MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermosynechococcus elongatus BP-1 chromosome

Total Repeats: 48110

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_004113	ATC	2	6	215410	215415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22297777
4002	NC_004113	TCT	2	6	215447	215452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22297777
4003	NC_004113	CTT	2	6	215458	215463	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22297777
4004	NC_004113	CGC	2	6	215528	215533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22297777
4005	NC_004113	GA	3	6	215558	215563	50 %	0 %	50 %	0 %	22297777
4006	NC_004113	AAC	2	6	215616	215621	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22297777
4007	NC_004113	TG	3	6	215632	215637	0 %	50 %	50 %	0 %	22297777
4008	NC_004113	TGGC	2	8	215868	215875	0 %	25 %	50 %	25 %	22297777
4009	NC_004113	TTC	2	6	215951	215956	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4010	NC_004113	TGC	2	6	216000	216005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4011	NC_004113	TTCC	2	8	216006	216013	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4012	NC_004113	AAAG	2	8	216129	216136	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_004113	TGC	2	6	216186	216191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4014	NC_004113	GCA	2	6	216312	216317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297778
4015	NC_004113	CAC	2	6	216370	216375	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22297778
4016	NC_004113	GGCG	2	8	216606	216613	0 %	0 %	75 %	25 %	22297778
4017	NC_004113	CTG	2	6	216653	216658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297778
4018	NC_004113	CTG	2	6	216671	216676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297778
4019	NC_004113	CTA	2	6	216708	216713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22297778
4020	NC_004113	T	6	6	216984	216989	0 %	100 %	0 %	0 %	22297779
4021	NC_004113	AGC	2	6	217015	217020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297779
4022	NC_004113	AAG	2	6	217097	217102	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4023	NC_004113	CGG	2	6	217116	217121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4024	NC_004113	G	7	7	217132	217138	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4025	NC_004113	TCCT	2	8	217177	217184	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4026	NC_004113	CAA	2	6	217207	217212	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4027	NC_004113	CAGC	2	8	217234	217241	25 %	0 %	25 %	50 %	22297780
4028	NC_004113	CCG	2	6	217286	217291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22297780
4029	NC_004113	TTC	2	6	217361	217366	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22297780
4030	NC_004113	AG	3	6	217367	217372	50 %	0 %	50 %	0 %	22297780
4031	NC_004113	TCC	2	6	217377	217382	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22297780
4032	NC_004113	GCA	2	6	217489	217494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297780
4033	NC_004113	TTTGC	2	10	217499	217508	0 %	60 %	20 %	20 %	22297780
4034	NC_004113	CCT	2	6	217511	217516	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22297780
4035	NC_004113	AAT	2	6	217525	217530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22297780
4036	NC_004113	GGT	2	6	217561	217566	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22297780
4037	NC_004113	CGC	2	6	217604	217609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22297780
4038	NC_004113	ATC	2	6	217631	217636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22297780
4039	NC_004113	GGTA	2	8	217638	217645	25 %	25 %	50 %	0 %	22297780
4040	NC_004113	CAT	2	6	217664	217669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22297780
4041	NC_004113	TCT	2	6	217794	217799	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22297780
4042	NC_004113	GTC	2	6	217801	217806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297780
4043	NC_004113	AG	3	6	217888	217893	50 %	0 %	50 %	0 %	22297780
4044	NC_004113	A	6	6	218001	218006	100 %	0 %	0 %	0 %	22297780
4045	NC_004113	C	6	6	218018	218023	0 %	0 %	0 %	100 %	22297780
4046	NC_004113	TCA	2	6	218031	218036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22297780
4047	NC_004113	CTG	2	6	218066	218071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297780
4048	NC_004113	TCA	2	6	218127	218132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22297780
4049	NC_004113	AGGG	2	8	218136	218143	25 %	0 %	75 %	0 %	22297780
4050	NC_004113	CCA	2	6	218314	218319	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22297780
4051	NC_004113	GAAA	2	8	218343	218350	75 %	0 %	25 %	0 %	22297780
4052	NC_004113	CAT	2	6	218372	218377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22297780
4053	NC_004113	CT	3	6	218463	218468	0 %	50 %	0 %	50 %	22297780
4054	NC_004113	CAC	2	6	218530	218535	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22297780
4055	NC_004113	CGC	2	6	218649	218654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22297780
4056	NC_004113	TAG	2	6	218736	218741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22297780
4057	NC_004113	CG	3	6	218764	218769	0 %	0 %	50 %	50 %	22297780
4058	NC_004113	ACG	2	6	218823	218828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297780
4059	NC_004113	TGC	2	6	218855	218860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297780
4060	NC_004113	TGC	2	6	218864	218869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297780
4061	NC_004113	CTC	2	6	218939	218944	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22297780
4062	NC_004113	TGG	2	6	219018	219023	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22297780
4063	NC_004113	CAT	2	6	219103	219108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22297780
4064	NC_004113	CA	3	6	219205	219210	50 %	0 %	0 %	50 %	22297780
4065	NC_004113	TCAG	2	8	219211	219218	25 %	25 %	25 %	25 %	22297780
4066	NC_004113	TCA	3	9	219231	219239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4067	NC_004113	ATATC	2	10	219297	219306	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
