MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermoplasma acidophilum DSM 1728 chromosome

Total Repeats: 29169

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_002578	ATG	2	6	26364	26369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081210
502	NC_002578	AAG	2	6	26383	26388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081210
503	NC_002578	CAT	2	6	26431	26436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081210
504	NC_002578	AGA	2	6	26541	26546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081210
505	NC_002578	TGA	2	6	26638	26643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081210
506	NC_002578	AG	3	6	26721	26726	50 %	0 %	50 %	0 %	16081210
507	NC_002578	ACA	2	6	26781	26786	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16081210
508	NC_002578	A	6	6	26791	26796	100 %	0 %	0 %	0 %	16081210
509	NC_002578	AG	3	6	26864	26869	50 %	0 %	50 %	0 %	16081210
510	NC_002578	GAT	2	6	26944	26949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081211
511	NC_002578	ATC	2	6	26963	26968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081211
512	NC_002578	GAG	2	6	27119	27124	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081211
513	NC_002578	AGA	2	6	27279	27284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081211
514	NC_002578	TTC	2	6	27356	27361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081211
515	NC_002578	GAA	2	6	27428	27433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081211
516	NC_002578	ATC	2	6	27459	27464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081211
517	NC_002578	CAG	2	6	27588	27593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081211
518	NC_002578	GCT	2	6	27731	27736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081211
519	NC_002578	ACAT	2	8	27899	27906	50 %	25 %	0 %	25 %	16081211
520	NC_002578	CGG	2	6	27934	27939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16081211
521	NC_002578	AGC	2	6	28002	28007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081211
522	NC_002578	TG	3	6	28114	28119	0 %	50 %	50 %	0 %	16081211
523	NC_002578	AT	3	6	28139	28144	50 %	50 %	0 %	0 %	16081212
524	NC_002578	TG	3	6	28283	28288	0 %	50 %	50 %	0 %	16081212
525	NC_002578	CTG	2	6	28380	28385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081212
526	NC_002578	GAGAA	2	10	28545	28554	60 %	0 %	40 %	0 %	16081212
527	NC_002578	AT	3	6	28572	28577	50 %	50 %	0 %	0 %	16081212
528	NC_002578	TCC	2	6	28604	28609	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16081213
529	NC_002578	TCTAT	2	10	28627	28636	20 %	60 %	0 %	20 %	16081213
530	NC_002578	GAA	2	6	28676	28681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081213
531	NC_002578	TTG	2	6	28709	28714	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16081213
532	NC_002578	CAC	2	6	28722	28727	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16081213
533	NC_002578	GCT	2	6	28833	28838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081213
534	NC_002578	ATG	2	6	28877	28882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081213
535	NC_002578	GTT	2	6	28899	28904	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16081213
536	NC_002578	ATC	2	6	28929	28934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081213
537	NC_002578	AC	3	6	28991	28996	50 %	0 %	0 %	50 %	16081213
538	NC_002578	GAT	3	9	29052	29060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
539	NC_002578	T	6	6	29080	29085	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_002578	TCTAT	2	10	29185	29194	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
541	NC_002578	CAT	2	6	29228	29233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
542	NC_002578	CGG	2	6	29235	29240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
543	NC_002578	TCCA	2	8	29244	29251	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
544	NC_002578	TGC	2	6	29358	29363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081214
545	NC_002578	CGA	2	6	29371	29376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081214
546	NC_002578	ATG	2	6	29466	29471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081214
547	NC_002578	AGCG	2	8	29494	29501	25 %	0 %	50 %	25 %	16081214
548	NC_002578	CTG	2	6	29618	29623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081214
549	NC_002578	ATA	2	6	29636	29641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081214
550	NC_002578	AGG	2	6	29751	29756	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081214
551	NC_002578	ATA	2	6	29771	29776	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081214
552	NC_002578	ATA	2	6	29801	29806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081214
553	NC_002578	AAC	2	6	29882	29887	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16081214
554	NC_002578	AGA	2	6	29935	29940	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081214
555	NC_002578	A	6	6	29956	29961	100 %	0 %	0 %	0 %	16081214
556	NC_002578	CTT	2	6	30062	30067	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081215
557	NC_002578	CAG	3	9	30076	30084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081215
558	NC_002578	TCA	2	6	30101	30106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081215
559	NC_002578	TGT	2	6	30111	30116	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16081215
