MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 42

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187127	AGCGC	2	10	198	207	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
2	NT_187127	TTCTA	2	10	743	752	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NT_187127	ATTTA	2	10	1906	1915	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NT_187127	AATTA	2	10	1941	1950	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NT_187127	CAGAA	2	10	22716	22725	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
6	NT_187127	GCGCT	2	10	32146	32155	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
7	NT_187127	GCGCT	2	10	42806	42815	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
8	NT_187127	TCGTT	2	10	42898	42907	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
9	NT_187127	ATAAA	2	10	62446	62455	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NT_187127	AATAT	2	10	66664	66673	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NT_187127	ACATC	2	10	86103	86112	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
12	NT_187127	ATTCG	2	10	88515	88524	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
13	NT_187127	TCTGC	2	10	111928	111937	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
14	NT_187127	CTTGC	2	10	135815	135824	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
15	NT_187127	ATTTT	2	10	135968	135977	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NT_187127	AGCGT	2	10	139962	139971	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
17	NT_187127	CAGAT	2	10	142121	142130	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
18	NT_187127	TTAAA	2	10	144165	144174	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NT_187127	TTGCC	2	10	144217	144226	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
20	NT_187127	GAGGG	2	10	145877	145886	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
21	NT_187127	TTGTA	2	10	148878	148887	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NT_187127	ATAAC	2	10	164033	164042	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NT_187127	CGATA	2	10	165809	165818	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
24	NT_187127	AAATG	2	10	170372	170381	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NT_187127	TTCTG	2	10	171984	171993	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
26	NT_187127	ATCGA	2	10	179749	179758	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
27	NT_187127	GAAAA	2	10	189525	189534	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NT_187127	GGCGT	2	10	203416	203425	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
29	NT_187127	ATTTT	2	10	241244	241253	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NT_187127	AGCGT	2	10	242918	242927	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
31	NT_187127	GGAAG	2	10	251670	251679	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
32	NT_187127	GTTCA	2	10	265101	265110	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
33	NT_187127	AAAAT	2	10	267881	267890	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NT_187127	GCCGT	2	10	269585	269594	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
35	NT_187127	ATTTT	2	10	272208	272217	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NT_187127	AATTA	2	10	272276	272285	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NT_187127	CTTTT	2	10	283465	283474	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
38	NT_187127	AAGCG	2	10	323617	323626	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
39	NT_187127	AGCGC	2	10	327003	327012	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
40	NT_187127	TTGTG	2	10	335810	335819	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
41	NT_187127	TTTTA	2	10	339215	339224	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NT_187127	ATTTT	2	10	340007	340016	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.