MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermosynechococcus elongatus BP-1 chromosome

Total Repeats: 48110

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_004113	G	8	8	158774	158781	0 %	0 %	100 %	0 %	22297723
3002	NC_004113	ATT	2	6	158851	158856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22297723
3003	NC_004113	TGC	2	6	158901	158906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297723
3004	NC_004113	TGT	2	6	158907	158912	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22297723
3005	NC_004113	GTG	2	6	158929	158934	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22297723
3006	NC_004113	A	6	6	158943	158948	100 %	0 %	0 %	0 %	22297723
3007	NC_004113	ATG	2	6	158987	158992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22297723
3008	NC_004113	CTGC	2	8	159014	159021	0 %	25 %	25 %	50 %	22297723
3009	NC_004113	GCCCA	2	10	159092	159101	20 %	0 %	20 %	60 %	22297723
3010	NC_004113	CTG	2	6	159106	159111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297723
3011	NC_004113	CCG	2	6	159117	159122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22297723
3012	NC_004113	TC	3	6	159249	159254	0 %	50 %	0 %	50 %	22297723
3013	NC_004113	C	6	6	159274	159279	0 %	0 %	0 %	100 %	22297723
3014	NC_004113	GAG	2	6	159283	159288	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22297723
3015	NC_004113	CGC	2	6	159300	159305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22297723
3016	NC_004113	GCC	2	6	159310	159315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22297723
3017	NC_004113	GTG	2	6	159341	159346	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22297723
3018	NC_004113	TTG	2	6	159395	159400	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22297723
3019	NC_004113	AAC	2	6	159431	159436	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22297723
3020	NC_004113	TTG	2	6	159464	159469	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22297723
3021	NC_004113	CAC	2	6	159487	159492	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22297723
3022	NC_004113	TGCCAA	2	12	159513	159524	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	22297723
3023	NC_004113	GCCA	2	8	159552	159559	25 %	0 %	25 %	50 %	22297723
3024	NC_004113	TTGAGG	2	12	159629	159640	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	22297724
3025	NC_004113	TGC	2	6	159675	159680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297724
3026	NC_004113	AG	3	6	159795	159800	50 %	0 %	50 %	0 %	22297724
3027	NC_004113	CTG	2	6	159826	159831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297724
3028	NC_004113	G	7	7	159879	159885	0 %	0 %	100 %	0 %	22297724
3029	NC_004113	GAC	2	6	159936	159941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297724
3030	NC_004113	T	7	7	159983	159989	0 %	100 %	0 %	0 %	22297724
3031	NC_004113	GCA	2	6	159993	159998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297724
3032	NC_004113	GA	4	8	160095	160102	50 %	0 %	50 %	0 %	22297724
3033	NC_004113	GAG	2	6	160183	160188	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22297724
3034	NC_004113	TGG	2	6	160412	160417	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22297725
3035	NC_004113	GGC	2	6	160420	160425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22297725
3036	NC_004113	G	6	6	160470	160475	0 %	0 %	100 %	0 %	22297725
3037	NC_004113	GGC	2	6	160483	160488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22297725
3038	NC_004113	CCA	2	6	160608	160613	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22297725
3039	NC_004113	TTCCGT	2	12	160621	160632	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	22297725
3040	NC_004113	GTA	2	6	160663	160668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22297725
3041	NC_004113	CCA	2	6	160719	160724	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22297725
3042	NC_004113	CAA	2	6	160729	160734	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22297725
3043	NC_004113	AAGGGC	2	12	160831	160842	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	22297725
3044	NC_004113	T	6	6	160914	160919	0 %	100 %	0 %	0 %	22297725
3045	NC_004113	CCA	2	6	160971	160976	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22297725
3046	NC_004113	CCAG	2	8	161022	161029	25 %	0 %	25 %	50 %	22297725
3047	NC_004113	GCT	2	6	161045	161050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297725
3048	NC_004113	AGT	2	6	161066	161071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22297725
3049	NC_004113	CTG	2	6	161095	161100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297725
3050	NC_004113	GTA	2	6	161146	161151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22297725
3051	NC_004113	TGCC	2	8	161172	161179	0 %	25 %	25 %	50 %	22297725
3052	NC_004113	CCG	2	6	161190	161195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22297725
3053	NC_004113	TCA	2	6	161240	161245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22297725
3054	NC_004113	TGA	2	6	161328	161333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22297725
3055	NC_004113	GTT	2	6	161373	161378	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22297725
3056	NC_004113	CAC	2	6	161424	161429	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22297725
3057	NC_004113	T	6	6	161458	161463	0 %	100 %	0 %	0 %	22297726
3058	NC_004113	AAG	2	6	161477	161482	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22297726
3059	NC_004113	TGG	2	6	161506	161511	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22297726
3060	NC_004113	T	6	6	161520	161525	0 %	100 %	0 %	0 %	22297726
3061	NC_004113	T	6	6	161548	161553	0 %	100 %	0 %	0 %	22297726
3062	NC_004113	TGC	2	6	161648	161653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297726
3063	NC_004113	TGC	2	6	161821	161826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297726
3064	NC_004113	C	7	7	161853	161859	0 %	0 %	0 %	100 %	22297726
3065	NC_004113	CTGG	2	8	161903	161910	0 %	25 %	50 %	25 %	22297726
3066	NC_004113	GCC	2	6	161926	161931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22297726
3067	NC_004113	TAAAT	2	10	161948	161957	60 %	40 %	0 %	0 %	22297726
3068	NC_004113	GTT	2	6	161992	161997	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22297726
3069	NC_004113	TAG	2	6	162060	162065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22297726
3070	NC_004113	TTC	2	6	162160	162165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22297726
3071	NC_004113	T	7	7	162234	162240	0 %	100 %	0 %	0 %	22297726
3072	NC_004113	TCA	3	9	162248	162256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22297726
3073	NC_004113	GCT	2	6	162317	162322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297726
3074	NC_004113	GCA	2	6	162341	162346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297726
