MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermoplasma acidophilum DSM 1728 chromosome

Total Repeats: 29169

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_002578	GTC	2	6	106838	106843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161760540
2002	NC_002578	GCA	2	6	106953	106958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161760540
2003	NC_002578	AAG	2	6	107093	107098	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161760540
2004	NC_002578	AC	3	6	107107	107112	50 %	0 %	0 %	50 %	161760540
2005	NC_002578	T	8	8	107213	107220	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2006	NC_002578	T	6	6	107254	107259	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2007	NC_002578	GCG	2	6	107335	107340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2008	NC_002578	AGCGA	2	10	107357	107366	40 %	0 %	40 %	20 %	16081279
2009	NC_002578	CGC	2	6	107427	107432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16081279
2010	NC_002578	ACG	2	6	107444	107449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081279
2011	NC_002578	AGA	2	6	107499	107504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081279
2012	NC_002578	TGC	2	6	107620	107625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081279
2013	NC_002578	AAGG	2	8	107770	107777	50 %	0 %	50 %	0 %	16081279
2014	NC_002578	GGA	2	6	107854	107859	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081279
2015	NC_002578	GGC	2	6	107894	107899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16081279
2016	NC_002578	GGC	2	6	107926	107931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16081279
2017	NC_002578	CAC	2	6	107936	107941	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16081279
2018	NC_002578	ATA	2	6	107957	107962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081279
2019	NC_002578	CCT	2	6	107997	108002	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16081279
2020	NC_002578	AGGG	2	8	108005	108012	25 %	0 %	75 %	0 %	16081279
2021	NC_002578	GAT	2	6	108110	108115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081279
2022	NC_002578	GAA	2	6	108131	108136	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081279
2023	NC_002578	GA	3	6	108167	108172	50 %	0 %	50 %	0 %	16081279
2024	NC_002578	GAAG	2	8	108246	108253	50 %	0 %	50 %	0 %	16081279
2025	NC_002578	TCG	2	6	108261	108266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081279
2026	NC_002578	GGC	2	6	108272	108277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16081279
2027	NC_002578	GCT	2	6	108289	108294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081279
2028	NC_002578	ATA	2	6	108305	108310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081279
2029	NC_002578	ATA	2	6	108356	108361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081279
2030	NC_002578	AT	3	6	108420	108425	50 %	50 %	0 %	0 %	16081279
2031	NC_002578	AGGA	2	8	108449	108456	50 %	0 %	50 %	0 %	16081279
2032	NC_002578	ATC	2	6	108510	108515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081279
2033	NC_002578	GAA	2	6	108570	108575	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081279
2034	NC_002578	TTCTT	2	10	108642	108651	0 %	80 %	0 %	20 %	16081280
2035	NC_002578	ATACG	2	10	108861	108870	40 %	20 %	20 %	20 %	16081280
2036	NC_002578	CATA	2	8	108887	108894	50 %	25 %	0 %	25 %	16081280
2037	NC_002578	CAT	2	6	108914	108919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081280
2038	NC_002578	GGA	2	6	108925	108930	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081280
2039	NC_002578	GTT	2	6	108943	108948	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16081280
2040	NC_002578	GCCAG	2	10	108962	108971	20 %	0 %	40 %	40 %	16081280
2041	NC_002578	TCTG	2	8	109008	109015	0 %	50 %	25 %	25 %	16081280
2042	NC_002578	GAT	2	6	109044	109049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081280
2043	NC_002578	ATT	2	6	109058	109063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16081280
2044	NC_002578	TCA	2	6	109064	109069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081280
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2046	NC_002578	TTTGAA	2	12	109084	109095	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	16081280
2047	NC_002578	ATC	3	9	109166	109174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2048	NC_002578	ATA	2	6	109300	109305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2049	NC_002578	TGA	2	6	109352	109357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081281
2050	NC_002578	AGCAT	2	10	109374	109383	40 %	20 %	20 %	20 %	16081281
2051	NC_002578	TC	3	6	109388	109393	0 %	50 %	0 %	50 %	16081281
2052	NC_002578	AGA	2	6	109514	109519	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081281
2053	NC_002578	GGA	2	6	109595	109600	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081281
2054	NC_002578	A	6	6	109620	109625	100 %	0 %	0 %	0 %	16081281
2055	NC_002578	AAC	2	6	109707	109712	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16081281
2056	NC_002578	ATG	2	6	109790	109795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2057	NC_002578	GAT	2	6	109948	109953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2058	NC_002578	TGCCG	2	10	109958	109967	0 %	20 %	40 %	40 %	16081282
2059	NC_002578	TCT	2	6	110041	110046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081282
2060	NC_002578	GA	4	8	110177	110184	50 %	0 %	50 %	0 %	16081282
2061	NC_002578	CA	3	6	110340	110345	50 %	0 %	0 %	50 %	16081282
2062	NC_002578	ATG	2	6	110361	110366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081282
