MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 386

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187130	TTG	3	9	1354	1362	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NT_187130	ATA	2	6	1369	1374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NT_187130	AAGAA	2	10	1403	1412	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NT_187130	ATTAA	2	10	1467	1476	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NT_187130	A	6	6	2842	2847	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NT_187130	A	6	6	4135	4140	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NT_187130	ATG	2	6	4164	4169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NT_187130	CAGG	2	8	4203	4210	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
9	NT_187130	ACAG	2	8	4275	4282	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NT_187130	TAA	2	6	4430	4435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NT_187130	GC	3	6	4449	4454	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NT_187130	AGG	2	6	4569	4574	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NT_187130	GCA	2	6	4582	4587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NT_187130	CCG	2	6	5613	5618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15	NT_187130	CT	3	6	5626	5631	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NT_187130	GCCA	2	8	5680	5687	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
17	NT_187130	CTA	2	6	5691	5696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NT_187130	TTAT	2	8	7237	7244	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NT_187130	TTGT	2	8	7279	7286	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NT_187130	ATG	2	6	7297	7302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NT_187130	AT	3	6	7539	7544	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NT_187130	ATT	3	9	7748	7756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NT_187130	GCAA	2	8	7858	7865	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NT_187130	ATT	3	9	7891	7899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NT_187130	CA	3	6	7930	7935	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NT_187130	AAG	2	6	7958	7963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NT_187130	A	8	8	8068	8075	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NT_187130	AAGC	2	8	8085	8092	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NT_187130	TCA	2	6	8121	8126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NT_187130	A	7	7	8185	8191	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NT_187130	CTTTTA	2	12	8256	8267	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NT_187130	TGA	2	6	8589	8594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NT_187130	TA	3	6	8641	8646	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NT_187130	TCA	2	6	8647	8652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NT_187130	TAAA	2	8	8654	8661	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NT_187130	AGGA	2	8	8702	8709	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NT_187130	AT	3	6	8715	8720	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NT_187130	TGA	2	6	8724	8729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NT_187130	ATA	2	6	8746	8751	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NT_187130	GGC	2	6	8779	8784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NT_187130	TA	3	6	8808	8813	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NT_187130	G	6	6	8825	8830	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
43	NT_187130	A	6	6	8874	8879	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NT_187130	AAT	2	6	8904	8909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NT_187130	AGA	3	9	11927	11935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NT_187130	TTG	2	6	11938	11943	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NT_187130	GGC	2	6	11978	11983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NT_187130	GAAT	2	8	11988	11995	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NT_187130	TATC	2	8	15593	15600	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NT_187130	TTA	2	6	15622	15627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NT_187130	TG	4	8	15675	15682	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NT_187130	AG	3	6	15697	15702	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NT_187130	CTT	2	6	15709	15714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NT_187130	CGG	2	6	15746	15751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NT_187130	ATCTA	2	10	15755	15764	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NT_187130	GGAT	2	8	15777	15784	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NT_187130	CAA	2	6	16903	16908	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NT_187130	TA	3	6	16934	16939	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NT_187130	TGTA	2	8	16946	16953	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NT_187130	AGA	2	6	17549	17554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NT_187130	GGC	2	6	17563	17568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NT_187130	GCCAG	2	10	17595	17604	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
63	NT_187130	TC	3	6	18579	18584	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NT_187130	GGC	2	6	18822	18827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
65	NT_187130	GAG	2	6	21098	21103	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
66	NT_187130	ATC	2	6	21139	21144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NT_187130	GC	3	6	21145	21150	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
68	NT_187130	AGTG	2	8	21168	21175	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NT_187130	AGG	2	6	21225	21230	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
70	NT_187130	TTG	2	6	21281	21286	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NT_187130	GC	3	6	21333	21338	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
72	NT_187130	GAC	2	6	23091	23096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NT_187130	CTG	2	6	26159	26164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NT_187130	T	6	6	26177	26182	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NT_187130	GC	3	6	26185	26190	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
76	NT_187130	CGC	2	6	26205	26210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
77	NT_187130	CT	3	6	26214	26219	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NT_187130	GGA	2	6	26678	26683	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
79	NT_187130	CCT	2	6	27160	27165	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
80	NT_187130	GAT	2	6	30961	30966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NT_187130	GCC	2	6	30988	30993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
82	NT_187130	AT	3	6	31001	31006	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NT_187130	A	6	6	33348	33353	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NT_187130	TGC	2	6	33383	33388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NT_187130	GCT	2	6	33411	33416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NT_187130	T	6	6	33442	33447	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NT_187130	TAA	2	6	33476	33481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NT_187130	TGCC	2	8	34071	34078	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
89	NT_187130	CGT	2	6	34082	34087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NT_187130	GCC	2	6	36755	36760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
