MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermosynechococcus elongatus BP-1 chromosome

Total Repeats: 48110

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
48001	NC_004113	CTG	2	6	2588265	2588270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22300016
48002	NC_004113	GCA	3	9	2588389	2588397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22300016
48003	NC_004113	TAA	2	6	2588440	2588445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22300016
48004	NC_004113	GTC	2	6	2588507	2588512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22300016
48005	NC_004113	ATG	2	6	2588565	2588570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22300016
48006	NC_004113	CCT	2	6	2588632	2588637	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22300016
48007	NC_004113	TCA	2	6	2588676	2588681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22300016
48008	NC_004113	GCG	2	6	2588730	2588735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22300016
48009	NC_004113	GCA	2	6	2588740	2588745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22300016
48010	NC_004113	TCAT	2	8	2588784	2588791	25 %	50 %	0 %	25 %	22300016
48011	NC_004113	CCCGC	2	10	2588827	2588836	0 %	0 %	20 %	80 %	22300016
48012	NC_004113	ATG	2	6	2588840	2588845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22300016
48013	NC_004113	AGG	2	6	2588868	2588873	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22300016
48014	NC_004113	GAC	2	6	2588903	2588908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22300016
48015	NC_004113	CCA	2	6	2588948	2588953	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22300016
48016	NC_004113	TCC	2	6	2588973	2588978	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22300016
48017	NC_004113	GTGC	2	8	2589012	2589019	0 %	25 %	50 %	25 %	22300016
48018	NC_004113	ATC	2	6	2589024	2589029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22300016
48019	NC_004113	CAC	2	6	2589047	2589052	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22300016
48020	NC_004113	CCT	2	6	2589097	2589102	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22300016
48021	NC_004113	GCC	2	6	2589132	2589137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22300016
48022	NC_004113	GCA	2	6	2589201	2589206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22300016
48023	NC_004113	TGC	2	6	2589226	2589231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22300016
48024	NC_004113	A	6	6	2589323	2589328	100 %	0 %	0 %	0 %	22300016
48025	NC_004113	CCG	2	6	2589348	2589353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22300016
48026	NC_004113	TCC	2	6	2589384	2589389	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22300016
48027	NC_004113	CAT	2	6	2589394	2589399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22300016
48028	NC_004113	AAT	2	6	2589446	2589451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22300016
48029	NC_004113	CAAT	2	8	2589469	2589476	50 %	25 %	0 %	25 %	22300016
48030	NC_004113	CA	3	6	2589644	2589649	50 %	0 %	0 %	50 %	22300016
48031	NC_004113	GCC	2	6	2589669	2589674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22300016
48032	NC_004113	CAG	2	6	2589776	2589781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22300016
48033	NC_004113	GAG	2	6	2589791	2589796	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22300016
48034	NC_004113	AAACC	2	10	2589813	2589822	60 %	0 %	0 %	40 %	22300016
48035	NC_004113	AAGGTC	2	12	2589861	2589872	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	22300016
48036	NC_004113	CAG	2	6	2590040	2590045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22300016
48037	NC_004113	GCG	2	6	2590081	2590086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22300016
48038	NC_004113	ATAAAA	2	12	2590116	2590127	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	22300016
48039	NC_004113	A	6	6	2590174	2590179	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48040	NC_004113	CA	3	6	2590370	2590375	50 %	0 %	0 %	50 %	22300017
48041	NC_004113	GCC	2	6	2590377	2590382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22300017
48042	NC_004113	GTA	2	6	2590406	2590411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22300017
48043	NC_004113	ACC	2	6	2590497	2590502	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22300017
48044	NC_004113	ATAG	2	8	2590522	2590529	50 %	25 %	25 %	0 %	22300017
48045	NC_004113	GGC	2	6	2590574	2590579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22300017
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48051	NC_004113	CA	3	6	2591011	2591016	50 %	0 %	0 %	50 %	22300017
48052	NC_004113	AAT	2	6	2591060	2591065	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22300017
48053	NC_004113	GAG	2	6	2591090	2591095	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22300017
48054	NC_004113	GTT	2	6	2591111	2591116	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22300017
48055	NC_004113	TCC	2	6	2591145	2591150	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22300017
48056	NC_004113	GCT	2	6	2591254	2591259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22300017
48057	NC_004113	GCC	2	6	2591304	2591309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22300017
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48059	NC_004113	CCA	2	6	2591355	2591360	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22300017
48060	NC_004113	AGC	3	9	2591393	2591401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22300017
48061	NC_004113	GCA	2	6	2591409	2591414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22300017
48062	NC_004113	TTCA	2	8	2591447	2591454	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
48063	NC_004113	CGG	2	6	2591493	2591498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22300018
48064	NC_004113	GCG	2	6	2591499	2591504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22300018
48065	NC_004113	AGGC	2	8	2591529	2591536	25 %	0 %	50 %	25 %	22300018
48066	NC_004113	G	6	6	2591641	2591646	0 %	0 %	100 %	0 %	22300018
48067	NC_004113	GAG	2	6	2591702	2591707	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22300018
48068	NC_004113	GTC	2	6	2591735	2591740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22300018
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48070	NC_004113	GCG	2	6	2591765	2591770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22300018
48071	NC_004113	TGAA	2	8	2591787	2591794	50 %	25 %	25 %	0 %	22300018
48072	NC_004113	TTCGGT	2	12	2591798	2591809	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	22300018
48073	NC_004113	TCCA	2	8	2591850	2591857	25 %	25 %	0 %	50 %	22300018
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48078	NC_004113	TGA	2	6	2592330	2592335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22300019
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48085	NC_004113	CAAA	2	8	2592698	2592705	75 %	0 %	0 %	25 %	22300019
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48088	NC_004113	GT	3	6	2592861	2592866	0 %	50 %	50 %	0 %	22300019
48089	NC_004113	GGC	2	6	2592867	2592872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22300019
48090	NC_004113	CAT	2	6	2593012	2593017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22300019
48091	NC_004113	TTCT	2	8	2593082	2593089	0 %	75 %	0 %	25 %	22300019
48092	NC_004113	GAA	2	6	2593136	2593141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22300019
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48101	NC_004113	T	6	6	2593508	2593513	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48102	NC_004113	ATTG	2	8	2593522	2593529	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
48103	NC_004113	GA	3	6	2593552	2593557	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48104	NC_004113	CAA	2	6	2593565	2593570	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48105	NC_004113	GA	3	6	2593613	2593618	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48106	NC_004113	C	6	6	2593632	2593637	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
48107	NC_004113	AGG	2	6	2593640	2593645	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48108	NC_004113	ATT	2	6	2593697	2593702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48109	NC_004113	GCT	2	6	2593731	2593736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48110	NC_004113	TC	4	8	2593748	2593755	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.