MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermoplasma acidophilum DSM 1728 chromosome

Total Repeats: 29169

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_002578	TGA	2	6	134086	134091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081299
2502	NC_002578	TA	3	6	134138	134143	50 %	50 %	0 %	0 %	16081299
2503	NC_002578	GA	3	6	134193	134198	50 %	0 %	50 %	0 %	16081299
2504	NC_002578	GCT	2	6	134209	134214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081299
2505	NC_002578	GTT	2	6	134217	134222	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16081299
2506	NC_002578	GAA	2	6	134245	134250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081299
2507	NC_002578	TA	3	6	134269	134274	50 %	50 %	0 %	0 %	16081299
2508	NC_002578	A	6	6	134303	134308	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2509	NC_002578	GTA	2	6	134338	134343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2510	NC_002578	GAT	2	6	134352	134357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081300
2511	NC_002578	CGG	2	6	134370	134375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16081300
2512	NC_002578	GCA	2	6	134471	134476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081300
2513	NC_002578	GGT	2	6	134712	134717	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16081300
2514	NC_002578	GGT	2	6	134751	134756	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16081300
2515	NC_002578	AGA	2	6	134764	134769	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081300
2516	NC_002578	TTG	2	6	134792	134797	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16081300
2517	NC_002578	TAC	2	6	134866	134871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081300
2518	NC_002578	AT	3	6	134921	134926	50 %	50 %	0 %	0 %	16081300
2519	NC_002578	TTC	2	6	135004	135009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081300
2520	NC_002578	AGA	2	6	135035	135040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081300
2521	NC_002578	TGA	2	6	135123	135128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081300
2522	NC_002578	TTA	2	6	135129	135134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16081300
2523	NC_002578	GTT	2	6	135147	135152	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16081300
2524	NC_002578	GAA	2	6	135171	135176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081300
2525	NC_002578	TTA	2	6	135294	135299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16081300
2526	NC_002578	AG	3	6	135353	135358	50 %	0 %	50 %	0 %	16081300
2527	NC_002578	TGAGG	2	10	135426	135435	20 %	20 %	60 %	0 %	16081300
2528	NC_002578	TTC	2	6	135526	135531	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081300
2529	NC_002578	GAG	2	6	135532	135537	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081300
2530	NC_002578	GTG	2	6	135582	135587	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16081300
2531	NC_002578	ACCT	2	8	135595	135602	25 %	25 %	0 %	50 %	16081300
2532	NC_002578	ATT	2	6	135635	135640	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16081300
2533	NC_002578	CAT	2	6	135654	135659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081300
2534	NC_002578	T	6	6	135663	135668	0 %	100 %	0 %	0 %	16081300
2535	NC_002578	CAG	2	6	135742	135747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081300
2536	NC_002578	ATG	2	6	135751	135756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081300
2537	NC_002578	GAA	2	6	135813	135818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081300
2538	NC_002578	CAA	2	6	135863	135868	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16081300
2539	NC_002578	CTA	2	6	135870	135875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081300
2540	NC_002578	GAC	2	6	135913	135918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081300
2541	NC_002578	CTT	2	6	135963	135968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081300
2542	NC_002578	GA	3	6	135987	135992	50 %	0 %	50 %	0 %	16081300
2543	NC_002578	CAT	2	6	136043	136048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081300
2544	NC_002578	AGAA	2	8	136154	136161	75 %	0 %	25 %	0 %	16081300
2545	NC_002578	TA	4	8	136180	136187	50 %	50 %	0 %	0 %	16081300
2546	NC_002578	GAA	2	6	136252	136257	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2547	NC_002578	TAA	2	6	136259	136264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2548	NC_002578	CCATAT	2	12	136339	136350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081301
2549	NC_002578	AAG	3	9	136385	136393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081301
2550	NC_002578	CTG	2	6	136495	136500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081301
2551	NC_002578	GAA	2	6	136517	136522	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081301
2552	NC_002578	AC	3	6	136660	136665	50 %	0 %	0 %	50 %	16081301
2553	NC_002578	ATA	2	6	136812	136817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081301
2554	NC_002578	ATG	2	6	136824	136829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081301
2555	NC_002578	GGC	2	6	136833	136838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16081301
2556	NC_002578	CAT	2	6	136876	136881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081301
2557	NC_002578	GCT	2	6	136907	136912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081301
2558	NC_002578	GCG	2	6	136921	136926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16081301
2559	NC_002578	CCAT	2	8	136928	136935	25 %	25 %	0 %	50 %	16081301
2560	NC_002578	AAGA	2	8	137057	137064	75 %	0 %	25 %	0 %	16081301
2561	NC_002578	AGA	2	6	137084	137089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081301
