MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermotoga maritima MSB8 chromosome

Total Repeats: 41002

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_000853	CAC	2	6	248308	248313	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15643005
5502	NC_000853	CTG	2	6	248363	248368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15643005
5503	NC_000853	GA	3	6	248413	248418	50 %	0 %	50 %	0 %	15643005
5504	NC_000853	TC	3	6	248459	248464	0 %	50 %	0 %	50 %	15643006
5505	NC_000853	GCTC	2	8	248508	248515	0 %	25 %	25 %	50 %	15643006
5506	NC_000853	GAA	2	6	248528	248533	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15643006
5507	NC_000853	CTT	2	6	248576	248581	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15643006
5508	NC_000853	CGA	2	6	248591	248596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15643006
5509	NC_000853	TC	3	6	248642	248647	0 %	50 %	0 %	50 %	15643006
5510	NC_000853	ATG	2	6	248653	248658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15643006
5511	NC_000853	AG	3	6	248693	248698	50 %	0 %	50 %	0 %	15643006
5512	NC_000853	T	6	6	248709	248714	0 %	100 %	0 %	0 %	15643006
5513	NC_000853	CA	3	6	248723	248728	50 %	0 %	0 %	50 %	15643006
5514	NC_000853	GT	3	6	248775	248780	0 %	50 %	50 %	0 %	15643006
5515	NC_000853	GT	3	6	248969	248974	0 %	50 %	50 %	0 %	15643006
5516	NC_000853	TTC	2	6	248977	248982	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15643006
5517	NC_000853	TTG	2	6	249085	249090	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15643006
5518	NC_000853	TCTG	2	8	249109	249116	0 %	50 %	25 %	25 %	15643006
5519	NC_000853	AGA	2	6	249159	249164	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15643006
5520	NC_000853	GAT	2	6	249176	249181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15643006
5521	NC_000853	CCA	2	6	249316	249321	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15643006
5522	NC_000853	GCGGTG	2	12	249367	249378	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	15643006
5523	NC_000853	T	6	6	249412	249417	0 %	100 %	0 %	0 %	15643006
5524	NC_000853	GGA	2	6	249471	249476	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15643006
5525	NC_000853	GAG	2	6	249477	249482	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15643006
5526	NC_000853	ACA	2	6	249526	249531	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15643006
5527	NC_000853	CCT	2	6	249559	249564	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15643006
5528	NC_000853	TTC	2	6	249585	249590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15643006
5529	NC_000853	T	6	6	249597	249602	0 %	100 %	0 %	0 %	15643006
5530	NC_000853	CTT	2	6	249647	249652	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15643006
5531	NC_000853	GAT	2	6	249653	249658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15643006
5532	NC_000853	AGA	2	6	249752	249757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15643007
5533	NC_000853	T	6	6	249790	249795	0 %	100 %	0 %	0 %	15643007
5534	NC_000853	TCCA	2	8	249802	249809	25 %	25 %	0 %	50 %	15643007
5535	NC_000853	GAA	2	6	249883	249888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15643007
5536	NC_000853	CTTT	2	8	250095	250102	0 %	75 %	0 %	25 %	15643007
5537	NC_000853	GTCC	2	8	250162	250169	0 %	25 %	25 %	50 %	15643007
5538	NC_000853	A	6	6	250253	250258	100 %	0 %	0 %	0 %	15643007
5539	NC_000853	GAA	2	6	250397	250402	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15643007
5540	NC_000853	GAAC	2	8	250468	250475	50 %	0 %	25 %	25 %	15643007
5541	NC_000853	TGG	2	6	250489	250494	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15643007
5542	NC_000853	CTT	2	6	250528	250533	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15643007
5543	NC_000853	TTC	3	9	250552	250560	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15643007
5544	NC_000853	GCT	2	6	250614	250619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15643007
5545	NC_000853	ATC	2	6	250620	250625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15643007
5546	NC_000853	T	7	7	250708	250714	0 %	100 %	0 %	0 %	15643008
5547	NC_000853	TGG	2	6	250719	250724	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15643008
5548	NC_000853	GAT	2	6	250765	250770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15643008
5549	NC_000853	TC	4	8	250840	250847	0 %	50 %	0 %	50 %	15643008
5550	NC_000853	TTC	2	6	250852	250857	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15643008
5551	NC_000853	TTTC	2	8	250912	250919	0 %	75 %	0 %	25 %	15643008
5552	NC_000853	GAA	2	6	250929	250934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15643008
5553	NC_000853	ATC	2	6	250981	250986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15643008
5554	NC_000853	T	8	8	251002	251009	0 %	100 %	0 %	0 %	15643008
5555	NC_000853	AC	3	6	251090	251095	50 %	0 %	0 %	50 %	15643008
5556	NC_000853	GCG	2	6	251102	251107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15643008
5557	NC_000853	ACC	2	6	251205	251210	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15643008
5558	NC_000853	CTT	2	6	251235	251240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15643008
5559	NC_000853	GAA	2	6	251245	251250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15643008
5560	NC_000853	CTT	2	6	251274	251279	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15643008
