MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus thermophilus HB27

Total Repeats: 51419

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3002	NC_005835	TCG	2	6	107827	107832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46198430
3003	NC_005835	CTT	2	6	107963	107968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46198430
3004	NC_005835	ACC	2	6	108039	108044	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198431
3005	NC_005835	GGA	2	6	108049	108054	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198431
3006	NC_005835	GAA	2	6	108076	108081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46198431
3007	NC_005835	GGA	2	6	108100	108105	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198431
3008	NC_005835	CTT	2	6	108109	108114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46198431
3009	NC_005835	TCC	2	6	108123	108128	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198431
3010	NC_005835	CCCT	2	8	108130	108137	0 %	25 %	0 %	75 %	46198431
3011	NC_005835	GGA	2	6	108139	108144	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198431
3012	NC_005835	TCCTC	2	10	108166	108175	0 %	40 %	0 %	60 %	46198431
3013	NC_005835	CCT	3	9	108256	108264	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198431
3014	NC_005835	C	7	7	108325	108331	0 %	0 %	0 %	100 %	46198431
3015	NC_005835	GCCC	2	8	108380	108387	0 %	0 %	25 %	75 %	46198431
3016	NC_005835	CCT	2	6	108412	108417	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198431
3017	NC_005835	CCT	2	6	108475	108480	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198431
3018	NC_005835	CCGC	2	8	108481	108488	0 %	0 %	25 %	75 %	46198431
3019	NC_005835	TCC	2	6	108516	108521	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198431
3020	NC_005835	AGG	2	6	108531	108536	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198431
3021	NC_005835	GCC	2	6	108600	108605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198431
3022	NC_005835	TCC	2	6	108712	108717	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198431
3023	NC_005835	GGCCC	2	10	108722	108731	0 %	0 %	40 %	60 %	46198431
3024	NC_005835	GGA	2	6	108799	108804	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198431
3025	NC_005835	GGC	2	6	108811	108816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198431
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3027	NC_005835	CTTC	2	8	108994	109001	0 %	50 %	0 %	50 %	46198431
3028	NC_005835	CCAC	2	8	109021	109028	25 %	0 %	0 %	75 %	46198431
3029	NC_005835	CGG	2	6	109038	109043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198431
3030	NC_005835	GGACGT	2	12	109087	109098	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	46198431
3031	NC_005835	AGG	3	9	109127	109135	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198432
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3033	NC_005835	CCT	2	6	109188	109193	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198432
3034	NC_005835	GAA	2	6	109195	109200	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46198432
3035	NC_005835	TCC	2	6	109217	109222	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198432
3036	NC_005835	CCG	2	6	109257	109262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198432
3037	NC_005835	GAG	2	6	109267	109272	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198432
3038	NC_005835	CGG	2	6	109278	109283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198432
3039	NC_005835	CGC	2	6	109284	109289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198432
3040	NC_005835	GCG	2	6	109316	109321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198432
3041	NC_005835	G	6	6	109332	109337	0 %	0 %	100 %	0 %	46198432
3042	NC_005835	GAG	2	6	109360	109365	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198432
3043	NC_005835	CCGC	2	8	109378	109385	0 %	0 %	25 %	75 %	46198432
3044	NC_005835	TCCCC	2	10	109390	109399	0 %	20 %	0 %	80 %	46198432
3045	NC_005835	ACC	2	6	109400	109405	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198432
3046	NC_005835	C	7	7	109419	109425	0 %	0 %	0 %	100 %	46198432
3047	NC_005835	GAG	2	6	109429	109434	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198432
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3049	NC_005835	CCG	2	6	109542	109547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198432
3050	NC_005835	GCC	2	6	109580	109585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198432
3051	NC_005835	GGA	2	6	109587	109592	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198432
3052	NC_005835	AGGCG	2	10	109620	109629	20 %	0 %	60 %	20 %	46198432
3053	NC_005835	GGA	2	6	109689	109694	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198432
3054	NC_005835	GGT	2	6	109756	109761	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198432
3055	NC_005835	GTC	2	6	109801	109806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46198432
3056	NC_005835	GAG	3	9	109822	109830	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198432
3057	NC_005835	TGG	2	6	109848	109853	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198432
3058	NC_005835	GAG	2	6	109855	109860	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198432
3059	NC_005835	C	6	6	109868	109873	0 %	0 %	0 %	100 %	46198432
3060	NC_005835	GAG	2	6	109933	109938	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198432
3061	NC_005835	TCC	2	6	109961	109966	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198432
3062	NC_005835	CAC	2	6	109988	109993	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198432
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3064	NC_005835	GGA	2	6	110052	110057	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198432
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3068	NC_005835	GGCG	2	8	110109	110116	0 %	0 %	75 %	25 %	46198432
3069	NC_005835	GGT	2	6	110163	110168	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198432
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3080	NC_005835	AGA	2	6	110545	110550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46198433
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3091	NC_005835	CCTC	2	8	111288	111295	0 %	25 %	0 %	75 %	46198435
3092	NC_005835	CGT	2	6	111324	111329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46198435
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3096	NC_005835	CCT	4	12	111432	111443	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198435
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3106	NC_005835	GAG	2	6	111790	111795	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198435
