MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Thermoplasma acidophilum DSM 1728 chromosome

Total Repeats: 3476

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002578	CAGA	2	8	833	840	50 %	0 %	25 %	25 %	16081188
2	NC_002578	GTAC	2	8	1278	1285	25 %	25 %	25 %	25 %	16081188
3	NC_002578	ACCC	2	8	2496	2503	25 %	0 %	0 %	75 %	16081190
4	NC_002578	CAGG	2	8	3720	3727	25 %	0 %	50 %	25 %	16081190
5	NC_002578	GAGC	2	8	4096	4103	25 %	0 %	50 %	25 %	16081190
6	NC_002578	CAGG	2	8	4577	4584	25 %	0 %	50 %	25 %	16081191
7	NC_002578	GAAT	2	8	4870	4877	50 %	25 %	25 %	0 %	16081191
8	NC_002578	AGGC	2	8	4956	4963	25 %	0 %	50 %	25 %	16081191
9	NC_002578	CGAG	2	8	5020	5027	25 %	0 %	50 %	25 %	16081191
10	NC_002578	ACTG	2	8	5612	5619	25 %	25 %	25 %	25 %	16081191
11	NC_002578	CGAC	2	8	5852	5859	25 %	0 %	25 %	50 %	16081192
12	NC_002578	ACCC	2	8	6139	6146	25 %	0 %	0 %	75 %	16081192
13	NC_002578	ATCA	2	8	6695	6702	50 %	25 %	0 %	25 %	16082633
14	NC_002578	GAAG	2	8	6745	6752	50 %	0 %	50 %	0 %	16082633
15	NC_002578	TTCG	2	8	7787	7794	0 %	50 %	25 %	25 %	16081193
16	NC_002578	AGAA	2	8	9026	9033	75 %	0 %	25 %	0 %	16081194
17	NC_002578	AAAT	2	8	9330	9337	75 %	25 %	0 %	0 %	16081194
18	NC_002578	TGGA	2	8	9417	9424	25 %	25 %	50 %	0 %	16081194
19	NC_002578	ATGG	2	8	9631	9638	25 %	25 %	50 %	0 %	16082469
20	NC_002578	CCTT	2	8	9757	9764	0 %	50 %	0 %	50 %	16082469
21	NC_002578	TGAA	2	8	10033	10040	50 %	25 %	25 %	0 %	16082469
22	NC_002578	CGAA	2	8	10177	10184	50 %	0 %	25 %	25 %	16082469
23	NC_002578	TCAT	2	8	10344	10351	25 %	50 %	0 %	25 %	16082469
24	NC_002578	GAAA	2	8	10378	10385	75 %	0 %	25 %	0 %	16082469
25	NC_002578	TAAT	2	8	10705	10712	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_002578	TCTT	2	8	11326	11333	0 %	75 %	0 %	25 %	16081195
27	NC_002578	TAAA	2	8	12065	12072	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_002578	AGAT	2	8	12165	12172	50 %	25 %	25 %	0 %	16081197
29	NC_002578	ATGG	2	8	13178	13185	25 %	25 %	50 %	0 %	16082470
30	NC_002578	AGAA	2	8	13218	13225	75 %	0 %	25 %	0 %	16082470
31	NC_002578	GAAG	2	8	15018	15025	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_002578	GGAG	2	8	15031	15038	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
33	NC_002578	TCAG	2	8	15796	15803	25 %	25 %	25 %	25 %	16081200
34	NC_002578	AGCT	2	8	16751	16758	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_002578	GAAT	2	8	16971	16978	50 %	25 %	25 %	0 %	16081202
36	NC_002578	CGTT	2	8	18198	18205	0 %	50 %	25 %	25 %	16082634
37	NC_002578	CTCC	2	8	18328	18335	0 %	25 %	0 %	75 %	16082634
38	NC_002578	ATGG	2	8	18837	18844	25 %	25 %	50 %	0 %	16082471
39	NC_002578	ATAC	2	8	19221	19228	50 %	25 %	0 %	25 %	16082471
40	NC_002578	GATC	2	8	19458	19465	25 %	25 %	25 %	25 %	16082471
41	NC_002578	ATTT	2	8	20462	20469	25 %	75 %	0 %	0 %	16082472
42	NC_002578	TTTC	2	8	21910	21917	0 %	75 %	0 %	25 %	16081205
43	NC_002578	GTTT	2	8	22564	22571	0 %	75 %	25 %	0 %	16081206
44	NC_002578	TCTT	2	8	23047	23054	0 %	75 %	0 %	25 %	16081206
45	NC_002578	TATG	2	8	23168	23175	25 %	50 %	25 %	0 %	16081206
46	NC_002578	GCCA	2	8	23318	23325	25 %	0 %	25 %	50 %	16081206
47	NC_002578	GATC	2	8	23805	23812	25 %	25 %	25 %	25 %	16081207
48	NC_002578	CCAG	2	8	23852	23859	25 %	0 %	25 %	50 %	16081207
