MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermoplasma acidophilum DSM 1728 chromosome

Total Repeats: 29169

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
28501	NC_002578	GGT	2	6	1529866	1529871	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28502	NC_002578	GCTTTT	2	12	1529929	1529940	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
28503	NC_002578	GGA	2	6	1529950	1529955	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28504	NC_002578	CCT	2	6	1529964	1529969	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28505	NC_002578	GTT	2	6	1529997	1530002	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28506	NC_002578	CCCA	2	8	1530016	1530023	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
28507	NC_002578	CCA	2	6	1530030	1530035	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28508	NC_002578	TCCT	2	8	1530130	1530137	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28509	NC_002578	CAC	2	6	1530158	1530163	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28510	NC_002578	GA	3	6	1530211	1530216	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28511	NC_002578	GCC	2	6	1530294	1530299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
28512	NC_002578	CCG	2	6	1530348	1530353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
28513	NC_002578	CTT	2	6	1530364	1530369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28514	NC_002578	AGC	2	6	1530439	1530444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28515	NC_002578	CGG	2	6	1530913	1530918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
28516	NC_002578	TTC	2	6	1530934	1530939	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28517	NC_002578	CTC	2	6	1530983	1530988	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28518	NC_002578	C	6	6	1531017	1531022	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
28519	NC_002578	TCT	2	6	1531079	1531084	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28520	NC_002578	GTGA	2	8	1531100	1531107	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
28521	NC_002578	GCT	2	6	1531133	1531138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28522	NC_002578	GTT	2	6	1531223	1531228	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28523	NC_002578	ACCA	2	8	1531330	1531337	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
28524	NC_002578	GTA	2	6	1531386	1531391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28525	NC_002578	G	6	6	1531394	1531399	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
28526	NC_002578	TCC	2	6	1531482	1531487	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28527	NC_002578	TC	3	6	1531542	1531547	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28528	NC_002578	C	7	7	1531577	1531583	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
28529	NC_002578	TTC	2	6	1531664	1531669	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28530	NC_002578	CAC	2	6	1531763	1531768	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28531	NC_002578	ACG	2	6	1531875	1531880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28532	NC_002578	CTT	2	6	1531951	1531956	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28533	NC_002578	AGA	2	6	1531960	1531965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28534	NC_002578	AGG	2	6	1531979	1531984	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28535	NC_002578	CTT	2	6	1532017	1532022	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28536	NC_002578	TCC	2	6	1532095	1532100	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28537	NC_002578	CTT	2	6	1532233	1532238	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28538	NC_002578	TC	3	6	1532297	1532302	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28539	NC_002578	TCA	2	6	1532311	1532316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28540	NC_002578	AAT	2	6	1532429	1532434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28541	NC_002578	AT	3	6	1532464	1532469	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28542	NC_002578	TTAA	2	8	1532471	1532478	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28543	NC_002578	A	6	6	1532499	1532504	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28544	NC_002578	CT	3	6	1532563	1532568	0 %	50 %	0 %	50 %	16082444
28545	NC_002578	AAC	2	6	1532639	1532644	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16082444
28546	NC_002578	AAC	2	6	1532681	1532686	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16082444
28547	NC_002578	CGC	2	6	1532687	1532692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16082444
28548	NC_002578	CGAT	2	8	1532862	1532869	25 %	25 %	25 %	25 %	16082444
28549	NC_002578	CAT	2	6	1532912	1532917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082444
28550	NC_002578	TTC	2	6	1532942	1532947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082445
28551	NC_002578	GAA	2	6	1532956	1532961	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082445
28552	NC_002578	TCC	2	6	1532975	1532980	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082445
28553	NC_002578	TGT	2	6	1532994	1532999	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16082445
28554	NC_002578	AGG	2	6	1533089	1533094	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16082445
28555	NC_002578	CTC	2	6	1533118	1533123	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082445
28556	NC_002578	GGAT	2	8	1533179	1533186	25 %	25 %	50 %	0 %	16082445
28557	NC_002578	TTC	2	6	1533242	1533247	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082445
28558	NC_002578	GTA	2	6	1533271	1533276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082445
28559	NC_002578	CAG	2	6	1533387	1533392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082445