3107	NC_005835	G	6	6	111801	111806	0 %	0 %	100 %	0 %	46198435
3108	NC_005835	GGA	2	6	111906	111911	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198435
3109	NC_005835	CGC	2	6	112002	112007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198435
3110	NC_005835	CTT	2	6	112065	112070	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46198435
3111	NC_005835	CCT	2	6	112095	112100	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198435
3112	NC_005835	TCC	2	6	112136	112141	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198435
3113	NC_005835	GGA	2	6	112143	112148	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198435
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3115	NC_005835	TGC	2	6	112256	112261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46198435
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3119	NC_005835	CTC	2	6	112412	112417	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198436
3120	NC_005835	CCG	2	6	112443	112448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198436
3121	NC_005835	CTTC	2	8	112533	112540	0 %	50 %	0 %	50 %	46198436
3122	NC_005835	AAG	2	6	112542	112547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46198436
3123	NC_005835	TCC	2	6	112581	112586	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198436
3124	NC_005835	TCCCCG	2	12	112596	112607	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	46198436
3125	NC_005835	AGG	2	6	112608	112613	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198436
3126	NC_005835	CTT	2	6	112644	112649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46198436
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3128	NC_005835	G	7	7	112682	112688	0 %	0 %	100 %	0 %	46198436
3129	NC_005835	GAG	2	6	112703	112708	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198436
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3131	NC_005835	CCT	2	6	112750	112755	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198436
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3134	NC_005835	CCA	2	6	112855	112860	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198436
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3138	NC_005835	CCCTC	2	10	112921	112930	0 %	20 %	0 %	80 %	46198436
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3142	NC_005835	CCT	2	6	113089	113094	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198436
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3157	NC_005835	GAG	2	6	113868	113873	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198437
3158	NC_005835	CCA	2	6	113879	113884	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198437
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3167	NC_005835	GCTG	2	8	114284	114291	0 %	25 %	50 %	25 %	46198437
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3182	NC_005835	G	7	7	114716	114722	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3183	NC_005835	CCA	2	6	114776	114781	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198438
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3199	NC_005835	CTG	2	6	115299	115304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46198438
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3216	NC_005835	GGA	2	6	116141	116146	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198438
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3225	NC_005835	GGCGG	2	10	116339	116348	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
3226	NC_005835	AAG	2	6	116356	116361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46198439
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3232	NC_005835	C	6	6	116823	116828	0 %	0 %	0 %	100 %	46198439
3233	NC_005835	C	6	6	116904	116909	0 %	0 %	0 %	100 %	46198439
3234	NC_005835	CCT	2	6	116932	116937	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198439
3235	NC_005835	GCGG	2	8	116958	116965	0 %	0 %	75 %	25 %	46198439
3236	NC_005835	GAG	2	6	116984	116989	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198439
3237	NC_005835	GTGCG	2	10	117002	117011	0 %	20 %	60 %	20 %	46198439
3238	NC_005835	GCC	2	6	117014	117019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198439
3239	NC_005835	GTG	2	6	117044	117049	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198439
3240	NC_005835	GCC	2	6	117050	117055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198439
3241	NC_005835	CTCTCC	2	12	117056	117067	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198439
3242	NC_005835	GCC	2	6	117078	117083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198439
3243	NC_005835	GGA	2	6	117091	117096	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198439
3244	NC_005835	C	6	6	117111	117116	0 %	0 %	0 %	100 %	46198439
3245	NC_005835	GTG	2	6	117119	117124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198439
3246	NC_005835	GGC	2	6	117127	117132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198439
3247	NC_005835	GAG	2	6	117202	117207	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3248	NC_005835	GGT	2	6	117226	117231	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198440
3249	NC_005835	GGC	2	6	117265	117270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198440
3250	NC_005835	CCG	2	6	117397	117402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198440
3251	NC_005835	GGA	2	6	117439	117444	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198440
3252	NC_005835	CCCG	2	8	117562	117569	0 %	0 %	25 %	75 %	46198440
3253	NC_005835	GGC	2	6	117622	117627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198440
3254	NC_005835	CCG	2	6	117754	117759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198440
3255	NC_005835	GGA	2	6	117796	117801	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198440
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3259	NC_005835	TC	3	6	117999	118004	0 %	50 %	0 %	50 %	46198441
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3372	NC_005835	TCC	2	6	122549	122554	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198445
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3384	NC_005835	CCT	2	6	123014	123019	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198446
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3497	NC_005835	GGT	4	12	127529	127540	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198452
3498	NC_005835	CGGGG	2	10	127544	127553	0 %	0 %	80 %	20 %	46198452
3499	NC_005835	G	6	6	127557	127562	0 %	0 %	100 %	0 %	46198452
3500	NC_005835	TGG	2	6	127582	127587	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198452

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