MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Thermosynechococcus elongatus BP-1 chromosome

Total Repeats: 1483

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004113	GCGCG	2	10	642	651	0 %	0 %	60 %	40 %	22297545
2	NC_004113	CAATC	2	10	1527	1536	40 %	20 %	0 %	40 %	22297546
3	NC_004113	GGTTC	2	10	1603	1612	0 %	40 %	40 %	20 %	22297546
4	NC_004113	CCCCA	2	10	4918	4927	20 %	0 %	0 %	80 %	22297550
5	NC_004113	CGCTG	2	10	10000	10009	0 %	20 %	40 %	40 %	22297554
6	NC_004113	TCTTG	2	10	10331	10340	0 %	60 %	20 %	20 %	22297554
7	NC_004113	AGGCA	2	10	13387	13396	40 %	0 %	40 %	20 %	22297557
8	NC_004113	CAATT	2	10	13802	13811	40 %	40 %	0 %	20 %	22297558
9	NC_004113	ATTGA	2	10	14840	14849	40 %	40 %	20 %	0 %	22297559
10	NC_004113	CCCAG	2	10	15218	15227	20 %	0 %	20 %	60 %	22297559
11	NC_004113	ATCAC	2	10	16559	16568	40 %	20 %	0 %	40 %	22297560
12	NC_004113	CGGCG	2	10	17906	17915	0 %	0 %	60 %	40 %	22297562
13	NC_004113	GCCAA	2	10	19609	19618	40 %	0 %	20 %	40 %	22297564
14	NC_004113	GCATC	2	10	20150	20159	20 %	20 %	20 %	40 %	22297564
15	NC_004113	CGTTG	2	10	20662	20671	0 %	40 %	40 %	20 %	22297565
16	NC_004113	TTGGC	2	10	22295	22304	0 %	40 %	40 %	20 %	22297568
17	NC_004113	TAAAA	2	10	23116	23125	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_004113	CCGAA	2	10	27483	27492	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
19	NC_004113	AAGTG	2	10	27576	27585	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
20	NC_004113	AAGTG	2	10	28204	28213	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
21	NC_004113	GGATT	2	10	28281	28290	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
22	NC_004113	GATGG	2	10	29553	29562	20 %	20 %	60 %	0 %	22297575
23	NC_004113	AGAAA	2	10	31475	31484	80 %	0 %	20 %	0 %	22297576
24	NC_004113	TGAGT	2	10	32846	32855	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
25	NC_004113	AAGCC	2	10	34496	34505	40 %	0 %	20 %	40 %	22297581
26	NC_004113	TGGAT	2	10	35693	35702	20 %	40 %	40 %	0 %	22297584
27	NC_004113	TTGAG	2	10	35909	35918	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
28	NC_004113	CCCAG	2	10	36108	36117	20 %	0 %	20 %	60 %	22297585
29	NC_004113	TCCTG	2	10	36571	36580	0 %	40 %	20 %	40 %	22297585
30	NC_004113	TCATT	2	10	40477	40486	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_004113	AACCC	2	10	41779	41788	40 %	0 %	0 %	60 %	22297591
32	NC_004113	TGCAC	2	10	42050	42059	20 %	20 %	20 %	40 %	22297592
33	NC_004113	CTGTG	2	10	44905	44914	0 %	40 %	40 %	20 %	22297594
34	NC_004113	GAGCA	2	10	47345	47354	40 %	0 %	40 %	20 %	22297595
35	NC_004113	GGCGG	2	10	47851	47860	0 %	0 %	80 %	20 %	22297595
36	NC_004113	CCCCT	2	10	51971	51980	0 %	20 %	0 %	80 %	22297599
37	NC_004113	CGCAG	2	10	52555	52564	20 %	0 %	40 %	40 %	22297600
38	NC_004113	GATTT	2	10	53244	53253	20 %	60 %	20 %	0 %	22297601
39	NC_004113	ACCCA	2	10	53582	53591	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
