MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermotoga maritima MSB8 chromosome

Total Repeats: 41002

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_000853	TTC	2	6	137313	137318	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642905
3002	NC_000853	AGA	2	6	137364	137369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15642905
3003	NC_000853	TGG	2	6	137433	137438	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15642905
3004	NC_000853	CAT	2	6	137461	137466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642905
3005	NC_000853	TTC	2	6	137504	137509	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642905
3006	NC_000853	ACTC	2	8	137523	137530	25 %	25 %	0 %	50 %	15642905
3007	NC_000853	TC	3	6	137617	137622	0 %	50 %	0 %	50 %	15642905
3008	NC_000853	TTCT	2	8	137623	137630	0 %	75 %	0 %	25 %	15642905
3009	NC_000853	CTTT	2	8	137639	137646	0 %	75 %	0 %	25 %	15642905
3010	NC_000853	TTC	2	6	137780	137785	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642905
3011	NC_000853	TTC	2	6	137807	137812	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642905
3012	NC_000853	CTT	2	6	137903	137908	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642905
3013	NC_000853	CCT	2	6	137942	137947	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3014	NC_000853	CCG	2	6	138003	138008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3015	NC_000853	ATG	2	6	138103	138108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3016	NC_000853	CTT	2	6	138124	138129	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3017	NC_000853	TGCT	2	8	138178	138185	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3018	NC_000853	CAC	2	6	138234	138239	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3019	NC_000853	GAT	2	6	138276	138281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3020	NC_000853	G	6	6	138359	138364	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3021	NC_000853	GAAA	2	8	138423	138430	75 %	0 %	25 %	0 %	15642906
3022	NC_000853	CAG	2	6	138483	138488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642906
3023	NC_000853	TCT	2	6	138551	138556	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642906
3024	NC_000853	AGAA	2	8	138670	138677	75 %	0 %	25 %	0 %	15642906
3025	NC_000853	GAG	2	6	138681	138686	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15642906
3026	NC_000853	ATC	2	6	138708	138713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642906
3027	NC_000853	CAG	2	6	138714	138719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642906
3028	NC_000853	CT	3	6	138832	138837	0 %	50 %	0 %	50 %	15642906
3029	NC_000853	TC	3	6	138919	138924	0 %	50 %	0 %	50 %	15642906
3030	NC_000853	AAG	2	6	138974	138979	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15642906
3031	NC_000853	TGA	2	6	138982	138987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642906
3032	NC_000853	AG	3	6	139013	139018	50 %	0 %	50 %	0 %	15642906
3033	NC_000853	GAAG	2	8	139061	139068	50 %	0 %	50 %	0 %	15642906
3034	NC_000853	GTA	2	6	139145	139150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642906
3035	NC_000853	AGAAA	2	10	139170	139179	80 %	0 %	20 %	0 %	15642907
3036	NC_000853	TCA	2	6	139208	139213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642907
3037	NC_000853	ATT	2	6	139226	139231	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15642907
3038	NC_000853	GAT	2	6	139362	139367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642907
3039	NC_000853	GAA	2	6	139368	139373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15642907
3040	NC_000853	GTG	2	6	139374	139379	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15642907
3041	NC_000853	T	6	6	139415	139420	0 %	100 %	0 %	0 %	15642907
3042	NC_000853	TTC	2	6	139427	139432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642907
3043	NC_000853	ACG	2	6	139451	139456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642907
3044	NC_000853	TGA	2	6	139526	139531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642907
3045	NC_000853	TGG	2	6	139592	139597	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15642907
3046	NC_000853	GGA	2	6	139683	139688	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15642907
3047	NC_000853	AGC	2	6	139733	139738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642907
3048	NC_000853	GAG	2	6	139751	139756	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15642908
3049	NC_000853	A	7	7	139783	139789	100 %	0 %	0 %	0 %	15642908
3050	NC_000853	GGA	2	6	139797	139802	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15642908
3051	NC_000853	ATT	2	6	139889	139894	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15642908
3052	NC_000853	GAA	2	6	139920	139925	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15642908
