MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermosynechococcus elongatus BP-1 chromosome

Total Repeats: 48110

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_004113	GAA	2	6	241963	241968	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22297801
4502	NC_004113	CTTC	2	8	242017	242024	0 %	50 %	0 %	50 %	22297801
4503	NC_004113	TGC	2	6	242055	242060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297801
4504	NC_004113	GTC	2	6	242083	242088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297801
4505	NC_004113	TCA	2	6	242103	242108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22297801
4506	NC_004113	ATT	2	6	242195	242200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22297801
4507	NC_004113	AAC	2	6	242228	242233	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22297801
4508	NC_004113	CGG	2	6	242266	242271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22297801
4509	NC_004113	GAA	2	6	242412	242417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22297801
4510	NC_004113	CAA	2	6	242487	242492	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22297801
4511	NC_004113	ACT	2	6	242713	242718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22297801
4512	NC_004113	ATC	2	6	242749	242754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22297801
4513	NC_004113	CTA	2	6	242783	242788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4514	NC_004113	TCT	2	6	242888	242893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22297802
4515	NC_004113	TGC	2	6	242927	242932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297802
4516	NC_004113	ACCTA	2	10	243039	243048	40 %	20 %	0 %	40 %	22297802
4517	NC_004113	ATA	2	6	243056	243061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22297803
4518	NC_004113	TTTC	2	8	243066	243073	0 %	75 %	0 %	25 %	22297803
4519	NC_004113	AGG	2	6	243080	243085	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22297803
4520	NC_004113	CGG	2	6	243206	243211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22297803
4521	NC_004113	GGC	2	6	243250	243255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22297803
4522	NC_004113	CGG	2	6	243292	243297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22297803
4523	NC_004113	CAT	2	6	243321	243326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22297803
4524	NC_004113	AG	3	6	243349	243354	50 %	0 %	50 %	0 %	22297803
4525	NC_004113	TCG	2	6	243411	243416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297803
4526	NC_004113	GTA	2	6	243469	243474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22297803
4527	NC_004113	CCA	2	6	243477	243482	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22297803
4528	NC_004113	TAA	2	6	243493	243498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22297803
4529	NC_004113	CGC	2	6	243499	243504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22297803
4530	NC_004113	AAT	2	6	243674	243679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22297804
4531	NC_004113	A	6	6	243893	243898	100 %	0 %	0 %	0 %	22297804
4532	NC_004113	CAC	2	6	243926	243931	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22297804
4533	NC_004113	CGG	2	6	243960	243965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22297804
4534	NC_004113	CCT	2	6	243985	243990	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22297804
4535	NC_004113	CAG	2	6	244114	244119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297804
4536	NC_004113	C	6	6	244152	244157	0 %	0 %	0 %	100 %	22297804
4537	NC_004113	CAC	2	6	244187	244192	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22297804
4538	NC_004113	ATA	2	6	244472	244477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4539	NC_004113	TCC	2	6	244515	244520	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22297805
4540	NC_004113	ACC	2	6	244550	244555	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22297805
4541	NC_004113	ACA	2	6	244612	244617	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22297805
4542	NC_004113	GCCT	2	8	244653	244660	0 %	25 %	25 %	50 %	22297805
4543	NC_004113	TGA	2	6	244661	244666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22297805
4544	NC_004113	CAG	2	6	244723	244728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297805
4545	NC_004113	TGA	2	6	244806	244811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22297805
4546	NC_004113	TGC	2	6	244820	244825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297805
4547	NC_004113	GAT	2	6	244851	244856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22297805
4548	NC_004113	CTG	2	6	244987	244992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297805
4549	NC_004113	CA	3	6	245149	245154	50 %	0 %	0 %	50 %	22297805
4550	NC_004113	GAG	2	6	245159	245164	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22297805
