MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus thermophilus HB27

Total Repeats: 51419

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_005835	CCT	3	9	17674	17682	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198327
502	NC_005835	GCC	2	6	17690	17695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198327
503	NC_005835	TCA	2	6	17697	17702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46198327
504	NC_005835	CTC	2	6	17747	17752	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198327
505	NC_005835	TGG	2	6	17775	17780	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198327
506	NC_005835	AGG	2	6	17808	17813	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198327
507	NC_005835	GGGC	3	12	17830	17841	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
508	NC_005835	CCT	2	6	17917	17922	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198328
509	NC_005835	GCC	2	6	17955	17960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198328
510	NC_005835	CCG	2	6	18027	18032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198328
511	NC_005835	CGA	2	6	18052	18057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46198328
512	NC_005835	GAG	2	6	18107	18112	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198328
513	NC_005835	AGA	2	6	18123	18128	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46198328
514	NC_005835	A	6	6	18143	18148	100 %	0 %	0 %	0 %	46198328
515	NC_005835	CTC	2	6	18206	18211	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198328
516	NC_005835	GAG	2	6	18239	18244	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198328
517	NC_005835	GGC	2	6	18271	18276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198328
518	NC_005835	G	6	6	18279	18284	0 %	0 %	100 %	0 %	46198328
519	NC_005835	GGGGC	2	10	18297	18306	0 %	0 %	80 %	20 %	46198328
520	NC_005835	GGC	2	6	18376	18381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198328
521	NC_005835	GGT	2	6	18436	18441	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198328
522	NC_005835	TCC	2	6	18459	18464	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198328
523	NC_005835	CTC	2	6	18497	18502	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198328
524	NC_005835	AGG	2	6	18504	18509	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198328
525	NC_005835	CCA	2	6	18555	18560	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198328
526	NC_005835	GGA	2	6	18562	18567	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198328
527	NC_005835	CGC	2	6	18577	18582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198328
528	NC_005835	CCG	2	6	18678	18683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198328
529	NC_005835	CGC	2	6	18736	18741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198328
530	NC_005835	C	6	6	18762	18767	0 %	0 %	0 %	100 %	46198328
531	NC_005835	CGC	2	6	18775	18780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198328
532	NC_005835	ACCCCA	2	12	18819	18830	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198328
533	NC_005835	CAG	3	9	18851	18859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46198328
534	NC_005835	CCT	2	6	18904	18909	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198328
535	NC_005835	CCT	2	6	19002	19007	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198329
536	NC_005835	G	7	7	19023	19029	0 %	0 %	100 %	0 %	46198329
537	NC_005835	G	6	6	19167	19172	0 %	0 %	100 %	0 %	46198329
538	NC_005835	AGG	2	6	19178	19183	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198329
539	NC_005835	GAG	2	6	19237	19242	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198329
540	NC_005835	GCC	2	6	19256	19261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198329
541	NC_005835	GGT	2	6	19305	19310	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198329
542	NC_005835	G	6	6	19319	19324	0 %	0 %	100 %	0 %	46198329
543	NC_005835	G	6	6	19345	19350	0 %	0 %	100 %	0 %	46198329
544	NC_005835	CG	3	6	19371	19376	0 %	0 %	50 %	50 %	46198329
545	NC_005835	GAG	2	6	19384	19389	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198329
546	NC_005835	GTGGAG	2	12	19408	19419	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	46198329
547	NC_005835	GTG	2	6	19420	19425	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198329
548	NC_005835	CCT	2	6	19476	19481	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198329
549	NC_005835	CCG	3	9	19499	19507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198329
550	NC_005835	CGC	2	6	19530	19535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198329
551	NC_005835	AGG	2	6	19547	19552	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198329
552	NC_005835	CCG	2	6	19562	19567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198329
553	NC_005835	CGC	2	6	19587	19592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198329
554	NC_005835	GGA	2	6	19632	19637	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198329
555	NC_005835	GAGG	2	8	19697	19704	25 %	0 %	75 %	0 %	46198330
556	NC_005835	GAG	2	6	19707	19712	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198330
557	NC_005835	GGC	2	6	19733	19738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198330
558	NC_005835	GCCC	2	8	19771	19778	0 %	0 %	25 %	75 %	46198330
559	NC_005835	GGA	2	6	19793	19798	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198330
560	NC_005835	AGG	3	9	19807	19815	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198330
561	NC_005835	GGAGCT	2	12	19823	19834	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	46198330
