MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus thermophilus HB27

Total Repeats: 51419

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_005835	CCT	2	6	34906	34911	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198345
1003	NC_005835	GAG	2	6	34919	34924	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198345
1004	NC_005835	CTC	3	9	34970	34978	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198345
1005	NC_005835	CCA	2	6	35047	35052	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198345
1006	NC_005835	CCT	2	6	35062	35067	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198345
1007	NC_005835	C	6	6	35144	35149	0 %	0 %	0 %	100 %	46198345
1008	NC_005835	GAG	2	6	35150	35155	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198345
1009	NC_005835	CAC	2	6	35189	35194	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198345
1010	NC_005835	CGC	2	6	35207	35212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198345
1011	NC_005835	GCC	3	9	35452	35460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198346
1012	NC_005835	GGA	2	6	35466	35471	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198346
1013	NC_005835	GGC	2	6	35530	35535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198346
1014	NC_005835	TGA	2	6	35562	35567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46198346
1015	NC_005835	CCT	2	6	35568	35573	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198346
1016	NC_005835	CCT	2	6	35667	35672	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198346
1017	NC_005835	GAG	2	6	35689	35694	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198346
1018	NC_005835	CTC	2	6	35725	35730	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198346
1019	NC_005835	GTA	2	6	35737	35742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46198346
1020	NC_005835	TGA	2	6	35787	35792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46198346
1021	NC_005835	GGCCG	2	10	35793	35802	0 %	0 %	60 %	40 %	46198346
1022	NC_005835	GGT	2	6	35803	35808	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198346
1023	NC_005835	CGC	2	6	35854	35859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198346
1024	NC_005835	TCC	2	6	35894	35899	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198346
1025	NC_005835	CTC	2	6	35917	35922	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198346
1026	NC_005835	GGC	2	6	35928	35933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198346
1027	NC_005835	TCC	2	6	35972	35977	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198346
1028	NC_005835	GGC	2	6	35995	36000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198346
1029	NC_005835	GGT	2	6	36082	36087	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198346
1030	NC_005835	G	6	6	36101	36106	0 %	0 %	100 %	0 %	46198346
1031	NC_005835	AGG	3	9	36113	36121	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198346
1032	NC_005835	GCC	2	6	36149	36154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198346
1033	NC_005835	GTC	2	6	36232	36237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46198346
1034	NC_005835	CTC	2	6	36242	36247	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198346
1035	NC_005835	GCG	2	6	36268	36273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198346
1036	NC_005835	GGC	2	6	36358	36363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198347
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1038	NC_005835	TGG	2	6	36402	36407	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198347
1039	NC_005835	GGA	2	6	36442	36447	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198347
1040	NC_005835	CCA	2	6	36454	36459	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198347
1041	NC_005835	GCC	2	6	36467	36472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198347
1042	NC_005835	G	6	6	36477	36482	0 %	0 %	100 %	0 %	46198347
1043	NC_005835	CTC	2	6	36545	36550	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198347
1044	NC_005835	CCT	2	6	36562	36567	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198347
1045	NC_005835	AGG	2	6	36570	36575	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198347
1046	NC_005835	G	8	8	36574	36581	0 %	0 %	100 %	0 %	46198347
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1051	NC_005835	GGC	2	6	36701	36706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198347
1052	NC_005835	GGA	2	6	36730	36735	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198347
1053	NC_005835	GCCTTG	2	12	36758	36769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46198347
1054	NC_005835	GAG	2	6	36770	36775	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198347
1055	NC_005835	GCCC	2	8	36808	36815	0 %	0 %	25 %	75 %	46198347
1056	NC_005835	AGG	2	6	36825	36830	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198347
1057	NC_005835	GGGCC	2	10	36867	36876	0 %	0 %	60 %	40 %	46198347
1058	NC_005835	ACG	2	6	36906	36911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46198347
1059	NC_005835	TGG	2	6	36912	36917	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198347
1060	NC_005835	AGG	2	6	36981	36986	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198347
1061	NC_005835	AGG	2	6	37005	37010	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198347
1062	NC_005835	GAG	2	6	37034	37039	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198347
1063	NC_005835	GTG	2	6	37099	37104	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_005835	CGGG	2	8	37194	37201	0 %	0 %	75 %	25 %	46198348
1065	NC_005835	GGT	2	6	37218	37223	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198348
1066	NC_005835	GAG	2	6	37252	37257	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198348
1067	NC_005835	GGA	2	6	37275	37280	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198348
1068	NC_005835	TCC	2	6	37292	37297	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198348
1069	NC_005835	ACGAGG	2	12	37325	37336	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	46198348
1070	NC_005835	CCT	2	6	37365	37370	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198348
1071	NC_005835	ACCC	2	8	37372	37379	25 %	0 %	0 %	75 %	46198348
1072	NC_005835	GGT	2	6	37404	37409	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198348
1073	NC_005835	CCT	3	9	37413	37421	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198348
1074	NC_005835	CTA	2	6	37428	37433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46198348
1075	NC_005835	GCG	2	6	37505	37510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198348
