MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus thermophilus HB27

Total Repeats: 51419

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_005835	GAG	3	9	127614	127622	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198452
3502	NC_005835	CCT	2	6	127658	127663	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198452
3503	NC_005835	GGA	2	6	127682	127687	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198452
3504	NC_005835	CCT	2	6	127757	127762	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198452
3505	NC_005835	TCC	2	6	127792	127797	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198452
3506	NC_005835	GTG	2	6	127836	127841	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198452
3507	NC_005835	CGCCC	2	10	127861	127870	0 %	0 %	20 %	80 %	46198452
3508	NC_005835	GAC	2	6	127920	127925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46198452
3509	NC_005835	TGG	2	6	127954	127959	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198452
3510	NC_005835	AAC	2	6	128022	128027	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	46198452
3511	NC_005835	CCCGGG	2	12	128068	128079	0 %	0 %	50 %	50 %	46198452
3512	NC_005835	GACG	2	8	128084	128091	25 %	0 %	50 %	25 %	46198452
3513	NC_005835	GCC	2	6	128106	128111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198452
3514	NC_005835	C	6	6	128159	128164	0 %	0 %	0 %	100 %	46198452
3515	NC_005835	GCC	2	6	128199	128204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198452
3516	NC_005835	GGA	2	6	128225	128230	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198452
3517	NC_005835	GGA	2	6	128240	128245	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198452
3518	NC_005835	CCT	2	6	128276	128281	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198452
3519	NC_005835	CCGCC	2	10	128327	128336	0 %	0 %	20 %	80 %	46198452
3520	NC_005835	AAG	2	6	128393	128398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46198453
3521	NC_005835	GGA	2	6	128439	128444	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198453
3522	NC_005835	GGGA	2	8	128506	128513	25 %	0 %	75 %	0 %	46198453
3523	NC_005835	TGG	2	6	128528	128533	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198453
3524	NC_005835	CCT	2	6	128553	128558	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198453
3525	NC_005835	G	6	6	128592	128597	0 %	0 %	100 %	0 %	46198453
3526	NC_005835	CCG	2	6	128625	128630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198453
3527	NC_005835	GTGGGG	2	12	128632	128643	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	46198453
3528	NC_005835	GGA	2	6	128646	128651	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198453
3529	NC_005835	GCCC	2	8	128682	128689	0 %	0 %	25 %	75 %	46198453
3530	NC_005835	CGC	2	6	128733	128738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198453
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3532	NC_005835	G	7	7	128778	128784	0 %	0 %	100 %	0 %	46198453
3533	NC_005835	GTG	2	6	128791	128796	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198453
3534	NC_005835	CCT	2	6	128811	128816	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198453
3535	NC_005835	CTC	2	6	128830	128835	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198453
3536	NC_005835	CTC	2	6	128887	128892	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198453
3537	NC_005835	CCTGCC	2	12	128973	128984	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	46198453
3538	NC_005835	C	7	7	129000	129006	0 %	0 %	0 %	100 %	46198453
3539	NC_005835	C	6	6	129121	129126	0 %	0 %	0 %	100 %	46198454
3540	NC_005835	CCT	2	6	129131	129136	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198454
3541	NC_005835	G	7	7	129143	129149	0 %	0 %	100 %	0 %	46198454
3542	NC_005835	GGT	2	6	129188	129193	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198454
3543	NC_005835	CGG	2	6	129257	129262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198455
3544	NC_005835	TGGG	2	8	129284	129291	0 %	25 %	75 %	0 %	46198455
3545	NC_005835	GAC	2	6	129320	129325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46198455
3546	NC_005835	TGG	4	12	129327	129338	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198455
3547	NC_005835	CTT	2	6	129370	129375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46198455
3548	NC_005835	TGG	2	6	129381	129386	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198455
3549	NC_005835	GACACC	2	12	129422	129433	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	46198455
3550	NC_005835	TCC	2	6	129501	129506	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198455
3551	NC_005835	GAG	2	6	129509	129514	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198455
3552	NC_005835	TTC	2	6	129515	129520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46198455
3553	NC_005835	C	6	6	129520	129525	0 %	0 %	0 %	100 %	46198455
3554	NC_005835	AGG	3	9	129555	129563	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198455
3555	NC_005835	CTA	2	6	129580	129585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46198455
3556	NC_005835	CCG	2	6	129624	129629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198455
3557	NC_005835	GGGC	2	8	129688	129695	0 %	0 %	75 %	25 %	46198455
3558	NC_005835	GGC	2	6	129724	129729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198455
3559	NC_005835	TCC	2	6	129750	129755	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198455
3560	NC_005835	GGA	2	6	129784	129789	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198455
3561	NC_005835	CCAGG	2	10	129796	129805	20 %	0 %	40 %	40 %	46198455
3562	NC_005835	TCC	2	6	129807	129812	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198455
3563	NC_005835	GGA	2	6	129829	129834	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198455
3564	NC_005835	CTT	2	6	129838	129843	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46198455
3565	NC_005835	CGCC	2	8	129859	129866	0 %	0 %	25 %	75 %	46198455
3566	NC_005835	GAG	2	6	129872	129877	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198455
3567	NC_005835	CG	3	6	129892	129897	0 %	0 %	50 %	50 %	46198455
3568	NC_005835	CGCCC	2	10	129940	129949	0 %	0 %	20 %	80 %	46198455
3569	NC_005835	AAG	2	6	129950	129955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46198455
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3572	NC_005835	TGG	2	6	130092	130097	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198455
3573	NC_005835	GGA	2	6	130159	130164	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198455
3574	NC_005835	G	7	7	130172	130178	0 %	0 %	100 %	0 %	46198455
3575	NC_005835	GC	3	6	130217	130222	0 %	0 %	50 %	50 %	46198455
3576	NC_005835	AGGGG	2	10	130288	130297	20 %	0 %	80 %	0 %	46198455
3577	NC_005835	AGGC	2	8	130316	130323	25 %	0 %	50 %	25 %	46198455
