MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Tropheryma whipplei str. Twist

Total Repeats: 17134

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_004572	GACA	2	8	266360	266367	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5002	NC_004572	AAC	2	6	266400	266405	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5003	NC_004572	CA	3	6	266413	266418	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5004	NC_004572	GGCC	2	8	266420	266427	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5005	NC_004572	GA	3	6	266468	266473	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_004572	TTG	2	6	266504	266509	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5007	NC_004572	CG	3	6	266591	266596	0 %	0 %	50 %	50 %	28493166
5008	NC_004572	T	6	6	266643	266648	0 %	100 %	0 %	0 %	28493166
5009	NC_004572	TCG	2	6	266745	266750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493166
5010	NC_004572	TTGGA	2	10	266888	266897	20 %	40 %	40 %	0 %	28493166
5011	NC_004572	CGG	2	6	266931	266936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28493166
5012	NC_004572	AGC	2	6	266939	266944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28493166
5013	NC_004572	AAAC	2	8	266973	266980	75 %	0 %	0 %	25 %	28493166
5014	NC_004572	G	6	6	267070	267075	0 %	0 %	100 %	0 %	28493166
5015	NC_004572	GTCA	2	8	267142	267149	25 %	25 %	25 %	25 %	28493166
5016	NC_004572	AAG	2	6	267218	267223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28493166
5017	NC_004572	CAA	2	6	267239	267244	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28493166
5018	NC_004572	GCA	2	6	267253	267258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28493166
5019	NC_004572	ATAAC	2	10	267287	267296	60 %	20 %	0 %	20 %	28493166
5020	NC_004572	ATT	2	6	267375	267380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28493166
5021	NC_004572	GACA	2	8	267490	267497	50 %	0 %	25 %	25 %	28493166
5022	NC_004572	CA	3	6	267598	267603	50 %	0 %	0 %	50 %	28493166
5023	NC_004572	A	6	6	267635	267640	100 %	0 %	0 %	0 %	28493166
5024	NC_004572	GACA	2	8	267647	267654	50 %	0 %	25 %	25 %	28493166
5025	NC_004572	A	6	6	267690	267695	100 %	0 %	0 %	0 %	28493166
5026	NC_004572	GACA	2	8	267702	267709	50 %	0 %	25 %	25 %	28493166
5027	NC_004572	ACA	2	6	267752	267757	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28493166
5028	NC_004572	ACA	2	6	267787	267792	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28493166
5029	NC_004572	CCAG	2	8	267853	267860	25 %	0 %	25 %	50 %	28493166
5030	NC_004572	GAT	2	6	267898	267903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28493166
5031	NC_004572	AAT	2	6	267943	267948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28493166
5032	NC_004572	AT	3	6	267953	267958	50 %	50 %	0 %	0 %	28493166
5033	NC_004572	TGT	2	6	267968	267973	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493166
5034	NC_004572	TAT	2	6	267998	268003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28493166
5035	NC_004572	GTG	2	6	268043	268048	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28493166
5036	NC_004572	CGC	2	6	268068	268073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28493166
5037	NC_004572	GC	3	6	268078	268083	0 %	0 %	50 %	50 %	28493166
5038	NC_004572	CTC	2	6	268091	268096	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	28493166
5039	NC_004572	TG	3	6	268148	268153	0 %	50 %	50 %	0 %	28493166
5040	NC_004572	CAA	2	6	268253	268258	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28493166
5041	NC_004572	CAGTA	2	10	268373	268382	40 %	20 %	20 %	20 %	28493166
5042	NC_004572	GCAGC	2	10	268429	268438	20 %	0 %	40 %	40 %	28493166
5043	NC_004572	CA	3	6	268463	268468	50 %	0 %	0 %	50 %	28493166
5044	NC_004572	GACA	2	8	268498	268505	50 %	0 %	25 %	25 %	28493166
5045	NC_004572	GAG	2	6	268549	268554	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28493166
5046	NC_004572	CTAT	2	8	268576	268583	25 %	50 %	0 %	25 %	28493166
5047	NC_004572	CAG	3	9	268595	268603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28493166
5048	NC_004572	CA	3	6	268656	268661	50 %	0 %	0 %	50 %	28493166
5049	NC_004572	ACA	2	6	268679	268684	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28493166
5050	NC_004572	AC	3	6	268704	268709	50 %	0 %	0 %	50 %	28493166
5051	NC_004572	GCG	2	6	268713	268718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28493166
5052	NC_004572	GACA	2	8	268746	268753	50 %	0 %	25 %	25 %	28493166
5053	NC_004572	CA	3	6	268784	268789	50 %	0 %	0 %	50 %	28493166
5054	NC_004572	GCA	2	6	268792	268797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28493166
5055	NC_004572	ACA	2	6	268859	268864	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28493166
5056	NC_004572	A	6	6	268871	268876	100 %	0 %	0 %	0 %	28493166
5057	NC_004572	GACA	2	8	268938	268945	50 %	0 %	25 %	25 %	28493166
5058	NC_004572	GCG	2	6	268988	268993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28493166
5059	NC_004572	CA	3	6	269041	269046	50 %	0 %	0 %	50 %	28493166
5060	NC_004572	AC	3	6	269050	269055	50 %	0 %	0 %	50 %	28493166
5061	NC_004572	AC	4	8	269078	269085	50 %	0 %	0 %	50 %	28493166
5062	NC_004572	TTA	2	6	269101	269106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28493166
5063	NC_004572	CA	3	6	269207	269212	50 %	0 %	0 %	50 %	28493166
5064	NC_004572	CG	3	6	269227	269232	0 %	0 %	50 %	50 %	28493166
5065	NC_004572	GCA	2	6	269276	269281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5066	NC_004572	CGC	2	6	269322	269327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28493167
