MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermoplasma acidophilum DSM 1728 chromosome

Total Repeats: 29169

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_002578	CCT	2	6	244240	244245	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082500
4502	NC_002578	GGGA	2	8	244323	244330	25 %	0 %	75 %	0 %	16082500
4503	NC_002578	AAG	2	6	244343	244348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082500
4504	NC_002578	GTG	2	6	244403	244408	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16082500
4505	NC_002578	AGGA	2	8	244459	244466	50 %	0 %	50 %	0 %	16081384
4506	NC_002578	TCG	2	6	244486	244491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081384
4507	NC_002578	CAT	2	6	244524	244529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081384
4508	NC_002578	ATA	2	6	244555	244560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081384
4509	NC_002578	TCC	2	6	244817	244822	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16081384
4510	NC_002578	AGA	2	6	244920	244925	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081384
4511	NC_002578	GAA	2	6	244986	244991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081384
4512	NC_002578	AGC	2	6	245091	245096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081384
4513	NC_002578	GAT	2	6	245130	245135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081384
4514	NC_002578	CTG	2	6	245230	245235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081385
4515	NC_002578	T	7	7	245362	245368	0 %	100 %	0 %	0 %	16081385
4516	NC_002578	AGC	2	6	245385	245390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081385
4517	NC_002578	TCG	2	6	245399	245404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081385
4518	NC_002578	CTT	2	6	245417	245422	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081385
4519	NC_002578	GTT	2	6	245436	245441	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16081385
4520	NC_002578	TAT	2	6	245532	245537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16081385
4521	NC_002578	CTT	2	6	245539	245544	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081385
4522	NC_002578	GAT	2	6	245599	245604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081385
4523	NC_002578	TTC	2	6	245686	245691	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081385
4524	NC_002578	CAAC	2	8	245695	245702	50 %	0 %	0 %	50 %	16081385
4525	NC_002578	GCC	2	6	245752	245757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16081385
4526	NC_002578	TCTG	2	8	245828	245835	0 %	50 %	25 %	25 %	16081385
4527	NC_002578	AAC	2	6	245919	245924	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16081385
4528	NC_002578	TCT	2	6	245969	245974	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081385
4529	NC_002578	CTC	2	6	246031	246036	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16081385
4530	NC_002578	TCA	2	6	246082	246087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081385
4531	NC_002578	CCG	2	6	246307	246312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16081385
4532	NC_002578	GCCT	2	8	246352	246359	0 %	25 %	25 %	50 %	16081385
4533	NC_002578	GA	3	6	246367	246372	50 %	0 %	50 %	0 %	16081385
4534	NC_002578	CTT	2	6	246461	246466	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082501
4535	NC_002578	TAT	2	6	246467	246472	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16082501
4536	NC_002578	TCGA	2	8	246474	246481	25 %	25 %	25 %	25 %	16082501
4537	NC_002578	CCG	2	6	246624	246629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16082501
4538	NC_002578	TCT	2	6	246724	246729	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082501
4539	NC_002578	TGA	2	6	246768	246773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082501
4540	NC_002578	ATC	2	6	246828	246833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082501
4541	NC_002578	GCATA	2	10	246864	246873	40 %	20 %	20 %	20 %	16082501
4542	NC_002578	TAT	2	6	246959	246964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16082501
4543	NC_002578	CAT	2	6	246967	246972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082501
4544	NC_002578	GTT	2	6	247124	247129	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16082501
4545	NC_002578	CCT	2	6	247183	247188	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082501
4546	NC_002578	CTC	2	6	247220	247225	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082501
4547	NC_002578	TCA	2	6	247345	247350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082501
4548	NC_002578	TCG	2	6	247353	247358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082501
4549	NC_002578	GGC	2	6	247367	247372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16082501
4550	NC_002578	TCA	2	6	247440	247445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082501
4551	NC_002578	TCT	2	6	247495	247500	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082501
4552	NC_002578	AG	3	6	247604	247609	50 %	0 %	50 %	0 %	16082501
4553	NC_002578	ATC	2	6	247610	247615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082501
4554	NC_002578	TTCC	2	8	247625	247632	0 %	50 %	0 %	50 %	16082501
4555	NC_002578	GCA	2	6	247666	247671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082501
4556	NC_002578	TGT	2	6	247820	247825	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16082501
4557	NC_002578	TCA	2	6	247869	247874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082501
4558	NC_002578	GCC	2	6	247929	247934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16082501
4559	NC_002578	TCC	2	6	247943	247948	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082501
4560	NC_002578	GTT	2	6	247994	247999	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16082501
4561	NC_002578	CCT	2	6	248020	248025	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082501
4562	NC_002578	TTTA	2	8	248111	248118	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4563	NC_002578	ATT	2	6	248130	248135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4564	NC_002578	TA	3	6	248143	248148	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4565	NC_002578	AT	3	6	248185	248190	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4566	NC_002578	GGCT	2	8	248243	248250	0 %	25 %	50 %	25 %	16081386
4567	NC_002578	GCT	2	6	248329	248334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081386