28560	NC_002578	ATCTC	2	10	1533410	1533419	20 %	40 %	0 %	40 %	16082445
28561	NC_002578	TAT	2	6	1533430	1533435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16082445
28562	NC_002578	TTC	2	6	1533443	1533448	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082445
28563	NC_002578	TGGCA	2	10	1533457	1533466	20 %	20 %	40 %	20 %	16082445
28564	NC_002578	TA	3	6	1533540	1533545	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28565	NC_002578	CAA	2	6	1533560	1533565	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28566	NC_002578	GTG	2	6	1533786	1533791	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28567	NC_002578	CCT	2	6	1533827	1533832	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082446
28568	NC_002578	GC	3	6	1533838	1533843	0 %	0 %	50 %	50 %	16082446
28569	NC_002578	AATGT	2	10	1533935	1533944	40 %	40 %	20 %	0 %	16082446
28570	NC_002578	GTT	2	6	1533953	1533958	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16082446
28571	NC_002578	CCA	2	6	1533978	1533983	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16082446
28572	NC_002578	ACGG	2	8	1534061	1534068	25 %	0 %	50 %	25 %	16082446
28573	NC_002578	ATC	2	6	1534087	1534092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082446
28574	NC_002578	ACC	2	6	1534097	1534102	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16082446
28575	NC_002578	TTC	2	6	1534175	1534180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082446
28576	NC_002578	ATTATG	2	12	1534191	1534202	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	16082446
28577	NC_002578	T	6	6	1534291	1534296	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28578	NC_002578	CGG	2	6	1534360	1534365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
28579	NC_002578	TAT	2	6	1534430	1534435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28580	NC_002578	TTA	2	6	1534575	1534580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28581	NC_002578	TTA	2	6	1534582	1534587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28582	NC_002578	CAG	2	6	1534701	1534706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082628
28583	NC_002578	CCG	2	6	1534786	1534791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16082628
28584	NC_002578	GAT	2	6	1534869	1534874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082628
28585	NC_002578	GTA	2	6	1534890	1534895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082628
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28587	NC_002578	GT	3	6	1534972	1534977	0 %	50 %	50 %	0 %	16082628
28588	NC_002578	GCA	2	6	1534990	1534995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082628
28589	NC_002578	GAC	2	6	1535166	1535171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082628
28590	NC_002578	AGA	2	6	1535219	1535224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082628
28591	NC_002578	TCTG	2	8	1535259	1535266	0 %	50 %	25 %	25 %	16082628
28592	NC_002578	T	6	6	1535278	1535283	0 %	100 %	0 %	0 %	16082628
28593	NC_002578	GAG	2	6	1535340	1535345	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16082628
28594	NC_002578	AT	3	6	1535355	1535360	50 %	50 %	0 %	0 %	16082628
28595	NC_002578	AGC	2	6	1535364	1535369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082628
28596	NC_002578	ACC	2	6	1535407	1535412	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16082628
28597	NC_002578	GGAAGA	2	12	1535492	1535503	50 %	0 %	50 %	0 %	16082628
28598	NC_002578	CCT	2	6	1535634	1535639	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082629
28599	NC_002578	CAT	2	6	1535713	1535718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082629
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28601	NC_002578	ACAT	2	8	1535768	1535775	50 %	25 %	0 %	25 %	16082629
28602	NC_002578	TCC	2	6	1535828	1535833	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082629
28603	NC_002578	CCAT	2	8	1535877	1535884	25 %	25 %	0 %	50 %	16082629
28604	NC_002578	GCT	2	6	1535898	1535903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082629
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28606	NC_002578	ATG	2	6	1536048	1536053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082629
28607	NC_002578	CAG	2	6	1536070	1536075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082629
28608	NC_002578	CGA	2	6	1536105	1536110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082629
28609	NC_002578	CGA	2	6	1536155	1536160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082629
28610	NC_002578	AGG	2	6	1536167	1536172	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16082629
28611	NC_002578	AGA	2	6	1536303	1536308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082629
28612	NC_002578	ATC	2	6	1536313	1536318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082629
28613	NC_002578	TCC	2	6	1536355	1536360	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082629
28614	NC_002578	GCAA	2	8	1536377	1536384	50 %	0 %	25 %	25 %	16082629
28615	NC_002578	AAC	2	6	1536394	1536399	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16082629
28616	NC_002578	AGGA	2	8	1536416	1536423	50 %	0 %	50 %	0 %	16082629
28617	NC_002578	GT	3	6	1536504	1536509	0 %	50 %	50 %	0 %	16082629
28618	NC_002578	AGT	2	6	1536615	1536620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082629
28619	NC_002578	TAT	2	6	1536628	1536633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16082629
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28621	NC_002578	ACC	2	6	1536701	1536706	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16082629
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28623	NC_002578	GAA	2	6	1536775	1536780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082629
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