49	NC_002578	AGGA	2	8	23892	23899	50 %	0 %	50 %	0 %	16081207
50	NC_002578	GATG	2	8	23956	23963	25 %	25 %	50 %	0 %	16081207
51	NC_002578	GCTT	2	8	24662	24669	0 %	50 %	25 %	25 %	16081208
52	NC_002578	CCTT	2	8	24692	24699	0 %	50 %	0 %	50 %	16081208
53	NC_002578	CTGC	2	8	25942	25949	0 %	25 %	25 %	50 %	16081209
54	NC_002578	ACAG	2	8	25950	25957	50 %	0 %	25 %	25 %	16081209
55	NC_002578	ATTC	2	8	25994	26001	25 %	50 %	0 %	25 %	16081209
56	NC_002578	ACAT	2	8	27899	27906	50 %	25 %	0 %	25 %	16081211
57	NC_002578	TCCA	2	8	29244	29251	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_002578	AGCG	2	8	29494	29501	25 %	0 %	50 %	25 %	16081214
59	NC_002578	TATG	2	8	30377	30384	25 %	50 %	25 %	0 %	16081216
60	NC_002578	GCAG	2	8	31884	31891	25 %	0 %	50 %	25 %	16082473
61	NC_002578	CGAT	2	8	32080	32087	25 %	25 %	25 %	25 %	16082473
62	NC_002578	AAGG	2	8	32609	32616	50 %	0 %	50 %	0 %	16082473
63	NC_002578	GATG	2	8	33512	33519	25 %	25 %	50 %	0 %	16082473
64	NC_002578	TGAA	2	8	34325	34332	50 %	25 %	25 %	0 %	16081217
65	NC_002578	TCTT	2	8	36713	36720	0 %	75 %	0 %	25 %	16081220
66	NC_002578	ATGG	2	8	38317	38324	25 %	25 %	50 %	0 %	16081220
67	NC_002578	CCTT	2	8	38348	38355	0 %	50 %	0 %	50 %	16081220
68	NC_002578	TTAA	2	8	38843	38850	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_002578	TCCA	2	8	39241	39248	25 %	25 %	0 %	50 %	16081221
70	NC_002578	ATCC	2	8	39881	39888	25 %	25 %	0 %	50 %	16081222
71	NC_002578	GATC	2	8	40720	40727	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
72	NC_002578	TTAA	2	8	42584	42591	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_002578	ACGA	2	8	43150	43157	50 %	0 %	25 %	25 %	16082475
74	NC_002578	GAAC	2	8	43196	43203	50 %	0 %	25 %	25 %	16082475
75	NC_002578	ATGG	2	8	45267	45274	25 %	25 %	50 %	0 %	16081223
76	NC_002578	AATG	2	8	46027	46034	50 %	25 %	25 %	0 %	16081224
77	NC_002578	GGCC	2	8	46482	46489	0 %	0 %	50 %	50 %	16081224
78	NC_002578	AGGA	2	8	46698	46705	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_002578	GCTG	2	8	46853	46860	0 %	25 %	50 %	25 %	16081225
80	NC_002578	GCAG	2	8	47102	47109	25 %	0 %	50 %	25 %	16081225
81	NC_002578	ATAC	2	8	47230	47237	50 %	25 %	0 %	25 %	16081225
82	NC_002578	CGGC	2	8	47499	47506	0 %	0 %	50 %	50 %	16081225
83	NC_002578	AGCG	2	8	48892	48899	25 %	0 %	50 %	25 %	16081226
84	NC_002578	AAAT	2	8	49097	49104	75 %	25 %	0 %	0 %	16081226
85	NC_002578	ATAA	2	8	49238	49245	75 %	25 %	0 %	0 %	16081226
86	NC_002578	GATG	2	8	50182	50189	25 %	25 %	50 %	0 %	16081228
87	NC_002578	AGGC	2	8	50313	50320	25 %	0 %	50 %	25 %	16081229
88	NC_002578	TCCG	2	8	50408	50415	0 %	25 %	25 %	50 %	16081229
89	NC_002578	TAAG	2	8	50548	50555	50 %	25 %	25 %	0 %	16081229
90	NC_002578	CTGG	2	8	50670	50677	0 %	25 %	50 %	25 %	16081230
91	NC_002578	AAGA	2	8	50834	50841	75 %	0 %	25 %	0 %	16081231
92	NC_002578	GATC	2	8	50918	50925	25 %	25 %	25 %	25 %	16081231
93	NC_002578	AAGT	2	8	50929	50936	50 %	25 %	25 %	0 %	16081231
94	NC_002578	GCCT	2	8	53954	53961	0 %	25 %	25 %	50 %	16082477
95	NC_002578	GGCC	2	8	54135	54142	0 %	0 %	50 %	50 %	16082477
96	NC_002578	GACA	2	8	54637	54644	50 %	0 %	25 %	25 %	16081233
97	NC_002578	TCCT	2	8	55186	55193	0 %	50 %	0 %	50 %	16081234
