MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Tropheryma whipplei str. Twist

Total Repeats: 17134

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_004572	AAC	2	6	238947	238952	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28493155
4502	NC_004572	TTA	2	6	238953	238958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28493155
4503	NC_004572	ATT	2	6	239049	239054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28493155
4504	NC_004572	GGT	2	6	239117	239122	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28493155
4505	NC_004572	TAT	2	6	239236	239241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28493155
4506	NC_004572	CGTCA	2	10	239243	239252	20 %	20 %	20 %	40 %	28493155
4507	NC_004572	TG	3	6	239261	239266	0 %	50 %	50 %	0 %	28493155
4508	NC_004572	CCT	2	6	239277	239282	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	28493155
4509	NC_004572	AGA	2	6	239431	239436	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28493155
4510	NC_004572	AT	3	6	239505	239510	50 %	50 %	0 %	0 %	28493155
4511	NC_004572	TAA	2	6	239558	239563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28493155
4512	NC_004572	CGC	2	6	239657	239662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28493155
4513	NC_004572	GTGA	2	8	239795	239802	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4514	NC_004572	TTA	2	6	239847	239852	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4515	NC_004572	TA	3	6	239858	239863	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4516	NC_004572	AAGG	2	8	239866	239873	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4517	NC_004572	ATC	2	6	239885	239890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4518	NC_004572	AT	3	6	239998	240003	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4519	NC_004572	GAGG	2	8	240005	240012	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
4520	NC_004572	TAT	2	6	240120	240125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4521	NC_004572	CTGTG	2	10	240242	240251	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
4522	NC_004572	CTG	2	6	240274	240279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4523	NC_004572	AG	3	6	240300	240305	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4524	NC_004572	TCA	2	6	240354	240359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4525	NC_004572	TTAT	2	8	240385	240392	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4526	NC_004572	TGT	2	6	240526	240531	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4527	NC_004572	ATC	2	6	240578	240583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4528	NC_004572	AC	3	6	240596	240601	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4529	NC_004572	ATT	2	6	240617	240622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4530	NC_004572	TAC	2	6	240714	240719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4531	NC_004572	AGGT	2	8	240774	240781	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4532	NC_004572	CACT	2	8	240802	240809	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4533	NC_004572	CAAA	2	8	240832	240839	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4534	NC_004572	CCG	2	6	240860	240865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4535	NC_004572	ACC	2	6	240879	240884	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4536	NC_004572	TC	3	6	240888	240893	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4537	NC_004572	AC	3	6	240940	240945	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4538	NC_004572	AC	3	6	240954	240959	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4539	NC_004572	CAAACC	2	12	241014	241025	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4540	NC_004572	TCA	3	9	241094	241102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4541	NC_004572	GTA	2	6	241124	241129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4542	NC_004572	AACCC	2	10	241165	241174	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
4543	NC_004572	GT	3	6	241194	241199	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4544	NC_004572	ACT	2	6	241208	241213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4545	NC_004572	ATA	2	6	241279	241284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4546	NC_004572	CTGTG	2	10	241336	241345	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
4547	NC_004572	AT	3	6	241489	241494	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4548	NC_004572	CAGG	2	8	241496	241503	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4549	NC_004572	TTC	2	6	241556	241561	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4550	NC_004572	TGC	2	6	241578	241583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4551	NC_004572	GCT	2	6	241656	241661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4552	NC_004572	GGT	2	6	241835	241840	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4553	NC_004572	TCTA	2	8	241936	241943	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4554	NC_004572	TA	3	6	242006	242011	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4555	NC_004572	CTT	2	6	242013	242018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4556	NC_004572	CA	3	6	242049	242054	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4557	NC_004572	AC	3	6	242239	242244	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4558	NC_004572	AC	3	6	242285	242290	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4559	NC_004572	AC	3	6	242476	242481	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4560	NC_004572	TC	3	6	242510	242515	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4561	NC_004572	TA	3	6	242528	242533	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4562	NC_004572	GGT	2	6	242597	242602	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4563	NC_004572	CTA	2	6	242617	242622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4564	NC_004572	AT	3	6	242710	242715	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4565	NC_004572	CACAT	2	10	242736	242745	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
4566	NC_004572	GGT	2	6	242801	242806	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4567	NC_004572	TGA	2	6	242815	242820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4568	NC_004572	CCAA	2	8	242936	242943	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4569	NC_004572	ACACA	2	10	242999	243008	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
4570	NC_004572	TCA	2	6	243046	243051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4571	NC_004572	GCC	2	6	243143	243148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4572	NC_004572	AT	3	6	243164	243169	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4573	NC_004572	CA	3	6	243195	243200	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4574	NC_004572	CA	3	6	243321	243326	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4575	NC_004572	GTGCT	2	10	243335	243344	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
4576	NC_004572	ATG	2	6	243353	243358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4577	NC_004572	ATC	2	6	243395	243400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4578	NC_004572	CTG	2	6	243477	243482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4579	NC_004572	CCA	2	6	243522	243527	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4580	NC_004572	CCA	2	6	243539	243544	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4581	NC_004572	ATG	2	6	243560	243565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4582	NC_004572	TG	3	6	243564	243569	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4583	NC_004572	GAA	3	9	243630	243638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4584	NC_004572	TGTTA	2	10	243694	243703	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
