MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Tropheryma whipplei str. Twist

Total Repeats: 17134

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_004572	CGG	2	6	317012	317017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28493196
6002	NC_004572	CAC	2	6	317119	317124	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28493196
6003	NC_004572	AGA	2	6	317218	317223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28493196
6004	NC_004572	GAT	2	6	317275	317280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28493196
6005	NC_004572	CAC	2	6	317287	317292	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28493196
6006	NC_004572	GCA	2	6	317334	317339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28493196
6007	NC_004572	GCA	2	6	317458	317463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28493196
6008	NC_004572	ATT	2	6	317497	317502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28493196
6009	NC_004572	CA	3	6	317554	317559	50 %	0 %	0 %	50 %	28493196
6010	NC_004572	T	7	7	317565	317571	0 %	100 %	0 %	0 %	28493196
6011	NC_004572	CTTT	2	8	317729	317736	0 %	75 %	0 %	25 %	28493197
6012	NC_004572	AGC	2	6	317746	317751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28493197
6013	NC_004572	AGG	2	6	317796	317801	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28493197
6014	NC_004572	TGGC	2	8	317887	317894	0 %	25 %	50 %	25 %	28493197
6015	NC_004572	GAT	2	6	317913	317918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28493197
6016	NC_004572	TTG	2	6	317962	317967	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493197
6017	NC_004572	A	6	6	317984	317989	100 %	0 %	0 %	0 %	28493197
6018	NC_004572	AGG	2	6	318013	318018	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28493197
6019	NC_004572	AG	3	6	318089	318094	50 %	0 %	50 %	0 %	28493197
6020	NC_004572	AGC	2	6	318199	318204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28493197
6021	NC_004572	TTG	2	6	318205	318210	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493197
6022	NC_004572	TGGG	2	8	318218	318225	0 %	25 %	75 %	0 %	28493197
6023	NC_004572	A	6	6	318252	318257	100 %	0 %	0 %	0 %	28493197
6024	NC_004572	AGT	2	6	318405	318410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28493197
6025	NC_004572	CAG	2	6	318436	318441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28493197
6026	NC_004572	TG	4	8	318481	318488	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6027	NC_004572	ATC	2	6	318540	318545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28493198
6028	NC_004572	TTC	2	6	318554	318559	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28493198
6029	NC_004572	TCT	2	6	318561	318566	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28493198
6030	NC_004572	TGC	2	6	318674	318679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493198
6031	NC_004572	TGT	2	6	318701	318706	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493198
6032	NC_004572	GTAA	2	8	318794	318801	50 %	25 %	25 %	0 %	28493198
6033	NC_004572	ATC	2	6	318875	318880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28493198
6034	NC_004572	TTGCA	2	10	318918	318927	20 %	40 %	20 %	20 %	28493198
6035	NC_004572	TGA	2	6	318934	318939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28493198
6036	NC_004572	TGCA	2	8	318944	318951	25 %	25 %	25 %	25 %	28493198
6037	NC_004572	GAAA	2	8	319025	319032	75 %	0 %	25 %	0 %	28493199
6038	NC_004572	TGT	3	9	319091	319099	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493199
6039	NC_004572	TGT	2	6	319262	319267	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493200
6040	NC_004572	T	7	7	319286	319292	0 %	100 %	0 %	0 %	28493200
6041	NC_004572	TTG	2	6	319297	319302	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493200
6042	NC_004572	TG	3	6	319309	319314	0 %	50 %	50 %	0 %	28493200
6043	NC_004572	TTC	2	6	319343	319348	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28493200
6044	NC_004572	CTG	2	6	319374	319379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493200
6045	NC_004572	CTT	2	6	319380	319385	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28493200
6046	NC_004572	T	6	6	319413	319418	0 %	100 %	0 %	0 %	28493200
6047	NC_004572	TG	3	6	319532	319537	0 %	50 %	50 %	0 %	28493200
6048	NC_004572	CTT	2	6	319618	319623	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28493200
6049	NC_004572	T	7	7	319710	319716	0 %	100 %	0 %	0 %	28493200
6050	NC_004572	G	6	6	319753	319758	0 %	0 %	100 %	0 %	28493201
6051	NC_004572	TGC	2	6	319808	319813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493201
6052	NC_004572	TCTT	2	8	319814	319821	0 %	75 %	0 %	25 %	28493201
6053	NC_004572	GAG	2	6	319842	319847	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28493201
6054	NC_004572	GCC	2	6	319868	319873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28493201
6055	NC_004572	CGGGG	2	10	319874	319883	0 %	0 %	80 %	20 %	28493201
6056	NC_004572	GTG	2	6	319900	319905	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28493201
6057	NC_004572	CTTG	2	8	319925	319932	0 %	50 %	25 %	25 %	28493201
6058	NC_004572	TGA	2	6	319982	319987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28493201
6059	NC_004572	GTT	2	6	320043	320048	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493201
6060	NC_004572	GCA	2	6	320081	320086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28493201
6061	NC_004572	TG	3	6	320107	320112	0 %	50 %	50 %	0 %	28493201
6062	NC_004572	T	6	6	320151	320156	0 %	100 %	0 %	0 %	28493201
6063	NC_004572	TCT	2	6	320189	320194	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28493202
6064	NC_004572	A	6	6	320202	320207	100 %	0 %	0 %	0 %	28493202
6065	NC_004572	A	6	6	320249	320254	100 %	0 %	0 %	0 %	28493202