40	NC_004113	CCGGT	2	10	53855	53864	0 %	20 %	40 %	40 %	22297602
41	NC_004113	AATTT	2	10	54522	54531	40 %	60 %	0 %	0 %	22297602
42	NC_004113	CTTTC	2	10	54572	54581	0 %	60 %	0 %	40 %	22297602
43	NC_004113	GTAGC	2	10	56356	56365	20 %	20 %	40 %	20 %	22297604
44	NC_004113	GGGGT	2	10	57430	57439	0 %	20 %	80 %	0 %	22297605
45	NC_004113	GGCGC	2	10	58386	58395	0 %	0 %	60 %	40 %	22297606
46	NC_004113	AAAAT	2	10	62637	62646	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_004113	AAATT	2	10	65972	65981	60 %	40 %	0 %	0 %	22297616
48	NC_004113	GCCAA	2	10	66397	66406	40 %	0 %	20 %	40 %	22297616
49	NC_004113	TCCAC	2	10	66850	66859	20 %	20 %	0 %	60 %	22297617
50	NC_004113	AGTTG	2	10	67669	67678	20 %	40 %	40 %	0 %	22297617
51	NC_004113	AGGCG	2	10	68296	68305	20 %	0 %	60 %	20 %	22297618
52	NC_004113	AGATC	2	10	69795	69804	40 %	20 %	20 %	20 %	22297620
53	NC_004113	AGGGC	2	10	70535	70544	20 %	0 %	60 %	20 %	22297621
54	NC_004113	CTCTA	2	10	78789	78798	20 %	40 %	0 %	40 %	22297636
55	NC_004113	CCCAG	2	10	78918	78927	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
56	NC_004113	CGCAA	2	10	79568	79577	40 %	0 %	20 %	40 %	22297638
57	NC_004113	CCCCA	2	10	81148	81157	20 %	0 %	0 %	80 %	22297641
58	NC_004113	TAGTG	2	10	81688	81697	20 %	40 %	40 %	0 %	22297642
59	NC_004113	TGGGC	2	10	82284	82293	0 %	20 %	60 %	20 %	22297643
60	NC_004113	GGTGA	2	10	84761	84770	20 %	20 %	60 %	0 %	22297648
61	NC_004113	CAGAT	2	10	90556	90565	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
62	NC_004113	CCTTG	2	10	94889	94898	0 %	40 %	20 %	40 %	22297659
63	NC_004113	TGGTG	2	10	102045	102054	0 %	40 %	60 %	0 %	22297669
64	NC_004113	GCGCC	2	10	102538	102547	0 %	0 %	40 %	60 %	22297669
65	NC_004113	ATTGG	2	10	102921	102930	20 %	40 %	40 %	0 %	22297669
66	NC_004113	TCTCT	2	10	104906	104915	0 %	60 %	0 %	40 %	22297671
67	NC_004113	CGCTG	2	10	107747	107756	0 %	20 %	40 %	40 %	22297672
68	NC_004113	GTTGA	2	10	108507	108516	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
69	NC_004113	CCCCA	2	10	112027	112036	20 %	0 %	0 %	80 %	22297675
70	NC_004113	GCGCG	2	10	113700	113709	0 %	0 %	60 %	40 %	22297677
71	NC_004113	TGGTG	2	10	114055	114064	0 %	40 %	60 %	0 %	22297677
72	NC_004113	TTTGG	2	10	114221	114230	0 %	60 %	40 %	0 %	22297677
73	NC_004113	TACGG	2	10	117738	117747	20 %	20 %	40 %	20 %	22297681
74	NC_004113	GCGGT	2	10	117871	117880	0 %	20 %	60 %	20 %	22297681
75	NC_004113	CCACC	2	10	118756	118765	20 %	0 %	0 %	80 %	22297683
76	NC_004113	TGAGT	2	10	120167	120176	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
77	NC_004113	CCCAT	2	10	120408	120417	20 %	20 %	0 %	60 %	22297684
78	NC_004113	TGGGG	2	10	120446	120455	0 %	20 %	80 %	0 %	22297684
79	NC_004113	GTGGC	2	10	125393	125402	0 %	20 %	60 %	20 %	22297688
80	NC_004113	TCGCT	2	10	126213	126222	0 %	40 %	20 %	40 %	22297689
81	NC_004113	TGCGC	2	10	128903	128912	0 %	20 %	40 %	40 %	22297691
82	NC_004113	GCGAC	2	10	131191	131200	20 %	0 %	40 %	40 %	22297694