4551	NC_004113	GCTG	2	8	245196	245203	0 %	25 %	50 %	25 %	22297806
4552	NC_004113	CTG	2	6	245231	245236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297806
4553	NC_004113	CGCC	2	8	245367	245374	0 %	0 %	25 %	75 %	22297806
4554	NC_004113	CAG	3	9	245375	245383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297806
4555	NC_004113	GGT	2	6	245518	245523	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22297806
4556	NC_004113	C	6	6	245542	245547	0 %	0 %	0 %	100 %	22297806
4557	NC_004113	CGG	2	6	245614	245619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22297806
4558	NC_004113	TGC	2	6	245623	245628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297806
4559	NC_004113	AG	3	6	245739	245744	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4560	NC_004113	AAG	2	6	245748	245753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4561	NC_004113	A	6	6	245758	245763	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4562	NC_004113	GAA	2	6	245766	245771	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4563	NC_004113	GTCG	2	8	245774	245781	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4564	NC_004113	G	6	6	245789	245794	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4565	NC_004113	TGC	2	6	245798	245803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4566	NC_004113	C	6	6	245856	245861	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4567	NC_004113	TGCA	2	8	245891	245898	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4568	NC_004113	CT	3	6	245923	245928	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4569	NC_004113	GAT	2	6	246059	246064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4570	NC_004113	CCA	2	6	246078	246083	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4571	NC_004113	ATCCA	2	10	246096	246105	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
4572	NC_004113	CCT	2	6	246133	246138	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4573	NC_004113	GGT	2	6	246249	246254	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4574	NC_004113	C	6	6	246280	246285	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4575	NC_004113	GAA	2	6	246291	246296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4576	NC_004113	TCACT	2	10	246381	246390	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
4577	NC_004113	TCC	2	6	246448	246453	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4578	NC_004113	ATC	2	6	246597	246602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4579	NC_004113	AGA	2	6	246624	246629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4580	NC_004113	CAT	2	6	246637	246642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4581	NC_004113	TGT	2	6	246688	246693	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22297807
4582	NC_004113	CGG	2	6	246710	246715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22297807
4583	NC_004113	GCG	2	6	246779	246784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22297807
4584	NC_004113	GGC	2	6	246811	246816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22297807
4585	NC_004113	C	6	6	246939	246944	0 %	0 %	0 %	100 %	22297807
4586	NC_004113	GGC	2	6	246992	246997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22297807
4587	NC_004113	GAG	2	6	247061	247066	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22297807
4588	NC_004113	GCAT	2	8	247196	247203	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4589	NC_004113	ATAAA	2	10	247266	247275	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4590	NC_004113	AT	3	6	247343	247348	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4591	NC_004113	TTGGC	2	10	247383	247392	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
4592	NC_004113	CTG	2	6	247462	247467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4593	NC_004113	GCA	2	6	247594	247599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297808
4594	NC_004113	GCC	2	6	247604	247609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22297808
4595	NC_004113	GGC	2	6	247633	247638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22297808
4596	NC_004113	ACCC	2	8	247654	247661	25 %	0 %	0 %	75 %	22297808
4597	NC_004113	GCC	3	9	247676	247684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22297808
4598	NC_004113	GC	3	6	247729	247734	0 %	0 %	50 %	50 %	22297808
4599	NC_004113	TGG	2	6	247746	247751	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22297808
4600	NC_004113	TGG	2	6	247767	247772	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22297808
4601	NC_004113	TGG	2	6	247907	247912	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22297808
4602	NC_004113	A	6	6	248000	248005	100 %	0 %	0 %	0 %	22297808
4603	NC_004113	CGC	2	6	248038	248043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22297808
