MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermoplasma acidophilum DSM 1728 chromosome

Total Repeats: 29169

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_002578	TAT	2	6	188461	188466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16081339
3502	NC_002578	T	6	6	188531	188536	0 %	100 %	0 %	0 %	16081339
3503	NC_002578	CAG	3	9	188584	188592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081339
3504	NC_002578	T	6	6	188600	188605	0 %	100 %	0 %	0 %	16081339
3505	NC_002578	TGG	2	6	188619	188624	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16081339
3506	NC_002578	TA	3	6	188633	188638	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3507	NC_002578	ATA	2	6	188641	188646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3508	NC_002578	AAT	2	6	188688	188693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081340
3509	NC_002578	ATA	2	6	188772	188777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081340
3510	NC_002578	ATG	2	6	188832	188837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081340
3511	NC_002578	GAA	2	6	188894	188899	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081340
3512	NC_002578	GCA	2	6	188916	188921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081340
3513	NC_002578	GTT	2	6	188931	188936	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16081340
3514	NC_002578	CA	3	6	188964	188969	50 %	0 %	0 %	50 %	16081340
3515	NC_002578	TGC	2	6	189002	189007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081340
3516	NC_002578	GA	3	6	189077	189082	50 %	0 %	50 %	0 %	16081340
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3519	NC_002578	ATA	3	9	189339	189347	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081340
3520	NC_002578	GGC	2	6	189377	189382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16081340
3521	NC_002578	CAT	2	6	189383	189388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081340
3522	NC_002578	GAA	2	6	189514	189519	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081340
3523	NC_002578	TTCA	2	8	189602	189609	25 %	50 %	0 %	25 %	16081340
3524	NC_002578	TGA	2	6	189658	189663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081340
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3529	NC_002578	GCAG	2	8	189771	189778	25 %	0 %	50 %	25 %	16081340
3530	NC_002578	TTA	2	6	189863	189868	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16081340
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3532	NC_002578	TA	3	6	190034	190039	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3533	NC_002578	GAA	2	6	190072	190077	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081341
3534	NC_002578	TCC	2	6	190114	190119	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16081341
3535	NC_002578	TCT	2	6	190153	190158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081341
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3537	NC_002578	GATT	2	8	190179	190186	25 %	50 %	25 %	0 %	16081341
3538	NC_002578	GTT	2	6	190276	190281	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3539	NC_002578	AAT	3	9	190360	190368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3540	NC_002578	GAT	2	6	190387	190392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3541	NC_002578	AT	3	6	190391	190396	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3542	NC_002578	A	8	8	190448	190455	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3543	NC_002578	AGA	2	6	190468	190473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3544	NC_002578	CCT	2	6	190477	190482	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3545	NC_002578	TAC	2	6	190626	190631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081342
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3547	NC_002578	TGA	2	6	190691	190696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081342
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3549	NC_002578	CGA	2	6	190779	190784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081342
3550	NC_002578	CGA	2	6	190804	190809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081342
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3554	NC_002578	T	6	6	190937	190942	0 %	100 %	0 %	0 %	16081342
3555	NC_002578	ATTA	2	8	191103	191110	50 %	50 %	0 %	0 %	16081343
3556	NC_002578	TGT	2	6	191118	191123	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16081343
3557	NC_002578	TAA	2	6	191132	191137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081343
3558	NC_002578	GAG	2	6	191165	191170	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3559	NC_002578	GAT	2	6	191194	191199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3560	NC_002578	CAA	2	6	191246	191251	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3561	NC_002578	CAT	2	6	191334	191339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3562	NC_002578	ATG	2	6	191351	191356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3563	NC_002578	CAT	2	6	191388	191393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3564	NC_002578	A	6	6	191413	191418	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3565	NC_002578	GGA	2	6	191423	191428	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3567	NC_002578	CAT	2	6	191638	191643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081344
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3570	NC_002578	TGA	2	6	191824	191829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081344
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3572	NC_002578	GCAT	2	8	191868	191875	25 %	25 %	25 %	25 %	16081344
3573	NC_002578	CAA	2	6	191928	191933	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3574	NC_002578	ATC	2	6	191971	191976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3576	NC_002578	AAT	2	6	192141	192146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3577	NC_002578	A	6	6	192150	192155	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3578	NC_002578	T	7	7	192253	192259	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3579	NC_002578	ATA	2	6	192260	192265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3581	NC_002578	ATT	2	6	192329	192334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3582	NC_002578	CTTT	2	8	192368	192375	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3583	NC_002578	CTAG	2	8	192463	192470	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3584	NC_002578	TA	3	6	192503	192508	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3590	NC_002578	TGG	2	6	192816	192821	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16081345
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3597	NC_002578	CAG	2	6	193125	193130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081345
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3599	NC_002578	CAA	2	6	193281	193286	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16081345
3600	NC_002578	TGA	2	6	193314	193319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081345
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3603	NC_002578	CATA	2	8	193361	193368	50 %	25 %	0 %	25 %	16081345
3604	NC_002578	AAC	2	6	193374	193379	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16081345
3605	NC_002578	CT	3	6	193403	193408	0 %	50 %	0 %	50 %	16081345
3606	NC_002578	ATGA	2	8	193431	193438	50 %	25 %	25 %	0 %	16081345
3607	NC_002578	AAT	2	6	193450	193455	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3608	NC_002578	AATC	2	8	193464	193471	50 %	25 %	0 %	25 %	16082495
3609	NC_002578	TC	3	6	193470	193475	0 %	50 %	0 %	50 %	16082495
3610	NC_002578	TCA	2	6	193489	193494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082495
3611	NC_002578	TC	3	6	193495	193500	0 %	50 %	0 %	50 %	16082495
3612	NC_002578	CTC	2	6	193593	193598	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082495
3613	NC_002578	TGA	2	6	193692	193697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082495
3614	NC_002578	GATC	2	8	193742	193749	25 %	25 %	25 %	25 %	16082495
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3617	NC_002578	AT	3	6	193849	193854	50 %	50 %	0 %	0 %	16082495
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3621	NC_002578	CCTT	2	8	194031	194038	0 %	50 %	0 %	50 %	16082495
3622	NC_002578	CATG	2	8	194048	194055	25 %	25 %	25 %	25 %	16082495
3623	NC_002578	G	6	6	194122	194127	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3624	NC_002578	ACC	2	6	194180	194185	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3625	NC_002578	GT	3	6	194400	194405	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3626	NC_002578	GAT	2	6	194487	194492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082496
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3628	NC_002578	GGA	2	6	194745	194750	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16082496
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3873	NC_002578	CTAAA	2	10	209025	209034	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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