5561	NC_000853	TTTC	2	8	251322	251329	0 %	75 %	0 %	25 %	15643008
5562	NC_000853	TGA	2	6	251337	251342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15643008
5563	NC_000853	TTCT	2	8	251364	251371	0 %	75 %	0 %	25 %	15643008
5564	NC_000853	A	6	6	251380	251385	100 %	0 %	0 %	0 %	15643008
5565	NC_000853	GAG	2	6	251410	251415	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15643008
5566	NC_000853	GGA	2	6	251429	251434	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15643008
5567	NC_000853	TCT	2	6	251498	251503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15643008
5568	NC_000853	TTTC	2	8	251607	251614	0 %	75 %	0 %	25 %	15643008
5569	NC_000853	GTG	2	6	251615	251620	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15643008
5570	NC_000853	TC	3	6	251749	251754	0 %	50 %	0 %	50 %	15643008
5571	NC_000853	CGA	2	6	251832	251837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15643008
5572	NC_000853	TC	3	6	251849	251854	0 %	50 %	0 %	50 %	15643008
5573	NC_000853	CTT	2	6	251856	251861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15643008
5574	NC_000853	TCC	2	6	251912	251917	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15643009
5575	NC_000853	CTT	2	6	251973	251978	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15643009
5576	NC_000853	TTC	2	6	251979	251984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15643009
5577	NC_000853	ACA	2	6	252025	252030	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15643009
5578	NC_000853	CTTCT	2	10	252071	252080	0 %	60 %	0 %	40 %	15643009
5579	NC_000853	ATC	2	6	252165	252170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15643009
5580	NC_000853	ACG	2	6	252184	252189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15643009
5581	NC_000853	CAT	2	6	252216	252221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15643009
5582	NC_000853	GA	3	6	252281	252286	50 %	0 %	50 %	0 %	15643009
5583	NC_000853	CGA	3	9	252341	252349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15643009
5584	NC_000853	TCT	2	6	252362	252367	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15643009
5585	NC_000853	TAC	2	6	252378	252383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15643009
5586	NC_000853	GAAC	2	8	252548	252555	50 %	0 %	25 %	25 %	15643009
5587	NC_000853	TTCC	2	8	252560	252567	0 %	50 %	0 %	50 %	15643009
5588	NC_000853	CAT	2	6	252683	252688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15643009
5589	NC_000853	CAG	2	6	252693	252698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15643009
5590	NC_000853	GCTTT	2	10	252713	252722	0 %	60 %	20 %	20 %	15643009
5591	NC_000853	TTG	2	6	252813	252818	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15643009
5592	NC_000853	GAA	2	6	252849	252854	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15643009
5593	NC_000853	TTTC	2	8	252875	252882	0 %	75 %	0 %	25 %	15643009
5594	NC_000853	GTG	2	6	252913	252918	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15643009
5595	NC_000853	GTC	2	6	252921	252926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15643009
5596	NC_000853	GTA	2	6	252927	252932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15643009
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5598	NC_000853	AG	3	6	252988	252993	50 %	0 %	50 %	0 %	15643009
5599	NC_000853	ATC	2	6	253009	253014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15643009
5600	NC_000853	GTT	2	6	253018	253023	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15643009
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5603	NC_000853	TAT	2	6	253206	253211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15643009
5604	NC_000853	T	7	7	253260	253266	0 %	100 %	0 %	0 %	15643009
5605	NC_000853	AGA	2	6	253272	253277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15643009
5606	NC_000853	AC	3	6	253286	253291	50 %	0 %	0 %	50 %	15643009
5607	NC_000853	AT	3	6	253361	253366	50 %	50 %	0 %	0 %	15643009
5608	NC_000853	TAG	2	6	253370	253375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15643009
5609	NC_000853	ACC	2	6	253377	253382	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5610	NC_000853	TTTA	2	8	253402	253409	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5611	NC_000853	AGG	2	6	253424	253429	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5612	NC_000853	ATC	2	6	253451	253456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15643010
5613	NC_000853	GGA	2	6	253516	253521	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15643010
5614	NC_000853	AGA	2	6	253581	253586	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15643010
5615	NC_000853	GA	3	6	253639	253644	50 %	0 %	50 %	0 %	15643010
5616	NC_000853	GAA	2	6	253738	253743	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15643010
5617	NC_000853	AGA	2	6	253770	253775	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15643010
5618	NC_000853	GA	4	8	253871	253878	50 %	0 %	50 %	0 %	15643010
5619	NC_000853	A	6	6	253939	253944	100 %	0 %	0 %	0 %	15643010
5620	NC_000853	AGA	2	6	253962	253967	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15643010
5621	NC_000853	GAAG	2	8	253999	254006	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5622	NC_000853	AG	3	6	254005	254010	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5623	NC_000853	GAA	2	6	254015	254020	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15643011
