MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Sinorhizobium fredii HH103 plasmid pSfHH103d partial sequence

Total Repeats: 450

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187148	GGC	2	6	3966	3971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NT_187148	GGA	2	6	3982	3987	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NT_187148	CCG	2	6	4056	4061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4	NT_187148	GGT	2	6	4085	4090	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NT_187148	GAT	2	6	4134	4139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NT_187148	CGG	2	6	4150	4155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7	NT_187148	TGA	2	6	4162	4167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NT_187148	ATC	2	6	4172	4177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NT_187148	GCT	2	6	5634	5639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NT_187148	CCT	2	6	5657	5662	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11	NT_187148	GAA	2	6	6190	6195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NT_187148	TCG	2	6	6200	6205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NT_187148	TGC	2	6	9216	9221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NT_187148	CTC	2	6	11502	11507	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15	NT_187148	CAT	2	6	11529	11534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NT_187148	AAG	2	6	11555	11560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NT_187148	CGG	2	6	11629	11634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NT_187148	GCC	2	6	11645	11650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19	NT_187148	CAG	2	6	11692	11697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NT_187148	GCC	3	9	12005	12013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
21	NT_187148	CGG	2	6	12072	12077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
22	NT_187148	CTG	2	6	12131	12136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NT_187148	CGA	2	6	12184	12189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NT_187148	TCC	2	6	12567	12572	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25	NT_187148	CCG	4	12	12622	12633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
26	NT_187148	GAT	2	6	12748	12753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NT_187148	GAT	2	6	12833	12838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NT_187148	TCC	2	6	12849	12854	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29	NT_187148	CGC	2	6	14191	14196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
30	NT_187148	CAT	2	6	14272	14277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NT_187148	CTG	2	6	14324	14329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NT_187148	GTC	2	6	14392	14397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NT_187148	ACG	2	6	14840	14845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NT_187148	AAG	2	6	15621	15626	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NT_187148	TCC	2	6	21497	21502	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36	NT_187148	ATG	2	6	21608	21613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NT_187148	GCC	2	6	21691	21696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
38	NT_187148	TGA	2	6	21728	21733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NT_187148	CGG	3	9	21770	21778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NT_187148	TCC	2	6	22428	22433	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41	NT_187148	TCG	2	6	22465	22470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NT_187148	GCA	2	6	22929	22934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NT_187148	TCC	2	6	23454	23459	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44	NT_187148	CGC	2	6	23522	23527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
45	NT_187148	GCC	2	6	23564	23569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
46	NT_187148	TCG	2	6	27783	27788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NT_187148	AGC	2	6	27882	27887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NT_187148	GCC	2	6	27920	27925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
49	NT_187148	TCG	2	6	27972	27977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NT_187148	CAC	2	6	28260	28265	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51	NT_187148	AGA	2	6	28268	28273	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NT_187148	CGC	2	6	28992	28997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
53	NT_187148	CTT	2	6	29022	29027	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NT_187148	TCA	2	6	33666	33671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NT_187148	CCG	2	6	33674	33679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
56	NT_187148	CAA	2	6	33718	33723	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NT_187148	GAT	2	6	33791	33796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NT_187148	TCG	2	6	33813	33818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NT_187148	TAT	2	6	35129	35134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NT_187148	GGC	2	6	35153	35158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NT_187148	CGT	2	6	35204	35209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NT_187148	ATA	2	6	37696	37701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NT_187148	ATT	2	6	38502	38507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NT_187148	CGA	2	6	38532	38537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NT_187148	GCC	2	6	38743	38748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
66	NT_187148	TGC	2	6	40988	40993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NT_187148	ATC	2	6	41028	41033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NT_187148	GCT	2	6	41113	41118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NT_187148	TGC	2	6	41745	41750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NT_187148	AGG	2	6	41775	41780	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
71	NT_187148	GTC	2	6	43683	43688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NT_187148	GCC	2	6	45815	45820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
73	NT_187148	CGG	2	6	45871	45876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NT_187148	CGG	2	6	45888	45893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
75	NT_187148	CTT	2	6	45984	45989	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NT_187148	CGC	2	6	45998	46003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
77	NT_187148	GCG	2	6	46005	46010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
78	NT_187148	CCG	2	6	46062	46067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
79	NT_187148	CTG	2	6	47179	47184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NT_187148	CTT	2	6	47217	47222	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NT_187148	TCG	2	6	47261	47266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NT_187148	ACG	2	6	47267	47272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NT_187148	GGC	2	6	47285	47290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
84	NT_187148	CGA	2	6	47511	47516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NT_187148	TAC	2	6	47532	47537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NT_187148	GAG	2	6	47570	47575	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
87	NT_187148	GCA	2	6	48339	48344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NT_187148	ATG	2	6	48465	48470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NT_187148	GAA	2	6	50027	50032	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NT_187148	CCG	2	6	50175	50180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
91	NT_187148	GGA	2	6	50209	50214	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
92	NT_187148	ATG	2	6	50273	50278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NT_187148	CGC	2	6	50279	50284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
94	NT_187148	CGC	2	6	50498	50503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