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3580	NC_005835	GTG	2	6	130448	130453	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198455
3581	NC_005835	C	6	6	130470	130475	0 %	0 %	0 %	100 %	46198455
3582	NC_005835	GTG	2	6	130490	130495	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198455
3583	NC_005835	CCT	2	6	130501	130506	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198455
3584	NC_005835	AGGA	2	8	130523	130530	50 %	0 %	50 %	0 %	46198455
3585	NC_005835	CAA	2	6	130576	130581	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	46198455
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3589	NC_005835	GTG	2	6	130706	130711	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198455
3590	NC_005835	GTG	2	6	130730	130735	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198455
3591	NC_005835	GCC	2	6	130737	130742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198455
3592	NC_005835	CGC	2	6	130747	130752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198455
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3594	NC_005835	TCC	2	6	130812	130817	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198455
3595	NC_005835	TCC	2	6	130833	130838	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198455
3596	NC_005835	CCT	2	6	130861	130866	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198455
3597	NC_005835	CCA	2	6	130893	130898	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198455
3598	NC_005835	GAG	2	6	130904	130909	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198455
3599	NC_005835	GGA	2	6	130915	130920	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198455
3600	NC_005835	CCG	2	6	130926	130931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198455
3601	NC_005835	TTC	2	6	130949	130954	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46198455
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3603	NC_005835	C	6	6	130983	130988	0 %	0 %	0 %	100 %	46198456
3604	NC_005835	TGG	2	6	131022	131027	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198456
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3607	NC_005835	GAG	2	6	131147	131152	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198456
3608	NC_005835	TCC	2	6	131163	131168	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198456
3609	NC_005835	ACG	2	6	131184	131189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46198456
3610	NC_005835	GCGGG	2	10	131239	131248	0 %	0 %	80 %	20 %	46198456
3611	NC_005835	GTG	2	6	131249	131254	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198456
3612	NC_005835	GAC	2	6	131255	131260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46198456
3613	NC_005835	TCTACC	2	12	131262	131273	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	46198456
3614	NC_005835	TGG	2	6	131298	131303	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198456
3615	NC_005835	CGC	2	6	131308	131313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198456
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3617	NC_005835	AGGCCC	2	12	131421	131432	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	46198456
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3619	NC_005835	CGTGGA	2	12	131446	131457	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	46198456
3620	NC_005835	TC	3	6	131458	131463	0 %	50 %	0 %	50 %	46198456
3621	NC_005835	GAA	2	6	131473	131478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46198456
3622	NC_005835	CCCG	2	8	131489	131496	0 %	0 %	25 %	75 %	46198456
3623	NC_005835	GCCC	2	8	131509	131516	0 %	0 %	25 %	75 %	46198456
3624	NC_005835	GGA	2	6	131542	131547	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198456
3625	NC_005835	GGA	2	6	131572	131577	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198456
3626	NC_005835	TGG	2	6	131601	131606	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198456
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3700	NC_005835	C	7	7	135049	135055	0 %	0 %	0 %	100 %	46198459
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3730	NC_005835	AAGCC	2	10	136254	136263	40 %	0 %	20 %	40 %	46198461
3731	NC_005835	C	6	6	136276	136281	0 %	0 %	0 %	100 %	46198461
3732	NC_005835	GGAA	2	8	136303	136310	50 %	0 %	50 %	0 %	46198461
3733	NC_005835	GAAGCG	2	12	136331	136342	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	46198461
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3738	NC_005835	AGA	2	6	136604	136609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46198462
3739	NC_005835	GCC	2	6	136657	136662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198462
3740	NC_005835	TCC	2	6	136693	136698	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198462
3741	NC_005835	GGC	2	6	136836	136841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198462
3742	NC_005835	TTTGG	2	10	136896	136905	0 %	60 %	40 %	0 %	46198462
3743	NC_005835	G	6	6	136939	136944	0 %	0 %	100 %	0 %	46198462
3744	NC_005835	CCA	3	9	136979	136987	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198462
3745	NC_005835	CTCCCG	2	12	137007	137018	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	46198462
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3747	NC_005835	GGC	2	6	137079	137084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198462
3748	NC_005835	TCC	2	6	137137	137142	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198463
3749	NC_005835	GAGG	2	8	137174	137181	25 %	0 %	75 %	0 %	46198463
3750	NC_005835	GGCC	2	8	137230	137237	0 %	0 %	50 %	50 %	46198463
3751	NC_005835	CCG	2	6	137238	137243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198463
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3753	NC_005835	G	6	6	137317	137322	0 %	0 %	100 %	0 %	46198463
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3818	NC_005835	GAA	2	6	140030	140035	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3823	NC_005835	AGG	2	6	140270	140275	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198465
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3859	NC_005835	GGT	2	6	141444	141449	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198466
3860	NC_005835	GAT	2	6	141513	141518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46198466
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3862	NC_005835	CGG	2	6	141547	141552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198466
3863	NC_005835	CCT	2	6	141557	141562	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198466
3864	NC_005835	GGCG	2	8	141596	141603	0 %	0 %	75 %	25 %	46198466
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3870	NC_005835	G	6	6	141911	141916	0 %	0 %	100 %	0 %	46198467
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