MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermosynechococcus elongatus BP-1 chromosome

Total Repeats: 48110

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_004113	TA	3	6	29146	29151	50 %	50 %	0 %	0 %	22297575
502	NC_004113	CAG	2	6	29257	29262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297575
503	NC_004113	CCG	2	6	29282	29287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22297575
504	NC_004113	CTA	2	6	29409	29414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22297575
505	NC_004113	CCCA	2	8	29490	29497	25 %	0 %	0 %	75 %	22297575
506	NC_004113	AGGG	2	8	29512	29519	25 %	0 %	75 %	0 %	22297575
507	NC_004113	GATGG	2	10	29553	29562	20 %	20 %	60 %	0 %	22297575
508	NC_004113	TTC	2	6	29791	29796	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22297575
509	NC_004113	TCA	2	6	29797	29802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22297575
510	NC_004113	GAA	3	9	29810	29818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22297575
511	NC_004113	AC	3	6	29893	29898	50 %	0 %	0 %	50 %	22297575
512	NC_004113	CAAA	2	8	30019	30026	75 %	0 %	0 %	25 %	22297575
513	NC_004113	TCA	2	6	30055	30060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22297575
514	NC_004113	TGA	2	6	30094	30099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22297575
515	NC_004113	A	6	6	30240	30245	100 %	0 %	0 %	0 %	22297575
516	NC_004113	CCG	2	6	30269	30274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22297575
517	NC_004113	GAA	2	6	30284	30289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22297575
518	NC_004113	GGT	2	6	30294	30299	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22297575
519	NC_004113	CCA	2	6	30350	30355	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22297575
520	NC_004113	GGT	2	6	30375	30380	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22297575
521	NC_004113	GAC	2	6	30384	30389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297575
522	NC_004113	C	6	6	30551	30556	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
523	NC_004113	GAG	2	6	30619	30624	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22297576
524	NC_004113	C	7	7	30688	30694	0 %	0 %	0 %	100 %	22297576
525	NC_004113	CTA	2	6	30719	30724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22297576
526	NC_004113	ACA	2	6	30743	30748	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22297576
527	NC_004113	CCA	2	6	30885	30890	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22297576
528	NC_004113	TC	3	6	30930	30935	0 %	50 %	0 %	50 %	22297576
529	NC_004113	GAC	2	6	31023	31028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297576
530	NC_004113	CAC	2	6	31159	31164	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22297576
531	NC_004113	ATCA	2	8	31189	31196	50 %	25 %	0 %	25 %	22297576
532	NC_004113	GCA	2	6	31377	31382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297576
533	NC_004113	GCC	2	6	31391	31396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22297576
534	NC_004113	GGT	2	6	31438	31443	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22297576
535	NC_004113	AGAAA	2	10	31475	31484	80 %	0 %	20 %	0 %	22297576
536	NC_004113	GTTGCT	2	12	31490	31501	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	22297576
537	NC_004113	G	6	6	31509	31514	0 %	0 %	100 %	0 %	22297576
538	NC_004113	TCA	2	6	31607	31612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
539	NC_004113	TGTT	2	8	31743	31750	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
540	NC_004113	T	6	6	31754	31759	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_004113	CAG	2	6	31844	31849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297577
542	NC_004113	AGTG	2	8	31876	31883	25 %	25 %	50 %	0 %	22297577
543	NC_004113	GCT	2	6	31909	31914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297577
544	NC_004113	TGA	3	9	31935	31943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22297577
545	NC_004113	TG	3	6	31993	31998	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
546	NC_004113	GGAC	2	8	31999	32006	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
547	NC_004113	CAC	2	6	32059	32064	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
548	NC_004113	T	6	6	32067	32072	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_004113	GCG	2	6	32109	32114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
550	NC_004113	CAT	2	6	32124	32129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
551	NC_004113	T	6	6	32129	32134	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_004113	ATC	2	6	32256	32261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22297578
553	NC_004113	CAC	2	6	32264	32269	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22297578
554	NC_004113	TGC	2	6	32287	32292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297578
555	NC_004113	TGA	2	6	32298	32303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22297578
556	NC_004113	TCA	2	6	32340	32345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22297578
557	NC_004113	ACC	2	6	32403	32408	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22297578
558	NC_004113	CAA	2	6	32527	32532	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
559	NC_004113	GTTG	2	8	32566	32573	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
560	NC_004113	CTT	3	9	32584	32592	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
561	NC_004113	TAG	2	6	32645	32650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
562	NC_004113	ATC	2	6	32659	32664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
563	NC_004113	TGAT	2	8	32691	32698	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
564	NC_004113	GT	3	6	32715	32720	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
565	NC_004113	AGC	2	6	32766	32771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
566	NC_004113	A	6	6	32834	32839	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_004113	TGAGT	2	10	32846	32855	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
568	NC_004113	AACG	2	8	32862	32869	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
