MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermosynechococcus elongatus BP-1 chromosome

Total Repeats: 48110

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_004113	CAA	2	6	81306	81311	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22297641
1502	NC_004113	GCC	2	6	81319	81324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22297641
1503	NC_004113	AAG	2	6	81356	81361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22297641
1504	NC_004113	CGG	2	6	81470	81475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22297642
1505	NC_004113	GCG	2	6	81510	81515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22297642
1506	NC_004113	CGT	2	6	81596	81601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297642
1507	NC_004113	GTC	2	6	81663	81668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297642
1508	NC_004113	TAGTG	2	10	81688	81697	20 %	40 %	40 %	0 %	22297642
1509	NC_004113	CCT	2	6	81709	81714	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22297642
1510	NC_004113	CAC	2	6	81730	81735	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22297642
1511	NC_004113	TGC	3	9	81796	81804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297642
1512	NC_004113	GCA	2	6	81822	81827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297642
1513	NC_004113	TGG	2	6	81841	81846	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22297642
1514	NC_004113	GT	4	8	81848	81855	0 %	50 %	50 %	0 %	22297642
1515	NC_004113	TGC	2	6	81868	81873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297642
1516	NC_004113	AGC	2	6	81958	81963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297643
1517	NC_004113	GGC	2	6	81975	81980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22297643
1518	NC_004113	TATC	2	8	82021	82028	25 %	50 %	0 %	25 %	22297643
1519	NC_004113	ATCG	2	8	82043	82050	25 %	25 %	25 %	25 %	22297643
1520	NC_004113	TC	3	6	82120	82125	0 %	50 %	0 %	50 %	22297643
1521	NC_004113	CAT	3	9	82174	82182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22297643
1522	NC_004113	CTG	2	6	82194	82199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297643
1523	NC_004113	CCTT	2	8	82205	82212	0 %	50 %	0 %	50 %	22297643
1524	NC_004113	GCCG	2	8	82241	82248	0 %	0 %	50 %	50 %	22297643
1525	NC_004113	TGGGC	2	10	82284	82293	0 %	20 %	60 %	20 %	22297643
1526	NC_004113	TGG	2	6	82407	82412	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22297643
1527	NC_004113	GGGT	2	8	82446	82453	0 %	25 %	75 %	0 %	22297643
1528	NC_004113	CCTC	2	8	82461	82468	0 %	25 %	0 %	75 %	22297643
1529	NC_004113	TTG	2	6	82485	82490	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22297643
1530	NC_004113	GTG	2	6	82536	82541	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22297643
1531	NC_004113	GGC	2	6	82550	82555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22297643
1532	NC_004113	CGC	2	6	82622	82627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22297643
1533	NC_004113	ATT	2	6	82727	82732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22297643
1534	NC_004113	CGG	2	6	82740	82745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22297643
1535	NC_004113	T	6	6	82851	82856	0 %	100 %	0 %	0 %	22297643
1536	NC_004113	TCT	2	6	82872	82877	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22297643
1537	NC_004113	CTC	2	6	82891	82896	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22297643
1538	NC_004113	TGG	2	6	82899	82904	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22297643
1539	NC_004113	A	7	7	82934	82940	100 %	0 %	0 %	0 %	22297643
1540	NC_004113	TGG	2	6	83043	83048	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22297643
1541	NC_004113	ATT	2	6	83051	83056	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22297643
1542	NC_004113	CAG	2	6	83061	83066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297643
1543	NC_004113	ACA	2	6	83087	83092	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22297643
1544	NC_004113	TGG	2	6	83127	83132	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22297643
1545	NC_004113	TGG	2	6	83226	83231	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22297644
1546	NC_004113	GGC	2	6	83256	83261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22297644
1547	NC_004113	CAC	2	6	83268	83273	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22297644
1548	NC_004113	CTC	2	6	83338	83343	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22297644
1549	NC_004113	TGG	2	6	83408	83413	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22297644
1550	NC_004113	AGC	2	6	83484	83489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297644
1551	NC_004113	GAG	2	6	83497	83502	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22297644
1552	NC_004113	T	7	7	83540	83546	0 %	100 %	0 %	0 %	22297644
1553	NC_004113	CAAG	2	8	83592	83599	50 %	0 %	25 %	25 %	22297644
1554	NC_004113	CAG	2	6	83611	83616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297644
1555	NC_004113	GAT	2	6	83623	83628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22297644
1556	NC_004113	GAT	2	6	83682	83687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22297644
1557	NC_004113	CTG	2	6	83753	83758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297644
1558	NC_004113	ATTGAA	2	12	83807	83818	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	22297645
1559	NC_004113	CGC	2	6	83909	83914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22297645
1560	NC_004113	AGT	2	6	84009	84014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22297645
1561	NC_004113	AGC	2	6	84171	84176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297646
1562	NC_004113	TGT	2	6	84193	84198	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_004113	CA	3	6	84201	84206	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1564	NC_004113	GCC	2	6	84429	84434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22297647
