MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Tropheryma whipplei str. Twist

Total Repeats: 17134

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_004572	CGC	2	6	54756	54761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28493021
1002	NC_004572	GCG	2	6	54810	54815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28493021
1003	NC_004572	GCG	2	6	54821	54826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28493021
1004	NC_004572	TGA	2	6	54837	54842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28493021
1005	NC_004572	ATG	2	6	54887	54892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28493021
1006	NC_004572	CGCA	2	8	54897	54904	25 %	0 %	25 %	50 %	28493021
1007	NC_004572	A	6	6	54952	54957	100 %	0 %	0 %	0 %	28493021
1008	NC_004572	GTT	2	6	55006	55011	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493021
1009	NC_004572	GTA	2	6	55060	55065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28493022
1010	NC_004572	AT	3	6	55084	55089	50 %	50 %	0 %	0 %	28493022
1011	NC_004572	TCT	3	9	55098	55106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28493022
1012	NC_004572	ATC	2	6	55190	55195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28493022
1013	NC_004572	TGT	2	6	55209	55214	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493022
1014	NC_004572	T	6	6	55256	55261	0 %	100 %	0 %	0 %	28493022
1015	NC_004572	TCTT	2	8	55284	55291	0 %	75 %	0 %	25 %	28493022
1016	NC_004572	AAC	2	6	55304	55309	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28493022
1017	NC_004572	TTG	2	6	55406	55411	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493022
1018	NC_004572	GAA	2	6	55531	55536	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28493022
1019	NC_004572	AAC	2	6	55542	55547	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28493022
1020	NC_004572	CGT	2	6	55615	55620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493022
1021	NC_004572	C	6	6	55643	55648	0 %	0 %	0 %	100 %	28493022
1022	NC_004572	GAT	2	6	55702	55707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28493022
1023	NC_004572	ATCG	2	8	55750	55757	25 %	25 %	25 %	25 %	28493022
1024	NC_004572	GCTC	2	8	55777	55784	0 %	25 %	25 %	50 %	28493022
1025	NC_004572	CACTTT	2	12	55810	55821	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	28493022
1026	NC_004572	GTT	3	9	55840	55848	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493022
1027	NC_004572	GGT	2	6	55950	55955	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28493022
1028	NC_004572	TGA	2	6	56019	56024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28493022
1029	NC_004572	ATT	2	6	56035	56040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28493022
1030	NC_004572	TGG	2	6	56194	56199	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28493022
1031	NC_004572	AT	3	6	56219	56224	50 %	50 %	0 %	0 %	28493022
1032	NC_004572	AT	3	6	56296	56301	50 %	50 %	0 %	0 %	28493022
1033	NC_004572	TC	3	6	56310	56315	0 %	50 %	0 %	50 %	28493022
1034	NC_004572	GAA	2	6	56347	56352	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28493022
1035	NC_004572	TTC	2	6	56364	56369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28493022
1036	NC_004572	GAT	2	6	56406	56411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_004572	ATG	2	6	56412	56417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_004572	CA	3	6	56695	56700	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1039	NC_004572	TTA	2	6	56732	56737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28493023
1040	NC_004572	CTT	2	6	56743	56748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28493023
1041	NC_004572	TTG	2	6	56837	56842	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493023
1042	NC_004572	TA	3	6	56846	56851	50 %	50 %	0 %	0 %	28493023
1043	NC_004572	AC	3	6	57072	57077	50 %	0 %	0 %	50 %	28493023
1044	NC_004572	T	6	6	57303	57308	0 %	100 %	0 %	0 %	28493023
1045	NC_004572	TGC	2	6	57318	57323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493023
1046	NC_004572	ATCC	2	8	57375	57382	25 %	25 %	0 %	50 %	28493023
1047	NC_004572	GCT	2	6	57506	57511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493023
1048	NC_004572	TGGTA	2	10	57565	57574	20 %	40 %	40 %	0 %	28493023
1049	NC_004572	AGA	2	6	57610	57615	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28493023
1050	NC_004572	AG	4	8	57656	57663	50 %	0 %	50 %	0 %	28493023
1051	NC_004572	CAA	2	6	57666	57671	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28493023
1052	NC_004572	CAA	2	6	57721	57726	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1053	NC_004572	AAC	2	6	57733	57738	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1054	NC_004572	AAT	2	6	57782	57787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_004572	CACG	2	8	57794	57801	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1056	NC_004572	TTA	2	6	57848	57853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28493024
1057	NC_004572	CTT	2	6	57859	57864	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28493024
1058	NC_004572	TCA	2	6	57950	57955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28493024
1059	NC_004572	GCT	2	6	58022	58027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493024
1060	NC_004572	TAA	2	6	58167	58172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28493024
1061	NC_004572	CAA	2	6	58227	58232	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28493024
1062	NC_004572	T	6	6	58394	58399	0 %	100 %	0 %	0 %	28493024
1063	NC_004572	T	6	6	58443	58448	0 %	100 %	0 %	0 %	28493024
1064	NC_004572	CCG	2	6	58592	58597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28493024
1065	NC_004572	GCT	2	6	58646	58651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493024
1066	NC_004572	GCCC	2	8	58661	58668	0 %	0 %	25 %	75 %	28493024
1067	NC_004572	TGGTA	2	10	58705	58714	20 %	40 %	40 %	0 %	28493024
1068	NC_004572	AGA	2	6	58750	58755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28493024
1069	NC_004572	AG	4	8	58796	58803	50 %	0 %	50 %	0 %	28493024
1070	NC_004572	CAA	2	6	58806	58811	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28493024