83	NC_004113	CCGCT	2	10	138200	138209	0 %	20 %	20 %	60 %	22297697
84	NC_004113	CCACA	2	10	139993	140002	40 %	0 %	0 %	60 %	22297700
85	NC_004113	GGGCG	2	10	140710	140719	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
86	NC_004113	CCCTG	2	10	141816	141825	0 %	20 %	20 %	60 %	22297702
87	NC_004113	CAAAT	2	10	142012	142021	60 %	20 %	0 %	20 %	22297702
88	NC_004113	AGCCC	2	10	142131	142140	20 %	0 %	20 %	60 %	22297702
89	NC_004113	CAAAC	2	10	143385	143394	60 %	0 %	0 %	40 %	22297704
90	NC_004113	CTGTG	2	10	143397	143406	0 %	40 %	40 %	20 %	22297704
91	NC_004113	GTGCT	2	10	148883	148892	0 %	40 %	40 %	20 %	22297712
92	NC_004113	GGGTC	2	10	150033	150042	0 %	20 %	60 %	20 %	22297714
93	NC_004113	TTGAT	2	10	152024	152033	20 %	60 %	20 %	0 %	22297716
94	NC_004113	CCAAA	2	10	152238	152247	60 %	0 %	0 %	40 %	22297716
95	NC_004113	TGCAC	2	10	152840	152849	20 %	20 %	20 %	40 %	22297716
96	NC_004113	GCTGT	2	10	153658	153667	0 %	40 %	40 %	20 %	22297717
97	NC_004113	CGCCC	2	10	155204	155213	0 %	0 %	20 %	80 %	22297718
98	NC_004113	CAGCT	2	10	156170	156179	20 %	20 %	20 %	40 %	22297718
99	NC_004113	GGGAC	2	10	156790	156799	20 %	0 %	60 %	20 %	22297719
100	NC_004113	ACCTC	2	10	156800	156809	20 %	20 %	0 %	60 %	22297719
101	NC_004113	TCCCC	2	10	157198	157207	0 %	20 %	0 %	80 %	22297719
102	NC_004113	GCCCA	2	10	159092	159101	20 %	0 %	20 %	60 %	22297723
103	NC_004113	TAAAT	2	10	161948	161957	60 %	40 %	0 %	0 %	22297726
104	NC_004113	CATGG	2	10	167831	167840	20 %	20 %	40 %	20 %	22297729
105	NC_004113	GGAAA	2	10	169215	169224	60 %	0 %	40 %	0 %	22297731
106	NC_004113	CCATG	2	10	169574	169583	20 %	20 %	20 %	40 %	22297732
107	NC_004113	ACCAA	2	10	170157	170166	60 %	0 %	0 %	40 %	22297732
108	NC_004113	TCCGC	2	10	170447	170456	0 %	20 %	20 %	60 %	22297732
109	NC_004113	CTAGG	2	10	173041	173050	20 %	20 %	40 %	20 %	22297734
110	NC_004113	AGCCA	2	10	174114	174123	40 %	0 %	20 %	40 %	22297736
111	NC_004113	TGCGG	2	10	174856	174865	0 %	20 %	60 %	20 %	22297737
112	NC_004113	CCCCA	2	10	175211	175220	20 %	0 %	0 %	80 %	22297737
113	NC_004113	TTTGG	2	10	176669	176678	0 %	60 %	40 %	0 %	22297737
114	NC_004113	TTCCT	2	10	177108	177117	0 %	60 %	0 %	40 %	22297738
115	NC_004113	AGCAG	2	10	177793	177802	40 %	0 %	40 %	20 %	22297739
116	NC_004113	CTGAA	2	10	180922	180931	40 %	20 %	20 %	20 %	22297744
117	NC_004113	TCAAT	2	10	181614	181623	40 %	40 %	0 %	20 %	22297745
118	NC_004113	AACGG	2	10	183351	183360	40 %	0 %	40 %	20 %	22297747
119	NC_004113	TTCTG	2	10	186799	186808	0 %	60 %	20 %	20 %	22297749
120	NC_004113	TATAT	2	10	186919	186928	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_004113	GTGAA	2	10	188459	188468	40 %	20 %	40 %	0 %	22297752
122	NC_004113	CCTCC	2	10	189096	189105	0 %	20 %	0 %	80 %	22297753
123	NC_004113	CCAAC	2	10	190429	190438	40 %	0 %	0 %	60 %	22297754
124	NC_004113	AGACC	2	10	190641	190650	40 %	0 %	20 %	40 %	22297754
