MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Tropheryma whipplei str. Twist

Total Repeats: 2416

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004572	CA	3	6	337	342	50 %	0 %	0 %	50 %	28492968
2	NC_004572	AC	3	6	374	379	50 %	0 %	0 %	50 %	28492968
3	NC_004572	TA	3	6	540	545	50 %	50 %	0 %	0 %	28492968
4	NC_004572	AC	3	6	568	573	50 %	0 %	0 %	50 %	28492968
5	NC_004572	GT	3	6	904	909	0 %	50 %	50 %	0 %	28492968
6	NC_004572	AT	3	6	1002	1007	50 %	50 %	0 %	0 %	28492968
7	NC_004572	AT	3	6	1238	1243	50 %	50 %	0 %	0 %	28492968
8	NC_004572	AT	3	6	1400	1405	50 %	50 %	0 %	0 %	28492968
9	NC_004572	GA	4	8	2598	2605	50 %	0 %	50 %	0 %	28492969
10	NC_004572	CT	3	6	3381	3386	0 %	50 %	0 %	50 %	28492970
11	NC_004572	GA	3	6	3609	3614	50 %	0 %	50 %	0 %	28492970
12	NC_004572	TG	3	6	4008	4013	0 %	50 %	50 %	0 %	28492971
13	NC_004572	AC	3	6	4492	4497	50 %	0 %	0 %	50 %	28492972
14	NC_004572	AT	4	8	5305	5312	50 %	50 %	0 %	0 %	28492972
15	NC_004572	AC	3	6	5349	5354	50 %	0 %	0 %	50 %	28492972
16	NC_004572	GC	3	6	5669	5674	0 %	0 %	50 %	50 %	28492972
17	NC_004572	AG	3	6	5676	5681	50 %	0 %	50 %	0 %	28492972
18	NC_004572	AG	3	6	6074	6079	50 %	0 %	50 %	0 %	28492972
19	NC_004572	AG	3	6	6261	6266	50 %	0 %	50 %	0 %	28492972
20	NC_004572	AT	3	6	6427	6432	50 %	50 %	0 %	0 %	28492972
21	NC_004572	CT	3	6	7271	7276	0 %	50 %	0 %	50 %	28492973
22	NC_004572	GC	4	8	7565	7572	0 %	0 %	50 %	50 %	28492973
23	NC_004572	TA	3	6	7983	7988	50 %	50 %	0 %	0 %	28492973
24	NC_004572	CA	3	6	8098	8103	50 %	0 %	0 %	50 %	28492973
25	NC_004572	TA	3	6	8574	8579	50 %	50 %	0 %	0 %	28492973
26	NC_004572	GC	3	6	10201	10206	0 %	0 %	50 %	50 %	28492975
27	NC_004572	AT	3	6	10303	10308	50 %	50 %	0 %	0 %	28492975
28	NC_004572	CT	3	6	10699	10704	0 %	50 %	0 %	50 %	28492976
29	NC_004572	CA	3	6	11254	11259	50 %	0 %	0 %	50 %	28492977
30	NC_004572	GC	3	6	11364	11369	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NC_004572	AT	3	6	11387	11392	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_004572	GT	3	6	12904	12909	0 %	50 %	50 %	0 %	28492980
33	NC_004572	GC	3	6	13812	13817	0 %	0 %	50 %	50 %	28492981
34	NC_004572	TC	3	6	14602	14607	0 %	50 %	0 %	50 %	28492982
35	NC_004572	CT	3	6	15257	15262	0 %	50 %	0 %	50 %	28492982
36	NC_004572	GT	3	6	15293	15298	0 %	50 %	50 %	0 %	28492982
37	NC_004572	GA	3	6	15696	15701	50 %	0 %	50 %	0 %	28492983
38	NC_004572	TA	3	6	15787	15792	50 %	50 %	0 %	0 %	28492983
39	NC_004572	GT	3	6	15848	15853	0 %	50 %	50 %	0 %	28492983
40	NC_004572	CG	3	6	16008	16013	0 %	0 %	50 %	50 %	28492983
41	NC_004572	AT	3	6	16169	16174	50 %	50 %	0 %	0 %	28492983
42	NC_004572	GC	3	6	17054	17059	0 %	0 %	50 %	50 %	28492984
43	NC_004572	TG	3	6	17351	17356	0 %	50 %	50 %	0 %	28492984
44	NC_004572	TC	3	6	17496	17501	0 %	50 %	0 %	50 %	28492984
45	NC_004572	CT	3	6	17922	17927	0 %	50 %	0 %	50 %	28492984
