MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Tropheryma whipplei str. Twist

Total Repeats: 17134

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_004572	CG	3	6	186907	186912	0 %	0 %	50 %	50 %	28493116
3502	NC_004572	TGC	2	6	186959	186964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493116
3503	NC_004572	TGA	2	6	186989	186994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28493116
3504	NC_004572	GC	3	6	187001	187006	0 %	0 %	50 %	50 %	28493116
3505	NC_004572	GCG	2	6	187014	187019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28493116
3506	NC_004572	GAG	2	6	187067	187072	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28493116
3507	NC_004572	AGG	2	6	187117	187122	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28493116
3508	NC_004572	AAT	2	6	187239	187244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28493116
3509	NC_004572	CTG	2	6	187258	187263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493116
3510	NC_004572	CCTT	2	8	187301	187308	0 %	50 %	0 %	50 %	28493116
3511	NC_004572	GCC	2	6	187374	187379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28493116
3512	NC_004572	CA	3	6	187396	187401	50 %	0 %	0 %	50 %	28493116
3513	NC_004572	CAGT	2	8	187409	187416	25 %	25 %	25 %	25 %	28493116
3514	NC_004572	TCT	2	6	187475	187480	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28493116
3515	NC_004572	ATG	2	6	187539	187544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28493116
3516	NC_004572	TGT	2	6	187568	187573	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493116
3517	NC_004572	GC	3	6	187614	187619	0 %	0 %	50 %	50 %	28493116
3518	NC_004572	CTTG	2	8	187650	187657	0 %	50 %	25 %	25 %	28493117
3519	NC_004572	TGT	2	6	187698	187703	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493117
3520	NC_004572	TTC	2	6	187742	187747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28493117
3521	NC_004572	CTG	2	6	187814	187819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493117
3522	NC_004572	GT	3	6	187871	187876	0 %	50 %	50 %	0 %	28493117
3523	NC_004572	TCT	2	6	187947	187952	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28493117
3524	NC_004572	CAA	2	6	187993	187998	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28493117
3525	NC_004572	G	9	9	188043	188051	0 %	0 %	100 %	0 %	28493117
3526	NC_004572	GAA	2	6	188064	188069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28493118
3527	NC_004572	GTC	2	6	188071	188076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493118
3528	NC_004572	TGC	2	6	188138	188143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493118
3529	NC_004572	GGC	2	6	188169	188174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28493118
3530	NC_004572	GCACCT	2	12	188220	188231	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	28493118
3531	NC_004572	GCA	2	6	188232	188237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28493118
3532	NC_004572	ACC	2	6	188294	188299	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28493118
3533	NC_004572	CGC	2	6	188309	188314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28493118
3534	NC_004572	CA	3	6	188318	188323	50 %	0 %	0 %	50 %	28493118
3535	NC_004572	CTG	3	9	188362	188370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493118
3536	NC_004572	GCCTGC	2	12	188375	188386	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	28493118
3537	NC_004572	GCA	2	6	188397	188402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28493118
3538	NC_004572	ACC	2	6	188453	188458	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28493118
3539	NC_004572	CGC	2	6	188468	188473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28493118
3540	NC_004572	GCT	2	6	188499	188504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493118
3541	NC_004572	CTG	3	9	188530	188538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493118
3542	NC_004572	GCCTGC	2	12	188543	188554	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	28493118
3543	NC_004572	GCA	2	6	188565	188570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28493118
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3545	NC_004572	CGC	2	6	188636	188641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28493118
3546	NC_004572	GCT	2	6	188667	188672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493118
3547	NC_004572	CTG	2	6	188698	188703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493118
3548	NC_004572	GCA	2	6	188721	188726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28493118
3549	NC_004572	ACC	2	6	188777	188782	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28493118
3550	NC_004572	CGC	2	6	188792	188797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28493118
3551	NC_004572	CGC	2	6	188807	188812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28493118
3552	NC_004572	GCT	2	6	188838	188843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493118
3553	NC_004572	CTG	2	6	188869	188874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493118
3554	NC_004572	GCT	2	6	188889	188894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493118
3555	NC_004572	CA	3	6	188912	188917	50 %	0 %	0 %	50 %	28493118
3556	NC_004572	CTG	3	9	188956	188964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493118
3557	NC_004572	CCTGCG	2	12	189021	189032	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	28493118
3558	NC_004572	CTT	2	6	189079	189084	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28493118
3559	NC_004572	AAT	2	6	189123	189128	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28493118
3560	NC_004572	GAA	2	6	189147	189152	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28493118
