MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Tropheryma whipplei str. Twist

Total Repeats: 17134

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_004572	CGC	2	6	135650	135655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28493085
2502	NC_004572	TGT	2	6	135715	135720	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493085
2503	NC_004572	G	6	6	135765	135770	0 %	0 %	100 %	0 %	28493085
2504	NC_004572	GCCGC	2	10	135789	135798	0 %	0 %	40 %	60 %	28493085
2505	NC_004572	AAT	2	6	135899	135904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28493085
2506	NC_004572	TTG	2	6	135925	135930	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493085
2507	NC_004572	GGC	2	6	135957	135962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28493085
2508	NC_004572	ATG	2	6	136032	136037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28493085
2509	NC_004572	CGA	2	6	136097	136102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28493085
2510	NC_004572	TGT	2	6	136184	136189	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493085
2511	NC_004572	ATT	2	6	136245	136250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28493085
2512	NC_004572	GAT	2	6	136257	136262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28493085
2513	NC_004572	TGT	2	6	136318	136323	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493085
2514	NC_004572	GTT	2	6	136353	136358	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493085
2515	NC_004572	A	6	6	136376	136381	100 %	0 %	0 %	0 %	28493085
2516	NC_004572	TTC	2	6	136385	136390	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28493085
2517	NC_004572	GAAA	2	8	136432	136439	75 %	0 %	25 %	0 %	28493085
2518	NC_004572	TGA	2	6	136453	136458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28493085
2519	NC_004572	ACG	2	6	136658	136663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28493085
2520	NC_004572	AGAA	2	8	136694	136701	75 %	0 %	25 %	0 %	28493085
2521	NC_004572	A	6	6	136751	136756	100 %	0 %	0 %	0 %	28493085
2522	NC_004572	GAT	2	6	136764	136769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28493085
2523	NC_004572	CGA	2	6	136820	136825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28493085
2524	NC_004572	T	6	6	136894	136899	0 %	100 %	0 %	0 %	28493085
2525	NC_004572	T	8	8	136984	136991	0 %	100 %	0 %	0 %	28493085
2526	NC_004572	CAG	2	6	137037	137042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28493085
2527	NC_004572	TGA	2	6	137111	137116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28493085
2528	NC_004572	GCT	2	6	137154	137159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493085
2529	NC_004572	GCC	2	6	137220	137225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28493085
2530	NC_004572	GCT	2	6	137325	137330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493085
2531	NC_004572	ATG	2	6	137350	137355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28493085
2532	NC_004572	AG	3	6	137399	137404	50 %	0 %	50 %	0 %	28493085
2533	NC_004572	CCT	2	6	137420	137425	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	28493085
2534	NC_004572	CTTG	2	8	137429	137436	0 %	50 %	25 %	25 %	28493085
2535	NC_004572	AGC	2	6	137458	137463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28493085
2536	NC_004572	TCG	2	6	137493	137498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493086
2537	NC_004572	CG	3	6	137508	137513	0 %	0 %	50 %	50 %	28493086
2538	NC_004572	TG	3	6	137527	137532	0 %	50 %	50 %	0 %	28493086
2539	NC_004572	TTGTA	2	10	137555	137564	20 %	60 %	20 %	0 %	28493086
2540	NC_004572	TAG	2	6	137596	137601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28493086
2541	NC_004572	CCG	2	6	137699	137704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28493087
2542	NC_004572	CTTC	2	8	137731	137738	0 %	50 %	0 %	50 %	28493087
2543	NC_004572	GATG	2	8	137916	137923	25 %	25 %	50 %	0 %	28493087
2544	NC_004572	TTG	3	9	137933	137941	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493087
2545	NC_004572	CTTG	2	8	137982	137989	0 %	50 %	25 %	25 %	28493087
2546	NC_004572	TGA	2	6	138048	138053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28493087
2547	NC_004572	TTG	2	6	138068	138073	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493087
2548	NC_004572	TGT	2	6	138092	138097	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493087
2549	NC_004572	TGA	2	6	138210	138215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28493087
2550	NC_004572	GTT	2	6	138301	138306	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493087
2551	NC_004572	GTG	2	6	138323	138328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28493087
2552	NC_004572	CTG	2	6	138451	138456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493087
2553	NC_004572	GTT	2	6	138496	138501	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493087
2554	NC_004572	GAA	2	6	138730	138735	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28493087
2555	NC_004572	TATCC	2	10	138871	138880	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
2556	NC_004572	CTT	2	6	138899	138904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2557	NC_004572	TCA	2	6	138913	138918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2558	NC_004572	CTT	2	6	139019	139024	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2559	NC_004572	GCAT	2	8	139089	139096	25 %	25 %	25 %	25 %	28493088
2560	NC_004572	ATC	2	6	139115	139120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28493088
2561	NC_004572	GCCAT	2	10	139149	139158	20 %	20 %	20 %	40 %	28493088
2562	NC_004572	CA	3	6	139182	139187	50 %	0 %	0 %	50 %	28493088
2563	NC_004572	GCC	2	6	139193	139198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28493088
2564	NC_004572	AGG	2	6	139199	139204	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28493088
2565	NC_004572	CAAC	2	8	139212	139219	50 %	0 %	0 %	50 %	28493088
2566	NC_004572	AGA	2	6	139229	139234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28493088
2567	NC_004572	TCG	2	6	139357	139362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493088
2568	NC_004572	CCCA	2	8	139367	139374	25 %	0 %	0 %	75 %	28493088