4604	NC_004113	GGA	2	6	248179	248184	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22297808
4605	NC_004113	TCC	2	6	248186	248191	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22297808
4606	NC_004113	GAG	2	6	248201	248206	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22297808
4607	NC_004113	GCTA	2	8	248435	248442	25 %	25 %	25 %	25 %	22297808
4608	NC_004113	A	6	6	248472	248477	100 %	0 %	0 %	0 %	22297809
4609	NC_004113	GCA	2	6	248479	248484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297809
4610	NC_004113	ATT	2	6	248540	248545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22297809
4611	NC_004113	TGC	2	6	248595	248600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297809
4612	NC_004113	ATT	2	6	248630	248635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22297809
4613	NC_004113	A	6	6	248667	248672	100 %	0 %	0 %	0 %	22297809
4614	NC_004113	TGC	2	6	248826	248831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297809
4615	NC_004113	ACT	2	6	248862	248867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22297809
4616	NC_004113	AGC	2	6	249050	249055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297810
4617	NC_004113	AGC	2	6	249092	249097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297810
4618	NC_004113	CGC	2	6	249132	249137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22297810
4619	NC_004113	GCTTG	2	10	249180	249189	0 %	40 %	40 %	20 %	22297810
4620	NC_004113	G	6	6	249252	249257	0 %	0 %	100 %	0 %	22297810
4621	NC_004113	A	6	6	249259	249264	100 %	0 %	0 %	0 %	22297810
4622	NC_004113	GA	3	6	249267	249272	50 %	0 %	50 %	0 %	22297810
4623	NC_004113	AGGC	2	8	249325	249332	25 %	0 %	50 %	25 %	22297810
4624	NC_004113	CCA	2	6	249390	249395	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22297810
4625	NC_004113	TGC	2	6	249494	249499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297810
4626	NC_004113	CAATC	2	10	249513	249522	40 %	20 %	0 %	40 %	22297810
4627	NC_004113	GGA	2	6	249540	249545	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22297810
4628	NC_004113	ACC	2	6	249578	249583	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22297810
4629	NC_004113	TGC	2	6	249590	249595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297810
4630	NC_004113	AG	3	6	249633	249638	50 %	0 %	50 %	0 %	22297810
4631	NC_004113	CGC	2	6	249733	249738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22297810
4632	NC_004113	A	6	6	249754	249759	100 %	0 %	0 %	0 %	22297810
4633	NC_004113	GCC	2	6	249779	249784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22297810
4634	NC_004113	AATC	2	8	249864	249871	50 %	25 %	0 %	25 %	22297810
4635	NC_004113	AC	3	6	249987	249992	50 %	0 %	0 %	50 %	22297811
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4642	NC_004113	G	7	7	250378	250384	0 %	0 %	100 %	0 %	22297812
4643	NC_004113	TG	3	6	250385	250390	0 %	50 %	50 %	0 %	22297812
4644	NC_004113	CTC	2	6	250392	250397	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22297812
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4648	NC_004113	AATA	2	8	250569	250576	75 %	25 %	0 %	0 %	22297812
4649	NC_004113	GCA	2	6	250592	250597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297812
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4662	NC_004113	CGG	2	6	251235	251240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22297813
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4665	NC_004113	CTG	2	6	251300	251305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297813
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4678	NC_004113	GATT	2	8	252223	252230	25 %	50 %	25 %	0 %	22297814
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4693	NC_004113	CCT	2	6	252935	252940	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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4732	NC_004113	CGG	2	6	255210	255215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22297815
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4865	NC_004113	CA	4	8	262905	262912	50 %	0 %	0 %	50 %	22297822
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4867	NC_004113	ATCAG	2	10	262973	262982	40 %	20 %	20 %	20 %	22297822
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4872	NC_004113	GCG	2	6	263251	263256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22297822
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4996	NC_004113	TACC	2	8	270246	270253	25 %	25 %	0 %	50 %	22297829
4997	NC_004113	AGC	2	6	270255	270260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297829
4998	NC_004113	GC	3	6	270319	270324	0 %	0 %	50 %	50 %	22297829
4999	NC_004113	ATG	2	6	270332	270337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22297829
5000	NC_004113	GCG	2	6	270338	270343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22297829

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