4568	NC_002578	GCA	2	6	248336	248341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081386
4569	NC_002578	CGCT	2	8	248345	248352	0 %	25 %	25 %	50 %	16081386
4570	NC_002578	TAC	2	6	248434	248439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081386
4571	NC_002578	TTC	2	6	248509	248514	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081386
4572	NC_002578	TAT	2	6	248557	248562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16081386
4573	NC_002578	TA	3	6	248590	248595	50 %	50 %	0 %	0 %	16081386
4574	NC_002578	GTT	2	6	248614	248619	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16081386
4575	NC_002578	CCTT	2	8	248659	248666	0 %	50 %	0 %	50 %	16081386
4576	NC_002578	ATT	2	6	248669	248674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16081386
4577	NC_002578	ATA	2	6	248710	248715	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081386
4578	NC_002578	TTC	2	6	248927	248932	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081386
4579	NC_002578	TGC	2	6	248934	248939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081386
4580	NC_002578	CTG	2	6	248944	248949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081386
4581	NC_002578	TCA	2	6	248992	248997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081386
4582	NC_002578	TCA	2	6	249001	249006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081386
4583	NC_002578	ATA	2	6	249025	249030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081386
4584	NC_002578	TCC	2	6	249118	249123	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16081386
4585	NC_002578	CT	3	6	249141	249146	0 %	50 %	0 %	50 %	16081386
4586	NC_002578	GA	3	6	249150	249155	50 %	0 %	50 %	0 %	16081386
4587	NC_002578	TCC	2	6	249161	249166	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16081386
4588	NC_002578	CTG	2	6	249223	249228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081386
4589	NC_002578	GGC	2	6	249235	249240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16081386
4590	NC_002578	ATA	3	9	249241	249249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081386
4591	NC_002578	CTG	2	6	249322	249327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081386
4592	NC_002578	TCT	2	6	249336	249341	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081386
4593	NC_002578	AT	3	6	249361	249366	50 %	50 %	0 %	0 %	16081386
4594	NC_002578	CT	3	6	249397	249402	0 %	50 %	0 %	50 %	16081386
4595	NC_002578	CTGC	2	8	249412	249419	0 %	25 %	25 %	50 %	16081386
4596	NC_002578	TAA	2	6	249443	249448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081386
4597	NC_002578	TAT	2	6	249451	249456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16081386
4598	NC_002578	CAG	2	6	249494	249499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081386
4599	NC_002578	TTA	2	6	249503	249508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16081386
4600	NC_002578	GCA	2	6	249557	249562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081386
4601	NC_002578	GGA	2	6	249603	249608	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081386
4602	NC_002578	GAA	2	6	249688	249693	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081387
4603	NC_002578	AAG	2	6	249770	249775	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081387
4604	NC_002578	TGACG	2	10	249790	249799	20 %	20 %	40 %	20 %	16081387
4605	NC_002578	TTG	2	6	249828	249833	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16081387
4606	NC_002578	GAT	2	6	249866	249871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081387
4607	NC_002578	CAA	2	6	249916	249921	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16081387
4608	NC_002578	ACT	2	6	249932	249937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081387
4609	NC_002578	GCG	2	6	250131	250136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4610	NC_002578	CTGC	2	8	250157	250164	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4611	NC_002578	GAT	2	6	250169	250174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4612	NC_002578	TTCT	2	8	250242	250249	0 %	75 %	0 %	25 %	16081388
4613	NC_002578	CAT	2	6	250254	250259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081388
4614	NC_002578	GAAG	2	8	250281	250288	50 %	0 %	50 %	0 %	16081388
4615	NC_002578	TCT	2	6	250328	250333	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081388
4616	NC_002578	TGG	2	6	250346	250351	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16081388
4617	NC_002578	GAT	2	6	250434	250439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081388
4618	NC_002578	CAG	2	6	250443	250448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081388
4619	NC_002578	TCC	2	6	250483	250488	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16081388
4620	NC_002578	TGC	3	9	250557	250565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081388
4621	NC_002578	G	6	6	250620	250625	0 %	0 %	100 %	0 %	16081388
4622	NC_002578	CCA	2	6	250670	250675	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16081388
4623	NC_002578	GCC	2	6	250714	250719	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16081388
4624	NC_002578	CCT	2	6	250760	250765	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16081388
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4642	NC_002578	CGG	3	9	251846	251854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4684	NC_002578	GA	3	6	253889	253894	50 %	0 %	50 %	0 %	16081390
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4747	NC_002578	TCC	2	6	258116	258121	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16081394
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4875	NC_002578	ATA	2	6	264653	264658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081400
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4883	NC_002578	GCG	2	6	265002	265007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16081400
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4968	NC_002578	TA	3	6	269443	269448	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4998	NC_002578	ATC	2	6	271040	271045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081403
4999	NC_002578	ACT	2	6	271078	271083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081403
5000	NC_002578	TGG	2	6	271115	271120	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16081403

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