2063	NC_002578	GAA	2	6	110477	110482	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081282
2064	NC_002578	CTG	2	6	110605	110610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081282
2065	NC_002578	TAT	2	6	110616	110621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16081282
2066	NC_002578	ATT	2	6	110659	110664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2067	NC_002578	GAT	2	6	110714	110719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2071	NC_002578	AT	3	6	110844	110849	50 %	50 %	0 %	0 %	16081283
2072	NC_002578	TGG	2	6	110896	110901	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16081283
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2075	NC_002578	AT	3	6	111154	111159	50 %	50 %	0 %	0 %	16081283
2076	NC_002578	GTC	2	6	111167	111172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081283
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2083	NC_002578	GA	3	6	111786	111791	50 %	0 %	50 %	0 %	16081283
2084	NC_002578	TGC	2	6	111795	111800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081283
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2090	NC_002578	T	6	6	112008	112013	0 %	100 %	0 %	0 %	16082485
2091	NC_002578	ATC	2	6	112090	112095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082485
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2093	NC_002578	ATCA	2	8	112123	112130	50 %	25 %	0 %	25 %	16082485
2094	NC_002578	ATC	2	6	112162	112167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082485
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2101	NC_002578	CTG	2	6	112562	112567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082485
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2103	NC_002578	TCAT	2	8	112586	112593	25 %	50 %	0 %	25 %	16082485
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2109	NC_002578	TTTC	2	8	112991	112998	0 %	75 %	0 %	25 %	16082486
2110	NC_002578	TAT	2	6	113087	113092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16082486
2111	NC_002578	ATGT	2	8	113153	113160	25 %	50 %	25 %	0 %	16082486
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2119	NC_002578	GAT	2	6	113499	113504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082486
2120	NC_002578	TAT	2	6	113513	113518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16082486
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2123	NC_002578	TTG	2	6	113666	113671	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16081284
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2125	NC_002578	GAT	2	6	113723	113728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081284
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2251	NC_002578	T	6	6	121202	121207	0 %	100 %	0 %	0 %	16081290
2252	NC_002578	GATG	2	8	121338	121345	25 %	25 %	50 %	0 %	16081290
2253	NC_002578	CAG	2	6	121392	121397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081290
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2265	NC_002578	AT	3	6	121806	121811	50 %	50 %	0 %	0 %	16081291
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2284	NC_002578	AATT	2	8	122598	122605	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2285	NC_002578	A	7	7	122645	122651	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2374	NC_002578	TAC	2	6	127079	127084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081292
2375	NC_002578	ACG	2	6	127101	127106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081292
2376	NC_002578	TGA	2	6	127122	127127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081292
2377	NC_002578	GTT	2	6	127296	127301	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16081292
2378	NC_002578	CAT	2	6	127323	127328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081292
2379	NC_002578	AT	3	6	127338	127343	50 %	50 %	0 %	0 %	16081292
2380	NC_002578	ACA	2	6	127413	127418	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16081292
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2407	NC_002578	AGAA	2	8	129088	129095	75 %	0 %	25 %	0 %	16081294
2408	NC_002578	CT	3	6	129130	129135	0 %	50 %	0 %	50 %	16081294
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2410	NC_002578	TTA	2	6	129186	129191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2411	NC_002578	TAGT	2	8	129201	129208	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2412	NC_002578	GTA	2	6	129265	129270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2413	NC_002578	A	6	6	129275	129280	100 %	0 %	0 %	0 %	16081295
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2450	NC_002578	TCT	2	6	131632	131637	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081296
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2455	NC_002578	TATAT	2	10	131947	131956	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
2456	NC_002578	T	7	7	131970	131976	0 %	100 %	0 %	0 %	16081297
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2472	NC_002578	AT	4	8	132400	132407	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2473	NC_002578	TA	3	6	132464	132469	50 %	50 %	0 %	0 %	16081298
2474	NC_002578	ATA	2	6	132479	132484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081298
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2498	NC_002578	ATC	2	6	134015	134020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081299
2499	NC_002578	TAA	2	6	134030	134035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081299
2500	NC_002578	AGC	2	6	134042	134047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081299

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