MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Tropheryma whipplei str. Twist

Total Repeats: 17134

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_004572	GCCT	2	8	27394	27401	0 %	25 %	25 %	50 %	28492993
502	NC_004572	TGG	2	6	27451	27456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28492993
503	NC_004572	TGT	2	6	27463	27468	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28492993
504	NC_004572	GACG	2	8	27485	27492	25 %	0 %	50 %	25 %	28492993
505	NC_004572	CATC	2	8	27606	27613	25 %	25 %	0 %	50 %	28492993
506	NC_004572	ACAA	2	8	27640	27647	75 %	0 %	0 %	25 %	28492993
507	NC_004572	CGGG	2	8	27699	27706	0 %	0 %	75 %	25 %	28492993
508	NC_004572	CAC	2	6	27724	27729	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28492993
509	NC_004572	TGT	2	6	27841	27846	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28492993
510	NC_004572	GAAC	2	8	27898	27905	50 %	0 %	25 %	25 %	28492993
511	NC_004572	AAC	2	6	27969	27974	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28492993
512	NC_004572	AT	3	6	28044	28049	50 %	50 %	0 %	0 %	28492993
513	NC_004572	TCAAT	2	10	28050	28059	40 %	40 %	0 %	20 %	28492993
514	NC_004572	AG	3	6	28076	28081	50 %	0 %	50 %	0 %	28492993
515	NC_004572	AT	3	6	28113	28118	50 %	50 %	0 %	0 %	28492993
516	NC_004572	TGT	2	6	28156	28161	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28492993
517	NC_004572	ACA	2	6	28180	28185	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28492993
518	NC_004572	GAA	2	6	28202	28207	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28492993
519	NC_004572	GA	3	6	28222	28227	50 %	0 %	50 %	0 %	28492993
520	NC_004572	TGG	2	6	28309	28314	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
521	NC_004572	GCA	2	6	28432	28437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28492994
522	NC_004572	AT	3	6	28443	28448	50 %	50 %	0 %	0 %	28492994
523	NC_004572	TGT	2	6	28462	28467	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28492994
524	NC_004572	GAT	2	6	28492	28497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28492994
525	NC_004572	GCT	2	6	28544	28549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28492994
526	NC_004572	ATCA	2	8	28821	28828	50 %	25 %	0 %	25 %	28492994
527	NC_004572	GCACG	2	10	29036	29045	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
528	NC_004572	AGGA	2	8	29183	29190	50 %	0 %	50 %	0 %	28492995
529	NC_004572	GA	3	6	29219	29224	50 %	0 %	50 %	0 %	28492995
530	NC_004572	A	6	6	29227	29232	100 %	0 %	0 %	0 %	28492995
531	NC_004572	AAG	2	6	29252	29257	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28492995
532	NC_004572	CAG	2	6	29268	29273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28492995
533	NC_004572	CCGA	2	8	29339	29346	25 %	0 %	25 %	50 %	28492995
534	NC_004572	CCGC	2	8	29360	29367	0 %	0 %	25 %	75 %	28492995
535	NC_004572	AGA	2	6	29416	29421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28492995
536	NC_004572	CAA	2	6	29427	29432	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28492995
537	NC_004572	CTC	2	6	29494	29499	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	28492995
538	NC_004572	GCC	2	6	29555	29560	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
539	NC_004572	CAGTA	2	10	29662	29671	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
540	NC_004572	ACACA	2	10	29672	29681	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
541	NC_004572	AGA	2	6	29755	29760	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
542	NC_004572	TGTA	2	8	29789	29796	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
543	NC_004572	TAC	2	6	29798	29803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
544	NC_004572	ACT	2	6	29810	29815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28492996
545	NC_004572	AC	3	6	29841	29846	50 %	0 %	0 %	50 %	28492996
546	NC_004572	CAT	2	6	29859	29864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28492996
547	NC_004572	CAT	2	6	29916	29921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28492996
548	NC_004572	AAT	2	6	29983	29988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28492996
549	NC_004572	GTT	2	6	30044	30049	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28492996
550	NC_004572	TGTT	2	8	30057	30064	0 %	75 %	25 %	0 %	28492996
551	NC_004572	AAG	2	6	30100	30105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28492996
552	NC_004572	GTTG	2	8	30137	30144	0 %	50 %	50 %	0 %	28492996
553	NC_004572	AAC	2	6	30160	30165	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28492996
554	NC_004572	GAT	2	6	30250	30255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28492996
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556	NC_004572	CAG	2	6	30297	30302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28492996
557	NC_004572	TCT	2	6	30344	30349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28492996
558	NC_004572	A	6	6	30375	30380	100 %	0 %	0 %	0 %	28492996
559	NC_004572	ACT	2	6	30401	30406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28492996
560	NC_004572	TGC	2	6	30421	30426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28492996
561	NC_004572	GCA	2	6	30476	30481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28492996
562	NC_004572	GCA	2	6	30512	30517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28492996
563	NC_004572	AATT	2	8	30519	30526	50 %	50 %	0 %	0 %	28492996