569	NC_004113	GGAA	2	8	32876	32883	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
570	NC_004113	CAG	2	6	32889	32894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
571	NC_004113	GGA	2	6	32913	32918	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
572	NC_004113	GTAG	2	8	32920	32927	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
573	NC_004113	AGG	2	6	32993	32998	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22297579
574	NC_004113	CTG	2	6	33020	33025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297579
575	NC_004113	TC	3	6	33051	33056	0 %	50 %	0 %	50 %	22297579
576	NC_004113	C	6	6	33075	33080	0 %	0 %	0 %	100 %	22297579
577	NC_004113	CCG	2	6	33172	33177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22297579
578	NC_004113	CTC	2	6	33202	33207	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22297579
579	NC_004113	TGC	2	6	33216	33221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297579
580	NC_004113	CAA	2	6	33263	33268	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22297579
581	NC_004113	CTG	2	6	33272	33277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297579
582	NC_004113	AAT	2	6	33285	33290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22297579
583	NC_004113	CGT	2	6	33348	33353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297580
584	NC_004113	CCT	2	6	33365	33370	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22297580
585	NC_004113	TGC	2	6	33380	33385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297580
586	NC_004113	GGC	2	6	33416	33421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22297580
587	NC_004113	GCC	2	6	33449	33454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22297580
588	NC_004113	TGAT	2	8	33487	33494	25 %	50 %	25 %	0 %	22297580
589	NC_004113	CAC	2	6	33513	33518	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22297580
590	NC_004113	CAA	2	6	33551	33556	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22297580
591	NC_004113	CGG	2	6	33659	33664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22297580
592	NC_004113	GGC	2	6	33711	33716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22297580
593	NC_004113	TAGCCA	2	12	33736	33747	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	22297580
594	NC_004113	AGCA	2	8	33793	33800	50 %	0 %	25 %	25 %	22297580
595	NC_004113	ACC	2	6	33867	33872	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22297580
596	NC_004113	CTA	2	6	33944	33949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22297580
597	NC_004113	TGG	2	6	33990	33995	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22297580
598	NC_004113	GGT	2	6	33998	34003	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22297580
599	NC_004113	AAT	2	6	34093	34098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22297581
600	NC_004113	CAC	2	6	34243	34248	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22297581
601	NC_004113	GTG	2	6	34301	34306	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22297581
602	NC_004113	CTA	2	6	34422	34427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22297581
603	NC_004113	T	6	6	34470	34475	0 %	100 %	0 %	0 %	22297581
604	NC_004113	AAGCC	2	10	34496	34505	40 %	0 %	20 %	40 %	22297581
605	NC_004113	CTGGCG	2	12	34663	34674	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	22297581
606	NC_004113	AAT	2	6	34690	34695	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22297581
607	NC_004113	GCT	2	6	34752	34757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297581
608	NC_004113	TCCC	2	8	34810	34817	0 %	25 %	0 %	75 %	22297581
609	NC_004113	GTT	2	6	34845	34850	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22297581
610	NC_004113	GGC	2	6	34927	34932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22297581
611	NC_004113	CTT	2	6	34950	34955	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22297581
612	NC_004113	CCT	2	6	35058	35063	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22297582
613	NC_004113	GTTTGC	2	12	35064	35075	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	22297582
614	NC_004113	CGC	2	6	35105	35110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22297582
615	NC_004113	T	7	7	35142	35148	0 %	100 %	0 %	0 %	22297582
616	NC_004113	CCT	2	6	35221	35226	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22297583
617	NC_004113	TGA	2	6	35227	35232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22297583
618	NC_004113	ACG	3	9	35242	35250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297583
619	NC_004113	CGC	2	6	35255	35260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22297583
620	NC_004113	TGA	2	6	35276	35281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22297583
621	NC_004113	CAT	3	9	35304	35312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22297583
622	NC_004113	TAAA	2	8	35320	35327	75 %	25 %	0 %	0 %	22297583
623	NC_004113	CTG	2	6	35329	35334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297583
624	NC_004113	GCA	2	6	35348	35353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297583
625	NC_004113	CAG	2	6	35515	35520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297583
626	NC_004113	GCC	2	6	35613	35618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22297584
627	NC_004113	CGC	2	6	35654	35659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22297584
628	NC_004113	TGGAT	2	10	35693	35702	20 %	40 %	40 %	0 %	22297584
629	NC_004113	TTC	2	6	35716	35721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22297584
630	NC_004113	TAT	2	6	35748	35753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22297584
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632	NC_004113	TTGAG	2	10	35909	35918	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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758	NC_004113	G	6	6	42557	42562	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
759	NC_004113	CAG	2	6	42577	42582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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