3561	NC_004572	TCC	2	6	189165	189170	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	28493118
3562	NC_004572	GTT	2	6	189240	189245	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493118
3563	NC_004572	TTG	2	6	189253	189258	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493118
3564	NC_004572	CTG	2	6	189268	189273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493118
3565	NC_004572	GGT	2	6	189304	189309	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28493118
3566	NC_004572	CCTT	2	8	189425	189432	0 %	50 %	0 %	50 %	28493119
3567	NC_004572	CGC	2	6	189486	189491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28493119
3568	NC_004572	GAT	2	6	189515	189520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28493119
3569	NC_004572	TA	3	6	189522	189527	50 %	50 %	0 %	0 %	28493119
3570	NC_004572	GA	3	6	189578	189583	50 %	0 %	50 %	0 %	28493119
3571	NC_004572	TTC	2	6	189613	189618	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28493119
3572	NC_004572	GT	3	6	189629	189634	0 %	50 %	50 %	0 %	28493119
3573	NC_004572	TCA	2	6	189707	189712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28493119
3574	NC_004572	TTA	2	6	189782	189787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28493119
3575	NC_004572	TC	3	6	189869	189874	0 %	50 %	0 %	50 %	28493119
3576	NC_004572	TC	3	6	189969	189974	0 %	50 %	0 %	50 %	28493119
3577	NC_004572	ATC	2	6	190002	190007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28493119
3578	NC_004572	GTT	2	6	190012	190017	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493119
3579	NC_004572	TGT	2	6	190093	190098	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493119
3580	NC_004572	TG	3	6	190109	190114	0 %	50 %	50 %	0 %	28493119
3581	NC_004572	ATC	2	6	190134	190139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28493119
3582	NC_004572	TAT	2	6	190181	190186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28493119
3583	NC_004572	T	6	6	190209	190214	0 %	100 %	0 %	0 %	28493119
3584	NC_004572	TCA	2	6	190232	190237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28493119
3585	NC_004572	CATGA	2	10	190276	190285	40 %	20 %	20 %	20 %	28493119
3586	NC_004572	CTG	3	9	190301	190309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493119
3587	NC_004572	CCGGCC	2	12	190319	190330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28493119
3588	NC_004572	GTAT	2	8	190444	190451	25 %	50 %	25 %	0 %	28493119
3589	NC_004572	TGTT	2	8	190494	190501	0 %	75 %	25 %	0 %	28493119
3590	NC_004572	CCAG	2	8	190536	190543	25 %	0 %	25 %	50 %	28493119
3591	NC_004572	ATAA	2	8	190576	190583	75 %	25 %	0 %	0 %	28493119
3592	NC_004572	GTAAT	2	10	190622	190631	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
3593	NC_004572	GAA	2	6	190655	190660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28493120
3594	NC_004572	ACA	2	6	190703	190708	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28493120
3595	NC_004572	TACAG	2	10	190814	190823	40 %	20 %	20 %	20 %	28493120
3596	NC_004572	AG	3	6	190822	190827	50 %	0 %	50 %	0 %	28493120
3597	NC_004572	TAA	2	6	190832	190837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28493120
3598	NC_004572	TACAG	2	10	190847	190856	40 %	20 %	20 %	20 %	28493120
3599	NC_004572	AG	3	6	190855	190860	50 %	0 %	50 %	0 %	28493120
3600	NC_004572	TAA	2	6	190865	190870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28493120
3601	NC_004572	AC	3	6	190879	190884	50 %	0 %	0 %	50 %	28493120
3602	NC_004572	CAGG	2	8	190911	190918	25 %	0 %	50 %	25 %	28493120
3603	NC_004572	AGCA	2	8	190957	190964	50 %	0 %	25 %	25 %	28493120
3604	NC_004572	TCT	2	6	191039	191044	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28493120
3605	NC_004572	AAGGTA	2	12	191082	191093	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	28493120
3606	NC_004572	GTT	2	6	191121	191126	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493120
3607	NC_004572	TTG	2	6	191202	191207	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493121
3608	NC_004572	GATA	2	8	191239	191246	50 %	25 %	25 %	0 %	28493121
3609	NC_004572	GTC	2	6	191256	191261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493121
3610	NC_004572	CAA	2	6	191301	191306	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28493121
3611	NC_004572	TCC	2	6	191421	191426	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	28493121
3612	NC_004572	TGA	2	6	191434	191439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28493121
3613	NC_004572	TGG	2	6	191440	191445	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28493121
3614	NC_004572	GAT	2	6	191510	191515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28493121
3615	NC_004572	CTT	2	6	191548	191553	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28493121
3616	NC_004572	AGA	2	6	191572	191577	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28493121
3617	NC_004572	TAA	2	6	191660	191665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28493121
3618	NC_004572	AGC	2	6	191698	191703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3619	NC_004572	ATA	2	6	191720	191725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3620	NC_004572	TCT	2	6	191806	191811	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3621	NC_004572	TA	3	6	191848	191853	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3622	NC_004572	GAC	2	6	191895	191900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3623	NC_004572	T	6	6	192078	192083	0 %	100 %	0 %	0 %	28493122
3624	NC_004572	TAT	2	6	192167	192172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28493122
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