98	NC_002578	TTTG	2	8	55216	55223	0 %	75 %	25 %	0 %	16081234
99	NC_002578	GTAT	2	8	55917	55924	25 %	50 %	25 %	0 %	16081234
100	NC_002578	CTTC	2	8	56121	56128	0 %	50 %	0 %	50 %	16081234
101	NC_002578	GGAG	2	8	56484	56491	25 %	0 %	75 %	0 %	16081235
102	NC_002578	GCTC	2	8	57242	57249	0 %	25 %	25 %	50 %	16081235
103	NC_002578	CATC	2	8	57388	57395	25 %	25 %	0 %	50 %	16081235
104	NC_002578	CCAG	2	8	57689	57696	25 %	0 %	25 %	50 %	16081235
105	NC_002578	TGAT	2	8	57958	57965	25 %	50 %	25 %	0 %	16081236
106	NC_002578	GATC	2	8	58444	58451	25 %	25 %	25 %	25 %	16081236
107	NC_002578	TATG	2	8	58940	58947	25 %	50 %	25 %	0 %	16081237
108	NC_002578	AGGA	2	8	59177	59184	50 %	0 %	50 %	0 %	16081237
109	NC_002578	CGGT	2	8	60772	60779	0 %	25 %	50 %	25 %	16081238
110	NC_002578	CTTC	2	8	61238	61245	0 %	50 %	0 %	50 %	16081238
111	NC_002578	CCGG	2	8	61391	61398	0 %	0 %	50 %	50 %	16081238
112	NC_002578	GAAA	2	8	61978	61985	75 %	0 %	25 %	0 %	16081238
113	NC_002578	ACTG	2	8	62467	62474	25 %	25 %	25 %	25 %	16082479
114	NC_002578	GAAT	2	8	62682	62689	50 %	25 %	25 %	0 %	16082479
115	NC_002578	TCCA	2	8	62907	62914	25 %	25 %	0 %	50 %	16082479
116	NC_002578	ATAA	2	8	63261	63268	75 %	25 %	0 %	0 %	16082479
117	NC_002578	GTTG	2	8	63504	63511	0 %	50 %	50 %	0 %	16082479
118	NC_002578	GAAG	2	8	63638	63645	50 %	0 %	50 %	0 %	16082479
119	NC_002578	CAAA	2	8	63674	63681	75 %	0 %	0 %	25 %	16082479
120	NC_002578	CATC	2	8	64533	64540	25 %	25 %	0 %	50 %	16081239
121	NC_002578	GCAA	2	8	65116	65123	50 %	0 %	25 %	25 %	16081240
122	NC_002578	ATTG	2	8	66076	66083	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_002578	TTCA	2	8	66141	66148	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_002578	TTTC	2	8	67794	67801	0 %	75 %	0 %	25 %	16081242
125	NC_002578	GAAT	2	8	68285	68292	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_002578	AAAG	2	8	68400	68407	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_002578	GATG	2	8	69316	69323	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_002578	AAGT	2	8	69574	69581	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_002578	CATT	2	8	72028	72035	25 %	50 %	0 %	25 %	16081246
130	NC_002578	TTGC	2	8	72418	72425	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
131	NC_002578	ATCG	2	8	72548	72555	25 %	25 %	25 %	25 %	16081247
132	NC_002578	CATC	2	8	73731	73738	25 %	25 %	0 %	50 %	16081248
133	NC_002578	ATGA	2	8	74396	74403	50 %	25 %	25 %	0 %	16081248
134	NC_002578	AACA	2	8	74455	74462	75 %	0 %	0 %	25 %	16081248
135	NC_002578	AGGG	2	8	74506	74513	25 %	0 %	75 %	0 %	16081248
136	NC_002578	ATCC	2	8	74731	74738	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_002578	ATTC	2	8	74823	74830	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
138	NC_002578	TACA	2	8	75020	75027	50 %	25 %	0 %	25 %	16081249
139	NC_002578	TGGA	2	8	75399	75406	25 %	25 %	50 %	0 %	16081249
140	NC_002578	CATA	2	8	75735	75742	50 %	25 %	0 %	25 %	16081249
141	NC_002578	TCTT	2	8	75994	76001	0 %	75 %	0 %	25 %	16081250
142	NC_002578	ACAT	2	8	77587	77594	50 %	25 %	0 %	25 %	16081251
143	NC_002578	TGGA	2	8	77681	77688	25 %	25 %	50 %	0 %	16081251
144	NC_002578	AGGT	2	8	78353	78360	25 %	25 %	50 %	0 %	16081252
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