3053	NC_000853	A	6	6	139945	139950	100 %	0 %	0 %	0 %	15642908
3054	NC_000853	ATTC	2	8	139968	139975	25 %	50 %	0 %	25 %	15642908
3055	NC_000853	GGT	2	6	140045	140050	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15642908
3056	NC_000853	GCA	2	6	140173	140178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642908
3057	NC_000853	GA	3	6	140205	140210	50 %	0 %	50 %	0 %	15642908
3058	NC_000853	A	6	6	140214	140219	100 %	0 %	0 %	0 %	15642908
3059	NC_000853	TAT	2	6	140232	140237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15642908
3060	NC_000853	GAA	3	9	140265	140273	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15642908
3061	NC_000853	AGGC	2	8	140339	140346	25 %	0 %	50 %	25 %	15642908
3062	NC_000853	CTT	2	6	140356	140361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642908
3063	NC_000853	GAAA	2	8	140376	140383	75 %	0 %	25 %	0 %	15642908
3064	NC_000853	TCG	2	6	140389	140394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642908
3065	NC_000853	CAGG	2	8	140414	140421	25 %	0 %	50 %	25 %	15642908
3066	NC_000853	AG	3	6	140472	140477	50 %	0 %	50 %	0 %	15642908
3067	NC_000853	CCCT	2	8	140494	140501	0 %	25 %	0 %	75 %	15642908
3068	NC_000853	AGG	2	6	140506	140511	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15642908
3069	NC_000853	CTG	2	6	140581	140586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642909
3070	NC_000853	TTC	2	6	140641	140646	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642909
3071	NC_000853	TGGTC	2	10	140681	140690	0 %	40 %	40 %	20 %	15642909
3072	NC_000853	TTTC	2	8	140694	140701	0 %	75 %	0 %	25 %	15642909
3073	NC_000853	GTA	2	6	140770	140775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642909
3074	NC_000853	TCT	2	6	140836	140841	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642909
3075	NC_000853	CTT	2	6	140844	140849	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642909
3076	NC_000853	T	6	6	140939	140944	0 %	100 %	0 %	0 %	15642909
3077	NC_000853	ATG	2	6	140948	140953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642909
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3079	NC_000853	CTG	2	6	140987	140992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642909
3080	NC_000853	GTT	2	6	141063	141068	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15642909
3081	NC_000853	TTTG	2	8	141072	141079	0 %	75 %	25 %	0 %	15642909
3082	NC_000853	CAG	2	6	141129	141134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642909
3083	NC_000853	CGA	2	6	141162	141167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642909
3084	NC_000853	CAAG	2	8	141210	141217	50 %	0 %	25 %	25 %	15642909
3085	NC_000853	AAG	3	9	141215	141223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15642909
3086	NC_000853	GAT	2	6	141230	141235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642909
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3088	NC_000853	GGT	2	6	141428	141433	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15642909
3089	NC_000853	CTT	2	6	141445	141450	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642909
3090	NC_000853	GCG	2	6	141472	141477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15642909
3091	NC_000853	AG	3	6	141501	141506	50 %	0 %	50 %	0 %	15642909
3092	NC_000853	GTA	2	6	141586	141591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642909
3093	NC_000853	T	6	6	141604	141609	0 %	100 %	0 %	0 %	15642909
3094	NC_000853	TCG	2	6	141615	141620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642909
3095	NC_000853	CTG	2	6	141691	141696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642909
3096	NC_000853	TA	3	6	141769	141774	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3097	NC_000853	GGT	2	6	141795	141800	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3098	NC_000853	TCC	2	6	141814	141819	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15642910
3099	NC_000853	AG	3	6	141872	141877	50 %	0 %	50 %	0 %	15642910
3100	NC_000853	AGA	2	6	141885	141890	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15642910
3101	NC_000853	TGG	2	6	141932	141937	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15642910
3102	NC_000853	C	6	6	141958	141963	0 %	0 %	0 %	100 %	15642910
3103	NC_000853	CCG	2	6	142067	142072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15642910
3104	NC_000853	TTCT	2	8	142281	142288	0 %	75 %	0 %	25 %	15642910
3105	NC_000853	TCT	2	6	142296	142301	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642910
3106	NC_000853	GAAA	2	8	142368	142375	75 %	0 %	25 %	0 %	15642910
3107	NC_000853	A	6	6	142396	142401	100 %	0 %	0 %	0 %	15642910
3108	NC_000853	TC	3	6	142405	142410	0 %	50 %	0 %	50 %	15642910
3109	NC_000853	GAAA	2	8	142443	142450	75 %	0 %	25 %	0 %	15642910