46	NC_004572	GT	3	6	20425	20430	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_004572	TG	3	6	20490	20495	0 %	50 %	50 %	0 %	28492987
48	NC_004572	AT	3	6	21601	21606	50 %	50 %	0 %	0 %	28492987
49	NC_004572	AT	3	6	22113	22118	50 %	50 %	0 %	0 %	28492987
50	NC_004572	AT	3	6	22213	22218	50 %	50 %	0 %	0 %	28492987
51	NC_004572	TG	3	6	22596	22601	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_004572	GC	3	6	22766	22771	0 %	0 %	50 %	50 %	28492988
53	NC_004572	GT	3	6	22863	22868	0 %	50 %	50 %	0 %	28492988
54	NC_004572	CT	3	6	24208	24213	0 %	50 %	0 %	50 %	28492990
55	NC_004572	TA	3	6	24422	24427	50 %	50 %	0 %	0 %	28492990
56	NC_004572	GC	3	6	26450	26455	0 %	0 %	50 %	50 %	28492991
57	NC_004572	AT	3	6	26898	26903	50 %	50 %	0 %	0 %	28492992
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59	NC_004572	CG	3	6	27324	27329	0 %	0 %	50 %	50 %	28492993
60	NC_004572	AT	3	6	28044	28049	50 %	50 %	0 %	0 %	28492993
61	NC_004572	AG	3	6	28076	28081	50 %	0 %	50 %	0 %	28492993
62	NC_004572	AT	3	6	28113	28118	50 %	50 %	0 %	0 %	28492993
63	NC_004572	GA	3	6	28222	28227	50 %	0 %	50 %	0 %	28492993
64	NC_004572	AT	3	6	28443	28448	50 %	50 %	0 %	0 %	28492994
65	NC_004572	GA	3	6	29219	29224	50 %	0 %	50 %	0 %	28492995
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69	NC_004572	AT	3	6	31280	31285	50 %	50 %	0 %	0 %	28492997
70	NC_004572	CT	3	6	32091	32096	0 %	50 %	0 %	50 %	28492998
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72	NC_004572	GA	3	6	32327	32332	50 %	0 %	50 %	0 %	28492998
73	NC_004572	AC	3	6	32506	32511	50 %	0 %	0 %	50 %	28492998
74	NC_004572	AT	3	6	32907	32912	50 %	50 %	0 %	0 %	28492999
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80	NC_004572	CT	3	6	34931	34936	0 %	50 %	0 %	50 %	28493001
81	NC_004572	TC	3	6	34967	34972	0 %	50 %	0 %	50 %	28493001
82	NC_004572	TC	3	6	35475	35480	0 %	50 %	0 %	50 %	28493002
83	NC_004572	CT	3	6	35675	35680	0 %	50 %	0 %	50 %	28493002
84	NC_004572	GA	3	6	36259	36264	50 %	0 %	50 %	0 %	28493003
85	NC_004572	GC	3	6	36776	36781	0 %	0 %	50 %	50 %	28493003
86	NC_004572	CG	3	6	36914	36919	0 %	0 %	50 %	50 %	28493003
87	NC_004572	GA	3	6	36952	36957	50 %	0 %	50 %	0 %	28493003
88	NC_004572	GA	3	6	37198	37203	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_004572	AT	3	6	38333	38338	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_004572	CT	3	6	38804	38809	0 %	50 %	0 %	50 %	28493006
91	NC_004572	GC	3	6	39136	39141	0 %	0 %	50 %	50 %	28493006
92	NC_004572	AT	3	6	39982	39987	50 %	50 %	0 %	0 %	28493006
93	NC_004572	CT	3	6	40672	40677	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_004572	TA	3	6	40947	40952	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_004572	GC	4	8	41040	41047	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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98	NC_004572	TC	3	6	42230	42235	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_004572	AG	3	6	42316	42321	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_004572	GC	3	6	42409	42414	0 %	0 %	50 %	50 %	28493008