1071	NC_004572	CCT	2	6	58843	58848	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1072	NC_004572	TAG	2	6	58910	58915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_004572	AAAG	2	8	58923	58930	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_004572	ATT	2	6	58994	58999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_004572	CTG	2	6	59012	59017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1076	NC_004572	AAT	2	6	59090	59095	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28493025
1077	NC_004572	ATC	2	6	59117	59122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28493025
1078	NC_004572	TAT	2	6	59123	59128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28493025
1079	NC_004572	T	7	7	59177	59183	0 %	100 %	0 %	0 %	28493025
1080	NC_004572	GA	3	6	59297	59302	50 %	0 %	50 %	0 %	28493025
1081	NC_004572	CGT	2	6	59348	59353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493025
1082	NC_004572	TCG	2	6	59358	59363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493025
1083	NC_004572	CTG	2	6	59381	59386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493025
1084	NC_004572	CTT	2	6	59497	59502	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28493025
1085	NC_004572	TGC	2	6	59655	59660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493025
1086	NC_004572	A	6	6	59712	59717	100 %	0 %	0 %	0 %	28493025
1087	NC_004572	AAT	2	6	59744	59749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28493025
1088	NC_004572	T	6	6	59802	59807	0 %	100 %	0 %	0 %	28493025
1089	NC_004572	GATA	3	12	59853	59864	50 %	25 %	25 %	0 %	28493025
1090	NC_004572	CAA	2	6	60011	60016	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28493026
1091	NC_004572	ATC	2	6	60109	60114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28493026
1092	NC_004572	CTT	2	6	60127	60132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28493026
1093	NC_004572	AATAAC	2	12	60192	60203	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	28493026
1094	NC_004572	TTA	2	6	60260	60265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28493026
1095	NC_004572	CTGA	2	8	60300	60307	25 %	25 %	25 %	25 %	28493026
1096	NC_004572	ATT	2	6	60352	60357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28493026
1097	NC_004572	CAA	2	6	60437	60442	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28493026
1098	NC_004572	TTCT	2	8	60479	60486	0 %	75 %	0 %	25 %	28493026
1099	NC_004572	CCA	2	6	60487	60492	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28493026
1100	NC_004572	TAT	2	6	60507	60512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28493026
1101	NC_004572	AAT	2	6	60543	60548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28493026
1102	NC_004572	CTGA	2	8	60742	60749	25 %	25 %	25 %	25 %	28493026
1103	NC_004572	ACC	2	6	60793	60798	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28493026
1104	NC_004572	CAGT	2	8	60979	60986	25 %	25 %	25 %	25 %	28493026
1105	NC_004572	CAAA	2	8	61007	61014	75 %	0 %	0 %	25 %	28493026
1106	NC_004572	AAT	2	6	61019	61024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28493027
1107	NC_004572	AT	3	6	61137	61142	50 %	50 %	0 %	0 %	28493027
1108	NC_004572	TCA	3	9	61216	61224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28493027
1109	NC_004572	T	7	7	61282	61288	0 %	100 %	0 %	0 %	28493027
1110	NC_004572	TTA	2	6	61342	61347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28493027
1111	NC_004572	AATAA	2	10	61433	61442	80 %	20 %	0 %	0 %	28493027
1112	NC_004572	CAG	2	6	61450	61455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28493027
1113	NC_004572	CCAA	2	8	61512	61519	50 %	0 %	0 %	50 %	28493027
1114	NC_004572	AGC	2	6	61563	61568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28493027
1115	NC_004572	TGC	2	6	61628	61633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493027
1116	NC_004572	CAA	2	6	61636	61641	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28493027
1117	NC_004572	GTC	2	6	61697	61702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493027
1118	NC_004572	TCAA	2	8	61722	61729	50 %	25 %	0 %	25 %	28493027
1119	NC_004572	ACG	2	6	61785	61790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28493027
1120	NC_004572	CA	3	6	61829	61834	50 %	0 %	0 %	50 %	28493027
1121	NC_004572	TCTT	2	8	61881	61888	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1122	NC_004572	CTT	2	6	61958	61963	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1123	NC_004572	GAA	2	6	61971	61976	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_004572	GAC	2	6	62115	62120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1125	NC_004572	CCTT	2	8	62122	62129	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1126	NC_004572	CAAC	2	8	62228	62235	50 %	0 %	0 %	50 %	28493028
1127	NC_004572	TTA	2	6	62262	62267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28493028
1128	NC_004572	CATG	2	8	62272	62279	25 %	25 %	25 %	25 %	28493028
1129	NC_004572	TC	3	6	62428	62433	0 %	50 %	0 %	50 %	28493028
1130	NC_004572	ATA	2	6	62455	62460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28493028
1131	NC_004572	TAT	2	6	62496	62501	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28493028
1132	NC_004572	TGT	2	6	62528	62533	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493028
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1134	NC_004572	TGG	2	6	62656	62661	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_004572	ACA	2	6	62690	62695	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1138	NC_004572	T	6	6	63002	63007	0 %	100 %	0 %	0 %	28493029
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1255	NC_004572	CTT	2	6	69906	69911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1256	NC_004572	TGC	2	6	69954	69959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1257	NC_004572	CAA	2	6	70072	70077	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28493033
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1331	NC_004572	GCTA	2	8	73622	73629	25 %	25 %	25 %	25 %	28493037
1332	NC_004572	CG	3	6	73722	73727	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1497	NC_004572	TGG	2	6	83198	83203	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28493041
1498	NC_004572	GTT	2	6	83265	83270	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493041
1499	NC_004572	GTT	2	6	83324	83329	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1500	NC_004572	TGG	2	6	83527	83532	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28493042

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