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5068	NC_004572	TCAA	2	8	269483	269490	50 %	25 %	0 %	25 %	28493167
5069	NC_004572	GCGT	2	8	269530	269537	0 %	25 %	50 %	25 %	28493167
5070	NC_004572	TAT	2	6	269580	269585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28493167
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5072	NC_004572	TCG	2	6	269644	269649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493167
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5077	NC_004572	TTG	2	6	269929	269934	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493167
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5084	NC_004572	AGGC	2	8	270336	270343	25 %	0 %	50 %	25 %	28493168
5085	NC_004572	A	6	6	270384	270389	100 %	0 %	0 %	0 %	28493168
5086	NC_004572	GTCT	2	8	270393	270400	0 %	50 %	25 %	25 %	28493168
5087	NC_004572	G	6	6	270469	270474	0 %	0 %	100 %	0 %	28493168
5088	NC_004572	CG	3	6	270605	270610	0 %	0 %	50 %	50 %	28493168
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5093	NC_004572	TAA	2	6	270868	270873	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5094	NC_004572	T	6	6	270915	270920	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5095	NC_004572	ATT	2	6	270943	270948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5096	NC_004572	TA	3	6	270952	270957	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5097	NC_004572	ATT	2	6	270965	270970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5098	NC_004572	ATT	2	6	270983	270988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5099	NC_004572	TAA	2	6	270994	270999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5100	NC_004572	ACT	2	6	271007	271012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5101	NC_004572	GT	3	6	271047	271052	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5102	NC_004572	AC	3	6	271099	271104	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5103	NC_004572	AACA	2	8	271141	271148	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5104	NC_004572	GTA	2	6	271164	271169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5105	NC_004572	TGT	2	6	271191	271196	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5106	NC_004572	ACAT	2	8	271197	271204	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5107	NC_004572	TACA	2	8	271214	271221	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5108	NC_004572	ACA	2	6	271252	271257	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5109	NC_004572	TACA	2	8	271266	271273	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5110	NC_004572	TG	3	6	271283	271288	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5111	NC_004572	ACAT	2	8	271302	271309	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5112	NC_004572	ACATAA	2	12	271313	271324	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5113	NC_004572	GTT	2	6	271359	271364	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5114	NC_004572	AAC	2	6	271381	271386	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5115	NC_004572	AAC	2	6	271503	271508	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5116	NC_004572	GTA	2	6	271542	271547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5117	NC_004572	AG	4	8	271566	271573	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5118	NC_004572	A	6	6	271593	271598	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5119	NC_004572	CT	4	8	271612	271619	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5120	NC_004572	TCC	2	6	271657	271662	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5121	NC_004572	ATC	2	6	271664	271669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5122	NC_004572	CAGA	2	8	271694	271701	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5123	NC_004572	CCT	2	6	271704	271709	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5124	NC_004572	ATC	2	6	271724	271729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5125	NC_004572	AGTA	2	8	271772	271779	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5126	NC_004572	AAG	2	6	271792	271797	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5127	NC_004572	AAC	2	6	271805	271810	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5128	NC_004572	TC	3	6	271824	271829	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5129	NC_004572	ACAAA	2	10	271854	271863	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
5130	NC_004572	TC	3	6	271881	271886	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5131	NC_004572	AT	4	8	271906	271913	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5132	NC_004572	AT	3	6	271952	271957	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5281	NC_004572	TGTTA	2	10	279043	279052	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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5292	NC_004572	AC	4	8	279690	279697	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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5294	NC_004572	AC	3	6	279803	279808	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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5297	NC_004572	TA	3	6	279834	279839	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5392	NC_004572	TCCC	2	8	285502	285509	0 %	25 %	0 %	75 %	28493171
5393	NC_004572	AAG	2	6	285611	285616	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28493171
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