101	NC_004572	TG	3	6	43680	43685	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_004572	TC	3	6	43825	43830	0 %	50 %	0 %	50 %	28493011
103	NC_004572	GC	3	6	44054	44059	0 %	0 %	50 %	50 %	28493011
104	NC_004572	GC	3	6	44231	44236	0 %	0 %	50 %	50 %	28493012
105	NC_004572	AC	3	6	44624	44629	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_004572	TA	3	6	46303	46308	50 %	50 %	0 %	0 %	28493014
107	NC_004572	AG	3	6	47555	47560	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_004572	GT	3	6	47614	47619	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_004572	AG	3	6	48187	48192	50 %	0 %	50 %	0 %	28493016
110	NC_004572	AG	3	6	48457	48462	50 %	0 %	50 %	0 %	28493016
111	NC_004572	AG	3	6	48468	48473	50 %	0 %	50 %	0 %	28493016
112	NC_004572	CT	3	6	48943	48948	0 %	50 %	0 %	50 %	28493017
113	NC_004572	AC	3	6	49025	49030	50 %	0 %	0 %	50 %	28493017
114	NC_004572	AG	3	6	49076	49081	50 %	0 %	50 %	0 %	28493017
115	NC_004572	TG	3	6	49135	49140	0 %	50 %	50 %	0 %	28493017
116	NC_004572	CA	3	6	49550	49555	50 %	0 %	0 %	50 %	28493017
117	NC_004572	TC	3	6	49596	49601	0 %	50 %	0 %	50 %	28493017
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120	NC_004572	AG	3	6	50680	50685	50 %	0 %	50 %	0 %	28493018
121	NC_004572	TC	3	6	51004	51009	0 %	50 %	0 %	50 %	28493018
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123	NC_004572	TG	3	6	52256	52261	0 %	50 %	50 %	0 %	28493019
124	NC_004572	AT	3	6	52670	52675	50 %	50 %	0 %	0 %	28493019
125	NC_004572	TG	3	6	53072	53077	0 %	50 %	50 %	0 %	28493019
126	NC_004572	AC	3	6	53320	53325	50 %	0 %	0 %	50 %	28493020
127	NC_004572	AT	3	6	53535	53540	50 %	50 %	0 %	0 %	28493020
128	NC_004572	GC	3	6	54168	54173	0 %	0 %	50 %	50 %	28493021
129	NC_004572	TA	3	6	54517	54522	50 %	50 %	0 %	0 %	28493021
130	NC_004572	GA	3	6	54629	54634	50 %	0 %	50 %	0 %	28493021
131	NC_004572	AT	3	6	55084	55089	50 %	50 %	0 %	0 %	28493022
132	NC_004572	AT	3	6	56219	56224	50 %	50 %	0 %	0 %	28493022
133	NC_004572	AT	3	6	56296	56301	50 %	50 %	0 %	0 %	28493022
134	NC_004572	TC	3	6	56310	56315	0 %	50 %	0 %	50 %	28493022
135	NC_004572	CA	3	6	56695	56700	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_004572	TA	3	6	56846	56851	50 %	50 %	0 %	0 %	28493023
137	NC_004572	AC	3	6	57072	57077	50 %	0 %	0 %	50 %	28493023
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139	NC_004572	AG	4	8	58796	58803	50 %	0 %	50 %	0 %	28493024
140	NC_004572	GA	3	6	59297	59302	50 %	0 %	50 %	0 %	28493025
141	NC_004572	AT	3	6	61137	61142	50 %	50 %	0 %	0 %	28493027
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145	NC_004572	CA	3	6	64185	64190	50 %	0 %	0 %	50 %	28493029
146	NC_004572	AT	3	6	64202	64207	50 %	50 %	0 %	0 %	28493029
147	NC_004572	GA	3	6	65167	65172	50 %	0 %	50 %	0 %	28493030
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