MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 103

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187120	TATT	2	8	5361	5368	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NT_187120	ACTA	2	8	9006	9013	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NT_187120	TCGC	2	8	14096	14103	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4	NT_187120	CAAA	2	8	14204	14211	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NT_187120	TTTA	2	8	19417	19424	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NT_187120	AATT	2	8	19445	19452	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NT_187120	AACC	2	8	25987	25994	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NT_187120	AGGG	2	8	27717	27724	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
9	NT_187120	TGGC	2	8	30536	30543	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10	NT_187120	GCCA	2	8	30550	30557	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11	NT_187120	CTTT	2	8	32999	33006	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NT_187120	TTAA	2	8	33043	33050	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NT_187120	ATTA	2	8	33072	33079	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NT_187120	TTAA	2	8	33103	33110	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NT_187120	AAAT	2	8	33160	33167	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NT_187120	TCAT	2	8	38134	38141	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NT_187120	TGCC	2	8	39658	39665	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
18	NT_187120	AGGG	2	8	45864	45871	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
19	NT_187120	TCAC	2	8	46073	46080	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NT_187120	TAAT	2	8	46087	46094	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NT_187120	ATTA	2	8	46312	46319	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NT_187120	GAAA	2	8	54028	54035	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NT_187120	AACC	2	8	56456	56463	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NT_187120	TCCG	2	8	76848	76855	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
25	NT_187120	ATCC	2	8	78022	78029	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NT_187120	TTTC	2	8	78381	78388	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NT_187120	CCCG	2	8	95208	95215	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
28	NT_187120	GCGG	2	8	95220	95227	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
29	NT_187120	GCCT	2	8	96727	96734	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
30	NT_187120	TAAG	2	8	97295	97302	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NT_187120	GCTA	2	8	98537	98544	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NT_187120	CCCG	2	8	107508	107515	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
33	NT_187120	CTTT	2	8	107551	107558	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NT_187120	TTGT	2	8	119912	119919	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NT_187120	CGGG	2	8	121146	121153	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
36	NT_187120	CAAA	2	8	121246	121253	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NT_187120	TAAC	2	8	123535	123542	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NT_187120	GCAA	2	8	123545	123552	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NT_187120	CTTT	2	8	129670	129677	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NT_187120	GAGT	2	8	134753	134760	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NT_187120	TTGT	2	8	135641	135648	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NT_187120	ATCC	2	8	135679	135686	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NT_187120	GGGC	2	8	137699	137706	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
44	NT_187120	CTGC	2	8	141347	141354	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
45	NT_187120	TACA	2	8	142776	142783	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NT_187120	GCAC	2	8	145042	145049	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
47	NT_187120	GCAA	2	8	145091	145098	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NT_187120	TTTA	2	8	145176	145183	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NT_187120	TGGC	2	8	145245	145252	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
50	NT_187120	TTCG	2	8	145344	145351	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NT_187120	ATGT	2	8	178366	178373	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NT_187120	AACA	2	8	178583	178590	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NT_187120	TTTC	2	8	178716	178723	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NT_187120	CGAA	2	8	182754	182761	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
55	NT_187120	CAAA	2	8	184573	184580	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NT_187120	TGAA	2	8	185553	185560	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NT_187120	TTAC	2	8	189009	189016	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NT_187120	ATTC	2	8	189862	189869	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NT_187120	CCCG	2	8	192507	192514	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
60	NT_187120	CCTG	2	8	192987	192994	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
61	NT_187120	AGGA	2	8	196746	196753	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NT_187120	GTTT	2	8	196796	196803	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NT_187120	TACT	2	8	198790	198797	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NT_187120	GAAA	2	8	212127	212134	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NT_187120	TAAC	2	8	230823	230830	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NT_187120	TGGT	2	8	231161	231168	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NT_187120	ACCT	2	8	231178	231185	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NT_187120	TCAC	2	8	235347	235354	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NT_187120	TATC	2	8	235373	235380	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NT_187120	CTGA	2	8	235809	235816	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
71	NT_187120	AATA	2	8	235899	235906	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NT_187120	CTTT	2	8	247605	247612	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NT_187120	TAAT	2	8	252591	252598	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NT_187120	AGCA	2	8	252612	252619	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
75	NT_187120	TAAA	2	8	261575	261582	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NT_187120	AGTC	2	8	261652	261659	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NT_187120	CTTC	2	8	265577	265584	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NT_187120	ATAA	2	8	269615	269622	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NT_187120	TCCT	2	8	271764	271771	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NT_187120	ATTT	2	8	272864	272871	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NT_187120	CGGG	2	8	299547	299554	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
82	NT_187120	TGCC	2	8	301548	301555	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
83	NT_187120	ATCG	2	8	301734	301741	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
84	NT_187120	TTAT	2	8	305739	305746	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NT_187120	ATTT	2	8	305975	305982	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NT_187120	GTTT	2	8	311528	311535	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NT_187120	CAAT	2	8	311539	311546	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NT_187120	GAAT	2	8	311787	311794	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NT_187120	GCGT	2	8	317354	317361	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
90	NT_187120	AGTC	2	8	317433	317440	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NT_187120	GTTT	2	8	317489	317496	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NT_187120	ACAG	2	8	319570	319577	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
93	NT_187120	ACTT	2	8	323270	323277	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NT_187120	TGAG	2	8	327420	327427	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NT_187120	TCAT	2	8	331793	331800	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NT_187120	GGCA	2	8	333905	333912	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
97	NT_187120	TCCT	2	8	335343	335350	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NT_187120	TATT	2	8	340996	341003	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NT_187120	CCCG	2	8	343961	343968	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
100	NT_187120	TGTT	2	8	344123	344130	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NT_187120	AGGA	2	8	353719	353726	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NT_187120	CAAC	2	8	356915	356922	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NT_187120	ATGA	2	8	356925	356932	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.