3075	NC_004113	TGAT	2	8	162383	162390	25 %	50 %	25 %	0 %	22297726
3076	NC_004113	TCA	2	6	162448	162453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3077	NC_004113	CCGC	2	8	162587	162594	0 %	0 %	25 %	75 %	22297727
3078	NC_004113	ACC	2	6	162601	162606	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22297727
3079	NC_004113	CCTTGC	2	12	162617	162628	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	22297727
3080	NC_004113	ACC	2	6	162667	162672	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22297727
3081	NC_004113	C	6	6	162743	162748	0 %	0 %	0 %	100 %	22297727
3082	NC_004113	GGT	2	6	162761	162766	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22297727
3083	NC_004113	GAAT	2	8	162795	162802	50 %	25 %	25 %	0 %	22297727
3084	NC_004113	CAC	2	6	162873	162878	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22297727
3085	NC_004113	GAG	2	6	162900	162905	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22297727
3086	NC_004113	CCCG	2	8	163045	163052	0 %	0 %	25 %	75 %	22297727
3087	NC_004113	GCA	3	9	163058	163066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297727
3088	NC_004113	GGC	2	6	163088	163093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22297727
3089	NC_004113	TGA	2	6	163190	163195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22297727
3090	NC_004113	GTG	2	6	163198	163203	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22297727
3091	NC_004113	GA	3	6	163255	163260	50 %	0 %	50 %	0 %	22297727
3092	NC_004113	GTG	2	6	163284	163289	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22297727
3093	NC_004113	CTA	2	6	163426	163431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22297728
3094	NC_004113	GCG	2	6	163445	163450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22297728
3095	NC_004113	ACC	2	6	163529	163534	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22297728
3096	NC_004113	CCG	2	6	163538	163543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22297728
3097	NC_004113	AAT	2	6	163570	163575	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22297728
3098	NC_004113	CCA	2	6	163638	163643	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22297728
3099	NC_004113	GAG	2	6	163660	163665	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22297728
3100	NC_004113	TCA	2	6	163703	163708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22297728
3101	NC_004113	CGG	2	6	163736	163741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22297728
3102	NC_004113	GCC	2	6	163751	163756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22297728
3103	NC_004113	C	7	7	163776	163782	0 %	0 %	0 %	100 %	22297728
3104	NC_004113	AG	3	6	163783	163788	50 %	0 %	50 %	0 %	22297728
3105	NC_004113	AGCCCA	2	12	163818	163829	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	22297728
3106	NC_004113	A	6	6	163876	163881	100 %	0 %	0 %	0 %	22297728
3107	NC_004113	CGG	2	6	163896	163901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22297728
3108	NC_004113	AGC	2	6	163926	163931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297728
3109	NC_004113	GCC	2	6	164062	164067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22297728
3110	NC_004113	G	6	6	164184	164189	0 %	0 %	100 %	0 %	22297728
3111	NC_004113	CAATGA	2	12	164211	164222	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	22297728
3112	NC_004113	TGC	2	6	164294	164299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297728
3113	NC_004113	AC	3	6	164362	164367	50 %	0 %	0 %	50 %	22297728
3114	NC_004113	GTT	2	6	164407	164412	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22297728
3115	NC_004113	CGGC	2	8	164452	164459	0 %	0 %	50 %	50 %	22297728
3116	NC_004113	GCC	2	6	164563	164568	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22297728
3117	NC_004113	ACA	2	6	164639	164644	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22297728
3118	NC_004113	GCA	2	6	164685	164690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297728
3119	NC_004113	AG	3	6	164806	164811	50 %	0 %	50 %	0 %	22297728
3120	NC_004113	GGC	2	6	164815	164820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22297728
3121	NC_004113	TGT	2	6	164909	164914	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22297728
3122	NC_004113	AGC	2	6	165016	165021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297728
3123	NC_004113	TTGA	2	8	165058	165065	25 %	50 %	25 %	0 %	22297728
3124	NC_004113	GTC	2	6	165104	165109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297728
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3126	NC_004113	GTA	2	6	165313	165318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22297728
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3144	NC_004113	TAT	2	6	166333	166338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3145	NC_004113	A	6	6	166378	166383	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3146	NC_004113	TAG	2	6	166488	166493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22297729
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3239	NC_004113	TCACCC	2	12	171421	171432	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	22297733
3240	NC_004113	GCA	2	6	171442	171447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297733
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3242	NC_004113	TGGAAC	2	12	171758	171769	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	22297733
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3244	NC_004113	GTC	2	6	171886	171891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297733
3245	NC_004113	GCA	2	6	171945	171950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297734
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3248	NC_004113	CAA	2	6	172221	172226	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22297734
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3373	NC_004113	GCA	2	6	178936	178941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297740
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3414	NC_004113	GCG	3	9	181248	181256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22297744
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3423	NC_004113	GCA	2	6	181698	181703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297745
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3496	NC_004113	AGT	2	6	185557	185562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3497	NC_004113	GCC	2	6	185572	185577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3498	NC_004113	TTGA	2	8	185618	185625	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3499	NC_004113	GT	3	6	185652	185657	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3500	NC_004113	TCC	2	6	185709	185714	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding

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