MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermosynechococcus elongatus BP-1 chromosome

Total Repeats: 48110

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_004113	C	6	6	185713	185718	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3502	NC_004113	CTT	2	6	185762	185767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22297749
3503	NC_004113	GT	3	6	185828	185833	0 %	50 %	50 %	0 %	22297749
3504	NC_004113	CAA	2	6	185931	185936	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22297749
3505	NC_004113	GTC	2	6	186149	186154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297749
3506	NC_004113	TTTG	2	8	186246	186253	0 %	75 %	25 %	0 %	22297749
3507	NC_004113	GTA	2	6	186289	186294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22297749
3508	NC_004113	AACC	2	8	186369	186376	50 %	0 %	0 %	50 %	22297749
3509	NC_004113	TCA	2	6	186413	186418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22297749
3510	NC_004113	CAG	2	6	186444	186449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297749
3511	NC_004113	A	6	6	186640	186645	100 %	0 %	0 %	0 %	22297749
3512	NC_004113	CTG	2	6	186679	186684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297749
3513	NC_004113	CTT	2	6	186730	186735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22297749
3514	NC_004113	TC	3	6	186775	186780	0 %	50 %	0 %	50 %	22297749
3515	NC_004113	TTCTG	2	10	186799	186808	0 %	60 %	20 %	20 %	22297749
3516	NC_004113	AACC	2	8	186829	186836	50 %	0 %	0 %	50 %	22297749
3517	NC_004113	TATAT	2	10	186919	186928	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3518	NC_004113	TCCC	2	8	186984	186991	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
3519	NC_004113	TC	3	6	187009	187014	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3520	NC_004113	CGA	2	6	187057	187062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3521	NC_004113	AGGG	2	8	187067	187074	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3522	NC_004113	TGGGGA	2	12	187239	187250	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	22297750
3523	NC_004113	TAC	2	6	187252	187257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22297750
3524	NC_004113	C	6	6	187316	187321	0 %	0 %	0 %	100 %	22297750
3525	NC_004113	GATT	2	8	187359	187366	25 %	50 %	25 %	0 %	22297750
3526	NC_004113	C	6	6	187370	187375	0 %	0 %	0 %	100 %	22297750
3527	NC_004113	CAG	2	6	187390	187395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297750
3528	NC_004113	TTGCCC	2	12	187559	187570	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	22297750
3529	NC_004113	GGC	2	6	187731	187736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22297750
3530	NC_004113	ATT	2	6	187794	187799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3531	NC_004113	ATCA	2	8	187816	187823	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3532	NC_004113	ATA	2	6	187830	187835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3533	NC_004113	TTGA	2	8	187854	187861	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3534	NC_004113	GGC	2	6	187901	187906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22297751
3535	NC_004113	AGA	2	6	187942	187947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22297751
3536	NC_004113	AAC	2	6	187995	188000	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22297751
3537	NC_004113	TCG	2	6	188049	188054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297751
3538	NC_004113	CG	3	6	188211	188216	0 %	0 %	50 %	50 %	22297751
3539	NC_004113	CCA	2	6	188228	188233	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22297751
3540	NC_004113	CAA	2	6	188399	188404	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22297751
3541	NC_004113	GTGAA	2	10	188459	188468	40 %	20 %	40 %	0 %	22297752
3542	NC_004113	AGC	2	6	188522	188527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297752
3543	NC_004113	GGA	2	6	188535	188540	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22297752
3544	NC_004113	G	6	6	188574	188579	0 %	0 %	100 %	0 %	22297752
3545	NC_004113	GCT	2	6	188720	188725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297752
3546	NC_004113	GCCTTG	2	12	188749	188760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297752
3547	NC_004113	CCA	2	6	188781	188786	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22297752
3548	NC_004113	TGG	2	6	188826	188831	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22297752
3549	NC_004113	CCA	2	6	188855	188860	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22297752
3550	NC_004113	CCTCC	2	10	189096	189105	0 %	20 %	0 %	80 %	22297753
3551	NC_004113	GCC	2	6	189171	189176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22297753
3552	NC_004113	CAG	2	6	189182	189187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297753
3553	NC_004113	CAC	2	6	189266	189271	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22297753
