CGGGG	2	10	91306	91315	0 %	0 %	80 %	20 %	46198410
72	NC_005835	GGCGG	2	10	92756	92765	0 %	0 %	80 %	20 %	46198411
73	NC_005835	GGAGG	2	10	92798	92807	20 %	0 %	80 %	0 %	46198411
74	NC_005835	CGGGC	2	10	93356	93365	0 %	0 %	60 %	40 %	46198412
75	NC_005835	CCTTA	2	10	93442	93451	20 %	40 %	0 %	40 %	46198412
76	NC_005835	GGACG	2	10	93796	93805	20 %	0 %	60 %	20 %	46198412
77	NC_005835	GAGAT	2	10	94279	94288	40 %	20 %	40 %	0 %	46198414
78	NC_005835	CCCCG	2	10	95805	95814	0 %	0 %	20 %	80 %	46198415
79	NC_005835	CCGGG	2	10	96598	96607	0 %	0 %	60 %	40 %	46198415
80	NC_005835	GCCCT	2	10	97280	97289	0 %	20 %	20 %	60 %	46198416
81	NC_005835	CCGCC	2	10	97621	97630	0 %	0 %	20 %	80 %	46198416
82	NC_005835	GCCCT	2	10	98122	98131	0 %	20 %	20 %	60 %	46198417
83	NC_005835	GGGGA	2	10	99352	99361	20 %	0 %	80 %	0 %	46198418
84	NC_005835	CCCCA	2	10	100048	100057	20 %	0 %	0 %	80 %	46198419
85	NC_005835	CTTAG	2	10	102269	102278	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
86	NC_005835	CGAGG	2	10	106501	106510	20 %	0 %	60 %	20 %	46198429
87	NC_005835	AAGGG	2	10	107081	107090	40 %	0 %	60 %	0 %	46198429
88	NC_005835	TCCTC	2	10	108166	108175	0 %	40 %	0 %	60 %	46198431
89	NC_005835	GGCCC	2	10	108722	108731	0 %	0 %	40 %	60 %	46198431
90	NC_005835	TCCCC	2	10	109390	109399	0 %	20 %	0 %	80 %	46198432
91	NC_005835	AGGCG	2	10	109620	109629	20 %	0 %	60 %	20 %	46198432
92	NC_005835	CCCCG	2	10	112906	112915	0 %	0 %	20 %	80 %	46198436
93	NC_005835	CCCTC	2	10	112921	112930	0 %	20 %	0 %	80 %	46198436
94	NC_005835	CCCTC	2	10	115103	115112	0 %	20 %	0 %	80 %	46198438
95	NC_005835	CGCCC	2	10	116112	116121	0 %	0 %	20 %	80 %	46198438
96	NC_005835	GGCGG	2	10	116339	116348	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
97	NC_005835	GTGCG	2	10	117002	117011	0 %	20 %	60 %	20 %	46198439
98	NC_005835	CCCGG	2	10	118026	118035	0 %	0 %	40 %	60 %	46198441
99	NC_005835	GGCCC	2	10	118788	118797	0 %	0 %	40 %	60 %	46198441
100	NC_005835	GTGGC	2	10	121641	121650	0 %	20 %	60 %	20 %	46198444
101	NC_005835	GAAGG	2	10	124009	124018	40 %	0 %	60 %	0 %	46198447
102	NC_005835	CGGGG	2	10	127544	127553	0 %	0 %	80 %	20 %	46198452
103	NC_005835	CGCCC	2	10	127861	127870	0 %	0 %	20 %	80 %	46198452
104	NC_005835	CCGCC	2	10	128327	128336	0 %	0 %	20 %	80 %	46198452
105	NC_005835	CCAGG	2	10	129796	129805	20 %	0 %	40 %	40 %	46198455
106	NC_005835	CGCCC	2	10	129940	129949	0 %	0 %	20 %	80 %	46198455
107	NC_005835	AGGGG	2	10	130288	130297	20 %	0 %	80 %	0 %	46198455
108	NC_005835	GCGGG	2	10	131239	131248	0 %	0 %	80 %	20 %	46198456
109	NC_005835	CCCCT	2	10	131996	132005	0 %	20 %	0 %	80 %	46198456
110	NC_005835	GGAAG	2	10	133881	133890	40 %	0 %	60 %	0 %	46198459
111	NC_005835	CCCGC	2	10	133963	133972	0 %	0 %	20 %	80 %	46198459
112	NC_005835	GCCCC	2	10	135290	135299	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
113	NC_005835	CCAGG	2	10	136199	136208	20 %	0 %	40 %	40 %	46198461
114	NC_005835	AAGCC	2	10	136254	136263	40 %	0 %	20 %	40 %	46198461
115	NC_005835	TTTGG	2	10	136896	136905	0 %	60 %	40 %	0 %	46198462
116	NC_005835	GCGCC	2	10	137289	137298	0 %	0 %	40 %	60 %	46198463
117	NC_005835	CCAGG	2	10	138638	138647	20 %	0 %	40 %	40 %	46198463
118	NC_005835	CCCAG	2	10	139910	139919	20 %	0 %	20 %	60 %	46198464
119	NC_005835	CAGGC	2	10	140054	140063	20 %	0 %	40 %	40 %	46198465
120	NC_005835	CCCGC	2	10	140846	140855	0 %	0 %	20 %	80 %	46198466
121	NC_005835	CCCCG	2	10	142156	142165	0 %	0 %	20 %	80 %	46198467
122	NC_005835	GGGGC	2	10	143636	143645	0 %	0 %	80 %	20 %	46198470
123	NC_005835	GCCCC	2	10	143680	143689	0 %	0 %	20 %	80 %	46198470
124	NC_005835	GCCAG	2	10	143965	143974	20 %	0 %	40 %	40 %	46198471
125	NC_005835	GGGGA	2	10	145005	145014	20 %	0 %	80 %	0 %	46198472
126	NC_005835	TGCGG	2	10	145202	145211	0 %	20 %	60 %	20 %	46198472
127	NC_005835	GCCCC	2	10	145409	145418	0 %	0 %	20 %	80 %	46198472
128	NC_005835	GGGGC	2	10	146614	146623	0 %	0 %	80 %	20 %	46198473
129	NC_005835	CGAGG	2	10	147808	147817	20 %	0 %	60 %	20 %	46198474
130	NC_005835	GGCCC	2	10	149711	149720	0 %	0 %	40 %	60 %	46198476
131	NC_005835	GCCCC	2	10	151219	151228	0 %	0 %	20 %	80 %	46198478
132	NC_005835	GGGCG	2	10	153195	153204	0 %	0 %	80 %	20 %	46198480
133	NC_005835	CTCCC	2	10	155190	155199	0 %	20 %	0 %	80 %	46198481
134	NC_005835	CGGGG	2	10	155346	155355	0 %	0 %	80 %	20 %	46198481
135	NC_005835	CTTCC	2	10	157171	157180	0 %	40 %	0 %	60 %	46198482
136	NC_005835	CCCCG	2	10	158290	158299	0 %	0 %	20 %	80 %	46198483
137	NC_005835	GGCCT	2	10	162150	162159	0 %	20 %	40 %	40 %	46198488
138	NC_005835	GAAGG	2	10	162780	162789	40 %	0 %	60 %	0 %	46198489
139	NC_005835	CGCTC	2	10	163493	163502	0 %	20 %	20 %	60 %	46198489
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