3110	NC_000853	TCA	2	6	142511	142516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642910
3111	NC_000853	GAAA	2	8	142615	142622	75 %	0 %	25 %	0 %	15642910
3112	NC_000853	A	6	6	142660	142665	100 %	0 %	0 %	0 %	15642910
3113	NC_000853	GAG	2	6	142702	142707	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15642910
3114	NC_000853	TGA	2	6	142751	142756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642910
3115	NC_000853	GAAA	2	8	142759	142766	75 %	0 %	25 %	0 %	15642910
3116	NC_000853	CG	3	6	142802	142807	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3117	NC_000853	GAG	2	6	142827	142832	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15642911
3118	NC_000853	CAA	2	6	142847	142852	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15642911
3119	NC_000853	ATT	2	6	142888	142893	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15642911
3120	NC_000853	CGA	2	6	142910	142915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642911
3121	NC_000853	AG	3	6	142982	142987	50 %	0 %	50 %	0 %	15642911
3122	NC_000853	TTCT	2	8	142997	143004	0 %	75 %	0 %	25 %	15642911
3123	NC_000853	AAGG	2	8	143030	143037	50 %	0 %	50 %	0 %	15642911
3124	NC_000853	CCTC	2	8	143180	143187	0 %	25 %	0 %	75 %	15642911
3125	NC_000853	CAGGT	2	10	143193	143202	20 %	20 %	40 %	20 %	15642911
3126	NC_000853	T	6	6	143226	143231	0 %	100 %	0 %	0 %	15642911
3127	NC_000853	GAG	2	6	143241	143246	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15642911
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3131	NC_000853	TTG	2	6	143483	143488	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15642911
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3140	NC_000853	CGG	2	6	144001	144006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15642912
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3143	NC_000853	CTTC	2	8	144055	144062	0 %	50 %	0 %	50 %	15642912
3144	NC_000853	T	6	6	144075	144080	0 %	100 %	0 %	0 %	15642912
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3232	NC_000853	TTC	2	6	147942	147947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642916
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3235	NC_000853	TTC	2	6	148151	148156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642916
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3240	NC_000853	TGTAGA	2	12	148394	148405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642916
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3242	NC_000853	GA	3	6	148441	148446	50 %	0 %	50 %	0 %	15642916
3243	NC_000853	ACC	2	6	148447	148452	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15642916
3244	NC_000853	CT	3	6	148512	148517	0 %	50 %	0 %	50 %	15642916
3245	NC_000853	TTC	2	6	148552	148557	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642916
3246	NC_000853	TGA	3	9	148616	148624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642916
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3248	NC_000853	CTTTGA	2	12	148700	148711	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	15642916
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3250	NC_000853	TCG	2	6	148780	148785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642916
3251	NC_000853	GAGAG	2	10	148833	148842	40 %	0 %	60 %	0 %	15642916
3252	NC_000853	GCT	2	6	148856	148861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642916
3253	NC_000853	T	6	6	148905	148910	0 %	100 %	0 %	0 %	15642916
3254	NC_000853	ACCTAT	2	12	148911	148922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642916
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3257	NC_000853	T	6	6	149128	149133	0 %	100 %	0 %	0 %	15642917
3258	NC_000853	CTTT	2	8	149169	149176	0 %	75 %	0 %	25 %	15642917
3259	NC_000853	CTTT	2	8	149205	149212	0 %	75 %	0 %	25 %	15642917
3260	NC_000853	TCT	2	6	149226	149231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642917
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3283	NC_000853	TC	3	6	150224	150229	0 %	50 %	0 %	50 %	15642917
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3290	NC_000853	T	6	6	150368	150373	0 %	100 %	0 %	0 %	15642917
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3295	NC_000853	TAT	2	6	150472	150477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3296	NC_000853	A	7	7	150483	150489	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3365	NC_000853	TCC	2	6	153090	153095	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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3370	NC_000853	CAT	2	6	153545	153550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642922
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3374	NC_000853	ATGT	2	8	153794	153801	25 %	50 %	25 %	0 %	15642922
3375	NC_000853	CAGTG	2	10	153833	153842	20 %	20 %	40 %	20 %	15642922
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