MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermoplasma acidophilum DSM 1728 chromosome

Total Repeats: 29169

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_002578	CTC	2	6	326246	326251	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16081439
6002	NC_002578	GGA	2	6	326470	326475	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081439
6003	NC_002578	TGG	2	6	326478	326483	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16081439
6004	NC_002578	ATA	2	6	326504	326509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081439
6005	NC_002578	CAGA	2	8	326514	326521	50 %	0 %	25 %	25 %	16081439
6006	NC_002578	GAT	2	6	326570	326575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081439
6007	NC_002578	GAA	2	6	326609	326614	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081439
6008	NC_002578	TGA	2	6	326634	326639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081439
6009	NC_002578	GGA	2	6	326680	326685	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081439
6010	NC_002578	TGT	2	6	326839	326844	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16082510
6011	NC_002578	AT	3	6	326878	326883	50 %	50 %	0 %	0 %	16082510
6012	NC_002578	CTT	2	6	327041	327046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082510
6013	NC_002578	GCC	2	6	327110	327115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16082510
6014	NC_002578	AAG	2	6	327170	327175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082510
6015	NC_002578	CGAG	2	8	327187	327194	25 %	0 %	50 %	25 %	16082510
6016	NC_002578	AAGA	2	8	327256	327263	75 %	0 %	25 %	0 %	16081440
6017	NC_002578	GA	3	6	327266	327271	50 %	0 %	50 %	0 %	16081440
6018	NC_002578	AGA	2	6	327300	327305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081440
6019	NC_002578	GGA	2	6	327349	327354	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081440
6020	NC_002578	GAT	2	6	327364	327369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081440
6021	NC_002578	TAT	2	6	327377	327382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16081440
6022	NC_002578	GCC	2	6	327431	327436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16081440
6023	NC_002578	GTT	2	6	327508	327513	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16081440
6024	NC_002578	ATG	2	6	327526	327531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081440
6025	NC_002578	AT	3	6	327603	327608	50 %	50 %	0 %	0 %	16081441
6026	NC_002578	ATT	2	6	327615	327620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16081441
6027	NC_002578	ACA	2	6	327642	327647	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16081441
6028	NC_002578	AG	3	6	327691	327696	50 %	0 %	50 %	0 %	16081441
6029	NC_002578	GAG	2	6	327721	327726	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081441
6030	NC_002578	AAG	2	6	327814	327819	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081441
6031	NC_002578	AGG	2	6	327827	327832	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081441
6032	NC_002578	AAG	2	6	327850	327855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081441
6033	NC_002578	AGA	2	6	327887	327892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081441
6034	NC_002578	GAT	2	6	327929	327934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081441
6035	NC_002578	ATC	2	6	327971	327976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6036	NC_002578	ACA	2	6	328023	328028	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16081442
6037	NC_002578	GTC	2	6	328078	328083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081442
6038	NC_002578	AGC	2	6	328168	328173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081442
6039	NC_002578	GCCA	2	8	328198	328205	25 %	0 %	25 %	50 %	16081442
6040	NC_002578	TTTC	2	8	328210	328217	0 %	75 %	0 %	25 %	16081442
6041	NC_002578	CGA	2	6	328254	328259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081442
6042	NC_002578	CATG	2	8	328323	328330	25 %	25 %	25 %	25 %	16081442
6043	NC_002578	CTC	2	6	328391	328396	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16081442
6044	NC_002578	AGA	2	6	328443	328448	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081442
6045	NC_002578	TAT	3	9	328531	328539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16081442
6046	NC_002578	CGG	2	6	328545	328550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16081442
6047	NC_002578	CCT	2	6	328575	328580	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16081442
6048	NC_002578	TATCC	2	10	328582	328591	20 %	40 %	0 %	40 %	16081442
6049	NC_002578	GCA	2	6	328676	328681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081442
6050	NC_002578	GAA	2	6	328711	328716	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081442
6051	NC_002578	ATAGG	2	10	328720	328729	40 %	20 %	40 %	0 %	16081442
6052	NC_002578	ATA	2	6	328759	328764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081442
6053	NC_002578	CTT	2	6	328768	328773	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081442
6054	NC_002578	AAC	2	6	328858	328863	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16081442
6055	NC_002578	ATC	2	6	328894	328899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6056	NC_002578	GATC	2	8	328902	328909	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6057	NC_002578	GAAAT	2	10	328911	328920	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
6058	NC_002578	GT	3	6	329088	329093	0 %	50 %	50 %	0 %	16081443
6059	NC_002578	GAA	2	6	329108	329113	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081443
6060	NC_002578	ATGA	2	8	329121	329128	50 %	25 %	25 %	0 %	16081443
6061	NC_002578	TAT	2	6	329312	329317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16081443
6062	NC_002578	ATG	2	6	329349	329354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081443
6063	NC_002578	TTA	2	6	329389	329394	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6064	NC_002578	A	6	6	329396	329401	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6065	NC_002578	A	6	6	329405	329410	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6066	NC_002578	TCC	2	6	329448	329453	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16081444
