MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermoplasma acidophilum DSM 1728 chromosome

Total Repeats: 29169

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_002578	AG	3	6	298153	298158	50 %	0 %	50 %	0 %	16081423
5502	NC_002578	TTC	2	6	298188	298193	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081423
5503	NC_002578	TGC	2	6	298276	298281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081423
5504	NC_002578	GATCA	2	10	298282	298291	40 %	20 %	20 %	20 %	16081423
5505	NC_002578	ATA	2	6	298321	298326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081423
5506	NC_002578	CCT	2	6	298482	298487	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16081423
5507	NC_002578	T	7	7	298569	298575	0 %	100 %	0 %	0 %	16081423
5508	NC_002578	TTC	2	6	298579	298584	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081423
5509	NC_002578	AGGTC	2	10	298592	298601	20 %	20 %	40 %	20 %	16081423
5510	NC_002578	TCA	2	6	298628	298633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081423
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5513	NC_002578	GGT	2	6	298848	298853	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16081423
5514	NC_002578	TCCT	2	8	298889	298896	0 %	50 %	0 %	50 %	16081423
5515	NC_002578	T	6	6	298910	298915	0 %	100 %	0 %	0 %	16081423
5516	NC_002578	TA	3	6	298927	298932	50 %	50 %	0 %	0 %	16081423
5517	NC_002578	TCT	2	6	298943	298948	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081423
5518	NC_002578	GAA	2	6	298995	299000	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081423
5519	NC_002578	TTC	2	6	299138	299143	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081423
5520	NC_002578	TCT	2	6	299190	299195	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081423
5521	NC_002578	GCC	2	6	299230	299235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16081423
5522	NC_002578	TTGC	2	8	299269	299276	0 %	50 %	25 %	25 %	16081423
5523	NC_002578	CCT	2	6	299430	299435	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16081423
5524	NC_002578	CT	3	6	299482	299487	0 %	50 %	0 %	50 %	16081423
5525	NC_002578	ATC	2	6	299659	299664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081423
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5527	NC_002578	TCCT	2	8	299720	299727	0 %	50 %	0 %	50 %	16081423
5528	NC_002578	AAG	2	6	299740	299745	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081423
5529	NC_002578	AATT	2	8	299774	299781	50 %	50 %	0 %	0 %	16081424
5530	NC_002578	GAA	2	6	299818	299823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081424
5531	NC_002578	GCT	2	6	299885	299890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081424
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5533	NC_002578	GGT	2	6	299916	299921	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16081424
5534	NC_002578	CT	3	6	299958	299963	0 %	50 %	0 %	50 %	16081424
5535	NC_002578	TGA	2	6	299964	299969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081424
5536	NC_002578	CGA	2	6	299991	299996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081424
5537	NC_002578	TAT	2	6	300022	300027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16081424
5538	NC_002578	TGT	2	6	300210	300215	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16081424
5539	NC_002578	AGC	2	6	300299	300304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081424
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5541	NC_002578	GGAT	2	8	300373	300380	25 %	25 %	50 %	0 %	16081424
5542	NC_002578	TCT	2	6	300393	300398	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081424
5543	NC_002578	TAG	2	6	300506	300511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081424
5544	NC_002578	GACGA	2	10	300521	300530	40 %	0 %	40 %	20 %	16081424
5545	NC_002578	TCT	2	6	300564	300569	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081424
5546	NC_002578	CGT	2	6	300588	300593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081424
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5549	NC_002578	TGC	2	6	300804	300809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081424
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5551	NC_002578	TA	3	6	300928	300933	50 %	50 %	0 %	0 %	16081424
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5554	NC_002578	AT	3	6	300991	300996	50 %	50 %	0 %	0 %	16081424
5555	NC_002578	GTT	2	6	301031	301036	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16081425
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5557	NC_002578	TA	3	6	301206	301211	50 %	50 %	0 %	0 %	16081425
5558	NC_002578	GCA	2	6	301227	301232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081425
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5562	NC_002578	TA	3	6	301559	301564	50 %	50 %	0 %	0 %	16081425
5563	NC_002578	GCT	3	9	301568	301576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081425
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5572	NC_002578	GCC	2	6	302205	302210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16081426
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5574	NC_002578	GTA	2	6	302280	302285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081426
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5581	NC_002578	TGT	2	6	302519	302524	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16081426
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5587	NC_002578	TCG	2	6	302801	302806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081427
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5591	NC_002578	ATC	2	6	303166	303171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081427
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5603	NC_002578	TA	3	6	303704	303709	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5604	NC_002578	ATA	2	6	303715	303720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5605	NC_002578	ACTG	2	8	303818	303825	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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5608	NC_002578	AAG	3	9	304008	304016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082505
5609	NC_002578	G	6	6	304016	304021	0 %	0 %	100 %	0 %	16082505
5610	NC_002578	TTG	2	6	304198	304203	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16082505
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5612	NC_002578	CT	3	6	304420	304425	0 %	50 %	0 %	50 %	16082505
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