3554	NC_004113	TC	3	6	189310	189315	0 %	50 %	0 %	50 %	22297753
3555	NC_004113	GCC	2	6	189416	189421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22297753
3556	NC_004113	CAG	2	6	189487	189492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297753
3557	NC_004113	TGC	2	6	189578	189583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297753
3558	NC_004113	GCA	2	6	189609	189614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297753
3559	NC_004113	GCA	2	6	189672	189677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297753
3560	NC_004113	ACC	2	6	189690	189695	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22297753
3561	NC_004113	C	6	6	189748	189753	0 %	0 %	0 %	100 %	22297753
3562	NC_004113	GCA	2	6	189846	189851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297753
3563	NC_004113	CAG	2	6	190068	190073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297753
3564	NC_004113	GCC	2	6	190106	190111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22297753
3565	NC_004113	AGC	2	6	190133	190138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297753
3566	NC_004113	GCA	3	9	190166	190174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297753
3567	NC_004113	ATGG	2	8	190179	190186	25 %	25 %	50 %	0 %	22297753
3568	NC_004113	T	6	6	190187	190192	0 %	100 %	0 %	0 %	22297753
3569	NC_004113	CCA	2	6	190230	190235	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22297754
3570	NC_004113	CCAAC	2	10	190429	190438	40 %	0 %	0 %	60 %	22297754
3571	NC_004113	A	6	6	190450	190455	100 %	0 %	0 %	0 %	22297754
3572	NC_004113	CGC	2	6	190504	190509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22297754
3573	NC_004113	AG	3	6	190530	190535	50 %	0 %	50 %	0 %	22297754
3574	NC_004113	CTCTAG	2	12	190552	190563	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	22297754
3575	NC_004113	CAGC	2	8	190573	190580	25 %	0 %	25 %	50 %	22297754
3576	NC_004113	ACA	2	6	190587	190592	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22297754
3577	NC_004113	AGACC	2	10	190641	190650	40 %	0 %	20 %	40 %	22297754
3578	NC_004113	ACCCA	2	10	190679	190688	40 %	0 %	0 %	60 %	22297754
3579	NC_004113	AC	3	6	190725	190730	50 %	0 %	0 %	50 %	22297754
3580	NC_004113	TGG	2	6	190808	190813	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22297754
3581	NC_004113	ACA	2	6	190860	190865	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22297754
3582	NC_004113	AGCT	2	8	190881	190888	25 %	25 %	25 %	25 %	22297754
3583	NC_004113	A	6	6	190907	190912	100 %	0 %	0 %	0 %	22297754
3584	NC_004113	CAG	2	6	190939	190944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297754
3585	NC_004113	TAG	2	6	190945	190950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22297754
3586	NC_004113	GCG	2	6	190987	190992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22297754
3587	NC_004113	GCC	2	6	191001	191006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3588	NC_004113	CAT	2	6	191144	191149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22297755
3589	NC_004113	CCA	2	6	191203	191208	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22297755
3590	NC_004113	CATTGT	2	12	191227	191238	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	22297755
3591	NC_004113	TTG	2	6	191308	191313	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22297755
3592	NC_004113	ACC	2	6	191394	191399	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22297756
3593	NC_004113	ATCAC	2	10	191431	191440	40 %	20 %	0 %	40 %	22297756
3594	NC_004113	AGC	2	6	191461	191466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297756
3595	NC_004113	CCT	2	6	191497	191502	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22297756
3596	NC_004113	GTGG	2	8	191503	191510	0 %	25 %	75 %	0 %	22297756
3597	NC_004113	TCA	2	6	191542	191547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22297756
3598	NC_004113	TCC	2	6	191593	191598	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22297756
3599	NC_004113	CGA	2	6	191660	191665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297756
3600	NC_004113	AAT	2	6	191668	191673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22297756
3601	NC_004113	CCA	2	6	191684	191689	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22297756
3602	NC_004113	TAA	2	6	192023	192028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22297756
3603	NC_004113	TCA	2	6	192044	192049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22297756
3604	NC_004113	GGTA	2	8	192239	192246	25 %	25 %	50 %	0 %	22297756
3605	NC_004113	TTTCAA	2	12	192296	192307	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	22297756
3606	NC_004113	GCG	2	6	192330	192335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22297756
3607	NC_004113	GGC	2	6	192339	192344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22297756
