MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus thermophilus HB27

Total Repeats: 51419

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5002	NC_005835	GAG	2	6	182894	182899	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198508
5003	NC_005835	GGC	2	6	182907	182912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198508
5004	NC_005835	GGAG	2	8	182952	182959	25 %	0 %	75 %	0 %	46198508
5005	NC_005835	ACC	2	6	182999	183004	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198508
5006	NC_005835	GCC	2	6	183029	183034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198508
5007	NC_005835	AGG	2	6	183156	183161	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198508
5008	NC_005835	TGG	2	6	183174	183179	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198508
5009	NC_005835	GGC	2	6	183229	183234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198508
5010	NC_005835	AGGG	2	8	183239	183246	25 %	0 %	75 %	0 %	46198508
5011	NC_005835	GCCCTC	2	12	183251	183262	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	46198508
5012	NC_005835	GCGG	2	8	183295	183302	0 %	0 %	75 %	25 %	46198508
5013	NC_005835	CCG	2	6	183342	183347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198508
5014	NC_005835	GGAGGG	2	12	183367	183378	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	46198508
5015	NC_005835	AGGGG	2	10	183406	183415	20 %	0 %	80 %	0 %	46198508
5016	NC_005835	GAGGCC	2	12	183419	183430	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	46198508
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5018	NC_005835	CTACCG	2	12	183595	183606	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	46198508
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5020	NC_005835	GCGGAG	2	12	183644	183655	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	46198508
5021	NC_005835	G	6	6	183676	183681	0 %	0 %	100 %	0 %	46198508
5022	NC_005835	G	6	6	183747	183752	0 %	0 %	100 %	0 %	46198508
5023	NC_005835	AGG	2	6	183795	183800	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198508
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5027	NC_005835	AGGGG	2	10	184042	184051	20 %	0 %	80 %	0 %	46198508
5028	NC_005835	G	6	6	184148	184153	0 %	0 %	100 %	0 %	46198508
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5031	NC_005835	CGGGG	2	10	184257	184266	0 %	0 %	80 %	20 %	46198508
5032	NC_005835	CCTGGA	2	12	184273	184284	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	46198508
5033	NC_005835	TGG	2	6	184302	184307	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198508
5034	NC_005835	GGC	2	6	184308	184313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198508
5035	NC_005835	CGCCT	2	10	184331	184340	0 %	20 %	20 %	60 %	46198508
5036	NC_005835	CG	3	6	184382	184387	0 %	0 %	50 %	50 %	46198508
5037	NC_005835	G	6	6	184500	184505	0 %	0 %	100 %	0 %	46198508
5038	NC_005835	G	6	6	184590	184595	0 %	0 %	100 %	0 %	46198508
5039	NC_005835	TCGGGG	2	12	184601	184612	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	46198508
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5042	NC_005835	GTGG	2	8	184753	184760	0 %	25 %	75 %	0 %	46198508
5043	NC_005835	CCT	2	6	184819	184824	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198508
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5047	NC_005835	CGCCT	2	10	184952	184961	0 %	20 %	20 %	60 %	46198508
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5050	NC_005835	GGAGG	2	10	185077	185086	20 %	0 %	80 %	0 %	46198508
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5055	NC_005835	CCT	2	6	185278	185283	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198508
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5057	NC_005835	CGG	2	6	185337	185342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198508
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5059	NC_005835	GGC	2	6	185447	185452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198508
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5096	NC_005835	GAG	2	6	186623	186628	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198508
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5110	NC_005835	TCC	3	9	187376	187384	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198508
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5253	NC_005835	CCCTG	2	10	192481	192490	0 %	20 %	20 %	60 %	46198514
5254	NC_005835	GTG	2	6	192527	192532	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198514
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5376	NC_005835	CGCGCC	2	12	196711	196722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198517
5377	NC_005835	TCC	2	6	196723	196728	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198517
5378	NC_005835	GCGAGG	2	12	196792	196803	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	46198517
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5380	NC_005835	GAG	2	6	196812	196817	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198517
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5413	NC_005835	GCCC	2	8	198258	198265	0 %	0 %	25 %	75 %	46198519
5414	NC_005835	GAG	2	6	198289	198294	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198519
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5451	NC_005835	GAA	2	6	199827	199832	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46198521
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5453	NC_005835	AGG	2	6	199979	199984	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198521
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5459	NC_005835	CTA	2	6	200253	200258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46198521
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5462	NC_005835	GGA	2	6	200373	200378	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198521
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5469	NC_005835	G	6	6	200554	200559	0 %	0 %	100 %	0 %	46198521
5470	NC_005835	GCC	2	6	200635	200640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198521
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5474	NC_005835	TCC	2	6	200688	200693	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198522
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5479	NC_005835	TGGGCC	2	12	200850	200861	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	46198522
5480	NC_005835	CCA	2	6	200872	200877	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198522
5481	NC_005835	GCC	2	6	200904	200909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198522
5482	NC_005835	C	8	8	200920	200927	0 %	0 %	0 %	100 %	46198522
5483	NC_005835	TGGGG	2	10	200932	200941	0 %	20 %	80 %	0 %	46198522
5484	NC_005835	CCT	2	6	200953	200958	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198522
5485	NC_005835	CCA	3	9	200989	200997	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198522
5486	NC_005835	C	6	6	201040	201045	0 %	0 %	0 %	100 %	46198522
5487	NC_005835	AGG	2	6	201051	201056	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198522
5488	NC_005835	GAG	2	6	201062	201067	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198522
5489	NC_005835	GGC	2	6	201086	201091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198522
5490	NC_005835	TGG	2	6	201136	201141	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198522
5491	NC_005835	GAA	2	6	201187	201192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46198522
5492	NC_005835	CG	3	6	201215	201220	0 %	0 %	50 %	50 %	46198522
5493	NC_005835	AAGG	2	8	201315	201322	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5494	NC_005835	CTT	2	6	201395	201400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46198523
5495	NC_005835	CGC	2	6	201407	201412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198523
5496	NC_005835	CAGGGG	2	12	201420	201431	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	46198523
5497	NC_005835	GAC	2	6	201435	201440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46198523
5498	NC_005835	GC	3	6	201484	201489	0 %	0 %	50 %	50 %	46198523
5499	NC_005835	G	6	6	201499	201504	0 %	0 %	100 %	0 %	46198523
5500	NC_005835	TCC	2	6	201523	201528	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198523

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