MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Tropheryma whipplei str. Twist

Total Repeats: 2172

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004572	CTCC	2	8	798	805	0 %	25 %	0 %	75 %	28492968
2	NC_004572	GCAG	2	8	815	822	25 %	0 %	50 %	25 %	28492968
3	NC_004572	TAGA	2	8	1729	1736	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_004572	CATC	2	8	2322	2329	25 %	25 %	0 %	50 %	28492969
5	NC_004572	ATTT	2	8	2884	2891	25 %	75 %	0 %	0 %	28492969
6	NC_004572	TCAA	2	8	3699	3706	50 %	25 %	0 %	25 %	28492970
7	NC_004572	AAAT	2	8	4666	4673	75 %	25 %	0 %	0 %	28492972
8	NC_004572	GTTT	2	8	5028	5035	0 %	75 %	25 %	0 %	28492972
9	NC_004572	CAAA	2	8	5514	5521	75 %	0 %	0 %	25 %	28492972
10	NC_004572	GTTC	2	8	7483	7490	0 %	50 %	25 %	25 %	28492973
11	NC_004572	TTCT	2	8	7810	7817	0 %	75 %	0 %	25 %	28492973
12	NC_004572	AGGG	2	8	8129	8136	25 %	0 %	75 %	0 %	28492973
13	NC_004572	CTTA	2	8	9016	9023	25 %	50 %	0 %	25 %	28492974
14	NC_004572	CTTG	2	8	9358	9365	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_004572	CTGC	2	8	10095	10102	0 %	25 %	25 %	50 %	28492975
16	NC_004572	GCTC	2	8	10409	10416	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
17	NC_004572	CTGA	2	8	12527	12534	25 %	25 %	25 %	25 %	28492979
18	NC_004572	TTGT	2	8	12800	12807	0 %	75 %	25 %	0 %	28492980
19	NC_004572	ACCC	3	12	13568	13579	25 %	0 %	0 %	75 %	28492980
20	NC_004572	GAAA	2	8	13603	13610	75 %	0 %	25 %	0 %	28492980
21	NC_004572	TTGC	2	8	13658	13665	0 %	50 %	25 %	25 %	28492981
22	NC_004572	GTTG	2	8	14125	14132	0 %	50 %	50 %	0 %	28492982
23	NC_004572	GTCT	2	8	15132	15139	0 %	50 %	25 %	25 %	28492982
24	NC_004572	CCCA	2	8	15144	15151	25 %	0 %	0 %	75 %	28492982
25	NC_004572	CTGG	2	8	15167	15174	0 %	25 %	50 %	25 %	28492982
26	NC_004572	GCTT	2	8	16759	16766	0 %	50 %	25 %	25 %	28492984
27	NC_004572	GCCG	2	8	16841	16848	0 %	0 %	50 %	50 %	28492984
28	NC_004572	CACG	2	8	17935	17942	25 %	0 %	25 %	50 %	28492984
29	NC_004572	GCCA	2	8	18692	18699	25 %	0 %	25 %	50 %	28492985
30	NC_004572	GGGA	2	8	18704	18711	25 %	0 %	75 %	0 %	28492985
31	NC_004572	TGGA	2	8	19328	19335	25 %	25 %	50 %	0 %	28492986
32	NC_004572	TCTG	2	8	20675	20682	0 %	50 %	25 %	25 %	28492987
33	NC_004572	ACAG	2	8	20812	20819	50 %	0 %	25 %	25 %	28492987
34	NC_004572	TTGA	2	8	20928	20935	25 %	50 %	25 %	0 %	28492987
35	NC_004572	CGCC	2	8	21086	21093	0 %	0 %	25 %	75 %	28492987
36	NC_004572	GGCG	2	8	21477	21484	0 %	0 %	75 %	25 %	28492987
37	NC_004572	GACC	2	8	21896	21903	25 %	0 %	25 %	50 %	28492987
38	NC_004572	TAGG	2	8	22026	22033	25 %	25 %	50 %	0 %	28492987
39	NC_004572	TTTC	2	8	22443	22450	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_004572	TATT	2	8	22471	22478	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_004572	CTGT	2	8	22650	22657	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_004572	ATAA	2	8	22879	22886	75 %	25 %	0 %	0 %	28492988
43	NC_004572	CTAT	2	8	23411	23418	25 %	50 %	0 %	25 %	28492989
44	NC_004572	TCAC	2	8	23921	23928	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_004572	TCAC	2	8	23939	23946	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_004572	TATG	2	8	23963	23970	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_004572	TTTG	2	8	24118	24125	0 %	75 %	25 %	0 %	28492990
48	NC_004572	TGCC	2	8	25610	25617	0 %	25 %	25 %	50 %	28492990