125	NC_004113	ACCCA	2	10	190679	190688	40 %	0 %	0 %	60 %	22297754
126	NC_004113	ATCAC	2	10	191431	191440	40 %	20 %	0 %	40 %	22297756
127	NC_004113	GCGCC	2	10	192696	192705	0 %	0 %	40 %	60 %	22297756
128	NC_004113	TGCTG	2	10	193561	193570	0 %	40 %	40 %	20 %	22297757
129	NC_004113	TTGAT	2	10	194838	194847	20 %	60 %	20 %	0 %	22297757
130	NC_004113	TGGAT	2	10	206462	206471	20 %	40 %	40 %	0 %	22297769
131	NC_004113	CGCTG	2	10	207220	207229	0 %	20 %	40 %	40 %	22297770
132	NC_004113	TGAAT	2	10	211430	211439	40 %	40 %	20 %	0 %	22297773
133	NC_004113	TGCAG	2	10	212466	212475	20 %	20 %	40 %	20 %	22297774
134	NC_004113	GCCAA	2	10	213842	213851	40 %	0 %	20 %	40 %	22297776
135	NC_004113	GGTGG	2	10	214194	214203	0 %	20 %	80 %	0 %	22297776
136	NC_004113	TTTGC	2	10	217499	217508	0 %	60 %	20 %	20 %	22297780
137	NC_004113	ATATC	2	10	219297	219306	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
138	NC_004113	AAGTG	2	10	219982	219991	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
139	NC_004113	TTTTA	2	10	221246	221255	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_004113	AATTC	2	10	221532	221541	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
141	NC_004113	GTCCT	2	10	225655	225664	0 %	40 %	20 %	40 %	22297786
142	NC_004113	TTTTA	2	10	230103	230112	20 %	80 %	0 %	0 %	22297790
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152	NC_004113	TTGGC	2	10	247383	247392	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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175	NC_004113	AAGTG	2	10	293638	293647	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
176	NC_004113	AAGTG	2	10	294266	294275	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
177	NC_004113	GGATT	2	10	294343	294352	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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199	NC_004113	CATGG	2	10	338482	338491	20 %	20 %	40 %	20 %	22297891
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272	NC_004113	AAGTG	2	10	444363	444372	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
273	NC_004113	AAGTG	2	10	445004	445013	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
274	NC_004113	GGATT	2	10	445081	445090	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
275	NC_004113	AGTTC	2	10	449520	449529	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
276	NC_004113	GGACT	2	10	451452	451461	20 %	20 %	40 %	20 %	22297993
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291	NC_004113	CAGTT	2	10	479726	479735	20 %	40 %	20 %	20 %	22298026
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316	NC_004113	GGATT	2	10	520420	520429	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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401	NC_004113	CTTGA	2	10	667662	667671	20 %	40 %	20 %	20 %	22298195
402	NC_004113	CCGTG	2	10	672960	672969	0 %	20 %	40 %	40 %	22298199
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