MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermosynechococcus elongatus BP-1 chromosome

Total Repeats: 48110

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_004113	CAA	2	6	270355	270360	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22297829
5002	NC_004113	CAG	2	6	270373	270378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297829
5003	NC_004113	GTT	2	6	270434	270439	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22297829
5004	NC_004113	TGG	3	9	270641	270649	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22297829
5005	NC_004113	TAC	2	6	270670	270675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22297829
5006	NC_004113	CT	3	6	270752	270757	0 %	50 %	0 %	50 %	22297829
5007	NC_004113	TGG	2	6	270911	270916	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22297829
5008	NC_004113	AAGCCC	2	12	271007	271018	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	22297829
5009	NC_004113	CAG	3	9	271100	271108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297830
5010	NC_004113	CTC	2	6	271131	271136	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22297830
5011	NC_004113	CTC	2	6	271165	271170	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22297830
5012	NC_004113	CGG	2	6	271247	271252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22297830
5013	NC_004113	CCA	2	6	271325	271330	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22297830
5014	NC_004113	GCAACT	2	12	271334	271345	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	22297830
5015	NC_004113	A	6	6	271358	271363	100 %	0 %	0 %	0 %	22297830
5016	NC_004113	CAC	3	9	271416	271424	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22297830
5017	NC_004113	CATGG	2	10	271455	271464	20 %	20 %	40 %	20 %	22297830
5018	NC_004113	GCCA	2	8	271480	271487	25 %	0 %	25 %	50 %	22297830
5019	NC_004113	AAC	2	6	271517	271522	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22297830
5020	NC_004113	CCT	2	6	271546	271551	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22297831
5021	NC_004113	CTG	2	6	271572	271577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297831
5022	NC_004113	GGCA	2	8	271694	271701	25 %	0 %	50 %	25 %	22297831
5023	NC_004113	AGT	2	6	271733	271738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22297831
5024	NC_004113	CCTT	2	8	271744	271751	0 %	50 %	0 %	50 %	22297831
5025	NC_004113	GGT	3	9	271775	271783	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22297831
5026	NC_004113	CAGTG	2	10	271815	271824	20 %	20 %	40 %	20 %	22297831
5027	NC_004113	GCCA	2	8	271874	271881	25 %	0 %	25 %	50 %	22297831
5028	NC_004113	GCTT	2	8	271903	271910	0 %	50 %	25 %	25 %	22297831
5029	NC_004113	C	6	6	271962	271967	0 %	0 %	0 %	100 %	22297831
5030	NC_004113	AG	3	6	272099	272104	50 %	0 %	50 %	0 %	22297831
5031	NC_004113	CT	3	6	272136	272141	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5032	NC_004113	ATTT	2	8	272147	272154	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5033	NC_004113	TGTC	2	8	272165	272172	0 %	50 %	25 %	25 %	22297832
5034	NC_004113	TGC	2	6	272190	272195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297832
5035	NC_004113	GCG	2	6	272369	272374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22297832
5036	NC_004113	TGT	2	6	272509	272514	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22297832
5037	NC_004113	CACAGG	2	12	272567	272578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297832
5038	NC_004113	GC	3	6	272697	272702	0 %	0 %	50 %	50 %	22297832
5039	NC_004113	GGC	2	6	272724	272729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22297832
5040	NC_004113	GCC	2	6	272876	272881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22297832
5041	NC_004113	ATG	2	6	272948	272953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22297832
5042	NC_004113	AGGC	2	8	272989	272996	25 %	0 %	50 %	25 %	22297832
5043	NC_004113	AGC	2	6	273017	273022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297832
5044	NC_004113	GGC	2	6	273074	273079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22297832
5045	NC_004113	AC	3	6	273098	273103	50 %	0 %	0 %	50 %	22297832
5046	NC_004113	TTTTC	2	10	273208	273217	0 %	80 %	0 %	20 %	22297832
5047	NC_004113	GAG	2	6	273220	273225	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22297832
5048	NC_004113	CCTTG	2	10	273238	273247	0 %	40 %	20 %	40 %	22297832
5049	NC_004113	CACC	2	8	273248	273255	25 %	0 %	0 %	75 %	22297832
5050	NC_004113	CTA	2	6	273331	273336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22297832
5051	NC_004113	CCA	2	6	273432	273437	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22297832
5052	NC_004113	ATTT	2	8	273486	273493	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5053	NC_004113	TA	3	6	273501	273506	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5054	NC_004113	TTG	2	6	273587	273592	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5055	NC_004113	A	6	6	273617	273622	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5056	NC_004113	GAA	2	6	273760	273765	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22297833
5057	NC_004113	A	6	6	273809	273814	100 %	0 %	0 %	0 %	22297833
5058	NC_004113	TGCA	2	8	273815	273822	25 %	25 %	25 %	25 %	22297833
5059	NC_004113	GTG	2	6	273919	273924	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22297833
5060	NC_004113	CGC	2	6	273975	273980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22297833
5061	NC_004113	C	7	7	274007	274013	0 %	0 %	0 %	100 %	22297833
5062	NC_004113	C	6	6	274015	274020	0 %	0 %	0 %	100 %	22297833
5063	NC_004113	TCT	2	6	274240	274245	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22297834
