MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermoplasma acidophilum DSM 1728 chromosome

Total Repeats: 29169

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_002578	GCA	2	6	81477	81482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081255
1502	NC_002578	GGAA	2	8	81528	81535	50 %	0 %	50 %	0 %	16081255
1503	NC_002578	TGA	2	6	81550	81555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081255
1504	NC_002578	TTTC	2	8	81581	81588	0 %	75 %	0 %	25 %	16081255
1505	NC_002578	GA	3	6	81630	81635	50 %	0 %	50 %	0 %	16081255
1506	NC_002578	ATA	2	6	81648	81653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081255
1507	NC_002578	AC	3	6	81655	81660	50 %	0 %	0 %	50 %	16081255
1508	NC_002578	CTT	2	6	81669	81674	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081255
1509	NC_002578	AGA	2	6	81773	81778	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081255
1510	NC_002578	TGG	2	6	81785	81790	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16081255
1511	NC_002578	ATA	2	6	81795	81800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081255
1512	NC_002578	TGA	2	6	81821	81826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081255
1513	NC_002578	TG	3	6	82044	82049	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_002578	TGA	2	6	82058	82063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_002578	AT	3	6	82079	82084	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_002578	TTTTC	2	10	82134	82143	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
1517	NC_002578	TTCA	2	8	82158	82165	25 %	50 %	0 %	25 %	16081256
1518	NC_002578	TCC	2	6	82187	82192	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16081256
1519	NC_002578	CTT	2	6	82195	82200	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081256
1520	NC_002578	TGTATA	2	12	82209	82220	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	16081256
1521	NC_002578	TG	3	6	82250	82255	0 %	50 %	50 %	0 %	16081256
1522	NC_002578	CGA	2	6	82276	82281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081256
1523	NC_002578	GAT	2	6	82335	82340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081256
1524	NC_002578	TG	3	6	82345	82350	0 %	50 %	50 %	0 %	16081256
1525	NC_002578	TCT	2	6	82382	82387	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1526	NC_002578	CGT	2	6	82548	82553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081257
1527	NC_002578	ATCT	2	8	82599	82606	25 %	50 %	0 %	25 %	16081257
1528	NC_002578	ATC	2	6	82618	82623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081257
1529	NC_002578	TCT	2	6	82755	82760	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081257
1530	NC_002578	ATC	2	6	82807	82812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081257
1531	NC_002578	CGGA	2	8	82926	82933	25 %	0 %	50 %	25 %	16081257
1532	NC_002578	AAC	2	6	82951	82956	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16081257
1533	NC_002578	T	6	6	82979	82984	0 %	100 %	0 %	0 %	16081257
1534	NC_002578	ATT	2	6	83020	83025	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16081257
1535	NC_002578	AGA	2	6	83067	83072	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081257
1536	NC_002578	TCT	2	6	83103	83108	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081257
1537	NC_002578	A	6	6	83146	83151	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_002578	GT	3	6	83154	83159	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_002578	ATT	2	6	83172	83177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16082480
1540	NC_002578	ATC	2	6	83227	83232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082480
1541	NC_002578	CTT	3	9	83353	83361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082480
1542	NC_002578	TAT	2	6	83395	83400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16082480
1543	NC_002578	GTA	2	6	83414	83419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082480
1544	NC_002578	TGC	2	6	83434	83439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082480
1545	NC_002578	GCG	2	6	83466	83471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16082480
1546	NC_002578	TCT	2	6	83508	83513	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082480
1547	NC_002578	CCT	2	6	83528	83533	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082480
1548	NC_002578	TAT	2	6	83554	83559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16082480
1549	NC_002578	TCT	2	6	83595	83600	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082480
1550	NC_002578	GTA	2	6	83638	83643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082480
1551	NC_002578	TTC	2	6	83645	83650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082480
1552	NC_002578	TCC	2	6	83714	83719	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082480
1553	NC_002578	GCT	2	6	83741	83746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082480
1554	NC_002578	CGT	2	6	83844	83849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082480
1555	NC_002578	CTT	2	6	83926	83931	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082480
1556	NC_002578	TCT	2	6	83988	83993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082480
1557	NC_002578	GCT	2	6	84036	84041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082480
1558	NC_002578	GAA	2	6	84157	84162	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082480
1559	NC_002578	CTTC	2	8	84189	84196	0 %	50 %	0 %	50 %	16082480
1560	NC_002578	GTC	2	6	84227	84232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082480
1561	NC_002578	TAT	2	6	84337	84342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16082480