4068	NC_004113	AGT	2	6	219336	219341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4069	NC_004113	TCC	2	6	219344	219349	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4070	NC_004113	CGG	2	6	219356	219361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4071	NC_004113	CTT	2	6	219429	219434	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4072	NC_004113	TAT	2	6	219453	219458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4073	NC_004113	T	6	6	219623	219628	0 %	100 %	0 %	0 %	22297781
4074	NC_004113	ACG	2	6	219672	219677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297781
4075	NC_004113	CA	3	6	219690	219695	50 %	0 %	0 %	50 %	22297781
4076	NC_004113	GAT	2	6	219771	219776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4077	NC_004113	CAA	2	6	219790	219795	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4078	NC_004113	GAG	2	6	219918	219923	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4079	NC_004113	AAGTG	2	10	219982	219991	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
4080	NC_004113	CAG	2	6	220014	220019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4081	NC_004113	CAC	2	6	220117	220122	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4082	NC_004113	CAT	2	6	220305	220310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4083	NC_004113	CCA	2	6	220433	220438	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4084	NC_004113	AGGC	2	8	220444	220451	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4085	NC_004113	AC	3	6	220477	220482	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4086	NC_004113	G	6	6	220511	220516	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4087	NC_004113	C	6	6	220578	220583	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4088	NC_004113	GAT	2	6	220614	220619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4089	NC_004113	TGG	2	6	220646	220651	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4090	NC_004113	CTG	2	6	220654	220659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4091	NC_004113	GGC	3	9	220668	220676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4092	NC_004113	TGC	3	9	220679	220687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4093	NC_004113	CTG	2	6	220758	220763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4094	NC_004113	T	6	6	220836	220841	0 %	100 %	0 %	0 %	22297782
4095	NC_004113	AGC	2	6	220949	220954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297782
4096	NC_004113	GCT	2	6	220955	220960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297782
4097	NC_004113	G	6	6	220972	220977	0 %	0 %	100 %	0 %	22297782
4098	NC_004113	TTG	2	6	221026	221031	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22297782
4099	NC_004113	CTT	2	6	221102	221107	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22297782
4100	NC_004113	GCT	2	6	221138	221143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4101	NC_004113	GC	3	6	221162	221167	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4102	NC_004113	TTTTA	2	10	221246	221255	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4103	NC_004113	TAT	2	6	221279	221284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4104	NC_004113	CAG	2	6	221295	221300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4105	NC_004113	TCAA	2	8	221343	221350	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4106	NC_004113	TCT	3	9	221365	221373	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4107	NC_004113	CTC	2	6	221426	221431	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4108	NC_004113	GTTA	2	8	221521	221528	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4109	NC_004113	AATTC	2	10	221532	221541	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
4110	NC_004113	CA	3	6	221543	221548	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4111	NC_004113	GGTCTT	2	12	221594	221605	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
4112	NC_004113	CGG	2	6	221632	221637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4113	NC_004113	G	6	6	221643	221648	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4114	NC_004113	ACC	2	6	221685	221690	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4115	NC_004113	TTTC	2	8	221708	221715	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4116	NC_004113	ATG	2	6	221729	221734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4117	NC_004113	CTTT	2	8	221745	221752	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4118	NC_004113	GCA	2	6	221777	221782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4119	NC_004113	GAA	2	6	221957	221962	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_004113	GAT	2	6	221976	221981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4121	NC_004113	AAT	2	6	221987	221992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_004113	ATC	2	6	222135	222140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4123	NC_004113	GAC	2	6	222147	222152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4124	NC_004113	GCG	2	6	222289	222294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4125	NC_004113	TGG	2	6	222301	222306	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4126	NC_004113	TGC	2	6	222308	222313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4127	NC_004113	GAT	2	6	222318	222323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4128	NC_004113	TTG	2	6	222352	222357	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4129	NC_004113	CTT	2	6	222390	222395	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4131	NC_004113	TC	3	6	222488	222493	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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4241	NC_004113	CTT	2	6	228485	228490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4244	NC_004113	GAT	2	6	228669	228674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22297789
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4250	NC_004113	GCTG	2	8	229354	229361	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4251	NC_004113	TAC	2	6	229489	229494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4254	NC_004113	TGT	2	6	229549	229554	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4255	NC_004113	A	6	6	229573	229578	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4386	NC_004113	GCG	2	6	235973	235978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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