MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus thermophilus HB27

Total Repeats: 51419

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2502	NC_005835	GCC	2	6	89273	89278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198408
2503	NC_005835	CCT	3	9	89346	89354	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198408
2504	NC_005835	G	6	6	89356	89361	0 %	0 %	100 %	0 %	46198408
2505	NC_005835	GGC	2	6	89381	89386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198408
2506	NC_005835	CCCTTC	2	12	89399	89410	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198408
2507	NC_005835	GGCGGG	2	12	89417	89428	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	46198408
2508	NC_005835	GCG	2	6	89473	89478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198408
2509	NC_005835	CTT	2	6	89526	89531	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46198408
2510	NC_005835	GGCCCT	2	12	89535	89546	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	46198408
2511	NC_005835	GCC	2	6	89551	89556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198408
2512	NC_005835	GTGGAC	2	12	89608	89619	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	46198408
2513	NC_005835	TCA	2	6	89624	89629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46198408
2514	NC_005835	CGC	2	6	89649	89654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198408
2515	NC_005835	TCC	2	6	89669	89674	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198408
2516	NC_005835	TGG	3	9	89732	89740	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198408
2517	NC_005835	GTG	2	6	89779	89784	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198408
2518	NC_005835	G	6	6	89786	89791	0 %	0 %	100 %	0 %	46198408
2519	NC_005835	GGC	2	6	89826	89831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198408
2520	NC_005835	TCC	2	6	89876	89881	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198408
2521	NC_005835	TCCT	2	8	89956	89963	0 %	50 %	0 %	50 %	46198408
2522	NC_005835	CCT	3	9	90000	90008	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198408
2523	NC_005835	GGC	2	6	90012	90017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198408
2524	NC_005835	GCA	2	6	90018	90023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46198408
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2530	NC_005835	GGA	2	6	90218	90223	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2534	NC_005835	CGC	2	6	90414	90419	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198409
2535	NC_005835	GTGG	2	8	90431	90438	0 %	25 %	75 %	0 %	46198409
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2559	NC_005835	GTGC	2	8	91210	91217	0 %	25 %	50 %	25 %	46198409
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2585	NC_005835	ACCG	2	8	92433	92440	25 %	0 %	25 %	50 %	46198411
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2596	NC_005835	GGAGG	2	10	92798	92807	20 %	0 %	80 %	0 %	46198411
2597	NC_005835	GCGG	2	8	92816	92823	0 %	0 %	75 %	25 %	46198411
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2600	NC_005835	C	6	6	92898	92903	0 %	0 %	0 %	100 %	46198411
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2606	NC_005835	GAGG	2	8	93052	93059	25 %	0 %	75 %	0 %	46198412
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2610	NC_005835	G	7	7	93208	93214	0 %	0 %	100 %	0 %	46198412
2611	NC_005835	CCA	2	6	93280	93285	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198412
2612	NC_005835	CGGGC	2	10	93356	93365	0 %	0 %	60 %	40 %	46198412
2613	NC_005835	CCA	2	6	93394	93399	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198412
2614	NC_005835	GAG	2	6	93428	93433	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198412
2615	NC_005835	CCTTA	2	10	93442	93451	20 %	40 %	0 %	40 %	46198412
2616	NC_005835	G	6	6	93513	93518	0 %	0 %	100 %	0 %	46198412
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2621	NC_005835	GGACG	2	10	93796	93805	20 %	0 %	60 %	20 %	46198412
2622	NC_005835	CTC	2	6	93821	93826	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198412
2623	NC_005835	ACC	2	6	93828	93833	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198412
2624	NC_005835	GAG	2	6	93965	93970	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198412
2625	NC_005835	C	6	6	94020	94025	0 %	0 %	0 %	100 %	46198412
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2883	NC_005835	CCT	2	6	103220	103225	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198423
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2987	NC_005835	GAG	2	6	107101	107106	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198429
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2993	NC_005835	GGCGCA	2	12	107310	107321	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	46198429
2994	NC_005835	CCGG	2	8	107482	107489	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2995	NC_005835	GGT	2	6	107555	107560	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2996	NC_005835	CCA	2	6	107577	107582	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2997	NC_005835	CTC	2	6	107667	107672	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198430
2998	NC_005835	AGG	2	6	107719	107724	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198430
2999	NC_005835	CAC	2	6	107774	107779	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198430
3000	NC_005835	CAT	2	6	107780	107785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46198430

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