562	NC_005835	TGG	2	6	19911	19916	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198331
563	NC_005835	TGG	2	6	19938	19943	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198331
564	NC_005835	TCC	3	9	19974	19982	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198331
565	NC_005835	CGG	2	6	20002	20007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198331
566	NC_005835	G	6	6	20027	20032	0 %	0 %	100 %	0 %	46198331
567	NC_005835	TGG	2	6	20040	20045	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198331
568	NC_005835	GCG	2	6	20114	20119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198331
569	NC_005835	GAG	2	6	20132	20137	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198331
570	NC_005835	CCT	2	6	20208	20213	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198331
571	NC_005835	CTT	2	6	20224	20229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46198331
572	NC_005835	GGT	2	6	20233	20238	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198331
573	NC_005835	GCGGG	2	10	20251	20260	0 %	0 %	80 %	20 %	46198331
574	NC_005835	TCC	3	9	20385	20393	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198331
575	NC_005835	GGA	2	6	20404	20409	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198331
576	NC_005835	TGG	2	6	20415	20420	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198331
577	NC_005835	G	6	6	20422	20427	0 %	0 %	100 %	0 %	46198331
578	NC_005835	GGT	2	6	20449	20454	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198331
579	NC_005835	GGA	3	9	20458	20466	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198331
580	NC_005835	G	6	6	20478	20483	0 %	0 %	100 %	0 %	46198331
581	NC_005835	G	6	6	20506	20511	0 %	0 %	100 %	0 %	46198331
582	NC_005835	CTT	2	6	20518	20523	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46198331
583	NC_005835	GGT	2	6	20533	20538	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198331
584	NC_005835	G	7	7	20548	20554	0 %	0 %	100 %	0 %	46198331
585	NC_005835	ACCTGG	2	12	20565	20576	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	46198331
586	NC_005835	GCG	2	6	20578	20583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198331
587	NC_005835	CG	3	6	20593	20598	0 %	0 %	50 %	50 %	46198331
588	NC_005835	GCGG	2	8	20674	20681	0 %	0 %	75 %	25 %	46198331
589	NC_005835	TCC	2	6	20772	20777	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198331
590	NC_005835	C	6	6	20787	20792	0 %	0 %	0 %	100 %	46198331
591	NC_005835	GAA	2	6	20923	20928	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46198331
592	NC_005835	GTG	2	6	20990	20995	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198331
593	NC_005835	CCT	2	6	21004	21009	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198331
594	NC_005835	CTT	2	6	21034	21039	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46198331
595	NC_005835	CTC	2	6	21167	21172	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198331
596	NC_005835	CCG	2	6	21217	21222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198331
597	NC_005835	TGG	2	6	21288	21293	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198331
598	NC_005835	G	6	6	21328	21333	0 %	0 %	100 %	0 %	46198331
599	NC_005835	AAGGG	2	10	21350	21359	40 %	0 %	60 %	0 %	46198331
600	NC_005835	CGC	2	6	21397	21402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198331
601	NC_005835	GGC	2	6	21409	21414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198331
602	NC_005835	GGGGC	2	10	21423	21432	0 %	0 %	80 %	20 %	46198331
603	NC_005835	G	7	7	21469	21475	0 %	0 %	100 %	0 %	46198331
604	NC_005835	GGC	2	6	21496	21501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198331
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608	NC_005835	GTG	2	6	21612	21617	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198332
609	NC_005835	CCA	2	6	21635	21640	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198332
610	NC_005835	G	6	6	21664	21669	0 %	0 %	100 %	0 %	46198332
611	NC_005835	CTC	2	6	21681	21686	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198332
612	NC_005835	CTC	2	6	21690	21695	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198332
613	NC_005835	C	6	6	21697	21702	0 %	0 %	0 %	100 %	46198332
614	NC_005835	CCA	2	6	21755	21760	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198332
615	NC_005835	AGG	2	6	21787	21792	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198332
616	NC_005835	CGG	2	6	21854	21859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198332
617	NC_005835	TCC	2	6	21874	21879	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198332
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620	NC_005835	CCT	2	6	21952	21957	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198333
621	NC_005835	TGG	2	6	21974	21979	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198333
622	NC_005835	CTC	2	6	22055	22060	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198333
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625	NC_005835	TCC	2	6	22104	22109	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198333
626	NC_005835	CGC	2	6	22111	22116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198333
627	NC_005835	GTG	2	6	22127	22132	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198333
628	NC_005835	CGGG	2	8	22159	22166	0 %	0 %	75 %	25 %	46198333
629	NC_005835	CGC	2	6	22269	22274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198334
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631	NC_005835	GCCC	2	8	22476	22483	0 %	0 %	25 %	75 %	46198334
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