MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Treponema denticola ATCC 35405 chromosome

Total Repeats: 33428

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002967	CTA	2	6	85	90	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_002967	ATT	2	6	146	151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_002967	CAA	2	6	153	158	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_002967	GCA	2	6	233	238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	42525520
5	NC_002967	AAT	2	6	423	428	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42525520
6	NC_002967	GAA	2	6	593	598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42525520
7	NC_002967	CTT	2	6	840	845	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	42525520
8	NC_002967	CAT	2	6	928	933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42525520
9	NC_002967	TTA	2	6	1139	1144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42525520
10	NC_002967	ACA	2	6	1154	1159	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	42525520
11	NC_002967	TCC	2	6	1207	1212	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	42525520
12	NC_002967	TCT	2	6	1265	1270	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	42525520
13	NC_002967	TCC	2	6	1282	1287	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	42525520
14	NC_002967	TGA	2	6	1329	1334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42525520
15	NC_002967	ATC	2	6	1406	1411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42525520
16	NC_002967	TTC	2	6	1516	1521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	42525520
17	NC_002967	TAC	2	6	1588	1593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_002967	AAT	2	6	1612	1617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_002967	ATT	2	6	1697	1702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42525521
20	NC_002967	ATA	2	6	1709	1714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42525521
21	NC_002967	CGG	2	6	1983	1988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	42525521
22	NC_002967	ACC	2	6	2218	2223	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	42525521
23	NC_002967	CTT	2	6	2268	2273	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	42525521
24	NC_002967	CCT	2	6	2484	2489	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	42525521
25	NC_002967	AAG	2	6	2581	2586	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42525521
26	NC_002967	GAA	2	6	2617	2622	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42525521
27	NC_002967	GCC	3	9	2833	2841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	42525521
28	NC_002967	TGC	2	6	2847	2852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	42525521
29	NC_002967	AGA	2	6	2854	2859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42525521
30	NC_002967	AGA	2	6	2875	2880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42525521
31	NC_002967	GGC	2	6	2983	2988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	42525521
32	NC_002967	AAC	2	6	3085	3090	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	42525521
33	NC_002967	ATT	2	6	3106	3111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42525521
34	NC_002967	TAA	2	6	3176	3181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42525521
35	NC_002967	CTT	2	6	3220	3225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	42525521
36	NC_002967	GCC	2	6	3288	3293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	42525521
37	NC_002967	ATG	3	9	3338	3346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42525521
38	NC_002967	TGC	2	6	3387	3392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	42525521
39	NC_002967	AAC	2	6	3444	3449	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	42525521
40	NC_002967	ATG	2	6	3472	3477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42525521
41	NC_002967	GAA	2	6	3535	3540	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42525521
42	NC_002967	CCG	2	6	3549	3554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	42525521
43	NC_002967	GAA	2	6	3565	3570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42525521
44	NC_002967	TCT	2	6	3696	3701	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	42525522
45	NC_002967	AGC	2	6	3775	3780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	42525522
46	NC_002967	GCT	2	6	3917	3922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	42525522
47	NC_002967	AAT	2	6	4003	4008	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42525522
48	NC_002967	TTA	2	6	4059	4064	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42525522
49	NC_002967	CTC	2	6	4097	4102	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	42525522
50	NC_002967	CTT	2	6	4364	4369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_002967	AGG	2	6	4372	4377	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_002967	GAA	2	6	4438	4443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42525523
53	NC_002967	GTT	2	6	4557	4562	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	42525523
54	NC_002967	ATT	2	6	4578	4583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42525523
55	NC_002967	GAA	2	6	4716	4721	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42525523
56	NC_002967	TTC	2	6	4754	4759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	42525523
57	NC_002967	TAC	2	6	4763	4768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42525523
58	NC_002967	CAT	2	6	4832	4837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42525523
59	NC_002967	GGC	2	6	4875	4880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	42525523
60	NC_002967	ATC	2	6	5016	5021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42525523
61	NC_002967	TTA	2	6	5072	5077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42525524
62	NC_002967	TGT	2	6	5141	5146	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	42525524
63	NC_002967	CTG	2	6	5170	5175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	42525524
64	NC_002967	TAT	2	6	5249	5254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42525524
65	NC_002967	ATC	2	6	5322	5327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42525524
66	NC_002967	TTC	2	6	5347	5352	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	42525524
67	NC_002967	GTT	2	6	5474	5479	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	42525524
68	NC_002967	GAT	2	6	5480	5485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42525524