3608	NC_004113	CAA	2	6	192465	192470	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22297756
3609	NC_004113	CCA	2	6	192497	192502	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22297756
3610	NC_004113	GGC	2	6	192594	192599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22297756
3611	NC_004113	A	6	6	192672	192677	100 %	0 %	0 %	0 %	22297756
3612	NC_004113	GCGCC	2	10	192696	192705	0 %	0 %	40 %	60 %	22297756
3613	NC_004113	GCA	2	6	192776	192781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297756
3614	NC_004113	TGC	2	6	192783	192788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297756
3615	NC_004113	CTT	2	6	192941	192946	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3616	NC_004113	TAC	2	6	193100	193105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22297757
3617	NC_004113	GCTG	2	8	193122	193129	0 %	25 %	50 %	25 %	22297757
3618	NC_004113	TAA	2	6	193135	193140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22297757
3619	NC_004113	CTA	2	6	193178	193183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22297757
3620	NC_004113	AGC	2	6	193257	193262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297757
3621	NC_004113	AGC	2	6	193446	193451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297757
3622	NC_004113	ACT	2	6	193467	193472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22297757
3623	NC_004113	TGCTG	2	10	193561	193570	0 %	40 %	40 %	20 %	22297757
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3625	NC_004113	GAA	2	6	193700	193705	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22297757
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3745	NC_004113	GCG	2	6	200965	200970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22297765
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3876	NC_004113	C	6	6	208407	208412	0 %	0 %	0 %	100 %	22297771
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3884	NC_004113	TTG	2	6	208678	208683	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22297771
3885	NC_004113	TC	3	6	208739	208744	0 %	50 %	0 %	50 %	22297771
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3892	NC_004113	GAT	2	6	209055	209060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22297771
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3922	NC_004113	GAGG	2	8	210911	210918	25 %	0 %	75 %	0 %	22297772
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3955	NC_004113	AGC	2	6	213325	213330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297775
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3962	NC_004113	G	7	7	213618	213624	0 %	0 %	100 %	0 %	22297775
3963	NC_004113	G	6	6	213627	213632	0 %	0 %	100 %	0 %	22297775
3964	NC_004113	GT	3	6	213653	213658	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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3974	NC_004113	GGC	2	6	214219	214224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22297776
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3979	NC_004113	GCC	2	6	214471	214476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22297776
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3983	NC_004113	GCT	2	6	214800	214805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297776
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3985	NC_004113	GCGATC	2	12	214894	214905	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	22297776
3986	NC_004113	GTT	2	6	214925	214930	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22297776
3987	NC_004113	GCGG	2	8	214973	214980	0 %	0 %	75 %	25 %	22297776
3988	NC_004113	C	7	7	215020	215026	0 %	0 %	0 %	100 %	22297776
3989	NC_004113	CGC	2	6	215075	215080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22297776
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3991	NC_004113	GCC	2	6	215111	215116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22297776
3992	NC_004113	CAA	2	6	215152	215157	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22297776
3993	NC_004113	GCT	2	6	215159	215164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297776
3994	NC_004113	GTC	2	6	215165	215170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297776
3995	NC_004113	ACC	2	6	215173	215178	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22297776
3996	NC_004113	GCC	3	9	215182	215190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22297776
3997	NC_004113	GAC	2	6	215194	215199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297776
3998	NC_004113	GCC	2	6	215298	215303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22297777
3999	NC_004113	GCT	2	6	215313	215318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297777
4000	NC_004113	GAT	2	6	215343	215348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22297777

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