MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermosynechococcus elongatus BP-1 chromosome

Total Repeats: 48110

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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6002	NC_004113	TGG	2	6	324830	324835	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22297878
6003	NC_004113	TC	3	6	324927	324932	0 %	50 %	0 %	50 %	22297878
6004	NC_004113	ATG	2	6	324965	324970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22297878
6005	NC_004113	CCCTTG	2	12	324995	325006	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	22297878
6006	NC_004113	GGC	3	9	325093	325101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22297878
6007	NC_004113	CAC	2	6	325116	325121	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22297878
6008	NC_004113	GCT	2	6	325157	325162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297878
6009	NC_004113	TGC	2	6	325176	325181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297878
6010	NC_004113	CTAGT	2	10	325199	325208	20 %	40 %	20 %	20 %	22297878
6011	NC_004113	CA	3	6	325227	325232	50 %	0 %	0 %	50 %	22297878
6012	NC_004113	GCC	2	6	325339	325344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22297878
6013	NC_004113	CTG	2	6	325345	325350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297878
6014	NC_004113	TG	3	6	325404	325409	0 %	50 %	50 %	0 %	22297879
6015	NC_004113	TGC	2	6	325552	325557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297879
6016	NC_004113	C	6	6	325582	325587	0 %	0 %	0 %	100 %	22297879
6017	NC_004113	AAT	2	6	325619	325624	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22297879
6018	NC_004113	TGA	2	6	325720	325725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22297879
6019	NC_004113	GCG	2	6	325800	325805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22297879
6020	NC_004113	CCT	2	6	325850	325855	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22297880
6021	NC_004113	GTC	2	6	325878	325883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297880
6022	NC_004113	CTG	2	6	325921	325926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297880
6023	NC_004113	GAC	2	6	326029	326034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297880
6024	NC_004113	CATGT	2	10	326042	326051	20 %	40 %	20 %	20 %	22297880
6025	NC_004113	CGA	2	6	326062	326067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297880
6026	NC_004113	CAC	2	6	326152	326157	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22297880
6027	NC_004113	TAG	2	6	326186	326191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22297880
6028	NC_004113	ATCGGC	2	12	326233	326244	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	22297880
6029	NC_004113	CAG	2	6	326251	326256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297880
6030	NC_004113	TGC	2	6	326272	326277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297880
6031	NC_004113	TGT	2	6	326373	326378	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22297880
6032	NC_004113	CA	3	6	326442	326447	50 %	0 %	0 %	50 %	22297880
6033	NC_004113	CCG	2	6	326457	326462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22297880
6034	NC_004113	CGC	2	6	326529	326534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22297880
6035	NC_004113	TCG	2	6	326554	326559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297880
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6037	NC_004113	GTT	2	6	326660	326665	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22297880
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6041	NC_004113	GCC	2	6	326790	326795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22297880
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6049	NC_004113	CTG	2	6	327158	327163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297880
6050	NC_004113	C	6	6	327170	327175	0 %	0 %	0 %	100 %	22297880
6051	NC_004113	CCA	2	6	327219	327224	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22297880
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6053	NC_004113	CAA	2	6	327261	327266	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22297880
6054	NC_004113	CG	3	6	327337	327342	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6055	NC_004113	CGT	2	6	327447	327452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297881
6056	NC_004113	GGC	2	6	327532	327537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22297881
6057	NC_004113	GCT	2	6	327562	327567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297881
6058	NC_004113	GAA	2	6	327591	327596	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22297881
6059	NC_004113	CCT	2	6	327598	327603	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22297881
6060	NC_004113	GTC	2	6	327674	327679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6061	NC_004113	TGG	2	6	327698	327703	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22297882
6062	NC_004113	C	6	6	327730	327735	0 %	0 %	0 %	100 %	22297882
6063	NC_004113	CAG	2	6	327886	327891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297882
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6088	NC_004113	TC	3	6	328973	328978	0 %	50 %	0 %	50 %	22297882
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6102	NC_004113	GGC	2	6	329671	329676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6103	NC_004113	GCC	2	6	329736	329741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6104	NC_004113	CCATT	2	10	329746	329755	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
6105	NC_004113	GCT	2	6	329769	329774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297883
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6108	NC_004113	AGGG	2	8	329936	329943	25 %	0 %	75 %	0 %	22297883
6109	NC_004113	ATC	2	6	329956	329961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22297883
6110	NC_004113	GGC	2	6	329962	329967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22297883
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6118	NC_004113	AACC	3	12	330345	330356	50 %	0 %	0 %	50 %	22297883
6119	NC_004113	GAG	2	6	330363	330368	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22297883
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6123	NC_004113	ATAGG	2	10	330757	330766	40 %	20 %	40 %	0 %	22297883
6124	NC_004113	CATC	2	8	330785	330792	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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6370	NC_004113	CCT	2	6	343692	343697	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22297892
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6373	NC_004113	TGC	2	6	343823	343828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297892
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6382	NC_004113	GGA	2	6	344400	344405	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22297892
6383	NC_004113	GCA	2	6	344419	344424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297892
6384	NC_004113	GCA	2	6	344454	344459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297892
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6479	NC_004113	GCTGG	2	10	349327	349336	0 %	20 %	60 %	20 %	22297897
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6481	NC_004113	AGTG	2	8	349570	349577	25 %	25 %	50 %	0 %	22297897
6482	NC_004113	GCT	2	6	349600	349605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297897
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6485	NC_004113	ATCG	2	8	349670	349677	25 %	25 %	25 %	25 %	22297897
6486	NC_004113	TTG	2	6	349695	349700	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22297897
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6488	NC_004113	AAGC	2	8	349958	349965	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6489	NC_004113	AGC	2	6	350064	350069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297898
6490	NC_004113	TGT	2	6	350112	350117	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22297898
6491	NC_004113	GAG	2	6	350212	350217	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22297898
6492	NC_004113	GCA	2	6	350267	350272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297898
6493	NC_004113	ATCGCG	2	12	350318	350329	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	22297898
6494	NC_004113	ACA	2	6	350354	350359	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22297898
6495	NC_004113	TGA	2	6	350580	350585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22297898
6496	NC_004113	GGC	2	6	350823	350828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22297899
6497	NC_004113	CCT	2	6	350910	350915	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22297899
6498	NC_004113	GAG	2	6	351018	351023	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22297900
6499	NC_004113	CCAA	2	8	351026	351033	50 %	0 %	0 %	50 %	22297900
6500	NC_004113	CATAGC	2	12	351040	351051	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	22297900

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