95	NT_187148	GCT	2	6	50516	50521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NT_187148	CGC	2	6	50647	50652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
97	NT_187148	AAG	2	6	50737	50742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NT_187148	GCA	2	6	50798	50803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NT_187148	TGC	2	6	50920	50925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NT_187148	TCT	2	6	51044	51049	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NT_187148	CTG	2	6	51088	51093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NT_187148	GAT	2	6	51100	51105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NT_187148	AGC	2	6	51209	51214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NT_187148	ACG	2	6	51239	51244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NT_187148	GCT	2	6	51272	51277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NT_187148	CTC	2	6	51316	51321	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
107	NT_187148	GCC	2	6	51491	51496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
108	NT_187148	GGC	2	6	52256	52261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
109	NT_187148	CAT	2	6	52276	52281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NT_187148	CCG	2	6	52323	52328	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
111	NT_187148	CCA	3	9	52403	52411	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
112	NT_187148	CCG	2	6	52467	52472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
113	NT_187148	GGC	3	9	53377	53385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
114	NT_187148	TCT	2	6	53458	53463	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NT_187148	AGG	2	6	54301	54306	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
116	NT_187148	GGA	2	6	54675	54680	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
117	NT_187148	GCC	2	6	54682	54687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
118	NT_187148	GGC	2	6	54722	54727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
119	NT_187148	CGC	2	6	57611	57616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
120	NT_187148	ATG	2	6	57623	57628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NT_187148	CAG	2	6	57632	57637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NT_187148	CGG	2	6	57693	57698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
123	NT_187148	CAC	2	6	58058	58063	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
124	NT_187148	CTT	2	6	58329	58334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NT_187148	CTG	2	6	58367	58372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NT_187148	GCG	2	6	58559	58564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
127	NT_187148	AGG	2	6	58580	58585	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
128	NT_187148	ATC	2	6	58636	58641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NT_187148	CCG	2	6	58701	58706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
130	NT_187148	CGG	2	6	58767	58772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
131	NT_187148	CGC	2	6	58812	58817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
132	NT_187148	ATC	2	6	58835	58840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NT_187148	CAT	2	6	58950	58955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NT_187148	CGC	2	6	60443	60448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
135	NT_187148	CAC	2	6	60485	60490	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
136	NT_187148	TAT	2	6	70134	70139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NT_187148	TCC	2	6	70212	70217	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
138	NT_187148	GTT	2	6	73222	73227	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NT_187148	TTG	2	6	73228	73233	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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404	NT_187148	GAG	2	6	232203	232208	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
405	NT_187148	CCT	2	6	232341	232346	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
406	NT_187148	CCT	2	6	232369	232374	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
407	NT_187148	TCA	2	6	232475	232480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
408	NT_187148	TCC	2	6	233440	233445	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
409	NT_187148	AAT	2	6	233501	233506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
410	NT_187148	GTA	2	6	233541	233546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
411	NT_187148	TTG	2	6	233704	233709	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
412	NT_187148	GCT	2	6	234781	234786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
413	NT_187148	CTG	2	6	234796	234801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
414	NT_187148	TGC	2	6	234841	234846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
415	NT_187148	TGC	2	6	234894	234899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
416	NT_187148	GTC	2	6	234938	234943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
417	NT_187148	GAA	2	6	236348	236353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
418	NT_187148	TCG	2	6	236358	236363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
419	NT_187148	ACC	2	6	238643	238648	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
420	NT_187148	CGC	2	6	238653	238658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
421	NT_187148	CAA	2	6	238892	238897	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
422	NT_187148	GTC	2	6	238977	238982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
423	NT_187148	GTC	2	6	241571	241576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
424	NT_187148	ATC	2	6	241581	241586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
425	NT_187148	CTG	2	6	241717	241722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
426	NT_187148	GTC	2	6	241766	241771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
427	NT_187148	GCG	2	6	241772	241777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
428	NT_187148	TTC	2	6	241846	241851	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
429	NT_187148	CGA	3	9	241982	241990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
430	NT_187148	CCT	2	6	242039	242044	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
431	NT_187148	TTA	2	6	242078	242083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
432	NT_187148	TGC	2	6	242260	242265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
433	NT_187148	ATG	2	6	242274	242279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
434	NT_187148	ATG	2	6	244309	244314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
435	NT_187148	CGT	2	6	246141	246146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
436	NT_187148	GGT	2	6	246190	246195	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
437	NT_187148	CGC	2	6	246279	246284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
438	NT_187148	CTG	2	6	246301	246306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
439	NT_187148	GAG	2	6	246308	246313	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
440	NT_187148	GGA	2	6	246343	246348	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
441	NT_187148	TGC	2	6	246367	246372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
442	NT_187148	GCC	2	6	247417	247422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
443	NT_187148	TCG	2	6	247531	247536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
444	NT_187148	CAT	2	6	247636	247641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
445	NT_187148	CGA	2	6	247747	247752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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447	NT_187148	GCC	2	6	247839	247844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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449	NT_187148	ATG	2	6	247938	247943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
450	NT_187148	AAT	2	6	247997	248002	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.