1076	NC_005835	TGG	3	9	37514	37522	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198348
1077	NC_005835	G	7	7	37531	37537	0 %	0 %	100 %	0 %	46198348
1078	NC_005835	TGA	2	6	37577	37582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46198348
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1080	NC_005835	TGG	2	6	37745	37750	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198348
1081	NC_005835	CACC	2	8	37773	37780	25 %	0 %	0 %	75 %	46198348
1082	NC_005835	GGC	3	9	37950	37958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198348
1083	NC_005835	G	7	7	37971	37977	0 %	0 %	100 %	0 %	46198348
1084	NC_005835	GGA	2	6	37986	37991	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198348
1085	NC_005835	GGT	2	6	37992	37997	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198348
1086	NC_005835	G	7	7	38058	38064	0 %	0 %	100 %	0 %	46198349
1087	NC_005835	CCTC	2	8	38122	38129	0 %	25 %	0 %	75 %	46198349
1088	NC_005835	TGG	2	6	38149	38154	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198349
1089	NC_005835	CCT	2	6	38276	38281	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198349
1090	NC_005835	CGG	2	6	38288	38293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198349
1091	NC_005835	GTG	2	6	38307	38312	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198349
1092	NC_005835	CGTGGC	2	12	38318	38329	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	46198349
1093	NC_005835	CAT	2	6	38420	38425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46198349
1094	NC_005835	GGGGC	2	10	38462	38471	0 %	0 %	80 %	20 %	46198349
1095	NC_005835	CAT	2	6	38504	38509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46198349
1096	NC_005835	G	6	6	38550	38555	0 %	0 %	100 %	0 %	46198349
1097	NC_005835	CCCA	2	8	38565	38572	25 %	0 %	0 %	75 %	46198349
1098	NC_005835	AGC	2	6	38575	38580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46198349
1099	NC_005835	GCC	2	6	38590	38595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198349
1100	NC_005835	AGG	2	6	38602	38607	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198349
1101	NC_005835	CTT	2	6	38618	38623	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46198349
1102	NC_005835	GAC	2	6	38637	38642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46198349
1103	NC_005835	ACC	2	6	38665	38670	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198349
1104	NC_005835	CCGGGA	2	12	38752	38763	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	46198349
1105	NC_005835	CGC	2	6	38774	38779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198349
1106	NC_005835	GAG	2	6	38792	38797	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198349
1107	NC_005835	TGGA	2	8	38887	38894	25 %	25 %	50 %	0 %	46198349
1108	NC_005835	TGGA	2	8	38915	38922	25 %	25 %	50 %	0 %	46198349
1109	NC_005835	GGA	2	6	39022	39027	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_005835	GAC	2	6	39227	39232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1111	NC_005835	GGT	2	6	39274	39279	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_005835	TGG	2	6	39292	39297	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198350
1113	NC_005835	CGC	2	6	39398	39403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198350
1114	NC_005835	GAG	2	6	39504	39509	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198350
1115	NC_005835	TGG	2	6	39544	39549	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198350
1116	NC_005835	GA	3	6	39563	39568	50 %	0 %	50 %	0 %	46198350
1117	NC_005835	CTC	2	6	39573	39578	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198350
1118	NC_005835	GCCC	2	8	39610	39617	0 %	0 %	25 %	75 %	46198351
1119	NC_005835	GCC	2	6	39620	39625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198351
1120	NC_005835	GAA	2	6	39702	39707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46198351
1121	NC_005835	CGG	2	6	39764	39769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198351
1122	NC_005835	TCCA	2	8	39787	39794	25 %	25 %	0 %	50 %	46198351
1123	NC_005835	CCT	2	6	39830	39835	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198351
1124	NC_005835	CCT	2	6	39923	39928	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198351
1125	NC_005835	GA	3	6	40054	40059	50 %	0 %	50 %	0 %	46198351
1126	NC_005835	GC	3	6	40134	40139	0 %	0 %	50 %	50 %	46198351
1127	NC_005835	CGT	2	6	40166	40171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46198351
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1129	NC_005835	CGGG	2	8	40222	40229	0 %	0 %	75 %	25 %	46198351
1130	NC_005835	C	6	6	40243	40248	0 %	0 %	0 %	100 %	46198351
1131	NC_005835	CTC	2	6	40335	40340	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198351
1132	NC_005835	CGG	2	6	40343	40348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198351
1133	NC_005835	CAG	2	6	40416	40421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46198351
1134	NC_005835	CTG	2	6	40470	40475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46198351
1135	NC_005835	GGT	2	6	40482	40487	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198351
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1137	NC_005835	G	6	6	40541	40546	0 %	0 %	100 %	0 %	46198351
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1140	NC_005835	CCT	3	9	40622	40630	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198351
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1142	NC_005835	TGG	2	6	40712	40717	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198351
1143	NC_005835	CTTCC	2	10	40793	40802	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
1144	NC_005835	CCG	2	6	40805	40810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1145	NC_005835	G	6	6	40856	40861	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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1253	NC_005835	CGG	2	6	44876	44881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198356
1254	NC_005835	CCT	2	6	44909	44914	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198356
1255	NC_005835	G	6	6	45024	45029	0 %	0 %	100 %	0 %	46198356
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1257	NC_005835	GGC	2	6	45060	45065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198356
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1498	NC_005835	GGA	2	6	53458	53463	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198367
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1500	NC_005835	GAG	2	6	53568	53573	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198368

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