MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermoplasma acidophilum DSM 1728 chromosome

Total Repeats: 29169

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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19002	NC_002578	T	6	6	1018563	1018568	0 %	100 %	0 %	0 %	16081993
19003	NC_002578	CA	3	6	1018570	1018575	50 %	0 %	0 %	50 %	16081993
19004	NC_002578	TAAT	2	8	1018613	1018620	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19005	NC_002578	AGCG	2	8	1018626	1018633	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
19006	NC_002578	ATC	2	6	1018684	1018689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19007	NC_002578	AAT	2	6	1018701	1018706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19008	NC_002578	GAA	2	6	1018743	1018748	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19009	NC_002578	TAG	2	6	1018749	1018754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19010	NC_002578	AAT	2	6	1018765	1018770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19011	NC_002578	A	6	6	1018792	1018797	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19012	NC_002578	TC	3	6	1018803	1018808	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19013	NC_002578	A	6	6	1018839	1018844	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19014	NC_002578	TA	4	8	1018938	1018945	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19015	NC_002578	AGA	2	6	1018976	1018981	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081994
19016	NC_002578	GAA	2	6	1019022	1019027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081994
19017	NC_002578	AAG	2	6	1019074	1019079	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081994
19018	NC_002578	ATA	2	6	1019095	1019100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081994
19019	NC_002578	GCC	2	6	1019152	1019157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16081994
19020	NC_002578	AGC	3	9	1019197	1019205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081994
19021	NC_002578	AT	3	6	1019275	1019280	50 %	50 %	0 %	0 %	16081994
19022	NC_002578	ATA	2	6	1019339	1019344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081994
19023	NC_002578	TA	3	6	1019343	1019348	50 %	50 %	0 %	0 %	16081994
19024	NC_002578	T	6	6	1019388	1019393	0 %	100 %	0 %	0 %	16081994
19025	NC_002578	AT	3	6	1019423	1019428	50 %	50 %	0 %	0 %	16081994
19026	NC_002578	CAAGA	2	10	1019502	1019511	60 %	0 %	20 %	20 %	16081994
19027	NC_002578	GTC	2	6	1019568	1019573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081994
19028	NC_002578	AAAC	2	8	1019712	1019719	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
19029	NC_002578	ATC	2	6	1019748	1019753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19030	NC_002578	ATA	2	6	1019755	1019760	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19031	NC_002578	TA	3	6	1019759	1019764	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19032	NC_002578	TAT	2	6	1019781	1019786	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19033	NC_002578	TGG	2	6	1019915	1019920	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16081995
19034	NC_002578	ATG	2	6	1020026	1020031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081995
19035	NC_002578	AAGA	2	8	1020032	1020039	75 %	0 %	25 %	0 %	16081995
19036	NC_002578	TA	3	6	1020142	1020147	50 %	50 %	0 %	0 %	16081995
19037	NC_002578	GA	3	6	1020161	1020166	50 %	0 %	50 %	0 %	16081995
19038	NC_002578	CCAGG	2	10	1020220	1020229	20 %	0 %	40 %	40 %	16081995
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19041	NC_002578	TAC	2	6	1020442	1020447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081996
19042	NC_002578	TACG	2	8	1020564	1020571	25 %	25 %	25 %	25 %	16081996
19043	NC_002578	GCA	2	6	1020607	1020612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081996
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19045	NC_002578	CCT	2	6	1020894	1020899	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16081996
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19054	NC_002578	CGC	2	6	1021325	1021330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16081997
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19059	NC_002578	TAT	2	6	1021620	1021625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16081997
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19063	NC_002578	ACA	2	6	1021876	1021881	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16081997
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19068	NC_002578	AAAT	2	8	1022068	1022075	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19069	NC_002578	AT	3	6	1022078	1022083	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19070	NC_002578	A	6	6	1022086	1022091	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19071	NC_002578	ATA	2	6	1022099	1022104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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19073	NC_002578	T	6	6	1022242	1022247	0 %	100 %	0 %	0 %	16082571
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19099	NC_002578	TAG	2	6	1023761	1023766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082572
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19103	NC_002578	GAG	2	6	1023970	1023975	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16082572
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19106	NC_002578	ATG	2	6	1024183	1024188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19107	NC_002578	TTC	2	6	1024354	1024359	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081998
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19112	NC_002578	ATC	2	6	1024645	1024650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081998
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19114	NC_002578	CATC	2	8	1024703	1024710	25 %	25 %	0 %	50 %	16081998
19115	NC_002578	TTA	2	6	1024868	1024873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16081998
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19118	NC_002578	CAA	2	6	1025096	1025101	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16081998
19119	NC_002578	AT	3	6	1025203	1025208	50 %	50 %	0 %	0 %	16081998
19120	NC_002578	AT	3	6	1025239	1025244	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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19240	NC_002578	CAT	2	6	1031519	1031524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082006
19241	NC_002578	CCT	2	6	1031599	1031604	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082007
19242	NC_002578	GAC	2	6	1031634	1031639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082007
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19244	NC_002578	TTC	2	6	1031755	1031760	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082007
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19246	NC_002578	TTC	2	6	1031832	1031837	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082008
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19322	NC_002578	A	7	7	1035915	1035921	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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19479	NC_002578	ATC	2	6	1045341	1045346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082015
19480	NC_002578	T	6	6	1045362	1045367	0 %	100 %	0 %	0 %	16082015
19481	NC_002578	ATTC	2	8	1045384	1045391	25 %	50 %	0 %	25 %	16082015
19482	NC_002578	GTT	2	6	1045396	1045401	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16082015
19483	NC_002578	ACT	2	6	1045407	1045412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082015
19484	NC_002578	ATG	2	6	1045450	1045455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082015
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19487	NC_002578	AATG	2	8	1045598	1045605	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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19500	NC_002578	AACTT	2	10	1046329	1046338	40 %	40 %	0 %	20 %	16082016

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