560	NC_002578	TTG	2	6	30147	30152	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16081215
561	NC_002578	GC	3	6	30158	30163	0 %	0 %	50 %	50 %	16081215
562	NC_002578	CAT	2	6	30175	30180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081215
563	NC_002578	AT	3	6	30296	30301	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_002578	ATAAA	2	10	30331	30340	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_002578	TATG	2	8	30377	30384	25 %	50 %	25 %	0 %	16081216
566	NC_002578	TAT	2	6	30443	30448	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16081216
567	NC_002578	CCT	2	6	30457	30462	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16081216
568	NC_002578	TTC	2	6	30495	30500	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081216
569	NC_002578	A	6	6	30556	30561	100 %	0 %	0 %	0 %	16081216
570	NC_002578	ATC	2	6	30584	30589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081216
571	NC_002578	TCC	2	6	30690	30695	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16081216
572	NC_002578	TCT	2	6	30727	30732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081216
573	NC_002578	ATC	2	6	30877	30882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
574	NC_002578	GAT	2	6	30914	30919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
575	NC_002578	TTA	2	6	30968	30973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
576	NC_002578	AG	3	6	31059	31064	50 %	0 %	50 %	0 %	16082473
577	NC_002578	GA	3	6	31149	31154	50 %	0 %	50 %	0 %	16082473
578	NC_002578	CAG	3	9	31205	31213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082473
579	NC_002578	GAG	2	6	31224	31229	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16082473
580	NC_002578	GCC	2	6	31257	31262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16082473
581	NC_002578	TCG	2	6	31339	31344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082473
582	NC_002578	GA	3	6	31487	31492	50 %	0 %	50 %	0 %	16082473
583	NC_002578	GGA	2	6	31520	31525	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16082473
584	NC_002578	AG	3	6	31532	31537	50 %	0 %	50 %	0 %	16082473
585	NC_002578	AGG	3	9	31660	31668	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16082473
586	NC_002578	TGA	2	6	31796	31801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082473
587	NC_002578	GAA	2	6	31850	31855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082473
588	NC_002578	GCAG	2	8	31884	31891	25 %	0 %	50 %	25 %	16082473
589	NC_002578	CCAGG	2	10	31912	31921	20 %	0 %	40 %	40 %	16082473
590	NC_002578	GCC	2	6	31965	31970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16082473
591	NC_002578	GGC	2	6	32054	32059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16082473
592	NC_002578	CGAT	2	8	32080	32087	25 %	25 %	25 %	25 %	16082473
593	NC_002578	GAT	2	6	32160	32165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082473
594	NC_002578	GA	3	6	32188	32193	50 %	0 %	50 %	0 %	16082473
595	NC_002578	TGG	2	6	32262	32267	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16082473
596	NC_002578	TAC	2	6	32361	32366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082473
597	NC_002578	ATT	2	6	32368	32373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16082473
598	NC_002578	AT	3	6	32383	32388	50 %	50 %	0 %	0 %	16082473
599	NC_002578	AGA	2	6	32505	32510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082473
600	NC_002578	TCA	3	9	32524	32532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082473
601	NC_002578	TAC	2	6	32538	32543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082473
602	NC_002578	CTT	2	6	32547	32552	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082473
603	NC_002578	A	6	6	32598	32603	100 %	0 %	0 %	0 %	16082473
604	NC_002578	AAGG	2	8	32609	32616	50 %	0 %	50 %	0 %	16082473
605	NC_002578	ATA	2	6	32655	32660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16082473
606	NC_002578	AGA	2	6	32778	32783	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082473
607	NC_002578	CAT	2	6	32786	32791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082473
608	NC_002578	CAA	2	6	32798	32803	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16082473
609	NC_002578	TTC	2	6	32835	32840	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082473
610	NC_002578	GCA	2	6	32929	32934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082473
611	NC_002578	AAG	2	6	33015	33020	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082473
612	NC_002578	TGA	2	6	33167	33172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082473
613	NC_002578	GGC	2	6	33251	33256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16082473
614	NC_002578	CGA	2	6	33287	33292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082473
615	NC_002578	TCT	2	6	33293	33298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082473
616	NC_002578	TAC	2	6	33306	33311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082473
617	NC_002578	ATA	2	6	33366	33371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16082473
618	NC_002578	CGG	2	6	33392	33397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16082473
619	NC_002578	ATA	2	6	33411	33416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16082473