1562	NC_002578	TGT	2	6	84401	84406	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_002578	AGA	2	6	84413	84418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_002578	GTT	2	6	84491	84496	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_002578	G	6	6	84517	84522	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_002578	CTT	3	9	84558	84566	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1567	NC_002578	GA	3	6	84567	84572	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_002578	ACGATC	2	12	84658	84669	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
1569	NC_002578	TAT	2	6	84750	84755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16081258
1570	NC_002578	TC	3	6	84765	84770	0 %	50 %	0 %	50 %	16081258
1571	NC_002578	TTG	2	6	84799	84804	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16081258
1572	NC_002578	CGC	2	6	84815	84820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16081258
1573	NC_002578	TATG	2	8	84870	84877	25 %	50 %	25 %	0 %	16081258
1574	NC_002578	TGC	2	6	84881	84886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081258
1575	NC_002578	AAG	2	6	85000	85005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081258
1576	NC_002578	GGA	2	6	85018	85023	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081258
1577	NC_002578	TCT	3	9	85024	85032	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081258
1578	NC_002578	CCG	2	6	85105	85110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16081258
1579	NC_002578	TAT	2	6	85179	85184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16081258
1580	NC_002578	TCCA	2	8	85230	85237	25 %	25 %	0 %	50 %	16081258
1581	NC_002578	ATT	2	6	85394	85399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_002578	AT	3	6	85435	85440	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1583	NC_002578	AT	3	6	85468	85473	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1584	NC_002578	TTG	2	6	85594	85599	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16081259
1585	NC_002578	TAA	2	6	85621	85626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081259
1586	NC_002578	CTT	2	6	85751	85756	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081259
1587	NC_002578	TGG	2	6	85757	85762	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16081259
1588	NC_002578	TA	3	6	85839	85844	50 %	50 %	0 %	0 %	16081259
1589	NC_002578	T	7	7	85863	85869	0 %	100 %	0 %	0 %	16081259
1590	NC_002578	CTG	2	6	85873	85878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081259
1591	NC_002578	TTG	2	6	86047	86052	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16081259
1592	NC_002578	CGG	2	6	86083	86088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16081259
1593	NC_002578	CT	3	6	86100	86105	0 %	50 %	0 %	50 %	16081259
1594	NC_002578	GCTG	2	8	86108	86115	0 %	25 %	50 %	25 %	16081259
1595	NC_002578	GAT	2	6	86153	86158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081259
1596	NC_002578	CCA	2	6	86215	86220	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16081259
1597	NC_002578	TA	3	6	86221	86226	50 %	50 %	0 %	0 %	16081259
1598	NC_002578	ACA	2	6	86463	86468	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16082481
1599	NC_002578	TTA	2	6	86490	86495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16082481
1600	NC_002578	AAG	2	6	86658	86663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082481
1601	NC_002578	GATCG	2	10	86673	86682	20 %	20 %	40 %	20 %	16082481
1602	NC_002578	AGA	2	6	86722	86727	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082481
1603	NC_002578	TC	3	6	86735	86740	0 %	50 %	0 %	50 %	16082481
1604	NC_002578	GCAGAG	2	12	86746	86757	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	16082481
1605	NC_002578	GTC	2	6	86758	86763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082481
1606	NC_002578	GCA	2	6	86770	86775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082481
1607	NC_002578	CTG	2	6	86800	86805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082481
1608	NC_002578	ATA	2	6	86860	86865	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16082481
1609	NC_002578	TCA	2	6	86945	86950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082481
1610	NC_002578	AT	3	6	86987	86992	50 %	50 %	0 %	0 %	16082481
1611	NC_002578	TGA	2	6	87042	87047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082481
1612	NC_002578	ATA	2	6	87052	87057	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16082481
1613	NC_002578	AGA	2	6	87089	87094	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082481
1614	NC_002578	ATA	2	6	87112	87117	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16082481
1615	NC_002578	GAG	2	6	87214	87219	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16082481
1616	NC_002578	TA	3	6	87223	87228	50 %	50 %	0 %	0 %	16082481
1617	NC_002578	GGATC	2	10	87244	87253	20 %	20 %	40 %	20 %	16082481
1618	NC_002578	TTA	2	6	87575	87580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16081260
1619	NC_002578	AT	3	6	87609	87614	50 %	50 %	0 %	0 %	16081260
1620	NC_002578	ATT	2	6	87684	87689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16081260
1621	NC_002578	GGT	2	6	87711	87716	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16081260
1622	NC_002578	GCT	2	6	87738	87743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081260
1623	NC_002578	ATT	2	6	87754	87759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16081260
1624	NC_002578	CCTT	2	8	87766	87773	0 %	50 %	0 %	50 %	16081260
1625	NC_002578	TTA	2	6	87788	87793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16081260
1626	NC_002578	ACA	2	6	87847	87852	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16081260
1627	NC_002578	TATT	2	8	88054	88061	25 %	75 %	0 %	0 %	16081260
1628	NC_002578	GTT	2	6	88101	88106	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16081260
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