5624	NC_000853	GATT	2	8	254033	254040	25 %	50 %	25 %	0 %	15643011
5625	NC_000853	GCG	2	6	254095	254100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15643011
5626	NC_000853	GGA	2	6	254257	254262	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15643011
5627	NC_000853	CGG	2	6	254318	254323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15643011
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5630	NC_000853	A	6	6	254439	254444	100 %	0 %	0 %	0 %	15643011
5631	NC_000853	CGA	2	6	254520	254525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15643011
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5660	NC_000853	GA	3	6	255869	255874	50 %	0 %	50 %	0 %	15643012
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5666	NC_000853	GTG	2	6	256110	256115	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15643012
5667	NC_000853	GA	3	6	256150	256155	50 %	0 %	50 %	0 %	15643012
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5673	NC_000853	T	7	7	256520	256526	0 %	100 %	0 %	0 %	15643013
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5681	NC_000853	AG	3	6	256980	256985	50 %	0 %	50 %	0 %	15643013
5682	NC_000853	AG	3	6	256997	257002	50 %	0 %	50 %	0 %	15643013
5683	NC_000853	GGAA	2	8	257141	257148	50 %	0 %	50 %	0 %	15643013
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5688	NC_000853	A	6	6	257269	257274	100 %	0 %	0 %	0 %	15643013
5689	NC_000853	GA	3	6	257278	257283	50 %	0 %	50 %	0 %	15643013
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5694	NC_000853	CGA	2	6	257356	257361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15643013
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5696	NC_000853	TTC	2	6	257410	257415	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15643013
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5698	NC_000853	TTTAC	2	10	257539	257548	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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5702	NC_000853	CTGT	2	8	257814	257821	0 %	50 %	25 %	25 %	15643015
5703	NC_000853	GC	3	6	257825	257830	0 %	0 %	50 %	50 %	15643015
5704	NC_000853	TC	3	6	257862	257867	0 %	50 %	0 %	50 %	15643015
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5715	NC_000853	GAAA	2	8	258262	258269	75 %	0 %	25 %	0 %	15643015
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5721	NC_000853	TCTT	2	8	258663	258670	0 %	75 %	0 %	25 %	15643016
5722	NC_000853	AGA	2	6	258810	258815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15643016
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5724	NC_000853	AGA	2	6	258922	258927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15643016
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5732	NC_000853	CAA	2	6	259174	259179	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15643016
5733	NC_000853	GATG	2	8	259180	259187	25 %	25 %	50 %	0 %	15643016
5734	NC_000853	CTC	2	6	259238	259243	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15643016
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5744	NC_000853	GT	3	6	259673	259678	0 %	50 %	50 %	0 %	15643016
5745	NC_000853	TCTCC	2	10	259708	259717	0 %	40 %	0 %	60 %	15643016
5746	NC_000853	ACG	2	6	259731	259736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15643016
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5748	NC_000853	AGA	2	6	259865	259870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15643016
5749	NC_000853	GAT	2	6	259912	259917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15643017
5750	NC_000853	GGC	2	6	259971	259976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15643017
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5856	NC_000853	ACAG	2	8	264693	264700	50 %	0 %	25 %	25 %	15643025
5857	NC_000853	CTGG	2	8	264795	264802	0 %	25 %	50 %	25 %	15643025
5858	NC_000853	GTT	2	6	264818	264823	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15644629
5859	NC_000853	A	6	6	264833	264838	100 %	0 %	0 %	0 %	15644629
5860	NC_000853	CTT	2	6	265049	265054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15644629
5861	NC_000853	A	6	6	265178	265183	100 %	0 %	0 %	0 %	15644629
5862	NC_000853	AG	3	6	265195	265200	50 %	0 %	50 %	0 %	15644629
5863	NC_000853	A	6	6	265208	265213	100 %	0 %	0 %	0 %	15644629
5864	NC_000853	GAAA	2	8	265224	265231	75 %	0 %	25 %	0 %	15644629
5865	NC_000853	GA	4	8	265279	265286	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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5868	NC_000853	ATT	2	6	265543	265548	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5869	NC_000853	TAA	2	6	265557	265562	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15643027
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5871	NC_000853	T	6	6	265638	265643	0 %	100 %	0 %	0 %	15643027
5872	NC_000853	A	6	6	265724	265729	100 %	0 %	0 %	0 %	15643027
5873	NC_000853	A	6	6	265749	265754	100 %	0 %	0 %	0 %	15643027
5874	NC_000853	TTC	2	6	265789	265794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15643027
5875	NC_000853	GA	3	6	265799	265804	50 %	0 %	50 %	0 %	15643027
5876	NC_000853	T	6	6	265830	265835	0 %	100 %	0 %	0 %	15643027
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