6066	NC_004572	CAT	2	6	320271	320276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28493202
6067	NC_004572	AGA	2	6	320293	320298	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28493202
6068	NC_004572	TTA	2	6	320307	320312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28493202
6069	NC_004572	CTG	2	6	320352	320357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493202
6070	NC_004572	CGA	2	6	320395	320400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28493202
6071	NC_004572	ATT	2	6	320417	320422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28493202
6072	NC_004572	ACT	2	6	320459	320464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28493202
6073	NC_004572	GCG	2	6	320479	320484	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28493202
6074	NC_004572	GAG	2	6	320486	320491	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28493202
6075	NC_004572	GAA	2	6	320614	320619	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28493202
6076	NC_004572	A	7	7	320654	320660	100 %	0 %	0 %	0 %	28493202
6077	NC_004572	TTC	2	6	320697	320702	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28493202
6078	NC_004572	AAGG	2	8	320713	320720	50 %	0 %	50 %	0 %	28493202
6079	NC_004572	CATT	2	8	320738	320745	25 %	50 %	0 %	25 %	28493202
6080	NC_004572	CTC	2	6	320753	320758	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	28493202
6081	NC_004572	AAT	2	6	320759	320764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28493202
6082	NC_004572	A	6	6	320801	320806	100 %	0 %	0 %	0 %	28493202
6083	NC_004572	T	6	6	320809	320814	0 %	100 %	0 %	0 %	28493202
6084	NC_004572	GAG	2	6	320895	320900	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6085	NC_004572	GTT	2	6	320954	320959	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493203
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6087	NC_004572	AGG	2	6	321036	321041	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28493203
6088	NC_004572	AT	3	6	321065	321070	50 %	50 %	0 %	0 %	28493203
6089	NC_004572	GGC	2	6	321105	321110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28493203
6090	NC_004572	AGC	2	6	321156	321161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28493203
6091	NC_004572	TCTA	2	8	321222	321229	25 %	50 %	0 %	25 %	28493203
6092	NC_004572	TTC	2	6	321303	321308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28493203
6093	NC_004572	GA	3	6	321359	321364	50 %	0 %	50 %	0 %	28493203
6094	NC_004572	CTGT	2	8	321388	321395	0 %	50 %	25 %	25 %	28493204
6095	NC_004572	TGA	2	6	321406	321411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28493204
6096	NC_004572	GCATAA	2	12	321447	321458	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	28493204
6097	NC_004572	AGG	2	6	321557	321562	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28493204
6098	NC_004572	AG	3	6	321649	321654	50 %	0 %	50 %	0 %	28493204
6099	NC_004572	CT	3	6	321778	321783	0 %	50 %	0 %	50 %	28493204
6100	NC_004572	AG	3	6	321805	321810	50 %	0 %	50 %	0 %	28493204
6101	NC_004572	T	6	6	321844	321849	0 %	100 %	0 %	0 %	28493205
6102	NC_004572	GT	3	6	321862	321867	0 %	50 %	50 %	0 %	28493205
6103	NC_004572	CA	3	6	321882	321887	50 %	0 %	0 %	50 %	28493205
6104	NC_004572	TGC	2	6	322000	322005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493205
6105	NC_004572	TAA	2	6	322102	322107	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28493205
6106	NC_004572	A	6	6	322106	322111	100 %	0 %	0 %	0 %	28493205
6107	NC_004572	AAT	2	6	322166	322171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28493205
6108	NC_004572	A	6	6	322182	322187	100 %	0 %	0 %	0 %	28493205
6109	NC_004572	AAT	2	6	322234	322239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28493205
6110	NC_004572	TAC	2	6	322410	322415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28493205
6111	NC_004572	AACA	2	8	322495	322502	75 %	0 %	0 %	25 %	28493205
6112	NC_004572	GCT	2	6	322507	322512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493205
6113	NC_004572	GTT	2	6	322538	322543	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493205
6114	NC_004572	GAAT	2	8	322579	322586	50 %	25 %	25 %	0 %	28493205
6115	NC_004572	TGG	2	6	322600	322605	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28493205
6116	NC_004572	AAAG	2	8	322625	322632	75 %	0 %	25 %	0 %	28493205
6117	NC_004572	TCG	2	6	322657	322662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493205
6118	NC_004572	TAT	2	6	322687	322692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28493205
6119	NC_004572	AG	3	6	322729	322734	50 %	0 %	50 %	0 %	28493205
6120	NC_004572	GTC	2	6	322824	322829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493205
6121	NC_004572	TCT	2	6	322916	322921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6122	NC_004572	TTTA	2	8	322937	322944	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6123	NC_004572	CCAG	2	8	322976	322983	25 %	0 %	25 %	50 %	28493206
6124	NC_004572	GTT	2	6	323015	323020	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493206
6125	NC_004572	ATT	2	6	323133	323138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28493206
6126	NC_004572	TAA	2	6	323218	323223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28493206
6127	NC_004572	CAGAAT	2	12	323240	323251	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	28493206
6128	NC_004572	AAG	2	6	323279	323284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28493206
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6147	NC_004572	AATA	2	8	324013	324020	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6249	NC_004572	CT	4	8	329295	329302	0 %	50 %	0 %	50 %	28493213
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