49	NC_004572	CAAG	2	8	26175	26182	50 %	0 %	25 %	25 %	28492991
50	NC_004572	TTTA	2	8	26494	26501	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_004572	TCTA	2	8	26518	26525	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_004572	TTGC	2	8	26624	26631	0 %	50 %	25 %	25 %	28492992
53	NC_004572	GCCT	2	8	27394	27401	0 %	25 %	25 %	50 %	28492993
54	NC_004572	GACG	2	8	27485	27492	25 %	0 %	50 %	25 %	28492993
55	NC_004572	CATC	2	8	27606	27613	25 %	25 %	0 %	50 %	28492993
56	NC_004572	ACAA	2	8	27640	27647	75 %	0 %	0 %	25 %	28492993
57	NC_004572	CGGG	2	8	27699	27706	0 %	0 %	75 %	25 %	28492993
58	NC_004572	GAAC	2	8	27898	27905	50 %	0 %	25 %	25 %	28492993
59	NC_004572	ATCA	2	8	28821	28828	50 %	25 %	0 %	25 %	28492994
60	NC_004572	AGGA	2	8	29183	29190	50 %	0 %	50 %	0 %	28492995
61	NC_004572	CCGA	2	8	29339	29346	25 %	0 %	25 %	50 %	28492995
62	NC_004572	CCGC	2	8	29360	29367	0 %	0 %	25 %	75 %	28492995
63	NC_004572	TGTA	2	8	29789	29796	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_004572	TGTT	2	8	30057	30064	0 %	75 %	25 %	0 %	28492996
65	NC_004572	GTTG	2	8	30137	30144	0 %	50 %	50 %	0 %	28492996
66	NC_004572	AATT	2	8	30519	30526	50 %	50 %	0 %	0 %	28492996
67	NC_004572	ATTG	2	8	30732	30739	25 %	50 %	25 %	0 %	28492997
68	NC_004572	TGCA	2	8	31742	31749	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_004572	TTTA	2	8	33186	33193	25 %	75 %	0 %	0 %	28492999
70	NC_004572	GTTG	2	8	33320	33327	0 %	50 %	50 %	0 %	28492999
71	NC_004572	TGGA	2	8	33352	33359	25 %	25 %	50 %	0 %	28492999
72	NC_004572	GGAT	2	8	33921	33928	25 %	25 %	50 %	0 %	28493000
73	NC_004572	ACTC	2	8	34209	34216	25 %	25 %	0 %	50 %	28493000
74	NC_004572	ATAC	2	8	34586	34593	50 %	25 %	0 %	25 %	28493001
75	NC_004572	CCGC	2	8	34778	34785	0 %	0 %	25 %	75 %	28493001
76	NC_004572	GAAT	2	8	35408	35415	50 %	25 %	25 %	0 %	28493002
77	NC_004572	TAAA	2	8	35684	35691	75 %	25 %	0 %	0 %	28493002
78	NC_004572	AAAT	2	8	35782	35789	75 %	25 %	0 %	0 %	28493002
79	NC_004572	AGAC	2	8	36081	36088	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_004572	CCTT	2	8	37669	37676	0 %	50 %	0 %	50 %	28493005
81	NC_004572	AGGG	2	8	38231	38238	25 %	0 %	75 %	0 %	28493005
82	NC_004572	TGTA	2	8	39849	39856	25 %	50 %	25 %	0 %	28493006
83	NC_004572	TTTC	2	8	40498	40505	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_004572	ATTG	2	8	41121	41128	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_004572	TGCT	2	8	41129	41136	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
86	NC_004572	AAGT	2	8	41327	41334	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_004572	GTTT	2	8	41645	41652	0 %	75 %	25 %	0 %	28493007
88	NC_004572	TTTC	2	8	42062	42069	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_004572	GTGG	2	8	42390	42397	0 %	25 %	75 %	0 %	28493008
90	NC_004572	GTTC	2	8	42777	42784	0 %	50 %	25 %	25 %	28493009
91	NC_004572	TCAG	2	8	42882	42889	25 %	25 %	25 %	25 %	28493009
92	NC_004572	GCTG	2	8	42983	42990	0 %	25 %	50 %	25 %	28493009
93	NC_004572	TTTC	2	8	43654	43661	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_004572	ATCA	2	8	45025	45032	50 %	25 %	0 %	25 %	28493013
95	NC_004572	CTAT	2	8	47074	47081	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_004572	GGTT	2	8	47678	47685	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_004572	CTGT	2	8	47903	47910	0 %	50 %	25 %	25 %	28493016