2569	NC_004572	GCA	3	9	139427	139435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28493088
2570	NC_004572	CCA	2	6	139520	139525	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28493088
2571	NC_004572	ATG	2	6	139598	139603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28493088
2572	NC_004572	CCA	2	6	139621	139626	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28493088
2573	NC_004572	CAT	2	6	139662	139667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28493088
2574	NC_004572	TAA	2	6	139701	139706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28493088
2575	NC_004572	CCCA	2	8	139836	139843	25 %	0 %	0 %	75 %	28493088
2576	NC_004572	CACC	2	8	139874	139881	25 %	0 %	0 %	75 %	28493088
2577	NC_004572	AACTG	2	10	139933	139942	40 %	20 %	20 %	20 %	28493088
2578	NC_004572	GCT	2	6	139998	140003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493088
2579	NC_004572	TAA	2	6	140051	140056	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28493088
2580	NC_004572	A	6	6	140055	140060	100 %	0 %	0 %	0 %	28493088
2581	NC_004572	CAG	2	6	140100	140105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28493088
2582	NC_004572	CCA	2	6	140125	140130	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28493088
2583	NC_004572	CAAT	2	8	140256	140263	50 %	25 %	0 %	25 %	28493088
2584	NC_004572	ATC	2	6	140270	140275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28493088
2585	NC_004572	C	6	6	140350	140355	0 %	0 %	0 %	100 %	28493088
2586	NC_004572	GGC	2	6	140380	140385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28493088
2587	NC_004572	AAT	2	6	140485	140490	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28493088
2588	NC_004572	A	6	6	140537	140542	100 %	0 %	0 %	0 %	28493088
2589	NC_004572	GTA	2	6	140647	140652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28493088
2590	NC_004572	GCA	2	6	140700	140705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28493088
2591	NC_004572	CAAGA	2	10	140935	140944	60 %	0 %	20 %	20 %	28493088
2592	NC_004572	ACA	2	6	140957	140962	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28493088
2593	NC_004572	AACC	2	8	140968	140975	50 %	0 %	0 %	50 %	28493088
2594	NC_004572	ATA	2	6	140980	140985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2595	NC_004572	CTGC	2	8	141075	141082	0 %	25 %	25 %	50 %	28493089
2596	NC_004572	CAT	2	6	141108	141113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28493089
2597	NC_004572	CAT	2	6	141135	141140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28493089
2598	NC_004572	CATG	2	8	141142	141149	25 %	25 %	25 %	25 %	28493089
2599	NC_004572	CAT	2	6	141194	141199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28493089
2600	NC_004572	TCT	2	6	141229	141234	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28493089
2601	NC_004572	GAA	2	6	141239	141244	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28493089
2602	NC_004572	AGA	2	6	141398	141403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28493089
2603	NC_004572	GCT	2	6	141434	141439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493089
2604	NC_004572	GCC	2	6	141441	141446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28493089
2605	NC_004572	TG	3	6	141601	141606	0 %	50 %	50 %	0 %	28493089
2606	NC_004572	TC	3	6	141649	141654	0 %	50 %	0 %	50 %	28493089
2607	NC_004572	A	7	7	141662	141668	100 %	0 %	0 %	0 %	28493089
2608	NC_004572	AAC	2	6	141694	141699	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28493089
2609	NC_004572	T	6	6	141726	141731	0 %	100 %	0 %	0 %	28493089
2610	NC_004572	GAAG	2	8	141768	141775	50 %	0 %	50 %	0 %	28493089
2611	NC_004572	AAC	2	6	141986	141991	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28493089
2612	NC_004572	TCT	2	6	142052	142057	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28493089
2613	NC_004572	CA	3	6	142063	142068	50 %	0 %	0 %	50 %	28493089
2614	NC_004572	GAG	2	6	142119	142124	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28493089
2615	NC_004572	CT	3	6	142131	142136	0 %	50 %	0 %	50 %	28493089
2616	NC_004572	TGC	2	6	142219	142224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493089
2617	NC_004572	ATG	2	6	142246	142251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28493089
2618	NC_004572	CATG	2	8	142290	142297	25 %	25 %	25 %	25 %	28493089
2619	NC_004572	CGGCCA	2	12	142339	142350	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	28493089
2620	NC_004572	TGG	2	6	142355	142360	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28493089
2621	NC_004572	ATC	2	6	142433	142438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28493089
2622	NC_004572	GAA	2	6	142446	142451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28493089
2623	NC_004572	TGA	2	6	142547	142552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28493089
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2625	NC_004572	GC	3	6	142718	142723	0 %	0 %	50 %	50 %	28493090
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2751	NC_004572	CGA	2	6	150710	150715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28493097
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2753	NC_004572	CTC	2	6	150748	150753	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	28493097
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2862	NC_004572	TCAA	2	8	156463	156470	50 %	25 %	0 %	25 %	28493102
2863	NC_004572	CTG	2	6	156593	156598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493102
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2866	NC_004572	TTG	2	6	156750	156755	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493102
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2868	NC_004572	AG	3	6	156809	156814	50 %	0 %	50 %	0 %	28493102
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2873	NC_004572	TGA	2	6	157117	157122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28493102
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2875	NC_004572	GCA	2	6	157249	157254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28493102
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