5064	NC_004113	GAT	2	6	274373	274378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22297834
5065	NC_004113	GCC	2	6	274387	274392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22297834
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5067	NC_004113	TGTT	2	8	274623	274630	0 %	75 %	25 %	0 %	22297834
5068	NC_004113	CGC	2	6	274676	274681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22297834
5069	NC_004113	GCC	2	6	274729	274734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22297834
5070	NC_004113	TCC	2	6	274750	274755	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22297834
5071	NC_004113	CTG	2	6	274815	274820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297834
5072	NC_004113	GCC	2	6	274922	274927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22297834
5073	NC_004113	GAT	2	6	275018	275023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22297834
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5075	NC_004113	CAG	2	6	275154	275159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297834
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5077	NC_004113	G	8	8	275370	275377	0 %	0 %	100 %	0 %	22297834
5078	NC_004113	CA	3	6	275396	275401	50 %	0 %	0 %	50 %	22297834
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5088	NC_004113	GCC	2	6	275790	275795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22297834
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5093	NC_004113	AACC	2	8	276007	276014	50 %	0 %	0 %	50 %	22297834
5094	NC_004113	GTG	2	6	276028	276033	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22297834
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5096	NC_004113	CTG	2	6	276171	276176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297834
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5098	NC_004113	CGG	2	6	276266	276271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22297834
5099	NC_004113	CGG	2	6	276275	276280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22297834
5100	NC_004113	AGCCA	2	10	276439	276448	40 %	0 %	20 %	40 %	22297834
5101	NC_004113	GATG	2	8	276473	276480	25 %	25 %	50 %	0 %	22297834
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5108	NC_004113	CAC	2	6	276868	276873	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22297834
5109	NC_004113	CGCTA	2	10	276900	276909	20 %	20 %	20 %	40 %	22297834
5110	NC_004113	GTC	2	6	277012	277017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297834
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5112	NC_004113	GTGAG	2	10	277037	277046	20 %	20 %	60 %	0 %	22297834
5113	NC_004113	GAAT	2	8	277060	277067	50 %	25 %	25 %	0 %	22297834
5114	NC_004113	GAG	2	6	277187	277192	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5115	NC_004113	TCAT	2	8	277199	277206	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5116	NC_004113	A	6	6	277224	277229	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5117	NC_004113	TTTA	2	8	277231	277238	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5118	NC_004113	CGG	2	6	277274	277279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22297835
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5125	NC_004113	GCA	2	6	277576	277581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297835
5126	NC_004113	GCC	2	6	277654	277659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22297835
5127	NC_004113	CCAAGG	2	12	277681	277692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297835
5128	NC_004113	TAA	2	6	277782	277787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22297835
5129	NC_004113	GGGT	2	8	277815	277822	0 %	25 %	75 %	0 %	22297835
5130	NC_004113	CTG	2	6	277845	277850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297835
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5132	NC_004113	GCA	2	6	277968	277973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297835
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5135	NC_004113	ATC	2	6	278151	278156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22297836
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5148	NC_004113	ATA	2	6	279019	279024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5149	NC_004113	GCCCC	2	10	279058	279067	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
5150	NC_004113	GCC	2	6	279076	279081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5151	NC_004113	GAA	2	6	279154	279159	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22297837
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5165	NC_004113	GCA	2	6	279926	279931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297838
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5179	NC_004113	TGT	2	6	280483	280488	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5180	NC_004113	GTT	2	6	280503	280508	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5195	NC_004113	AGG	2	6	281416	281421	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5199	NC_004113	AAAG	2	8	281622	281629	75 %	0 %	25 %	0 %	161485774
5200	NC_004113	A	7	7	281742	281748	100 %	0 %	0 %	0 %	161485774
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5217	NC_004113	GTG	2	6	282457	282462	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5219	NC_004113	G	7	7	282561	282567	0 %	0 %	100 %	0 %	22297843
5220	NC_004113	TTTAC	2	10	282581	282590	20 %	60 %	0 %	20 %	22297843
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5232	NC_004113	CAC	2	6	283321	283326	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22297844