91	NT_187130	CTTT	2	8	36774	36781	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NT_187130	ATG	2	6	36800	36805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NT_187130	TTG	2	6	36827	36832	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NT_187130	ACC	2	6	36845	36850	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
95	NT_187130	ACGCA	2	10	36853	36862	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
96	NT_187130	CAGG	2	8	36891	36898	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
97	NT_187130	ATG	2	6	36981	36986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NT_187130	AGC	2	6	37037	37042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NT_187130	ATGG	2	8	37096	37103	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NT_187130	TTG	2	6	37113	37118	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NT_187130	ATGA	2	8	37144	37151	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NT_187130	ATG	2	6	37182	37187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NT_187130	TTAAT	2	10	37222	37231	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NT_187130	CAAT	2	8	37304	37311	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
105	NT_187130	TAAT	2	8	37339	37346	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NT_187130	TTA	2	6	37390	37395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NT_187130	GGC	2	6	37413	37418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
108	NT_187130	GGA	2	6	37427	37432	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
109	NT_187130	TC	3	6	39309	39314	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NT_187130	ATA	2	6	39393	39398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NT_187130	CAG	3	9	39410	39418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NT_187130	ATG	2	6	40256	40261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NT_187130	AATGAT	2	12	40270	40281	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
114	NT_187130	GTT	2	6	40332	40337	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NT_187130	CAG	2	6	40356	40361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NT_187130	TTAT	2	8	41439	41446	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NT_187130	GTT	3	9	41516	41524	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NT_187130	TCA	2	6	41569	41574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NT_187130	AT	3	6	41627	41632	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NT_187130	TTATCA	2	12	41646	41657	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
121	NT_187130	AGGA	2	8	41921	41928	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NT_187130	G	8	8	41946	41953	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
123	NT_187130	G	8	8	42064	42071	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
124	NT_187130	G	8	8	42178	42185	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
125	NT_187130	GATT	2	8	42344	42351	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NT_187130	GCGCT	2	10	42422	42431	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
127	NT_187130	TTC	2	6	42447	42452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NT_187130	TAG	2	6	43491	43496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NT_187130	CGA	2	6	43569	43574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NT_187130	GC	3	6	43627	43632	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
131	NT_187130	TTCCC	2	10	43652	43661	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
132	NT_187130	CG	3	6	43734	43739	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
133	NT_187130	TGC	2	6	43792	43797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NT_187130	CGC	2	6	43840	43845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
135	NT_187130	ACG	2	6	43869	43874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NT_187130	CGG	2	6	43903	43908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
137	NT_187130	CGC	2	6	45146	45151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
138	NT_187130	AAG	2	6	45160	45165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NT_187130	T	6	6	46847	46852	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NT_187130	T	6	6	46867	46872	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NT_187130	TGA	2	6	46921	46926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NT_187130	TAA	2	6	47004	47009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NT_187130	CGT	2	6	47036	47041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
144	NT_187130	CAC	2	6	47828	47833	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
145	NT_187130	A	7	7	48168	48174	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NT_187130	AGCA	2	8	52730	52737	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
147	NT_187130	TGCG	2	8	52741	52748	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
148	NT_187130	GCC	2	6	53568	53573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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290	NT_187130	T	7	7	108954	108960	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
291	NT_187130	GAA	2	6	108990	108995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
292	NT_187130	CAG	2	6	109000	109005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
293	NT_187130	A	6	6	109016	109021	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
294	NT_187130	TGAA	2	8	109057	109064	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
295	NT_187130	CG	3	6	109655	109660	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
296	NT_187130	A	8	8	109706	109713	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
297	NT_187130	TAT	2	6	115861	115866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
298	NT_187130	TAT	2	6	115868	115873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
299	NT_187130	TGCGT	2	10	116759	116768	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
300	NT_187130	AAAAG	2	10	117153	117162	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
301	NT_187130	GT	3	6	117632	117637	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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306	NT_187130	CAT	2	6	117792	117797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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314	NT_187130	T	6	6	119494	119499	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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319	NT_187130	TAG	2	6	119586	119591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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324	NT_187130	GAT	2	6	119771	119776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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326	NT_187130	ATT	2	6	119825	119830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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328	NT_187130	TTG	2	6	119882	119887	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
329	NT_187130	TAA	2	6	119914	119919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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333	NT_187130	AAG	2	6	124167	124172	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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341	NT_187130	AAT	2	6	124571	124576	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
342	NT_187130	GAA	2	6	124602	124607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.