98	NC_004572	CCTC	2	8	48107	48114	0 %	25 %	0 %	75 %	28493016
99	NC_004572	CACG	2	8	48612	48619	25 %	0 %	25 %	50 %	28493016
100	NC_004572	TACA	2	8	49049	49056	50 %	25 %	0 %	25 %	28493017
101	NC_004572	GTTT	2	8	49147	49154	0 %	75 %	25 %	0 %	28493017
102	NC_004572	TGAC	2	8	50435	50442	25 %	25 %	25 %	25 %	28493018
103	NC_004572	GCAG	2	8	50746	50753	25 %	0 %	50 %	25 %	28493018
104	NC_004572	TCTT	2	8	50942	50949	0 %	75 %	0 %	25 %	28493018
105	NC_004572	GGCC	2	8	51142	51149	0 %	0 %	50 %	50 %	28493018
106	NC_004572	ATAA	2	8	51475	51482	75 %	25 %	0 %	0 %	28493018
107	NC_004572	GCCA	2	8	51745	51752	25 %	0 %	25 %	50 %	28493018
108	NC_004572	AACC	2	8	51803	51810	50 %	0 %	0 %	50 %	28493018
109	NC_004572	GTTT	2	8	52688	52695	0 %	75 %	25 %	0 %	28493019
110	NC_004572	TGTA	2	8	52965	52972	25 %	50 %	25 %	0 %	28493019
111	NC_004572	ATTT	2	8	53031	53038	25 %	75 %	0 %	0 %	28493019
112	NC_004572	AATC	2	8	53865	53872	50 %	25 %	0 %	25 %	28493020
113	NC_004572	GATC	2	8	54317	54324	25 %	25 %	25 %	25 %	28493021
114	NC_004572	GATC	2	8	54669	54676	25 %	25 %	25 %	25 %	28493021
115	NC_004572	CGCA	2	8	54897	54904	25 %	0 %	25 %	50 %	28493021
116	NC_004572	TCTT	2	8	55284	55291	0 %	75 %	0 %	25 %	28493022
117	NC_004572	ATCG	2	8	55750	55757	25 %	25 %	25 %	25 %	28493022
118	NC_004572	GCTC	2	8	55777	55784	0 %	25 %	25 %	50 %	28493022
119	NC_004572	ATCC	2	8	57375	57382	25 %	25 %	0 %	50 %	28493023
120	NC_004572	CACG	2	8	57794	57801	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
121	NC_004572	GCCC	2	8	58661	58668	0 %	0 %	25 %	75 %	28493024
122	NC_004572	AAAG	2	8	58923	58930	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_004572	GATA	3	12	59853	59864	50 %	25 %	25 %	0 %	28493025
124	NC_004572	CTGA	2	8	60300	60307	25 %	25 %	25 %	25 %	28493026
125	NC_004572	TTCT	2	8	60479	60486	0 %	75 %	0 %	25 %	28493026
126	NC_004572	CTGA	2	8	60742	60749	25 %	25 %	25 %	25 %	28493026
127	NC_004572	CAGT	2	8	60979	60986	25 %	25 %	25 %	25 %	28493026
128	NC_004572	CAAA	2	8	61007	61014	75 %	0 %	0 %	25 %	28493026
129	NC_004572	CCAA	2	8	61512	61519	50 %	0 %	0 %	50 %	28493027
130	NC_004572	TCAA	2	8	61722	61729	50 %	25 %	0 %	25 %	28493027
131	NC_004572	TCTT	2	8	61881	61888	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_004572	CCTT	2	8	62122	62129	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_004572	CAAC	2	8	62228	62235	50 %	0 %	0 %	50 %	28493028
134	NC_004572	CATG	2	8	62272	62279	25 %	25 %	25 %	25 %	28493028
135	NC_004572	CCGA	2	8	62844	62851	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
136	NC_004572	CTTG	2	8	63168	63175	0 %	50 %	25 %	25 %	28493029
137	NC_004572	GAAA	2	8	63352	63359	75 %	0 %	25 %	0 %	28493029
138	NC_004572	TTGG	2	8	63511	63518	0 %	50 %	50 %	0 %	28493029
139	NC_004572	AAAC	2	8	64524	64531	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_004572	TGCT	2	8	65397	65404	0 %	50 %	25 %	25 %	28493030
141	NC_004572	ATCT	2	8	65542	65549	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_004572	AAAG	2	8	65603	65610	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_004572	TTCT	2	8	65881	65888	0 %	75 %	0 %	25 %	28493031
144	NC_004572	CCGC	2	8	66242	66249	0 %	0 %	25 %	75 %	28493031
145	NC_004572	CTAG	2	8	67222	67229	25 %	25 %	25 %	25 %	28493031
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