69	NC_002967	ATC	2	6	5750	5755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42525524
70	NC_002967	CCG	2	6	5788	5793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	42525524
71	NC_002967	CGG	2	6	5884	5889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	42525524
72	NC_002967	TTC	2	6	6224	6229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	42525525
73	NC_002967	ATC	2	6	6300	6305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42525525
74	NC_002967	TCA	2	6	6306	6311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42525525
75	NC_002967	AAT	2	6	6605	6610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42525525
76	NC_002967	AAT	2	6	6650	6655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42525525
77	NC_002967	GAA	2	6	6669	6674	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42525525
78	NC_002967	ATT	2	6	6675	6680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42525525
79	NC_002967	GAT	2	6	6760	6765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42525525
80	NC_002967	GCT	2	6	6883	6888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	42525525
81	NC_002967	CGG	2	6	6966	6971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	42525525
82	NC_002967	ATC	2	6	7001	7006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42525525
83	NC_002967	TCG	2	6	7062	7067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	42525525
84	NC_002967	GAA	2	6	7087	7092	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42525525
85	NC_002967	GTT	2	6	7124	7129	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	42525525
86	NC_002967	TTA	3	9	7300	7308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42525525
87	NC_002967	CGG	2	6	7351	7356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	42525525
88	NC_002967	AAG	2	6	7403	7408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42525525
89	NC_002967	CTT	2	6	7444	7449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	42525525
90	NC_002967	GTC	2	6	7508	7513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	42525525
91	NC_002967	CTT	2	6	7621	7626	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	42525525
92	NC_002967	CTT	2	6	7750	7755	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	42525525
93	NC_002967	CAT	2	6	7882	7887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42525525
94	NC_002967	TTC	2	6	8045	8050	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	42525525
95	NC_002967	TCG	2	6	8136	8141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	42525525
96	NC_002967	CTC	2	6	8151	8156	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	42525525
97	NC_002967	TGC	2	6	8159	8164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	42525525
98	NC_002967	TCG	2	6	8274	8279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	42525525
99	NC_002967	TTC	2	6	8399	8404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	42525525
100	NC_002967	GAA	2	6	8545	8550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42525525
101	NC_002967	GAA	2	6	8604	8609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42525525
102	NC_002967	CGG	2	6	8659	8664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	42525525
103	NC_002967	TCT	2	6	8934	8939	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	42525525
104	NC_002967	TAT	2	6	9020	9025	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42525525
105	NC_002967	TGA	2	6	9035	9040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42525525
106	NC_002967	AGG	2	6	9053	9058	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	42525525
107	NC_002967	CTG	2	6	9172	9177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	42525525
108	NC_002967	GCT	2	6	9220	9225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	42525525
109	NC_002967	GGA	2	6	9229	9234	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	42525525
110	NC_002967	TCC	2	6	9251	9256	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	42525525
111	NC_002967	GCC	2	6	9369	9374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	42525525
112	NC_002967	CCG	2	6	9634	9639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	42525525
113	NC_002967	ATC	2	6	9713	9718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42525525
114	NC_002967	GTC	2	6	9759	9764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	42525525
115	NC_002967	TCA	2	6	9844	9849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_002967	ATT	2	6	9912	9917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_002967	TAA	2	6	9953	9958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_002967	TTC	2	6	9978	9983	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_002967	AAT	2	6	9990	9995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_002967	AGA	2	6	10076	10081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42525526
121	NC_002967	TTC	2	6	10093	10098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	42525526
122	NC_002967	TTG	2	6	10104	10109	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	42525526
123	NC_002967	AAC	2	6	10260	10265	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	42525526
124	NC_002967	TAT	2	6	10296	10301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42525526
125	NC_002967	AAG	2	6	10510	10515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42525526
126	NC_002967	ATA	2	6	10528	10533	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42525526
127	NC_002967	TTA	2	6	10545	10550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42525526
128	NC_002967	ATG	2	6	10617	10622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42525526
129	NC_002967	TGA	2	6	10789	10794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42525526
130	NC_002967	AGA	2	6	10847	10852	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42525526
131	NC_002967	GAA	2	6	10874	10879	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_002967	TTC	2	6	11081	11086	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	42525527
133	NC_002967	CTT	2	6	11260	11265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	42525527
134	NC_002967	GCC	2	6	11322	11327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	42525527
135	NC_002967	GAT	2	6	11708	11713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42525527
136	NC_002967	TGA	2	6	11788	11793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42525527