6067	NC_002578	GTG	2	6	329563	329568	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16081444
6068	NC_002578	TTC	2	6	329572	329577	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081444
6069	NC_002578	GAACT	2	10	329586	329595	40 %	20 %	20 %	20 %	16081444
6070	NC_002578	CA	3	6	329659	329664	50 %	0 %	0 %	50 %	16081444
6071	NC_002578	TATT	2	8	329699	329706	25 %	75 %	0 %	0 %	16081444
6072	NC_002578	GCA	2	6	329753	329758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081444
6073	NC_002578	CTG	2	6	329775	329780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081444
6074	NC_002578	TCGT	2	8	329866	329873	0 %	50 %	25 %	25 %	16081444
6075	NC_002578	TAT	2	6	329981	329986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16081444
6076	NC_002578	CTG	2	6	330086	330091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081444
6077	NC_002578	GAA	2	6	330102	330107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081444
6078	NC_002578	TCCAG	2	10	330170	330179	20 %	20 %	20 %	40 %	16081444
6079	NC_002578	CCT	2	6	330266	330271	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16081444
6080	NC_002578	CTG	2	6	330282	330287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081444
6081	NC_002578	CCGGTT	2	12	330307	330318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081444
6082	NC_002578	GTA	2	6	330342	330347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081444
6083	NC_002578	GTT	2	6	330405	330410	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16081444
6084	NC_002578	AACTG	2	10	330433	330442	40 %	20 %	20 %	20 %	16081444
6085	NC_002578	GAA	2	6	330525	330530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081444
6086	NC_002578	ATTT	2	8	330546	330553	25 %	75 %	0 %	0 %	16081444
6087	NC_002578	GCC	2	6	330585	330590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16081444
6088	NC_002578	CTGG	2	8	330621	330628	0 %	25 %	50 %	25 %	16081444
6089	NC_002578	CGT	2	6	330636	330641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081444
6090	NC_002578	GCT	2	6	330676	330681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081444
6091	NC_002578	ACC	2	6	330793	330798	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16081444
6092	NC_002578	CCAT	2	8	330965	330972	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6093	NC_002578	ATC	2	6	331155	331160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6094	NC_002578	TCT	2	6	331280	331285	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6095	NC_002578	AAT	2	6	331316	331321	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081445
6096	NC_002578	GAT	2	6	331388	331393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081445
6097	NC_002578	GATAA	2	10	331439	331448	60 %	20 %	20 %	0 %	16081445
6098	NC_002578	TC	3	6	331478	331483	0 %	50 %	0 %	50 %	16081445
6099	NC_002578	CAT	2	6	331491	331496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081445
6100	NC_002578	GAT	2	6	331549	331554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081445
6101	NC_002578	ATC	2	6	331612	331617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081445
6102	NC_002578	ACC	2	6	331772	331777	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16081445
6103	NC_002578	A	6	6	331785	331790	100 %	0 %	0 %	0 %	16081445
6104	NC_002578	GCT	2	6	331798	331803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081445
6105	NC_002578	GAT	2	6	331888	331893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081445
6106	NC_002578	AGG	2	6	331941	331946	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081445
6107	NC_002578	AG	3	6	331964	331969	50 %	0 %	50 %	0 %	16081445
6108	NC_002578	ATA	2	6	331973	331978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081445
6109	NC_002578	TGA	2	6	331999	332004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081445
6110	NC_002578	GAA	2	6	332020	332025	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081445
6111	NC_002578	TGAGC	2	10	332050	332059	20 %	20 %	40 %	20 %	16081445
6112	NC_002578	GCCAGA	2	12	332134	332145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081445
6113	NC_002578	GGA	2	6	332161	332166	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081445
6114	NC_002578	GGA	2	6	332245	332250	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6115	NC_002578	AGGC	2	8	332322	332329	25 %	0 %	50 %	25 %	16081446
6116	NC_002578	GAT	2	6	332384	332389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081446
6117	NC_002578	GATAG	2	10	332433	332442	40 %	20 %	40 %	0 %	16081446
6118	NC_002578	TGC	2	6	332450	332455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081446
6119	NC_002578	ACG	2	6	332475	332480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081446
6120	NC_002578	TCT	2	6	332589	332594	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081446
6121	NC_002578	CGG	2	6	332666	332671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16081446
6122	NC_002578	TA	3	6	332691	332696	50 %	50 %	0 %	0 %	16081446
6123	NC_002578	ATG	2	6	332739	332744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081446
6124	NC_002578	GGA	2	6	332750	332755	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081446
6125	NC_002578	TGA	2	6	332773	332778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081446
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6189	NC_002578	CGATC	2	10	337501	337510	20 %	20 %	20 %	40 %	16081452
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6231	NC_002578	TA	3	6	339716	339721	50 %	50 %	0 %	0 %	16082511
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6240	NC_002578	ATGG	2	8	340092	340099	25 %	25 %	50 %	0 %	16082511
6241	NC_002578	TC	3	6	340119	340124	0 %	50 %	0 %	50 %	16082511
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6244	NC_002578	ATTT	2	8	340486	340493	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6245	NC_002578	AGA	2	6	340525	340530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6246	NC_002578	TCGC	2	8	340548	340555	0 %	25 %	25 %	50 %	16081454
6247	NC_002578	ATTC	2	8	340600	340607	25 %	50 %	0 %	25 %	16081454
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