2562	NC_002578	TGA	2	6	137150	137155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2563	NC_002578	A	6	6	137175	137180	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2564	NC_002578	TTC	2	6	137181	137186	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2565	NC_002578	GGT	2	6	137292	137297	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16081302
2566	NC_002578	TCC	2	6	137364	137369	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16081302
2567	NC_002578	TGG	2	6	137533	137538	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16081302
2568	NC_002578	ATC	2	6	137539	137544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2569	NC_002578	TAA	2	6	137582	137587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2570	NC_002578	ATC	2	6	137606	137611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2571	NC_002578	GCG	2	6	137644	137649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16081303
2572	NC_002578	ATG	2	6	137657	137662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081303
2573	NC_002578	TCT	2	6	137672	137677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081303
2574	NC_002578	TG	3	6	137695	137700	0 %	50 %	50 %	0 %	16081303
2575	NC_002578	TGGT	2	8	137721	137728	0 %	50 %	50 %	0 %	16081303
2576	NC_002578	ATG	2	6	137756	137761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081303
2577	NC_002578	TCT	2	6	137790	137795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081303
2578	NC_002578	ACC	2	6	137846	137851	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16081303
2579	NC_002578	GGAA	2	8	137906	137913	50 %	0 %	50 %	0 %	16081303
2580	NC_002578	GCT	2	6	137932	137937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081303
2581	NC_002578	TTCC	2	8	137969	137976	0 %	50 %	0 %	50 %	16081303
2582	NC_002578	CCA	2	6	137985	137990	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16081303
2583	NC_002578	TCG	2	6	138071	138076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081303
2584	NC_002578	TAA	3	9	138270	138278	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081303
2585	NC_002578	GGA	2	6	138307	138312	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081303
2586	NC_002578	AAAGAA	2	12	138319	138330	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	16081303
2587	NC_002578	CGA	2	6	138354	138359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081303
2588	NC_002578	TTC	2	6	138431	138436	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081303
2589	NC_002578	GAA	2	6	138558	138563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081303
2590	NC_002578	ATA	2	6	138674	138679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081303
2591	NC_002578	CAT	2	6	138714	138719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081303
2592	NC_002578	GAG	2	6	138748	138753	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081303
2593	NC_002578	TGG	2	6	138857	138862	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16081303
2594	NC_002578	TCA	2	6	138870	138875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081303
2595	NC_002578	CTG	2	6	138903	138908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081303
2596	NC_002578	T	7	7	138968	138974	0 %	100 %	0 %	0 %	16081304
2597	NC_002578	GGC	2	6	139004	139009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16081304
2598	NC_002578	CTT	2	6	139032	139037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081304
2599	NC_002578	CAA	2	6	139072	139077	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16081304
2600	NC_002578	TAT	2	6	139151	139156	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16081304
2601	NC_002578	GCAGC	2	10	139219	139228	20 %	0 %	40 %	40 %	16081304
2602	NC_002578	CGT	2	6	139280	139285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081304
2603	NC_002578	GCA	2	6	139350	139355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081304
2604	NC_002578	TCA	2	6	139402	139407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081304
2605	NC_002578	GCA	2	6	139410	139415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081304
2606	NC_002578	CGA	2	6	139420	139425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081304
2607	NC_002578	GGAA	2	8	139485	139492	50 %	0 %	50 %	0 %	16081304
2608	NC_002578	TTCCT	2	10	139545	139554	0 %	60 %	0 %	40 %	16081304
2609	NC_002578	CA	3	6	139689	139694	50 %	0 %	0 %	50 %	16081304
2610	NC_002578	CGTATG	2	12	139741	139752	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16081304
2611	NC_002578	GCA	2	6	139764	139769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081304
2612	NC_002578	TGA	2	6	139772	139777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081304
2613	NC_002578	AG	3	6	139790	139795	50 %	0 %	50 %	0 %	16081304
2614	NC_002578	TGC	2	6	139797	139802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081304
2615	NC_002578	GAA	2	6	139861	139866	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081304
2616	NC_002578	AT	3	6	139871	139876	50 %	50 %	0 %	0 %	16081304
2617	NC_002578	GCCT	2	8	139959	139966	0 %	25 %	25 %	50 %	16081304
2618	NC_002578	CGC	2	6	140006	140011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16081304
2619	NC_002578	TAT	2	6	140054	140059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16081304
2620	NC_002578	GGAT	2	8	140063	140070	25 %	25 %	50 %	0 %	16081304
2621	NC_002578	TGGT	2	8	140139	140146	0 %	50 %	50 %	0 %	16081304
2622	NC_002578	GAA	3	9	140180	140188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081304
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2624	NC_002578	AAC	2	6	140285	140290	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16081304
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