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5239	NC_004113	A	6	6	283685	283690	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5240	NC_004113	TTA	2	6	283756	283761	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5241	NC_004113	AGG	2	6	283793	283798	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22297845
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5250	NC_004113	ATC	2	6	284043	284048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22297845
5251	NC_004113	GAG	2	6	284140	284145	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5252	NC_004113	GTT	2	6	284159	284164	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	109150052
5253	NC_004113	TTG	2	6	284178	284183	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	109150052
5254	NC_004113	CGA	2	6	284202	284207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	109150052
5255	NC_004113	GA	3	6	284292	284297	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5256	NC_004113	GTG	3	9	284406	284414	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22297846
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5263	NC_004113	CAT	2	6	284882	284887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22297846
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5265	NC_004113	GAT	2	6	285071	285076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22297846
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5270	NC_004113	GGC	2	6	285308	285313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22297846
5271	NC_004113	GCG	2	6	285351	285356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22297846
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5275	NC_004113	TGA	2	6	285583	285588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22297847
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5277	NC_004113	G	6	6	285686	285691	0 %	0 %	100 %	0 %	22297847
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5282	NC_004113	ATA	2	6	285831	285836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22297847
5283	NC_004113	TAT	2	6	285847	285852	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22297847
5284	NC_004113	GC	3	6	285890	285895	0 %	0 %	50 %	50 %	22297847
5285	NC_004113	A	6	6	285940	285945	100 %	0 %	0 %	0 %	22297847
5286	NC_004113	CG	3	6	285954	285959	0 %	0 %	50 %	50 %	22297847
5287	NC_004113	GAG	2	6	286004	286009	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22297847
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5301	NC_004113	AATG	2	8	286743	286750	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5302	NC_004113	GGATT	2	10	286784	286793	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
5303	NC_004113	CAA	2	6	286796	286801	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5304	NC_004113	CTG	2	6	287084	287089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297848
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5319	NC_004113	CGC	3	9	287788	287796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22297848
5320	NC_004113	CA	3	6	287844	287849	50 %	0 %	0 %	50 %	22297848
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5333	NC_004113	A	6	6	288731	288736	100 %	0 %	0 %	0 %	22297848
5334	NC_004113	GAAT	2	8	288802	288809	50 %	25 %	25 %	0 %	22297848
5335	NC_004113	AGG	2	6	288810	288815	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22297848
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5342	NC_004113	G	7	7	289275	289281	0 %	0 %	100 %	0 %	22297850
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5344	NC_004113	CAAGG	2	10	289329	289338	40 %	0 %	40 %	20 %	22297850
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5352	NC_004113	AGT	2	6	289762	289767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22297850
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5354	NC_004113	TGC	2	6	289894	289899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297850
5355	NC_004113	AGC	2	6	289918	289923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297850
5356	NC_004113	G	6	6	289961	289966	0 %	0 %	100 %	0 %	22297850
5357	NC_004113	GTT	2	6	289974	289979	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22297850
5358	NC_004113	CTT	2	6	290000	290005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22297850
5359	NC_004113	CCAC	2	8	290018	290025	25 %	0 %	0 %	75 %	22297850
5360	NC_004113	CTGTC	2	10	290028	290037	0 %	40 %	20 %	40 %	22297850
5361	NC_004113	TCA	2	6	290227	290232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22297850
5362	NC_004113	GCA	2	6	290708	290713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5363	NC_004113	AG	3	6	290828	290833	50 %	0 %	50 %	0 %	22297851
5364	NC_004113	TCC	2	6	290853	290858	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22297851
5365	NC_004113	CGC	2	6	290877	290882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22297851
5366	NC_004113	TCA	2	6	290916	290921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22297851
5367	NC_004113	AAT	2	6	291050	291055	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22297851
5368	NC_004113	TCA	2	6	291057	291062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22297851
5369	NC_004113	CGG	2	6	291142	291147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22297851
5370	NC_004113	CGC	2	6	291179	291184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22297851
5371	NC_004113	CAC	2	6	291347	291352	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22297851
5372	NC_004113	CGC	3	9	291363	291371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22297851
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5374	NC_004113	ATC	2	6	291480	291485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22297851
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