MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermosynechococcus elongatus BP-1 chromosome

Total Repeats: 48110

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
47501	NC_004113	GA	3	6	2562328	2562333	50 %	0 %	50 %	0 %	22299993
47502	NC_004113	CTG	2	6	2562345	2562350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299993
47503	NC_004113	GCG	2	6	2562366	2562371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22299993
47504	NC_004113	CAG	2	6	2562455	2562460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299993
47505	NC_004113	TGT	3	9	2562490	2562498	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22299993
47506	NC_004113	GCC	2	6	2562506	2562511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22299993
47507	NC_004113	GCA	2	6	2562526	2562531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299993
47508	NC_004113	GTTG	2	8	2562607	2562614	0 %	50 %	50 %	0 %	22299993
47509	NC_004113	ATT	2	6	2562693	2562698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22299993
47510	NC_004113	CAC	2	6	2562706	2562711	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22299993
47511	NC_004113	CCGGCA	2	12	2562796	2562807	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	22299993
47512	NC_004113	CGGC	2	8	2562828	2562835	0 %	0 %	50 %	50 %	22299993
47513	NC_004113	CCCA	2	8	2562874	2562881	25 %	0 %	0 %	75 %	22299993
47514	NC_004113	GAT	2	6	2562989	2562994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22299993
47515	NC_004113	CAG	2	6	2563008	2563013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299993
47516	NC_004113	CAG	2	6	2563027	2563032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299993
47517	NC_004113	GC	3	6	2563090	2563095	0 %	0 %	50 %	50 %	22299993
47518	NC_004113	ATTG	2	8	2563112	2563119	25 %	50 %	25 %	0 %	22299993
47519	NC_004113	GCG	2	6	2563203	2563208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22299993
47520	NC_004113	AAT	2	6	2563209	2563214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22299993
47521	NC_004113	CTG	2	6	2563221	2563226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299993
47522	NC_004113	TTG	2	6	2563289	2563294	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22299993
47523	NC_004113	GGC	2	6	2563354	2563359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22299993
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47525	NC_004113	CTG	2	6	2563437	2563442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299993
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47532	NC_004113	CGAT	2	8	2563710	2563717	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
47533	NC_004113	GA	3	6	2563761	2563766	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47534	NC_004113	T	7	7	2563856	2563862	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47535	NC_004113	TTG	2	6	2563880	2563885	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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47538	NC_004113	CGC	2	6	2564026	2564031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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47544	NC_004113	GAA	2	6	2564305	2564310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22299994
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47546	NC_004113	GCAT	2	8	2564504	2564511	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
47547	NC_004113	ATAAA	2	10	2564574	2564583	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
47548	NC_004113	G	6	6	2564648	2564653	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
47549	NC_004113	C	6	6	2564715	2564720	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
47550	NC_004113	TGCA	2	8	2564750	2564757	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
47551	NC_004113	CT	3	6	2564782	2564787	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
47552	NC_004113	CT	3	6	2564903	2564908	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
47553	NC_004113	GAT	2	6	2564918	2564923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47554	NC_004113	CCT	2	6	2564992	2564997	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47555	NC_004113	GGT	2	6	2565108	2565113	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47556	NC_004113	GAA	2	6	2565150	2565155	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47557	NC_004113	TCC	2	6	2565307	2565312	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47558	NC_004113	AAC	2	6	2565416	2565421	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47559	NC_004113	TTG	2	6	2565437	2565442	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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47562	NC_004113	AGA	2	6	2565494	2565499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47563	NC_004113	ACC	2	6	2565572	2565577	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47564	NC_004113	TTC	2	6	2565598	2565603	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47565	NC_004113	CTG	2	6	2565677	2565682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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47567	NC_004113	ACAGTG	2	12	2565714	2565725	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
47568	NC_004113	TGT	2	6	2565745	2565750	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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47603	NC_004113	GTG	2	6	2567519	2567524	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22299995
47604	NC_004113	GCAGC	2	10	2567533	2567542	20 %	0 %	40 %	40 %	22299995
47605	NC_004113	GAG	2	6	2567566	2567571	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22299995
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47971	NC_004113	CAGC	2	8	2586300	2586307	25 %	0 %	25 %	50 %	22300014
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47976	NC_004113	CAG	2	6	2586544	2586549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22300014
47977	NC_004113	CCACGG	2	12	2586567	2586578	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	22300014
47978	NC_004113	CCG	2	6	2586591	2586596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22300014
47979	NC_004113	CCT	2	6	2586652	2586657	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22300014
47980	NC_004113	GCA	2	6	2586710	2586715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22300015
47981	NC_004113	TTC	2	6	2586730	2586735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22300015
47982	NC_004113	GGT	2	6	2586851	2586856	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22300015
47983	NC_004113	GCA	3	9	2586873	2586881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22300015
47984	NC_004113	ACCA	2	8	2586884	2586891	50 %	0 %	0 %	50 %	22300015
47985	NC_004113	GAG	2	6	2586981	2586986	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22300015
47986	NC_004113	CAT	2	6	2587184	2587189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22300015
47987	NC_004113	CAC	2	6	2587232	2587237	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22300015
47988	NC_004113	GCC	2	6	2587253	2587258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22300015
47989	NC_004113	T	6	6	2587296	2587301	0 %	100 %	0 %	0 %	22300015
47990	NC_004113	CGT	2	6	2587305	2587310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22300015
47991	NC_004113	TGG	2	6	2587441	2587446	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22300015
47992	NC_004113	G	6	6	2587474	2587479	0 %	0 %	100 %	0 %	22300015
47993	NC_004113	T	6	6	2587554	2587559	0 %	100 %	0 %	0 %	22300015
47994	NC_004113	GCA	2	6	2587827	2587832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22300015
47995	NC_004113	TGG	2	6	2587868	2587873	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22300015
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47998	NC_004113	GGCGG	2	10	2588101	2588110	0 %	0 %	80 %	20 %	22300016
47999	NC_004113	GTG	2	6	2588157	2588162	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22300016
48000	NC_004113	CTG	2	6	2588185	2588190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22300016

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