564	NC_004572	GGC	2	6	30544	30549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28492996
565	NC_004572	CT	3	6	30605	30610	0 %	50 %	0 %	50 %	28492996
566	NC_004572	ACC	2	6	30643	30648	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28492996
567	NC_004572	GCC	2	6	30682	30687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28492997
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570	NC_004572	ATTG	2	8	30732	30739	25 %	50 %	25 %	0 %	28492997
571	NC_004572	AC	3	6	30806	30811	50 %	0 %	0 %	50 %	28492997
572	NC_004572	AAT	2	6	30885	30890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28492997
573	NC_004572	CTCAA	2	10	30910	30919	40 %	20 %	0 %	40 %	28492997
574	NC_004572	C	6	6	30921	30926	0 %	0 %	0 %	100 %	28492997
575	NC_004572	TCA	2	6	30991	30996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28492997
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579	NC_004572	TCA	2	6	31270	31275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28492997
580	NC_004572	AT	3	6	31280	31285	50 %	50 %	0 %	0 %	28492997
581	NC_004572	GCA	2	6	31312	31317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28492997
582	NC_004572	GCC	2	6	31328	31333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28492997
583	NC_004572	TCA	2	6	31456	31461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28492997
584	NC_004572	CGA	2	6	31494	31499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28492997
585	NC_004572	CACTGT	2	12	31551	31562	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	28492997
586	NC_004572	ATT	2	6	31710	31715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
587	NC_004572	TGCA	2	8	31742	31749	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
588	NC_004572	CAC	2	6	31757	31762	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
589	NC_004572	AGT	2	6	31784	31789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
590	NC_004572	GCT	2	6	31798	31803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
591	NC_004572	AAG	2	6	32062	32067	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28492998
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593	NC_004572	TG	3	6	32126	32131	0 %	50 %	50 %	0 %	28492998
594	NC_004572	ACT	2	6	32294	32299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28492998
595	NC_004572	GA	3	6	32327	32332	50 %	0 %	50 %	0 %	28492998
596	NC_004572	ACT	2	6	32380	32385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28492998
597	NC_004572	TGC	3	9	32412	32420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28492998
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599	NC_004572	AC	3	6	32506	32511	50 %	0 %	0 %	50 %	28492998
600	NC_004572	TAT	2	6	32590	32595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28492999
601	NC_004572	TGG	2	6	32602	32607	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28492999
602	NC_004572	GAT	2	6	32677	32682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28492999
603	NC_004572	TAT	2	6	32684	32689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28492999
604	NC_004572	ATG	2	6	32705	32710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28492999
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606	NC_004572	AT	3	6	32907	32912	50 %	50 %	0 %	0 %	28492999
607	NC_004572	GTT	2	6	33011	33016	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28492999
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609	NC_004572	TTTA	2	8	33186	33193	25 %	75 %	0 %	0 %	28492999
610	NC_004572	GTTG	2	8	33320	33327	0 %	50 %	50 %	0 %	28492999
611	NC_004572	TGGA	2	8	33352	33359	25 %	25 %	50 %	0 %	28492999
612	NC_004572	GAT	3	9	33362	33370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28492999
613	NC_004572	CCT	2	6	33430	33435	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	28492999
614	NC_004572	ACT	2	6	33467	33472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28493000
615	NC_004572	T	7	7	33546	33552	0 %	100 %	0 %	0 %	28493000
616	NC_004572	A	8	8	33594	33601	100 %	0 %	0 %	0 %	28493000
617	NC_004572	A	6	6	33720	33725	100 %	0 %	0 %	0 %	28493000
618	NC_004572	ATG	2	6	33769	33774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28493000
619	NC_004572	AT	3	6	33863	33868	50 %	50 %	0 %	0 %	28493000
620	NC_004572	GGAT	2	8	33921	33928	25 %	25 %	50 %	0 %	28493000
621	NC_004572	AG	3	6	34001	34006	50 %	0 %	50 %	0 %	28493000
622	NC_004572	CAA	2	6	34196	34201	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28493000
623	NC_004572	ACTC	2	8	34209	34216	25 %	25 %	0 %	50 %	28493000
624	NC_004572	A	6	6	34246	34251	100 %	0 %	0 %	0 %	28493000
625	NC_004572	TC	3	6	34252	34257	0 %	50 %	0 %	50 %	28493000
626	NC_004572	TCATTG	2	12	34307	34318	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	28493000
627	NC_004572	TGT	2	6	34352	34357	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493001
628	NC_004572	TAG	2	6	34362	34367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28493001
629	NC_004572	T	7	7	34491	34497	0 %	100 %	0 %	0 %	28493001
630	NC_004572	TCA	2	6	34527	34532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28493001
631	NC_004572	CAA	2	6	34535	34540	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28493001
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633	NC_004572	ATAC	2	8	34586	34593	50 %	25 %	0 %	25 %	28493001
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