620	NC_002578	TTC	2	6	33453	33458	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082473
621	NC_002578	AGG	2	6	33471	33476	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16082473
622	NC_002578	TGA	2	6	33488	33493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082473
623	NC_002578	GATG	2	8	33512	33519	25 %	25 %	50 %	0 %	16082473
624	NC_002578	G	6	6	33561	33566	0 %	0 %	100 %	0 %	16082473
625	NC_002578	TGTCC	2	10	33584	33593	0 %	40 %	20 %	40 %	16082473
626	NC_002578	GGC	2	6	33674	33679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16082473
627	NC_002578	GAT	2	6	33716	33721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082473
628	NC_002578	AAG	2	6	33741	33746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082473
629	NC_002578	ATC	2	6	33764	33769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082473
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631	NC_002578	GAA	2	6	33872	33877	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082473
632	NC_002578	CCGTG	2	10	33881	33890	0 %	20 %	40 %	40 %	16082473
633	NC_002578	TGA	2	6	33896	33901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082473
634	NC_002578	TGC	2	6	33905	33910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082473
635	NC_002578	TTC	2	6	33963	33968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082473
636	NC_002578	TGCAA	2	10	33993	34002	40 %	20 %	20 %	20 %	16082473
637	NC_002578	CAA	2	6	34048	34053	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16082473
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641	NC_002578	CAG	2	6	34289	34294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081217
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645	NC_002578	GTG	3	9	34558	34566	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16081217
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649	NC_002578	TTC	2	6	34738	34743	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081217
650	NC_002578	ATG	2	6	34750	34755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081217
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653	NC_002578	TCT	2	6	34830	34835	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081217
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659	NC_002578	ATC	2	6	35200	35205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081218
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662	NC_002578	TCA	2	6	35312	35317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081218
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718	NC_002578	TTAA	2	8	38843	38850	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
719	NC_002578	AAT	2	6	38901	38906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081221
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729	NC_002578	TTA	2	6	39515	39520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16081222
730	NC_002578	ATT	2	6	39562	39567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16081222
731	NC_002578	ATC	2	6	39630	39635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081222
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733	NC_002578	ATC	2	6	39658	39663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081222
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740	NC_002578	ATCC	2	8	39881	39888	25 %	25 %	0 %	50 %	16081222
741	NC_002578	ATC	2	6	40035	40040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081222
742	NC_002578	CCA	2	6	40045	40050	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16081222
743	NC_002578	ATC	2	6	40051	40056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081222
744	NC_002578	TCC	2	6	40060	40065	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082635
745	NC_002578	TATCT	2	10	40074	40083	20 %	60 %	0 %	20 %	16082635
746	NC_002578	CTT	2	6	40089	40094	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082635
747	NC_002578	AAT	2	6	40122	40127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16082635
748	NC_002578	TCC	2	6	40200	40205	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082635
749	NC_002578	CTT	2	6	40232	40237	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082635
750	NC_002578	ATC	2	6	40281	40286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082635
751	NC_002578	ATC	2	6	40320	40325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082635
752	NC_002578	ATA	2	6	40369	40374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
753	NC_002578	TG	3	6	40400	40405	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
754	NC_002578	CAA	2	6	40537	40542	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
755	NC_002578	A	7	7	40570	40576	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
756	NC_002578	CTG	2	6	40624	40629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
757	NC_002578	CAGAT	2	10	40646	40655	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
758	NC_002578	CTTTAT	2	12	40682	40693	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
759	NC_002578	GATC	2	8	40720	40727	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
760	NC_002578	CTC	2	6	40796	40801	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
761	NC_002578	CTT	2	6	40872	40877	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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