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138	NC_002967	TAG	2	6	11920	11925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42525527
139	NC_002967	TTC	2	6	11933	11938	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	42525527
140	NC_002967	GTA	2	6	12000	12005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42525527
141	NC_002967	GAT	2	6	12060	12065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42525527
142	NC_002967	AAT	2	6	12080	12085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42525527
143	NC_002967	AGA	2	6	12095	12100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42525527
144	NC_002967	ACT	2	6	12151	12156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42525527
145	NC_002967	GCC	2	6	12424	12429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	42525527
146	NC_002967	GAA	2	6	12621	12626	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42525527
147	NC_002967	GCG	2	6	12757	12762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	42525527
148	NC_002967	ACA	2	6	12907	12912	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	42525527
149	NC_002967	GAT	2	6	12951	12956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42525527
150	NC_002967	TGC	2	6	12959	12964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	42525527
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152	NC_002967	TGA	2	6	13138	13143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42525527
153	NC_002967	GAT	2	6	13301	13306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42525527
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162	NC_002967	CGG	2	6	14110	14115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	42525528
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164	NC_002967	TCC	2	6	14226	14231	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	42525528
165	NC_002967	CTT	2	6	14245	14250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	42525528
166	NC_002967	AAT	2	6	14257	14262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42525528
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168	NC_002967	TCG	2	6	14295	14300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	42525528
169	NC_002967	GCA	2	6	14301	14306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	42525528
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171	NC_002967	AAT	2	6	14416	14421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42525528
172	NC_002967	TCA	2	6	14475	14480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42525528
173	NC_002967	CCT	2	6	14641	14646	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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179	NC_002967	TGA	2	6	15151	15156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42525529
180	NC_002967	TAT	2	6	15235	15240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42525529
181	NC_002967	TTA	2	6	15401	15406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
182	NC_002967	GAC	2	6	15584	15589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	42525530
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184	NC_002967	TAC	2	6	15700	15705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42525530
185	NC_002967	TGC	2	6	15856	15861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	42525530
186	NC_002967	GAA	2	6	16001	16006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42525530
187	NC_002967	TAA	2	6	16075	16080	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42525530
188	NC_002967	CCG	2	6	16109	16114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	42525530
189	NC_002967	AGG	2	6	16297	16302	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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222	NC_002967	ATA	2	6	18844	18849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
223	NC_002967	AAG	2	6	18991	18996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42525533
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244	NC_002967	CCT	2	6	21287	21292	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	42525535
245	NC_002967	GAA	2	6	21293	21298	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42525535
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247	NC_002967	AAG	2	6	21347	21352	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42525535
248	NC_002967	ATG	2	6	21387	21392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42525535
249	NC_002967	GCC	2	6	21437	21442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	42525535
250	NC_002967	GTT	2	6	21557	21562	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	42525535
251	NC_002967	ATC	2	6	21612	21617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42525535
252	NC_002967	TGC	2	6	21625	21630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	42525535
253	NC_002967	AAG	2	6	21711	21716	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42525535
254	NC_002967	ATA	2	6	21967	21972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
255	NC_002967	GTG	2	6	22070	22075	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	42525536
256	NC_002967	GAT	2	6	22259	22264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42525536
257	NC_002967	TTC	2	6	22370	22375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	42525536
258	NC_002967	GTA	2	6	22398	22403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42525536
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260	NC_002967	TTC	2	6	22571	22576	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	42525536
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360	NC_002967	CCT	2	6	31839	31844	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
361	NC_002967	AAG	2	6	31997	32002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42525545
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381	NC_002967	GAA	2	6	33676	33681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42525546
382	NC_002967	GAT	2	6	33740	33745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42525546
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386	NC_002967	CAT	2	6	33989	33994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42525546
387	NC_002967	AAT	2	6	34101	34106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
388	NC_002967	GAA	2	6	34232	34237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42525547
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