1565	NC_004113	GCT	2	6	84471	84476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297647
1566	NC_004113	CGT	2	6	84545	84550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297647
1567	NC_004113	CGC	2	6	84557	84562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22297647
1568	NC_004113	A	6	6	84578	84583	100 %	0 %	0 %	0 %	22297647
1569	NC_004113	CGC	2	6	84586	84591	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22297647
1570	NC_004113	TAA	2	6	84727	84732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22297648
1571	NC_004113	GGTGA	2	10	84761	84770	20 %	20 %	60 %	0 %	22297648
1572	NC_004113	CTG	2	6	84783	84788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297648
1573	NC_004113	A	6	6	84812	84817	100 %	0 %	0 %	0 %	22297648
1574	NC_004113	CTG	3	9	84840	84848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297648
1575	NC_004113	C	6	6	85013	85018	0 %	0 %	0 %	100 %	22297648
1576	NC_004113	CGG	3	9	85022	85030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22297648
1577	NC_004113	GAG	2	6	85102	85107	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22297649
1578	NC_004113	GCG	2	6	85182	85187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22297649
1579	NC_004113	CGA	2	6	85259	85264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297649
1580	NC_004113	TGC	2	6	85298	85303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297649
1581	NC_004113	GTC	2	6	85352	85357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297649
1582	NC_004113	GGT	2	6	85431	85436	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22297649
1583	NC_004113	CGA	2	6	85539	85544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297649
1584	NC_004113	GCG	2	6	85593	85598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22297649
1585	NC_004113	GGC	2	6	85722	85727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22297649
1586	NC_004113	GAAG	2	8	85758	85765	50 %	0 %	50 %	0 %	22297649
1587	NC_004113	AC	3	6	85773	85778	50 %	0 %	0 %	50 %	22297649
1588	NC_004113	GCCACC	2	12	85786	85797	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	22297649
1589	NC_004113	GAC	2	6	85798	85803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297649
1590	NC_004113	GTGC	2	8	85849	85856	0 %	25 %	50 %	25 %	22297649
1591	NC_004113	TCT	2	6	85899	85904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22297649
1592	NC_004113	AAG	2	6	85916	85921	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22297649
1593	NC_004113	AG	3	6	86030	86035	50 %	0 %	50 %	0 %	22297649
1594	NC_004113	GAC	2	6	86085	86090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297650
1595	NC_004113	GCT	2	6	86110	86115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297650
1596	NC_004113	ACC	3	9	86156	86164	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22297650
1597	NC_004113	GCAGAG	2	12	86189	86200	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	22297650
1598	NC_004113	GAT	2	6	86203	86208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22297650
1599	NC_004113	GGC	2	6	86233	86238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22297650
1600	NC_004113	CCG	2	6	86239	86244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22297650
1601	NC_004113	TC	3	6	86285	86290	0 %	50 %	0 %	50 %	22297650
1602	NC_004113	TAT	2	6	86341	86346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22297650
1603	NC_004113	GCG	2	6	86356	86361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22297650
1604	NC_004113	ATG	2	6	86411	86416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22297651
1605	NC_004113	AGG	2	6	86523	86528	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22297651
1606	NC_004113	ATC	2	6	86559	86564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22297651
1607	NC_004113	TGT	2	6	86572	86577	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22297651
1608	NC_004113	GCA	2	6	86579	86584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297651
1609	NC_004113	TGC	2	6	86608	86613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297651
1610	NC_004113	CTG	2	6	86691	86696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297651
1611	NC_004113	TGC	2	6	86710	86715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297651
1612	NC_004113	GGC	2	6	86716	86721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22297651
1613	NC_004113	GCC	2	6	86725	86730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22297651
1614	NC_004113	ACT	3	9	86829	86837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22297651
1615	NC_004113	GCA	2	6	86864	86869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297651
1616	NC_004113	TGG	2	6	86883	86888	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22297651
1617	NC_004113	GGC	2	6	86889	86894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22297651
1618	NC_004113	GCG	2	6	86971	86976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22297651
1619	NC_004113	ATG	2	6	87026	87031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22297651
1620	NC_004113	TGG	2	6	87039	87044	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22297651
1621	NC_004113	CGCC	2	8	87078	87085	0 %	0 %	25 %	75 %	22297651
1622	NC_004113	TGC	2	6	87133	87138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297651
1623	NC_004113	C	6	6	87140	87145	0 %	0 %	0 %	100 %	22297651
1624	NC_004113	CCAGTT	2	12	87220	87231	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	22297651
1625	NC_004113	TGA	2	6	87280	87285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22297652
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1627	NC_004113	TCA	2	6	87460	87465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22297652
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