4585	NC_004572	TGT	2	6	243738	243743	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4586	NC_004572	GCG	2	6	243877	243882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4587	NC_004572	AC	3	6	243949	243954	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4588	NC_004572	AT	3	6	243955	243960	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4589	NC_004572	CCA	2	6	243985	243990	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4590	NC_004572	CA	3	6	244040	244045	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4591	NC_004572	CTG	2	6	244096	244101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4592	NC_004572	TAT	2	6	244106	244111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4593	NC_004572	TAT	2	6	244120	244125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4594	NC_004572	CCTG	2	8	244163	244170	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4595	NC_004572	ATA	2	6	244260	244265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4596	NC_004572	CTG	2	6	244339	244344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4597	NC_004572	GGC	2	6	244402	244407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4598	NC_004572	TAC	2	6	244527	244532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4599	NC_004572	TA	3	6	244609	244614	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4600	NC_004572	CTT	2	6	244616	244621	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4601	NC_004572	ACA	2	6	244636	244641	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4602	NC_004572	ACT	2	6	244654	244659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4603	NC_004572	GGT	2	6	244660	244665	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4604	NC_004572	TAC	2	6	244731	244736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4605	NC_004572	ACTGCA	2	12	244759	244770	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
4606	NC_004572	TTC	2	6	244779	244784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4607	NC_004572	TA	3	6	244823	244828	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4608	NC_004572	TAC	2	6	244845	244850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4609	NC_004572	CTA	2	6	244951	244956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4610	NC_004572	CCA	2	6	245177	245182	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4611	NC_004572	CCA	2	6	245194	245199	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4612	NC_004572	ATG	2	6	245215	245220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4613	NC_004572	TG	3	6	245219	245224	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4614	NC_004572	TACCC	2	10	245297	245306	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
4615	NC_004572	CA	3	6	245348	245353	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4616	NC_004572	CG	3	6	245482	245487	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4617	NC_004572	TAA	2	6	245505	245510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4618	NC_004572	AC	3	6	245515	245520	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4619	NC_004572	AC	3	6	245551	245556	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4620	NC_004572	TAG	2	6	245623	245628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4621	NC_004572	ACA	2	6	245631	245636	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4622	NC_004572	ATA	2	6	245812	245817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4623	NC_004572	ATA	2	6	245969	245974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4624	NC_004572	CA	3	6	246008	246013	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4625	NC_004572	CA	4	8	246024	246031	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4626	NC_004572	CA	3	6	246056	246061	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4627	NC_004572	TGC	2	6	246165	246170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4628	NC_004572	CATTT	2	10	246174	246183	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
4629	NC_004572	TCC	2	6	246293	246298	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	28493156
4630	NC_004572	TGA	2	6	246464	246469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28493156
4631	NC_004572	AGA	2	6	246473	246478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28493156
4632	NC_004572	CAT	2	6	246533	246538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28493156
4633	NC_004572	TGA	2	6	246539	246544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28493156
4634	NC_004572	TGC	2	6	246667	246672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493156
4635	NC_004572	GCG	2	6	246683	246688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28493156
4636	NC_004572	TTG	2	6	246709	246714	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493156
4637	NC_004572	CTG	2	6	246850	246855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493156
4638	NC_004572	TCC	2	6	246858	246863	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	28493156
4639	NC_004572	T	6	6	246899	246904	0 %	100 %	0 %	0 %	28493156
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4644	NC_004572	TTG	2	6	247129	247134	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493156
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4648	NC_004572	CTTT	2	8	247549	247556	0 %	75 %	0 %	25 %	28493157
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4653	NC_004572	T	6	6	247751	247756	0 %	100 %	0 %	0 %	28493157
4654	NC_004572	CTG	2	6	247874	247879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493157
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4656	NC_004572	CT	3	6	247914	247919	0 %	50 %	0 %	50 %	28493157
4657	NC_004572	T	6	6	247952	247957	0 %	100 %	0 %	0 %	28493157
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4674	NC_004572	CA	3	6	248591	248596	50 %	0 %	0 %	50 %	28493158
4675	NC_004572	TCAG	2	8	248642	248649	25 %	25 %	25 %	25 %	28493158
4676	NC_004572	T	6	6	248713	248718	0 %	100 %	0 %	0 %	28493158
4677	NC_004572	A	6	6	248826	248831	100 %	0 %	0 %	0 %	28493158
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4683	NC_004572	AT	3	6	249302	249307	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4684	NC_004572	ATA	2	6	249341	249346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28493159
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4720	NC_004572	GTA	2	6	251161	251166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4724	NC_004572	AGC	2	6	251409	251414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4726	NC_004572	GTTGT	2	10	251466	251475	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
4727	NC_004572	TTG	2	6	251536	251541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4729	NC_004572	TGG	2	6	251659	251664	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4730	NC_004572	AAC	2	6	251728	251733	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4731	NC_004572	AC	4	8	251836	251843	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4732	NC_004572	TTGTG	2	10	251910	251919	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
4733	NC_004572	TGT	2	6	251948	251953	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4736	NC_004572	ACA	2	6	252008	252013	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4737	NC_004572	CTGTG	2	10	252163	252172	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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4739	NC_004572	CATATA	2	12	252265	252276	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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4743	NC_004572	ATC	2	6	252396	252401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4746	NC_004572	CAA	2	6	252437	252442	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4747	NC_004572	CCA	2	6	252473	252478	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4748	NC_004572	ATCA	2	8	252493	252500	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4749	NC_004572	ATCT	2	8	252533	252540	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4750	NC_004572	CAA	2	6	252638	252643	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4751	NC_004572	AT	3	6	252646	252651	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4752	NC_004572	CAA	2	6	252784	252789	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4753	NC_004572	TGG	2	6	252818	252823	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4755	NC_004572	CAA	2	6	252916	252921	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4756	NC_004572	TA	3	6	252938	252943	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4757	NC_004572	CTGC	2	8	253019	253026	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4758	NC_004572	CTG	2	6	253041	253046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4760	NC_004572	AT	3	6	253108	253113	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4761	NC_004572	ATCA	2	8	253150	253157	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4762	NC_004572	GTG	2	6	253230	253235	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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