MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Tropheryma whipplei str. Twist

Total Repeats: 17134

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_004572	ACCT	2	8	110414	110421	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2002	NC_004572	AGC	2	6	110422	110427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2003	NC_004572	CAA	2	6	110506	110511	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2004	NC_004572	AT	3	6	110512	110517	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2005	NC_004572	CT	3	6	110649	110654	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2006	NC_004572	CTT	2	6	110661	110666	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2007	NC_004572	TACC	2	8	110667	110674	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2008	NC_004572	AAC	2	6	110779	110784	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2009	NC_004572	TCTG	2	8	110813	110820	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2010	NC_004572	TG	3	6	110840	110845	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2011	NC_004572	CCA	2	6	110870	110875	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2012	NC_004572	GT	3	6	110900	110905	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2013	NC_004572	GT	3	6	110928	110933	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2014	NC_004572	AGA	2	6	110939	110944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2015	NC_004572	CT	3	6	110976	110981	0 %	50 %	0 %	50 %	28493065
2016	NC_004572	TC	3	6	111032	111037	0 %	50 %	0 %	50 %	28493065
2017	NC_004572	GCA	2	6	111071	111076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28493065
2018	NC_004572	TCC	2	6	111137	111142	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	28493065
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2020	NC_004572	CG	3	6	111218	111223	0 %	0 %	50 %	50 %	28493065
2021	NC_004572	TCA	2	6	111234	111239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28493065
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2023	NC_004572	CA	3	6	111297	111302	50 %	0 %	0 %	50 %	28493065
2024	NC_004572	CTT	2	6	111309	111314	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28493065
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2031	NC_004572	AT	3	6	111703	111708	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2032	NC_004572	TA	3	6	111738	111743	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2033	NC_004572	AGC	2	6	111776	111781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2037	NC_004572	GAATT	2	10	111989	111998	40 %	40 %	20 %	0 %	28493067
2038	NC_004572	TTTC	2	8	112005	112012	0 %	75 %	0 %	25 %	28493067
2039	NC_004572	TG	3	6	112091	112096	0 %	50 %	50 %	0 %	28493067
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2042	NC_004572	ATC	2	6	112393	112398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28493067
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2049	NC_004572	GTTTT	2	10	113034	113043	0 %	80 %	20 %	0 %	28493067
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2057	NC_004572	GCTG	2	8	113530	113537	0 %	25 %	50 %	25 %	28493067
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2062	NC_004572	AGC	2	6	113857	113862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2063	NC_004572	AGC	2	6	113877	113882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2066	NC_004572	AT	3	6	114062	114067	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2093	NC_004572	TACC	2	8	115445	115452	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2094	NC_004572	CCAA	2	8	115485	115492	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2095	NC_004572	ATA	2	6	115523	115528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2112	NC_004572	TGC	2	6	116637	116642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493069
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2115	NC_004572	T	7	7	116875	116881	0 %	100 %	0 %	0 %	28493069
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2256	NC_004572	GTT	3	9	124133	124141	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493071
2257	NC_004572	GTG	3	9	124155	124163	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28493071
2258	NC_004572	TAC	2	6	124165	124170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28493071
2259	NC_004572	TGG	2	6	124182	124187	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28493071
2260	NC_004572	TG	3	6	124267	124272	0 %	50 %	50 %	0 %	28493071
2261	NC_004572	CTG	2	6	124276	124281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493071
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2264	NC_004572	ACC	2	6	124423	124428	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28493071
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2286	NC_004572	T	7	7	125340	125346	0 %	100 %	0 %	0 %	28493071
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2288	NC_004572	GAA	2	6	125396	125401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2363	NC_004572	CA	3	6	128556	128561	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2364	NC_004572	GAT	2	6	128633	128638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2498	NC_004572	GGA	2	6	135310	135315	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28493084
2499	NC_004572	AGGAC	2	10	135421	135430	40 %	0 %	40 %	20 %	28493085
2500	NC_004572	TGC	2	6	135629	135634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493085

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